; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc05G20260 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc05G20260
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationClcChr05:29034949..29035587
RNA-Seq ExpressionClc05G20260
SyntenyClc05G20260
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7024157.1 hypothetical protein SDJN02_12970, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-2487.5Show/hide
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PON93881.1 hypothetical protein TorRG33x02_102710 [Trema orientale]1.5e-2365.26Show/hide
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XP_007017791.2 PREDICTED: uncharacterized protein LOC18591544 [Theobroma cacao]2.1e-2265.96Show/hide
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XP_024925739.1 uncharacterized protein LOC107408298 [Ziziphus jujuba]5.5e-2360Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A061FD82 Uncharacterized protein1.0e-2265.96Show/hide
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A0A0A0LDK4 Uncharacterized protein1.6e-3986.36Show/hide
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A0A2P5F7X5 Uncharacterized protein7.0e-2465.26Show/hide
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A0A6J1ADC8 uncharacterized protein LOC1104170841.0e-2265.96Show/hide
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A0A6P6FUZ0 uncharacterized protein LOC1074082982.7e-2360Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G75717.1 unknown protein8.5e-1456.94Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAAGGCCTAAAACCACTGAAGCACTTATCACTGCTTCTTCTTCCAACTCTCTTAACTTCTCTTCCATGAAGCTCTTTCACCGAATCCGTAAGCTACTCGTGCGCTT
CGTCTTCTCCCTCCCGTCTCGAGTGTCGTCGTCGTCATCGTCAAGACGAAGAACAAGCTACGACAAGTCGTTTGATCCACCAAAAACATCATGCAGCTCCTATTACTCCT
CCCACTCCCACTACGACGAGGCCATTGCCGATTGTATTGAGTTCTTCAACAAGTCATCGCAAGATGGGGTTTTTGAAGCTCAAAAACCAATCACCTTGGTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAATTTTGCTCTGACTACATGCTCTGCAAATCTTCGCACATAGAAACCCCTTTGAAAATCTCAATCCCTCTTTTTGAACCAAAACATAAATTTCAAATTTCTATATATAA
ATCACAATAAACGACACCCATTATAGCATTCCCCATTTCCCCAGAGAATTTTTTACACAAATATGCAAAGGCCTAAAACCACTGAAGCACTTATCACTGCTTCTTCTTCC
AACTCTCTTAACTTCTCTTCCATGAAGCTCTTTCACCGAATCCGTAAGCTACTCGTGCGCTTCGTCTTCTCCCTCCCGTCTCGAGTGTCGTCGTCGTCATCGTCAAGACG
AAGAACAAGCTACGACAAGTCGTTTGATCCACCAAAAACATCATGCAGCTCCTATTACTCCTCCCACTCCCACTACGACGAGGCCATTGCCGATTGTATTGAGTTCTTCA
ACAAGTCATCGCAAGATGGGGTTTTTGAAGCTCAAAAACCAATCACCTTGGTATGATATATATTCAGAATACACAAACAAAATACCCCACATATTCGAGTGGACAATATC
AAATCATTATAGAAATATGAAGAGAGTCTATTATTCGTTGGAGAAAATTTGGTTTGTCATTTGATTTGTATGTGTCTTTTGTTGTTGTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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