; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc05G10200 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc05G10200
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionremorin
Genome locationClcChr05:8217513..8219628
RNA-Seq ExpressionClc05G10200
SyntenyClc05G10200
Gene Ontology termsGO:0006950 - response to stress (biological process)
GO:0010033 - response to organic substance (biological process)
GO:1901700 - response to oxygen-containing compound (biological process)
InterPro domainsIPR005516 - Remorin, C-terminal
IPR005518 - Remorin, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0033640.1 remorin [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-5490.51Show/hide
Query:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE
        +KAEEKEK+SEGSINRDAVLARVATEKRL  +KAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELK+IEEKLEKKK EYIEKMKNKIALIHK+AEE
Subjt:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE

Query:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF
        KKAVIEAKRGEEKLKAEE+AAK++ATGT PKKI GCF
Subjt:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF

TYK22939.1 remorin [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-5490.51Show/hide
Query:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE
        +KAEEKEK+SEGSINRDAVLARVATEKRL  +KAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELK+IEEKLEKKK EYIEKMKNKIALIHK+AEE
Subjt:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE

Query:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF
        KKAVIEAKRGEEKLKAEE+AAK++ATGT PKKI GCF
Subjt:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF

XP_008439225.1 PREDICTED: remorin [Cucumis melo]1.7e-5490.51Show/hide
Query:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE
        +KAEEKEK+SEGSINRDAVLARVATEKRL  +KAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELK+IEEKLEKKK EYIEKMKNKIALIHK+AEE
Subjt:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE

Query:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF
        KKAVIEAKRGEEKLKAEE+AAK++ATGT PKKI GCF
Subjt:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF

XP_038875876.1 remorin-like isoform X1 [Benincasa hispida]7.6e-5591.24Show/hide
Query:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE
        +KAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRL  +KAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENS KAAVEAELK+IEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE
Subjt:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE

Query:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF
        KKA IEAKRGEEK+KAEE+AAKY++TGT PKKILGCF
Subjt:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF

XP_038875881.1 remorin-like isoform X2 [Benincasa hispida]1.3e-5488.65Show/hide
Query:  KRLKKKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHK
        ++  +KAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRL  +KAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENS KAAVEAELK+IEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHK
Subjt:  KRLKKKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHK

Query:  SAEEKKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF
        SAEEKKA IEAKRGEEK+KAEE+AAKY++TGT PKKILGCF
Subjt:  SAEEKKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L9S3 Uncharacterized protein5.9e-5388.32Show/hide
Query:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE
        +KAEEKEK+SEGSINRDAVLARVATEKRL  +KAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELK+IEEK EKKK E+IEKMKNKIA IHK AEE
Subjt:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE

Query:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF
        KKAVIEAKRGEEKLKAEE+AAK++ATGT PKKI GCF
Subjt:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF

A0A1S3AXW2 remorin8.2e-5590.51Show/hide
Query:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE
        +KAEEKEK+SEGSINRDAVLARVATEKRL  +KAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELK+IEEKLEKKK EYIEKMKNKIALIHK+AEE
Subjt:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE

Query:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF
        KKAVIEAKRGEEKLKAEE+AAK++ATGT PKKI GCF
Subjt:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF

A0A5A7SRU5 Remorin8.2e-5590.51Show/hide
Query:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE
        +KAEEKEK+SEGSINRDAVLARVATEKRL  +KAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELK+IEEKLEKKK EYIEKMKNKIALIHK+AEE
Subjt:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE

Query:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF
        KKAVIEAKRGEEKLKAEE+AAK++ATGT PKKI GCF
Subjt:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF

A0A5D3DI57 Remorin8.2e-5590.51Show/hide
Query:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE
        +KAEEKEK+SEGSINRDAVLARVATEKRL  +KAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELK+IEEKLEKKK EYIEKMKNKIALIHK+AEE
Subjt:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE

Query:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF
        KKAVIEAKRGEEKLKAEE+AAK++ATGT PKKI GCF
Subjt:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF

A0A6J1CHU8 remorin-like2.7e-5082.98Show/hide
Query:  KRLKKKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHK
        ++  +KAE+KEKD+ GSINRDAVLARVATEKRL  +KAWEESEKSKAENRAHKKLS IGSWENSKKAAVEAELK+IEEKLEKKKAEYIEKMKNKIA IHK
Subjt:  KRLKKKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHK

Query:  SAEEKKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF
        SAEEKKA+IEA RGE+ LKAEE AAK++ATGT P K+LGCF
Subjt:  SAEEKKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80837 Remorin1.2e-3966.67Show/hide
Query:  LKKKAEE--KEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHK
        ++K  EE   +K S GS +RD +LA +  EK+   +KAWEESEKSKAENRA KK+S + +WENSKKAAVEA+L+KIEEKLEKKKA+Y EKMKNK+A IHK
Subjt:  LKKKAEE--KEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHK

Query:  SAEEKKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF
         AEEK+A++EAK+GEE LKAEEM AKY+ATG VPK   GCF
Subjt:  SAEEKKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF

P93788 Remorin6.0e-4776.64Show/hide
Query:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE
        K  E  ++  EGSI+RDAVLARVATEKR+  +KAWEESEKSKAEN+A KK+SAIG+WENSKKA +EAELKK+EE+LEKKKAEY EKMKNKIAL+HK AEE
Subjt:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE

Query:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF
        K+A+IEAKRGE+ LKAEE+AAKY+ATGT PKKILG F
Subjt:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF

Q7XII4 Remorin 4.11.5e-0834.96Show/hide
Query:  SEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEEKKAVIEAKR
        S G + ++ V +++A         AW+ +E +K  NR  ++   I  WE  +     A LKK E KLE+K+A+ +EK +N++A   + AEEK+A  EAKR
Subjt:  SEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEEKKAVIEAKR

Query:  GEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKK
        G +  +  E+A   +A G  P K
Subjt:  GEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKK

Q9FFA5 Remorin 1.42.3e-4675.74Show/hide
Query:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE
        K+ EE++K  EGS+NRDAVLARV TEKR+  +KAWEE+EK K EN+A KKLS+IGSWEN+KKAAVEAELKK+EE+LEKKKAEY+E+MKNKIA IHK AEE
Subjt:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE

Query:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGC
        K+A+IEAKRGEE LKAEE+AAKY+ATGT PKK+ GC
Subjt:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGC

Q9M2D8 Uncharacterized protein At3g612603.0e-3864.54Show/hide
Query:  LKKKAEE--KEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHK
        ++K  EE    K +  S++RD  LA ++ EKRL  ++AWEESEKSKAEN+A KK++ + +WENSKKAAVEA+LKKIEE+LEKKKAEY E+MKNK+A IHK
Subjt:  LKKKAEE--KEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHK

Query:  SAEEKKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF
         AEE++A+IEAKRGE+ LKAEE AAKY+ATG VPK   GCF
Subjt:  SAEEKKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45820.1 Remorin family protein8.7e-4166.67Show/hide
Query:  LKKKAEE--KEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHK
        ++K  EE   +K S GS +RD +LA +  EK+   +KAWEESEKSKAENRA KK+S + +WENSKKAAVEA+L+KIEEKLEKKKA+Y EKMKNK+A IHK
Subjt:  LKKKAEE--KEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHK

Query:  SAEEKKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF
         AEEK+A++EAK+GEE LKAEEM AKY+ATG VPK   GCF
Subjt:  SAEEKKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF

AT3G48940.1 Remorin family protein6.6e-4167.16Show/hide
Query:  EEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEEKKA
        E  E    GS++RDAVL R+  +KR+  +KAWEE+EKSK EN+A KK+S++G+WENSKKA+VEAELKKIEE+L KKKA Y E+MKNKIA IHK AEEK+A
Subjt:  EEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEEKKA

Query:  VIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF
        + EAKRGE+ LKAEEMAAKY+ATGT P K+ G F
Subjt:  VIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF

AT3G61260.1 Remorin family protein2.1e-3964.54Show/hide
Query:  LKKKAEE--KEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHK
        ++K  EE    K +  S++RD  LA ++ EKRL  ++AWEESEKSKAEN+A KK++ + +WENSKKAAVEA+LKKIEE+LEKKKAEY E+MKNK+A IHK
Subjt:  LKKKAEE--KEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHK

Query:  SAEEKKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF
         AEE++A+IEAKRGE+ LKAEE AAKY+ATG VPK   GCF
Subjt:  SAEEKKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF

AT5G23750.1 Remorin family protein1.6e-4775.74Show/hide
Query:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE
        K+ EE++K  EGS+NRDAVLARV TEKR+  +KAWEE+EK K EN+A KKLS+IGSWEN+KKAAVEAELKK+EE+LEKKKAEY+E+MKNKIA IHK AEE
Subjt:  KKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEE

Query:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGC
        K+A+IEAKRGEE LKAEE+AAKY+ATGT PKK+ GC
Subjt:  KKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGC

AT5G23750.2 Remorin family protein1.6e-4776.3Show/hide
Query:  KAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEEK
        K EE++K  EGS+NRDAVLARV TEKR+  +KAWEE+EK K EN+A KKLS+IGSWEN+KKAAVEAELKK+EE+LEKKKAEY+E+MKNKIA IHK AEEK
Subjt:  KAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAEEK

Query:  KAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGC
        +A+IEAKRGEE LKAEE+AAKY+ATGT PKK+ GC
Subjt:  KAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCACCGATGAGCCCAACAAAAGACTGAAGAAAAAGGCAGAGGAGAAAGAGAAAGACAGTGAAGGCTCAATTAATAGAGATGCTGTACTTGCAAGAGTGGCAACAGA
GAAGAGATTGGTCACTCTTAAAGCTTGGGAAGAGAGTGAAAAATCAAAGGCAGAGAATAGAGCTCACAAAAAGCTATCAGCAATTGGATCATGGGAGAACAGCAAGAAAG
CAGCTGTGGAGGCTGAACTGAAAAAGATTGAGGAAAAATTGGAGAAGAAGAAAGCAGAGTATATAGAGAAAATGAAGAACAAAATAGCTTTGATTCACAAATCAGCAGAA
GAAAAGAAGGCTGTTATTGAAGCAAAGCGTGGAGAAGAAAAGCTTAAGGCAGAGGAAATGGCAGCCAAATACAAAGCTACTGGAACTGTTCCTAAGAAGATCCTTGGTTG
TTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCACCGATGAGCCCAACAAAAGACTGAAGAAAAAGGCAGAGGAGAAAGAGAAAGACAGTGAAGGCTCAATTAATAGAGATGCTGTACTTGCAAGAGTGGCAACAGA
GAAGAGATTGGTCACTCTTAAAGCTTGGGAAGAGAGTGAAAAATCAAAGGCAGAGAATAGAGCTCACAAAAAGCTATCAGCAATTGGATCATGGGAGAACAGCAAGAAAG
CAGCTGTGGAGGCTGAACTGAAAAAGATTGAGGAAAAATTGGAGAAGAAGAAAGCAGAGTATATAGAGAAAATGAAGAACAAAATAGCTTTGATTCACAAATCAGCAGAA
GAAAAGAAGGCTGTTATTGAAGCAAAGCGTGGAGAAGAAAAGCTTAAGGCAGAGGAAATGGCAGCCAAATACAAAGCTACTGGAACTGTTCCTAAGAAGATCCTTGGTTG
TTTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATDEPNKRLKKKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLVTLKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEKMKNKIALIHKSAE
EKKAVIEAKRGEEKLKAEEMAAKYKATGTVPKKILGCF