; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc05G10310 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc05G10310
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionremorin
Genome locationClcChr05:8279830..8282249
RNA-Seq ExpressionClc05G10310
SyntenyClc05G10310
Gene Ontology termsGO:0006950 - response to stress (biological process)
GO:0010033 - response to organic substance (biological process)
GO:1901700 - response to oxygen-containing compound (biological process)
InterPro domainsIPR005516 - Remorin, C-terminal
IPR005518 - Remorin, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0033640.1 remorin [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-5185.33Show/hide
Query:  ATDEPNKVES-QSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEE-PADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWE
        ++DEP K+ES +SP EPPPPAA EP ++   DVA+EKSIIPLPPPE+E PADDSKALAIVEK++EKAEEKEK+SEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWE
Subjt:  ATDEPNKVES-QSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEE-PADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWE

Query:  ESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        ESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELK+IEEKLEKKK EYIEK
Subjt:  ESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

XP_008439225.1 PREDICTED: remorin [Cucumis melo]2.7e-5286Show/hide
Query:  ATDEPNKVES-QSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEE-PADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWE
        ++DEP K+ES +SPSEPPPPAA EP ++   DVA+EKSIIPLPPPE+E PADDSKALAIVEK++EKAEEKEK+SEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWE
Subjt:  ATDEPNKVES-QSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEE-PADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWE

Query:  ESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        ESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELK+IEEKLEKKK EYIEK
Subjt:  ESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

XP_022141174.1 remorin-like [Momordica charantia]6.9e-4885.21Show/hide
Query:  ESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPE--EEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEESEKSKAE
        ES+S S+PPP  A EPVEEP+KDVA+EKSIIP  PPE  E PAD SKALA+VEKT EKAE+KEKD+ GSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEESEKSKAE
Subjt:  ESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPE--EEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEESEKSKAE

Query:  NRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        NRAHKKLS IGSWENSKKAAVEAELK+IEEKLEKKKAEYIEK
Subjt:  NRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

XP_038875876.1 remorin-like isoform X1 [Benincasa hispida]6.0e-5284.42Show/hide
Query:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEEPADDSKALAIVE-----KTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLI
        MA DEPNKVESQSPSE PP  A + +EE TKDVA+EKSIIPL PPE +PADDSKALA +E     +T EKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLI
Subjt:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEEPADDSKALAIVE-----KTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLI

Query:  KAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        KAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENS KAAVEAELK+IEEKLEKKKAEYIEK
Subjt:  KAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

XP_038875881.1 remorin-like isoform X2 [Benincasa hispida]2.9e-5487.92Show/hide
Query:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEE
        MA DEPNKVESQSPSE PP  A + +EE TKDVA+EKSIIPL PPE +PADDSKALA +EKT EKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEE
Subjt:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEE

Query:  SEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        SEKSKAENRAHKKLSAIGSWENS KAAVEAELK+IEEKLEKKKAEYIEK
Subjt:  SEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L9S3 Uncharacterized protein4.0e-4982.89Show/hide
Query:  MATDEPNKVE-SQSPSEPPPPAATEPVEEPTK-DVADEKSIIPLPPPEEE-PADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKA
        MA+DEP ++E  +SPSE PPP     V EPTK DVA+EKSIIPL PPE+E PADDSKALAIVEK++EKAEEKEK+SEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKA
Subjt:  MATDEPNKVE-SQSPSEPPPPAATEPVEEPTK-DVADEKSIIPLPPPEEE-PADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKA

Query:  WEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        WEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELK+IEEK EKKK E+IEK
Subjt:  WEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

A0A1S3AXW2 remorin1.3e-5286Show/hide
Query:  ATDEPNKVES-QSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEE-PADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWE
        ++DEP K+ES +SPSEPPPPAA EP ++   DVA+EKSIIPLPPPE+E PADDSKALAIVEK++EKAEEKEK+SEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWE
Subjt:  ATDEPNKVES-QSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEE-PADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWE

Query:  ESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        ESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELK+IEEKLEKKK EYIEK
Subjt:  ESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

A0A5A7SRU5 Remorin6.5e-5285.33Show/hide
Query:  ATDEPNKVES-QSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEE-PADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWE
        ++DEP K+ES +SP EPPPPAA EP ++   DVA+EKSIIPLPPPE+E PADDSKALAIVEK++EKAEEKEK+SEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWE
Subjt:  ATDEPNKVES-QSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEE-PADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWE

Query:  ESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        ESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELK+IEEKLEKKK EYIEK
Subjt:  ESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

A0A6J1CHU8 remorin-like3.3e-4885.21Show/hide
Query:  ESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPE--EEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEESEKSKAE
        ES+S S+PPP  A EPVEEP+KDVA+EKSIIP  PPE  E PAD SKALA+VEKT EKAE+KEKD+ GSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEESEKSKAE
Subjt:  ESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPE--EEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEESEKSKAE

Query:  NRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        NRAHKKLS IGSWENSKKAAVEAELK+IEEKLEKKKAEYIEK
Subjt:  NRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

A0A6J1HZY5 remorin-like1.7e-4476.51Show/hide
Query:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEE
        MA DEP K+ES+ PSEP PP A E VEEPTK+VA+EKSII L PPE+ PADDSK L I EKTE K EEK+     SINRDA LARVATEKRL+LIKAWEE
Subjt:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEE

Query:  SEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        SEKS+ ENRAHKKLS IGSWE+SKKAAVEAELK+IEEK EKKKAEY+EK
Subjt:  SEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80837 Remorin5.5e-2459.44Show/hide
Query:  NKVESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEESEKSKA
        +KV+ +SP+   P  A EP   P  +VADEK  I  PPP E     SKALA+VEK  E+   K K S GS +RD +LA +  EK+ S IKAWEESEKSKA
Subjt:  NKVESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEESEKSKA

Query:  ENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        ENRA KK+S + +WENSKKAAVEA+L+KIEEKLEKKKA+Y EK
Subjt:  ENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

P93788 Remorin3.5e-3466.88Show/hide
Query:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSII--PLPPP--EEEPADDSKALAIVE-KTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLI
        MA  E  KVE   P+ P P     PVE P + VADEK+I+   LPPP  E+E  DDSKAL +VE K  E A+EK+   EGSI+RDAVLARVATEKR+SLI
Subjt:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSII--PLPPP--EEEPADDSKALAIVE-KTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLI

Query:  KAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        KAWEESEKSKAEN+A KK+SAIG+WENSKKA +EAELKK+EE+LEKKKAEY EK
Subjt:  KAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

Q9FFA5 Remorin 1.44.0e-3058.6Show/hide
Query:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATEPVEEP--TKDVADEKS------IIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRL
        MA +EP KV +++ SEP P     PVE+P    DVA ++       ++P P P EE  +DSKA+  V   E + E+K    EGS+NRDAVLARV TEKR+
Subjt:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATEPVEEP--TKDVADEKS------IIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRL

Query:  SLIKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        SLIKAWEE+EK K EN+A KKLS+IGSWEN+KKAAVEAELKK+EE+LEKKKAEY+E+
Subjt:  SLIKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

Q9M2D8 Uncharacterized protein At3g612603.8e-2553.5Show/hide
Query:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATE-----PVEEP---TKDVADEKSIIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRL
        + ++ P KV + +P++ P PA  E     P   P   TKDVA+EK  I  PPP E+  DDSKAL +VEK  E+     K +  S++RD  LA ++ EKRL
Subjt:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATE-----PVEEP---TKDVADEKSIIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRL

Query:  SLIKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        S ++AWEESEKSKAEN+A KK++ + +WENSKKAAVEA+LKKIEE+LEKKKAEY E+
Subjt:  SLIKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45820.1 Remorin family protein3.9e-2559.44Show/hide
Query:  NKVESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEESEKSKA
        +KV+ +SP+   P  A EP   P  +VADEK  I  PPP E     SKALA+VEK  E+   K K S GS +RD +LA +  EK+ S IKAWEESEKSKA
Subjt:  NKVESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEESEKSKA

Query:  ENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        ENRA KK+S + +WENSKKAAVEA+L+KIEEKLEKKKA+Y EK
Subjt:  ENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

AT3G48940.1 Remorin family protein1.2e-2661.47Show/hide
Query:  PLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLE
        P PP +EE +DDSKA+ +V   +E  E+K+    GS++RDAVL R+  +KR+SLIKAWEE+EKSK EN+A KK+S++G+WENSKKA+VEAELKKIEE+L 
Subjt:  PLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLE

Query:  KKKAEYIEK
        KKKA Y E+
Subjt:  KKKAEYIEK

AT3G61260.1 Remorin family protein2.7e-2653.5Show/hide
Query:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATE-----PVEEP---TKDVADEKSIIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRL
        + ++ P KV + +P++ P PA  E     P   P   TKDVA+EK  I  PPP E+  DDSKAL +VEK  E+     K +  S++RD  LA ++ EKRL
Subjt:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATE-----PVEEP---TKDVADEKSIIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRL

Query:  SLIKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        S ++AWEESEKSKAEN+A KK++ + +WENSKKAAVEA+LKKIEE+LEKKKAEY E+
Subjt:  SLIKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

AT5G23750.1 Remorin family protein2.8e-3158.6Show/hide
Query:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATEPVEEP--TKDVADEKS------IIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRL
        MA +EP KV +++ SEP P     PVE+P    DVA ++       ++P P P EE  +DSKA+  V   E + E+K    EGS+NRDAVLARV TEKR+
Subjt:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATEPVEEP--TKDVADEKS------IIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRL

Query:  SLIKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        SLIKAWEE+EK K EN+A KKLS+IGSWEN+KKAAVEAELKK+EE+LEKKKAEY+E+
Subjt:  SLIKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK

AT5G23750.2 Remorin family protein6.3e-3159.24Show/hide
Query:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATEPVEEP--TKDVADEKS------IIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRL
        MA +EP KV +++ SEP P     PVE+P    DVA ++       ++P P P EE  +DSKA+  V     K EE++K  EGS+NRDAVLARV TEKR+
Subjt:  MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATEPVEEP--TKDVADEKS------IIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRL

Query:  SLIKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK
        SLIKAWEE+EK K EN+A KKLS+IGSWEN+KKAAVEAELKK+EE+LEKKKAEY+E+
Subjt:  SLIKAWEESEKSKAENRAHKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
atggccaccgatgagcccaacaaagtagagtctcaatctccgtcagagccccctccgccagctgcaacggagccggtggaggagcctaccaaagacgtggcggatgagaa
atcaattatcccattacccccaccggaggaggagccggccgatgactccaaagctctggcaatcgttgaaaagactgaagaaaaagcagaggagaaagagaaagacagtg
aaggctcaattaatagagatgctgtacttgcaagagtggcaacagagaagagattgtcactcattaaagcttgggaagagagtgaaaaatcaaaggcagagaatagagct
cacaaaaagctatcagcaattggatcatgggagaacagcaagaaagcagctgtggaggctgaactgaaaaagattgaggaaaaattggagaagaagaaagcagagtatat
agagaaatga
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
tgaaagtttttgtttgagtaattagataacatatggtaatgccaagtgccaactcataataaggcaatatttgtccatcctcatccacctatgtttaattaccaactcca
aatatttcccttcttattcttccaactataatatctcaaccacctctctctctctctcatttccatttttccctttcattttctctctcttaactcacaaatggccaccg
atgagcccaacaaagtagagtctcaatctccgtcagagccccctccgccagctgcaacggagccggtggaggagcctaccaaagacgtggcggatgagaaatcaattatc
ccattacccccaccggaggaggagccggccgatgactccaaagctctggcaatcgttgaaaagactgaagaaaaagcagaggagaaagagaaagacagtgaaggctcaat
taatagagatgctgtacttgcaagagtggcaacagagaagagattgtcactcattaaagcttgggaagagagtgaaaaatcaaaggcagagaatagagctcacaaaaagc
tatcagcaattggatcatgggagaacagcaagaaagcagctgtggaggctgaactgaaaaagattgaggaaaaattggagaagaagaaagcagagtatatagagaaatga
agaacaaaatagctttgattcacaaatcagcagaagaaaagaaggctgttattgaagcaaagcgtggagaagaaaagcttaaggcagaggaaatggcagccaaatacaaa
gctactggaactgttcctaagaagatccttggttgtttctaattaaaaactatgtgaatttgcttcttttatttcttggttaaggatgggtgttgctttctattcttgtt
tctttcatttatatatatatatctactttctttctttataattcatatatcatATCAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATDEPNKVESQSPSEPPPPAATEPVEEPTKDVADEKSIIPLPPPEEEPADDSKALAIVEKTEEKAEEKEKDSEGSINRDAVLARVATEKRLSLIKAWEESEKSKAENRA
HKKLSAIGSWENSKKAAVEAELKKIEEKLEKKKAEYIEK