; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc05G10560 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc05G10560
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionsec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic
Genome locationClcChr05:8524242..8529932
RNA-Seq ExpressionClc05G10560
SyntenyClc05G10560
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
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GO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003369 - Sec-independent protein translocase protein TatA/B/E


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140768.2 sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic isoform X3 [Cucumis sativus]4.7e-9467.67Show/hide
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XP_038891753.1 sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic isoform X2 [Benincasa hispida]1.2e-10574.07Show/hide
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A0A0A0L6M5 Uncharacterized protein2.3e-9467.67Show/hide
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A0A1S3AYF5 sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic isoform X12.5e-9370Show/hide
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A0A5A7SWY3 Sec-independent protein translocase protein TATB2.5e-9370Show/hide
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A0A6J1CJQ6 sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic isoform X24.3e-9366.56Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O48950 Sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic7.9e-2037.82Show/hide
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Q2R237 Sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic9.3e-2137.81Show/hide
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Q94G16 Sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic2.1e-3340.62Show/hide
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        Y+S   NT   P +      S    +P +     SKAY+SEEYLK+TEEQLK   AQ Q QT+   E + E Q+QP       T   P
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Q9XH75 Sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic2.1e-3341.1Show/hide
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        ++ AS+SSS +I+ S            +  K  LS     LG   FSP+ GLKHLGIS   K   PE+++R  K   + ASLFGVGAPEALVIGVVALLV
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        FGPKGLAE                                               VAR LGKTLR FQPTI+ELQ       +TLEREIGLD+IS+   +
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         YN  ++N         PPSVP  E  V   +P D  S + KAYTSE+YLK TEEQLKA         AESQ+E Q Q +   +  T   P  ++     
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Query:  VEESTASAP
          E+TA++P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G52440.1 Bacterial sec-independent translocation protein mttA/Hcf1061.5e-3441.1Show/hide
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        FGPKGLAE                                               VAR LGKTLR FQPTI+ELQ       +TLEREIGLD+IS+   +
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Query:  VEESTASAP
          E+TA++P
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTCGTTCTCATAATCATGGCCTCCAAAATTTCAGTTTCCACGTTCCCATTTTCCCCATCTTCCTCATCTGCTTGCTCAAGACTTGCAGCTTCCACTTCATCTTCATC
TTCCATCTCATACTCCAGAACCCCCAAAATTCGTCTCTCCTTGTGTAATTTCCCACTGGGTCTCGGCCTTTTCTCTCCATGGAGTGGTTTAAAGCATTTGGGTATTTCTA
CCAGAGCAAAGTTTCCCGAGAGAAGGAAGAGAATTCCTAAGGGGAAAGCAGTTTTTGCATCTTTGTTCGGGGTTGGAGCTCCCGAGGCACTGGTTATTGGGGTAGTGGCT
CTGTTAGTTTTTGGTCCCAAGGGTCTTGCTGAGGCCGAGGCCAAGCGACTTGGCCCAAGTCAACTCTTCTATTCAGGTGGAACTGCATACCCAAAAAGGGAAGGCATAGG
CTGCCTCATAGGTTTCCCTGTGATGCACACTTGTTATGAAAAACCTCCATATCAATGGTTCTCTGTTGCTCGGACTCTGGGGAAGACCTTACGTGCATTTCAACCCACTA
TAAAAGAACTTCAGACCACACTTGAGCGAGAAATTGGTCTCGATGAAATCTCGAGTTCAGTCAACAGCTCATACAATTCAAGAAAATCAAATACCTACTCAGACCCACCT
TCTGTTCCTAAAGCAGAAGAGTCTGTTGCAGTAGCTGAACCAACAGATGATTCTTCATCAGCAAGCAAAGCTTATACCTCTGAAGAGTACCTAAAGGTTACAGAAGAGCA
GCTGAAAGCTCAAGATCAGCTCCAAACCAATTTTGCAGCAGAAAGCCAGAGTGAATCCCAAGTACAGCCTGAAGGAACTGTCGAAGAACCTACCACGGCAGCTCCTGGAC
TCCAAAATCATGGAACAGTTAAGGTTGAGGAATCAACTGCCTCAGCTCCTGGACCTCCTGGAACTGAGACGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCCGAATCAGAAGGGACTAAAGCGGTGTCCAAATTAGCGACTATCTGTTTGCCGGGTCTCTCCCAGTTCATGGTCGTTCTCATAATCATGGCCTCCAAAATTTCAGTTTC
CACGTTCCCATTTTCCCCATCTTCCTCATCTGCTTGCTCAAGACTTGCAGCTTCCACTTCATCTTCATCTTCCATCTCATACTCCAGAACCCCCAAAATTCGTCTCTCCT
TGTGTAATTTCCCACTGGGTCTCGGCCTTTTCTCTCCATGGAGTGGTTTAAAGCATTTGGGTATTTCTACCAGAGCAAAGTTTCCCGAGAGAAGGAAGAGAATTCCTAAG
GGGAAAGCAGTTTTTGCATCTTTGTTCGGGGTTGGAGCTCCCGAGGCACTGGTTATTGGGGTAGTGGCTCTGTTAGTTTTTGGTCCCAAGGGTCTTGCTGAGGCCGAGGC
CAAGCGACTTGGCCCAAGTCAACTCTTCTATTCAGGTGGAACTGCATACCCAAAAAGGGAAGGCATAGGCTGCCTCATAGGTTTCCCTGTGATGCACACTTGTTATGAAA
AACCTCCATATCAATGGTTCTCTGTTGCTCGGACTCTGGGGAAGACCTTACGTGCATTTCAACCCACTATAAAAGAACTTCAGACCACACTTGAGCGAGAAATTGGTCTC
GATGAAATCTCGAGTTCAGTCAACAGCTCATACAATTCAAGAAAATCAAATACCTACTCAGACCCACCTTCTGTTCCTAAAGCAGAAGAGTCTGTTGCAGTAGCTGAACC
AACAGATGATTCTTCATCAGCAAGCAAAGCTTATACCTCTGAAGAGTACCTAAAGGTTACAGAAGAGCAGCTGAAAGCTCAAGATCAGCTCCAAACCAATTTTGCAGCAG
AAAGCCAGAGTGAATCCCAAGTACAGCCTGAAGGAACTGTCGAAGAACCTACCACGGCAGCTCCTGGACTCCAAAATCATGGAACAGTTAAGGTTGAGGAATCAACTGCC
TCAGCTCCTGGACCTCCTGGAACTGAGACGTAAAGTTATTAGGATCGATTTTGGATCGAGGAGTATTTGTTGTTTCATCAATTGATTGGATGTGATACAACATGCTCTTT
AGGTGGCCAATTTAGAAAATGTGTTTAGTGTTTGAACCTCATGTGAGAGAAGTGATCTTATCAGTGTCTTGGAACTTAATCAGTTTCTAGGCATTGGATAAGATGATTTT
GTTGGATTACTAATTAGAATTCCTCCCTCATTTCATATGATATCTTCCACGGGTTTTAATTACTTCATATCCAAAGTCGTTAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVVLIIMASKISVSTFPFSPSSSSACSRLAASTSSSSSISYSRTPKIRLSLCNFPLGLGLFSPWSGLKHLGISTRAKFPERRKRIPKGKAVFASLFGVGAPEALVIGVVA
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SVPKAEESVAVAEPTDDSSSASKAYTSEEYLKVTEEQLKAQDQLQTNFAAESQSESQVQPEGTVEEPTTAAPGLQNHGTVKVEESTASAPGPPGTET