; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc05G13700 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc05G13700
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionmajor latex protein 149-like
Genome locationClcChr05:12445920..12448622
RNA-Seq ExpressionClc05G13700
SyntenyClc05G13700
Gene Ontology termsGO:0006952 - defense response (biological process)
InterPro domainsIPR000916 - Bet v I/Major latex protein
IPR023393 - START-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581204.1 hypothetical protein SDJN03_21206, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.9e-6276Show/hide
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XP_008457055.1 PREDICTED: major latex protein 149-like [Cucumis melo]1.1e-6175.5Show/hide
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XP_022935319.1 kirola-like [Cucurbita moschata]8.5e-6275.33Show/hide
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XP_023528799.1 kirola-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.9e-5973.33Show/hide
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XP_038893753.1 kirola-like [Benincasa hispida]3.8e-6276.82Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LCM8 Bet_v_1 domain-containing protein3.2e-5973.51Show/hide
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        K QV +NG+NG +V+WSIEFVKANEDV  PH YL+   K++KGLDDYLCNN
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A0A1S3C4L4 major latex protein 149-like5.4e-6275.5Show/hide
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A0A5D3BQS1 Major latex protein 149-like protein5.4e-6275.5Show/hide
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A0A6J1F4J9 kirola-like isoform X11.2e-5668.67Show/hide
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        I+V +NGSNGSS +WSIEFVKANEDV  PH+YL+   K+S+G+DDYLC N
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A0A6J1F532 kirola-like4.1e-6275.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P85524 Kirola5.6e-1631.47Show/hide
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        K+ +QV + S     Y+  + ++  + +M P   +G D+LEGN  + GS+I  KY +    +  + I  AID+  KS+TF+ +EGD+   ++ F + +QV
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           G + +SV W+  + K  EDV  P++ + F  +I+K ++ Y
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Q41020 Major latex protein 222.0e-1331.51Show/hide
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        + K+  ++ +  +A + Y   K+  D +    P IY+G   +EG+  + G I    Y + G P   KER   +D  ++I    +EG +  D++ F   + 
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              +GS V W +E+ K NED P P SYL F  KI + L+ YLC
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Q941R6 MLP-like protein 317.3e-1632.65Show/hide
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        K+   + +K+SA K +     +   V +  P   +GC++ EG+    GSI+   Y     A+V KERI A++     ITF  +EGD+ ++++ F + IQV
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            G  GS V W +E+ K ++ V  P ++L F  ++SK +D++L N
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Q9SSK7 MLP-like protein 342.3e-1736.11Show/hide
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        +  +V +K+SA K +     K   V +  P   + CD+ EG+  + GSI+   Y     A+V KERI A+D     ITF  +EGD+ ++++ F + IQV 
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          +G +GS V W  E+ K NE+V  P + L FA ++SK +D++L
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Q9SSK9 MLP-like protein 285.1e-1735.37Show/hide
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        + K+   V +K+SA K +     K   V +  P   +GCD+ EG+  + GSI+   Y     A+V KERI A++     ITF  +EGD+ ++++ F L I
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        QV    G  GS V W +E+ K +E+V  P + L F  ++SK +D++L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70830.1 MLP-like protein 283.6e-1835.37Show/hide
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        + K+   V +K+SA K +     K   V +  P   +GCD+ EG+  + GSI+   Y     A+V KERI A++     ITF  +EGD+ ++++ F L I
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        QV    G  GS V W +E+ K +E+V  P + L F  ++SK +D++L
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AT1G70830.2 MLP-like protein 283.6e-1835.37Show/hide
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        + K+   V +K+SA K +     K   V +  P   +GCD+ EG+  + GSI+   Y     A+V KERI A++     ITF  +EGD+ ++++ F L I
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        QV    G  GS V W +E+ K +E+V  P + L F  ++SK +D++L
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AT1G70830.3 MLP-like protein 283.6e-1835.37Show/hide
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        + K+   V +K+SA K +     K   V +  P   +GCD+ EG+  + GSI+   Y     A+V KERI A++     ITF  +EGD+ ++++ F L I
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        QV    G  GS V W +E+ K +E+V  P + L F  ++SK +D++L
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AT1G70850.1 MLP-like protein 341.6e-1836.11Show/hide
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        +  +V +K+SA K +     K   V +  P   + CD+ EG+  + GSI+   Y     A+V KERI A+D     ITF  +EGD+ ++++ F + IQV 
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          +G +GS V W  E+ K NE+V  P + L FA ++SK +D++L
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AT1G70850.3 MLP-like protein 341.6e-1836.11Show/hide
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        +  +V +K+SA K +     K   V +  P   + CD+ EG+  + GSI+   Y     A+V KERI A+D     ITF  +EGD+ ++++ F + IQV 
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Query:  -DNGSNGSSVDWSIEFVKANEDVPPPHSYLIFADKISKGLDDYL
          +G +GS V W  E+ K NE+V  P + L FA ++SK +D++L
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCAGATTGCTAAGATCTCAGAGCAAGTGCACCTTAAATCTTCTGCTCACAAGGTGTATGATTTCTTGAAGAACAAAATGGACTTTGTTATCCAAATGTTCCCTGA
TATTTATAAGGGCTGTGACGTTCTGGAAGGAAATGGTTTTTCTCATGGAAGCATCATTCATTTGAAATATAACTTAGGTAGCCCAGCAGAGGTAAAGGAGAGGATAGCTA
TTGATGATGCAAACAAGTCAATAACTTTTGAGTGCCTTGAAGGAGATGTATTCAGAGATTTTGAGGTGTTCAAATTGAAAATTCAAGTTTTTGACAATGGAAGCAATGGA
AGCTCAGTTGATTGGTCTATAGAATTTGTGAAGGCAAATGAAGATGTGCCTCCACCACATAGCTACCTCATATTTGCAGATAAAATCAGCAAAGGCCTTGATGATTACCT
TTGCAACAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGAACATTAATTATGAGCAGAGTTGAAGTTACTTCAGAAGCTTGAAAATGGCTCAGATTGCTAAGATCTCAGAGCAAGTGCACCTTAAATCTTCTGCTCACAAGGTGTAT
GATTTCTTGAAGAACAAAATGGACTTTGTTATCCAAATGTTCCCTGATATTTATAAGGGCTGTGACGTTCTGGAAGGAAATGGTTTTTCTCATGGAAGCATCATTCATTT
GAAATATAACTTAGGTAGCCCAGCAGAGGTAAAGGAGAGGATAGCTATTGATGATGCAAACAAGTCAATAACTTTTGAGTGCCTTGAAGGAGATGTATTCAGAGATTTTG
AGGTGTTCAAATTGAAAATTCAAGTTTTTGACAATGGAAGCAATGGAAGCTCAGTTGATTGGTCTATAGAATTTGTGAAGGCAAATGAAGATGTGCCTCCACCACATAGC
TACCTCATATTTGCAGATAAAATCAGCAAAGGCCTTGATGATTACCTTTGCAACAATTGAACTAAAAACCATTAATGGCTTGGCTATTGCAATGTGATCTAAATAAATTA
TTTATGTTCTAATTACCTCTATGTTGTTATCATGTGTCTTTTTAAGGTTAATTTGGAATAAATAATGATGGTGATGTTGCTTTATTCTATTTCTACATGCTTTTGTCTAT
TTGTTAGACATTTCTTTAACTTATAAGAAGAAAGGTGAAAATATCATTCGTCTGCATTTCGAGACTCAGTTTTAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAQIAKISEQVHLKSSAHKVYDFLKNKMDFVIQMFPDIYKGCDVLEGNGFSHGSIIHLKYNLGSPAEVKERIAIDDANKSITFECLEGDVFRDFEVFKLKIQVFDNGSNG
SSVDWSIEFVKANEDVPPPHSYLIFADKISKGLDDYLCNN