; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc05G06920 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc05G06920
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUPF0613 protein PB24D3.06c
Genome locationClcChr05:5077211..5083698
RNA-Seq ExpressionClc05G06920
SyntenyClc05G06920
Gene Ontology termsGO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR013744 - Fusarinine C esterase SidJ
IPR029058 - Alpha/Beta hydrolase fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6597471.1 hypothetical protein SDJN03_10651, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.5e-17689.81Show/hide
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A0A6J1IF85 UPF0613 protein PB24D3.06c1.0e-17589.81Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q4WF56 Fusarinine C esterase sidJ2.1e-2431.74Show/hide
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        K    G+L  Y    +   + T   ++   ++F+GGL DG   T YL  LA AL   +WSL  + L+SSY  +G   L +D  E+ Q + Y+        
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Query:  -NKEDSEGVVLLGHSTGCQDIVHYM-RTNAAC-------------SRAVRGAILQAPVSDREY----------RATLPETAAMIDLASTMISEG-----R
             S  +VL+GHSTG Q ++HY+ R N                   + GAI+QAPVSDRE             T  E   + +  ++M  E       
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Query:  GLDL-----MPREADPA-SPITATRYYSLCS-----YMGDDDMFSSDLSDDQLKMRLG-----HMANTPCQVIFSMGDEYVPEYVDKKSLVNR
        G D+     M     PA +P++A R+ SL S        +DD+FSSDLSD+QL    G      +      V+FS  D+ VP +VDK +L++R
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Q9C0Y8 UPF0613 protein PB24D3.06c1.2e-2734.4Show/hide
Query:  VIFIGGLTDGFMATEYLEPLAIALDKEKWSLVQILLSSSYSGYGTSSLQQDAKELDQLVSYLIN----KEDSEGVVLLGHSTGCQDIVHYMRTNAACSRA
        ++F+GGL DG +   Y++ L   LD+  WS+VQ+   SSY G+GT SL++D ++L + V Y ++       +  +VL+GHSTG Q++++Y+  +   +  
Subjt:  VIFIGGLTDGFMATEYLEPLAIALDKEKWSLVQILLSSSYSGYGTSSLQQDAKELDQLVSYLIN----KEDSEGVVLLGHSTGCQDIVHYMRTNAACSRA

Query:  VRGAILQAPVSDRE--YRATLPE-TAAMID-LASTMISEGRGLDLMPREADP----ASPITATRYYSLCSYMGDDDMFSSDLSDD-------QLKMRLGH
        + G I QAPVSDRE  Y+    E T  ++D + +  + +G G D++PR          P +A R   L    G+DD FSSDLS D        LK   G 
Subjt:  VRGAILQAPVSDRE--YRATLPE-TAAMID-LASTMISEGRGLDLMPREADP----ASPITATRYYSLCSYMGDDDMFSSDLSDD-------QLKMRLGH

Query:  MANTPCQVIFSMGDEYVPEYVDKKSLVNRLCKAMGGAEKVEIEHGNHSLS
         A++   ++ S  DE+V    DK  L+NR        E +     N SLS
Subjt:  MANTPCQVIFSMGDEYVPEYVDKKSLVNRLCKAMGGAEKVEIEHGNHSLS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G19050.1 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein7.6e-15577.26Show/hide
Query:  MNLSLSSSSPSSVPTAAVSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTTSWLSGIVRGRSDRSASMKMSANT---GSGSPAGDSPGPVVKKNHFRGLLFKYGPKPIQVAF
        M+LSL SSS      AA ++S+S SSSS +++SSSS+TTSW SGIVRGR D+S + K+S ++   G GS +GD  GP+  KN FRG+LFKYGPK IQVAF
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Query:  KTGDYKQQVIFIGGLTDGFMATEYLEPLAIALDKEKWSLVQILLSSSYSGYGTSSLQQDAKELDQLVSYLINKEDSEGVVLLGHSTGCQDIVHYMRTNAA
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTTCCATTCCTATATTTTGTTTATGTATTTCTTAATTAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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GNHSLSNRVNEAVEVIVDFVRREGPKGWDDPWH