; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc05G17850 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc05G17850
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionVQ motif-containing protein 31-like
Genome locationClcChr05:26819623..26820472
RNA-Seq ExpressionClc05G17850
SyntenyClc05G17850
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8649934.1 hypothetical protein Csa_012580 [Cucumis sativus]2.7e-7886.44Show/hide
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XP_004145579.1 VQ motif-containing protein 11 [Cucumis sativus]9.1e-7985.56Show/hide
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XP_008452821.1 PREDICTED: VQ motif-containing protein 31-like [Cucumis melo]8.8e-8288.89Show/hide
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XP_023536342.1 VQ motif-containing protein 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.3e-7281.01Show/hide
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             SPSH R FDSP+PSPVTPLAAE LF R+P +ASPL+PPVTAED+AIADGGFY HPSPR+SQPPELLNLFPSK A
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XP_038899085.1 VQ motif-containing protein 4-like [Benincasa hispida]2.5e-8488.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L104 VQ domain-containing protein4.4e-7985.56Show/hide
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A0A1S3BVZ0 VQ motif-containing protein 31-like4.3e-8288.89Show/hide
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A0A5A7VC76 VQ motif-containing protein 31-like4.3e-8288.89Show/hide
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A0A6J1F605 VQ motif-containing protein 11-like4.9e-7079.67Show/hide
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        MEKHL   SSP P   STSPTTFVQAD NSFRDLVQKLTGF+G SEKLPVTHLSKLSSS P PP A D+ TGPRRSPFKLQERRHTIRKLEIKLG TG F
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        KN      SPSH R FDSP+PSPVTPLAAE  F R+PS ASPL+PPVTAED+AIADGGFY HPSPR+SQPPELLNLFPSK A
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A0A6J1IP36 VQ motif-containing protein 11-like4.9e-7078.69Show/hide
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        FKN      SPSH R FDSP+PSPVTPLA E LF R+P +ASPL+PPVTAED+AIADGGFY HPSPR+SQPPELLNLFPSK A
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5M750 VQ motif-containing protein 44.1e-1336.9Show/hide
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        S S +  PTTFVQADT+SF+ +VQ LTG A     G S K   TH      S P     PP  A      +    S F+L ERR++++ L+I        
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         +   F    P + SPS    F S V SPVTPL  +   F R   ++     + AE++A+ + GFY HPSP  +     P LL LFP
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 331.6e-0934.01Show/hide
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        PTTFVQADT++F+ +VQ LTG + D+          PV + +K  SS   PP         + + FKL ERR     +  K  L   T   +NS   + +
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Query:  PSHTRGFDSPVPSPVTPLAAESLF-------FRRPSLASPLSP------------PV-----TAEDRAIADGGFYFHPS----PRNSQPPELLNLFP
          ++    SP  SP    ++E++        F +  L SP++P            P+     + ED+AIAD GFY HPS    PR+SQ P LL LFP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 311.2e-0933.33Show/hide
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        TTFVQ DTN+FR++VQ+LTG             ++ +++   P A        +R   KL ERR  +R    KL +  P  +  P+  +PS   G  + +
Subjt:  TTFVQADTNSFRDLVQKLTGFAGDSEKLPVTHLSKLSSSKPFPPAAADYLTGPRRSPFKLQERRHTIRKLEIKLGLTGPFKNSPPSLDSPSHTRGFDSPV

Query:  PSPV-TPLAAESLFFRRPSLASPLSPPVTAEDRAIADGGFYFHPSPRNS---QPPELLNLFP
         SPV TP +  S            +  +  E++AI +  FY HPSPR+      PELL LFP
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 191.5e-0731.75Show/hide
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        PTTFVQAD++SF+ +VQ LTG +     DS + P T           P    +++  P ++    Q ++H+  KL  +    G     KNS         
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Query:  TRGFDSPVPSPVTP--LAAESLFFRRPSLASPLSP-----------------PVTAEDRAIADGGFYFHPS----PRNSQPPELLNLFP
          G  SP  SP     L+   L F + +L SP++P                 P++ E+R IAD G+Y H S    PR+S+ P+LL LFP
Subjt:  TRGFDSPVPSPVTP--LAAESLFFRRPSLASPLSP-----------------PVTAEDRAIADGGFYFHPS----PRNSQPPELLNLFP

Q9M8L3 VQ motif-containing protein 114.1e-1338.51Show/hide
Query:  PSPSTSPTT-FVQADTNSFRDLVQKLTGFAGDSEKLPVTHLSKLSSSKPFPPAAADYLTGPRRSPFKLQERRHTIRKLEIKL-GLTGPFKNSPPSLDSPS
        PS +T P T FVQAD ++FR++VQKLTG   D      + +S      P           P++  FKL ERR + +K+E+K+  +T P        D+ S
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Query:  H-TRGFDSPVPSPVTPLAAESLFFRRPSLASPL----SPPVTAEDRAIADGGFYFHPSPRN-SQP-PELLNLFP
        H  RGF       V+P++    F+ R S  S      + P   E +AIA+ GFYF PSPR+ S+P PELL LFP
Subjt:  H-TRGFDSPVPSPVTPLAAESLFFRRPSLASPL----SPPVTAEDRAIADGGFYFHPSPRN-SQP-PELLNLFP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein2.9e-1436.9Show/hide
Query:  SPSPSTSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFA-----GDSEKLPVTHLSKLSSSKP----FPPAAA---DYLTGPRRSPFKLQERRHTIRKLEIK------L
        S S +  PTTFVQADT+SF+ +VQ LTG A     G S K   TH      S P     PP  A      +    S F+L ERR++++ L+I        
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         +   F    P + SPS    F S V SPVTPL  +   F R   ++     + AE++A+ + GFY HPSP  +     P LL LFP
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein2.9e-1436.9Show/hide
Query:  SPSPSTSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFA-----GDSEKLPVTHLSKLSSSKP----FPPAAA---DYLTGPRRSPFKLQERRHTIRKLEIK------L
        S S +  PTTFVQADT+SF+ +VQ LTG A     G S K   TH      S P     PP  A      +    S F+L ERR++++ L+I        
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Query:  GLTGPFKNSPPSLDSPSHTRGFDSPVPSPVTPLAAESLFFRRPSLASPLSPPVTAEDRAIADGGFYFHPSPRNS---QPPELLNLFP
         +   F    P + SPS    F S V SPVTPL  +   F R   ++     + AE++A+ + GFY HPSP  +     P LL LFP
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AT1G80450.1 VQ motif-containing protein2.9e-1438.51Show/hide
Query:  PSPSTSPTT-FVQADTNSFRDLVQKLTGFAGDSEKLPVTHLSKLSSSKPFPPAAADYLTGPRRSPFKLQERRHTIRKLEIKL-GLTGPFKNSPPSLDSPS
        PS +T P T FVQAD ++FR++VQKLTG   D      + +S      P           P++  FKL ERR + +K+E+K+  +T P        D+ S
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Query:  H-TRGFDSPVPSPVTPLAAESLFFRRPSLASPL----SPPVTAEDRAIADGGFYFHPSPRN-SQP-PELLNLFP
        H  RGF       V+P++    F+ R S  S      + P   E +AIA+ GFYF PSPR+ S+P PELL LFP
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AT5G08480.2 VQ motif-containing protein8.7e-1133.33Show/hide
Query:  TTFVQADTNSFRDLVQKLTGFAGDSEKLPVTHLSKLSSSKPFPPAAADYLTGPRRSPFKLQERRHTIRKLEIKLGLTGPFKNSPPSLDSPSHTRGFDSPV
        TTFVQ DTN+FR++VQ+LTG             ++ +++   P A        +R   KL ERR  +R    KL +  P  +  P+  +PS   G  + +
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Query:  PSPV-TPLAAESLFFRRPSLASPLSPPVTAEDRAIADGGFYFHPSPRNS---QPPELLNLFP
         SPV TP +  S            +  +  E++AI +  FY HPSPR+      PELL LFP
Subjt:  PSPV-TPLAAESLFFRRPSLASPLSPPVTAEDRAIADGGFYFHPSPRNS---QPPELLNLFP

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein1.1e-1034.01Show/hide
Query:  PTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFAGDS-------EKLPVTHLSKLSSSKPFPPAAADYLTGPRRSPFKLQERRHTIRKLEIKLGL---TGPFKNSPPSLDS
        PTTFVQADT++F+ +VQ LTG + D+          PV + +K  SS   PP         + + FKL ERR     +  K  L   T   +NS   + +
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Query:  PSHTRGFDSPVPSPVTPLAAESLF-------FRRPSLASPLSP------------PV-----TAEDRAIADGGFYFHPS----PRNSQPPELLNLFP
          ++    SP  SP    ++E++        F +  L SP++P            P+     + ED+AIAD GFY HPS    PR+SQ P LL LFP
Subjt:  PSHTRGFDSPVPSPVTPLAAESLF-------FRRPSLASPLSP------------PV-----TAEDRAIADGGFYFHPS----PRNSQPPELLNLFP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAAAACATTTAATGGCCGCCTCTTCGCCTTCGCCGTCAACTTCTCCGACCACCTTCGTTCAAGCCGACACAAATTCCTTCAGAGATCTCGTCCAGAAGCTCACCGG
CTTTGCCGGTGACTCCGAAAAGCTTCCGGTCACCCACCTCTCCAAGCTTTCCTCTTCTAAGCCCTTCCCTCCTGCCGCCGCTGACTACCTTACCGGTCCTCGCCGGTCTC
CGTTCAAGCTCCAAGAGCGACGTCACACAATCCGAAAGCTAGAGATCAAACTCGGCCTCACCGGACCTTTCAAAAACTCGCCGCCGAGTCTTGACTCACCGAGTCACACT
CGCGGGTTTGACTCGCCCGTTCCGAGTCCTGTTACGCCTCTCGCCGCCGAGTCGCTGTTTTTTCGAAGGCCCAGCTTGGCCTCGCCACTTTCGCCGCCGGTAACGGCGGA
GGATAGGGCCATAGCTGACGGCGGATTTTATTTTCACCCGTCTCCGAGGAATTCACAGCCGCCGGAGCTCTTGAATTTGTTCCCTTCTAAACTCGCCAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTGATAGGTACCGTTATAAAGAGAAAATAACTTCCAAAAAGCTCGAAAGCACTGACTCACTTCTTTTCTCTCTCTCTACAATGGAAAAACATTTAATGGCCGCCTCTTCG
CCTTCGCCGTCAACTTCTCCGACCACCTTCGTTCAAGCCGACACAAATTCCTTCAGAGATCTCGTCCAGAAGCTCACCGGCTTTGCCGGTGACTCCGAAAAGCTTCCGGT
CACCCACCTCTCCAAGCTTTCCTCTTCTAAGCCCTTCCCTCCTGCCGCCGCTGACTACCTTACCGGTCCTCGCCGGTCTCCGTTCAAGCTCCAAGAGCGACGTCACACAA
TCCGAAAGCTAGAGATCAAACTCGGCCTCACCGGACCTTTCAAAAACTCGCCGCCGAGTCTTGACTCACCGAGTCACACTCGCGGGTTTGACTCGCCCGTTCCGAGTCCT
GTTACGCCTCTCGCCGCCGAGTCGCTGTTTTTTCGAAGGCCCAGCTTGGCCTCGCCACTTTCGCCGCCGGTAACGGCGGAGGATAGGGCCATAGCTGACGGCGGATTTTA
TTTTCACCCGTCTCCGAGGAATTCACAGCCGCCGGAGCTCTTGAATTTGTTCCCTTCTAAACTCGCCAAATGAGCAGTCTCAAAATGCATAAAAGGACGAAAATGGAAAT
TTGCTTTTTCTTTTTTTAAATAATGTCTCTGTATATTTTATTTTTTGTGCAATTTTTTAATATTTGAGGATCCTGAAGCTGATCCATTGGAGTTGTTGAATTTTATTTAT
TTCTCATTGTTATTGTCAATTTTTTTTTCCCATTTCTTAAGCCATATATTTCACTAGAAAAACTCCAATTTTTCTGAATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEKHLMAASSPSPSTSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFAGDSEKLPVTHLSKLSSSKPFPPAAADYLTGPRRSPFKLQERRHTIRKLEIKLGLTGPFKNSPPSLDSPSHT
RGFDSPVPSPVTPLAAESLFFRRPSLASPLSPPVTAEDRAIADGGFYFHPSPRNSQPPELLNLFPSKLAK