; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc06G00380 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc06G00380
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionAT-hook motif nuclear-localized protein
Genome locationClcChr06:334531..335370
RNA-Seq ExpressionClc06G00380
SyntenyClc06G00380
Gene Ontology termsGO:0010228 - vegetative to reproductive phase transition of meristem (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003680 - AT DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR005175 - PPC domain
IPR014476 - AT-hook motif nuclear-localized protein 15-29


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008467078.1 PREDICTED: AT-hook motif nuclear-localized protein 22-like [Cucumis melo]6.3e-13591.2Show/hide
Query:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFH-HHQNSDDDQTAGAKRDRE-DENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHL
        MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFH HHQNSDDD T G KRDR+ D+NPT     D+KELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHL
Subjt:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFH-HHQNSDDDQTAGAKRDRE-DENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHL

Query:  IEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGP
        IEISTASDIVDSLA FARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITL GRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGP
Subjt:  IEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGP

Query:  VIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAA-EIAGQQ--AAPPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY
        VIIMAASFGNAAYERLPIDD+DETSPAA ++AGQQ  AA PPPQL+GDPNGGLFHGMAQN VNSSCQLP EAAAAFWGGGRPPY
Subjt:  VIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAA-EIAGQQ--AAPPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY

XP_022964157.1 AT-hook motif nuclear-localized protein 22-like [Cucurbita moschata]1.0e-13287.72Show/hide
Query:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDDQTA---GAKRDREDENPTT--AAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALR
        MDGI+PHNRPLPP FLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDD  A   G+KRDRE+ENP T  A  ADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALR
Subjt:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDDQTA---GAKRDREDENPTT--AAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALR

Query:  SHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSA
        SHLIEI++ SDIVDSL  FARRRQRGVCILSATGTV NV LRQPASPGAVI LHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGP  +
Subjt:  SHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSA

Query:  SGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQA-APPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY
        SGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAE+AGQ A  PPPPQL+GDPNGGLFHG+AQN VNSSCQLP EAAAA W GGRPPY
Subjt:  SGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQA-APPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY

XP_023000180.1 AT-hook motif nuclear-localized protein 22-like [Cucurbita maxima]2.6e-13387.76Show/hide
Query:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDDQTA---GAKRDREDENPTT--AAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALR
        MDGI+PHNRPLPP FLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDD  A   G+KRDRE+ENP T  A  ADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALR
Subjt:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDDQTA---GAKRDREDENPTT--AAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALR

Query:  SHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSA
        SHLIEI++ SDIVD+L  FARRRQRGVCILSATGTV NVTLRQPASPGAVI LHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGP  +
Subjt:  SHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSA

Query:  SGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQAA--PPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY
        SGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAE+AGQ A   PPPPQL+GDPNGGLFHG+AQNVVNSSCQLP EAAAA W GGRPPY
Subjt:  SGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQAA--PPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY

XP_031742682.1 AT-hook motif nuclear-localized protein 18 [Cucumis sativus]2.2e-13591.2Show/hide
Query:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFH-HHQNSDDDQTAGAKRDRE-DENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHL
        MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFH HHQNSDDD T G KRDR+ D+NPT     D+KELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHL
Subjt:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFH-HHQNSDDDQTAGAKRDRE-DENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHL

Query:  IEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGP
        IEISTASDIVDSLA FARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQP+SPGAVITL GRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGP
Subjt:  IEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGP

Query:  VIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAA-EIAGQQ--AAPPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY
        VIIMAASFGNAAYERLPIDD+DETSPA  ++AGQQ  AAPPPPQL+GDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLP EAAAAFWGGGRPPY
Subjt:  VIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAA-EIAGQQ--AAPPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY

XP_038875925.1 AT-hook motif nuclear-localized protein 22-like [Benincasa hispida]3.2e-14796.43Show/hide
Query:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDDQTAGAKRDREDENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIE
        MDGITPHNR LPPPFLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDDQT GAKRDRE+ENPTTAAM+D+KELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIE
Subjt:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDDQTAGAKRDREDENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIE

Query:  ISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVI
        ISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVI
Subjt:  ISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVI

Query:  IMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQAA-PPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY
        IMAASFGNAAYERLPIDDDDE SPAAE+AGQQ A PPPPQL+GDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY
Subjt:  IMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQAA-PPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBK2 PPC domain-containing protein1.0e-13591.2Show/hide
Query:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFH-HHQNSDDDQTAGAKRDRE-DENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHL
        MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFH HHQNSDDD T G KRDR+ D+NPT     D+KELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHL
Subjt:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFH-HHQNSDDDQTAGAKRDRE-DENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHL

Query:  IEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGP
        IEISTASDIVDSLA FARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQP+SPGAVITL GRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGP
Subjt:  IEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGP

Query:  VIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAA-EIAGQQ--AAPPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY
        VIIMAASFGNAAYERLPIDD+DETSPA  ++AGQQ  AAPPPPQL+GDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLP EAAAAFWGGGRPPY
Subjt:  VIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAA-EIAGQQ--AAPPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY

A0A1S3CSP2 AT-hook motif nuclear-localized protein 22-like3.0e-13591.2Show/hide
Query:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFH-HHQNSDDDQTAGAKRDRE-DENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHL
        MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFH HHQNSDDD T G KRDR+ D+NPT     D+KELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHL
Subjt:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFH-HHQNSDDDQTAGAKRDRE-DENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHL

Query:  IEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGP
        IEISTASDIVDSLA FARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITL GRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGP
Subjt:  IEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGP

Query:  VIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAA-EIAGQQ--AAPPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY
        VIIMAASFGNAAYERLPIDD+DETSPAA ++AGQQ  AA PPPQL+GDPNGGLFHGMAQN VNSSCQLP EAAAAFWGGGRPPY
Subjt:  VIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAA-EIAGQQ--AAPPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY

A0A5A7TT08 AT-hook motif nuclear-localized protein 22-like3.0e-13591.2Show/hide
Query:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFH-HHQNSDDDQTAGAKRDRE-DENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHL
        MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFH HHQNSDDD T G KRDR+ D+NPT     D+KELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHL
Subjt:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFH-HHQNSDDDQTAGAKRDRE-DENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHL

Query:  IEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGP
        IEISTASDIVDSLA FARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITL GRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGP
Subjt:  IEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGP

Query:  VIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAA-EIAGQQ--AAPPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY
        VIIMAASFGNAAYERLPIDD+DETSPAA ++AGQQ  AA PPPQL+GDPNGGLFHGMAQN VNSSCQLP EAAAAFWGGGRPPY
Subjt:  VIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAA-EIAGQQ--AAPPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY

A0A6J1HH20 AT-hook motif nuclear-localized protein 22-like4.8e-13387.72Show/hide
Query:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDDQTA---GAKRDREDENPTT--AAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALR
        MDGI+PHNRPLPP FLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDD  A   G+KRDRE+ENP T  A  ADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALR
Subjt:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDDQTA---GAKRDREDENPTT--AAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALR

Query:  SHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSA
        SHLIEI++ SDIVDSL  FARRRQRGVCILSATGTV NV LRQPASPGAVI LHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGP  +
Subjt:  SHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSA

Query:  SGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQA-APPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY
        SGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAE+AGQ A  PPPPQL+GDPNGGLFHG+AQN VNSSCQLP EAAAA W GGRPPY
Subjt:  SGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQA-APPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY

A0A6J1KHL9 AT-hook motif nuclear-localized protein 22-like1.3e-13387.76Show/hide
Query:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDDQTA---GAKRDREDENPTT--AAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALR
        MDGI+PHNRPLPP FLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDD  A   G+KRDRE+ENP T  A  ADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALR
Subjt:  MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDDQTA---GAKRDREDENPTT--AAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALR

Query:  SHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSA
        SHLIEI++ SDIVD+L  FARRRQRGVCILSATGTV NVTLRQPASPGAVI LHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGP  +
Subjt:  SHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSA

Query:  SGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQAA--PPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY
        SGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAE+AGQ A   PPPPQL+GDPNGGLFHG+AQNVVNSSCQLP EAAAA W GGRPPY
Subjt:  SGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQAA--PPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22130 AT-hook motif nuclear-localized protein 225.2e-7653.77Show/hide
Query:  NRPLPPPFLSKDLHLH-HGLFHHHQNS---------DDDQTAGAKRDRE---DENPTTAAMADSKEL------------SNSSSRRPRGRPAGSKNKPKP
        +R LPPPFLS+DLHLH H  F H Q           D  +  G KRDR+   D N  ++A  D                 N  +RRPRGRPAGSKNKPKP
Subjt:  NRPLPPPFLSKDLHLH-HGLFHHHQNS---------DDDQTAGAKRDRE---DENPTTAAMADSKEL------------SNSSSRRPRGRPAGSKNKPKP

Query:  PIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPAS-PG---AVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLA
        PIIITRDSANAL+SH++E++   D+++S+  FARRRQRG+C+LS  G V NVT+RQPAS PG   +V+ LHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLT+YLA
Subjt:  PIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPAS-PG---AVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLA

Query:  GGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAA-----------------EIAGQQAAPPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSC
        GGQGQVVGG+V+GPL ASGPV+IMAASFGNAAYERLP+++DD+    A                 +   Q       QLM DP      G+  N++N S 
Subjt:  GGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAA-----------------EIAGQQAAPPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSC

Query:  QLPAEAAAAFWGGGRPPY
        QLPAE   A+WG  RP +
Subjt:  QLPAEAAAAFWGGGRPPY

O49662 AT-hook motif nuclear-localized protein 243.0e-7149.54Show/hide
Query:  MDGITPH--NRPLPPPFLSKDLHLH------HGLFHHHQ----NSDDDQTAGA------KRDRED-----ENPTTAAMADSKEL---------------S
        MD +  H     LPPPF ++D  LH          HHHQ     +D DQ  G+      K DRE+     +N    + ++ K++                
Subjt:  MDGITPH--NRPLPPPFLSKDLHLH------HGLFHHHQ----NSDDDQTAGA------KRDRED-----ENPTTAAMADSKEL---------------S

Query:  NSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPA---SPGAVITLHGRFEILSLSG
        +  +RRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALR+H++EI    D+V+S+A FARRRQRGVC++S TG V NVT+RQP    SPG+V++LHGRFEILSLSG
Subjt:  NSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPA---SPGAVITLHGRFEILSLSG

Query:  SFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQAAPPPP----QLMGDPNGGLFH-GMAQ
        SFLPPPAPP A+GL+VYLAGGQGQVVGG+V+GPL  +GPV++MAASF NAAYERLP+++D+  +P     G  +   PP    QL         H G+  
Subjt:  SFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQAAPPPP----QLMGDPNGGLFH-GMAQ

Query:  NVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY
        N++  S QL  +   ++W  GRPPY
Subjt:  NVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY

Q6DBQ1 AT-hook motif nuclear-localized protein 251.1e-6050.75Show/hide
Query:  PFLSKDLHLHH---GLFHHHQNSDDDQTAGAKRDREDENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDS
        P L ++LHL           QN+ +   + A   + +  PT  A + +    +SS RRPRGRPAGSKNKPKPP IITRDS N LRSH++E+++ SDI ++
Subjt:  PFLSKDLHLHH---GLFHHHQNSDDDQTAGAKRDREDENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDS

Query:  LAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASP--GAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGN
        ++ +A RR  GVCI+S TG V NVT+RQPA+P  G VITLHGRF+ILSL+G+ LPPPAPP A GLTVYLAGGQGQVVGGNV G L ASGPV++MAASF N
Subjt:  LAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASP--GAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGN

Query:  AAYERLPIDDDD--------------ETSPAAEIAGQQAAPPPPQLMGDPNGG--LFHGMAQNVVN
        A Y+RLPI++++              E S ++E+ G  A      L G   GG   F+ +  N+ N
Subjt:  AAYERLPIDDDD--------------ETSPAAEIAGQQAAPPPPQLMGDPNGG--LFHGMAQNVVN

Q9LZX7 AT-hook motif nuclear-localized protein 181.5e-6755.07Show/hide
Query:  NRPLPPPFLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDDQTAGAKRDREDENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDI
        +R   P FLS D H H    +HHQN+   +    +   E  N             N   RRPRGRPAGSKNKPK PII+TRDSANA R H++EI+ A D+
Subjt:  NRPLPPPFLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDDQTAGAKRDREDENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDI

Query:  VDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFG
        ++SLA FARRRQRGVC+L+  G V NVT+RQP   G V++LHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGL VYLAGGQGQV+GG+V+GPL+AS PV++MAASFG
Subjt:  VDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFG

Query:  NAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQA----APPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY
        NA+YERLP+++++ET    EI G  A         QLM D     F G   N++N S  LP E   A+WG  RP +
Subjt:  NAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQA----APPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY

Q9SZ70 AT-hook motif nuclear-localized protein 268.1e-6948.38Show/hide
Query:  MDGITPH--NRPLPPPFLSKDLHLH-----------------HGLFHHHQ------NSDDDQTAGA------KRDRE------DENPTTAAMADSKELS-
        MD +  H     LPPPF ++D  LH                     HHHQ      + D +Q  G+      K DRE      D    T + ++ KE+S 
Subjt:  MDGITPH--NRPLPPPFLSKDLHLH-----------------HGLFHHHQ------NSDDDQTAGA------KRDRE------DENPTTAAMADSKELS-

Query:  -------------NSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPAS-PGAVITL
                        +RRPRGRPAGSKNKPK PIIITRDSANALR+H++EI    DIVD +A FARRRQRGVC++S TG+V NVT+RQP S PG+V++L
Subjt:  -------------NSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPAS-PGAVITL

Query:  HGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSP---AAEIAGQQAAPPPPQLMGDPN
        HGRFEILSLSGSFLPPPAPPAA+GL+VYLAGGQGQVVGG+V+GPL  SGPV++MAASF NAAYERLP+++D+  +P        G       P +MG   
Subjt:  HGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSP---AAEIAGQQAAPPPPQLMGDPN

Query:  GGLFHGMAQNV---VNSSCQL--PAEAAAAFWGGGRPPY
               AQ +   +  S QL  P +    +W  GRPPY
Subjt:  GGLFHGMAQNV---VNSSCQL--PAEAAAAFWGGGRPPY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45430.1 AT-hook motif nuclear-localized protein 223.7e-7753.77Show/hide
Query:  NRPLPPPFLSKDLHLH-HGLFHHHQNS---------DDDQTAGAKRDRE---DENPTTAAMADSKEL------------SNSSSRRPRGRPAGSKNKPKP
        +R LPPPFLS+DLHLH H  F H Q           D  +  G KRDR+   D N  ++A  D                 N  +RRPRGRPAGSKNKPKP
Subjt:  NRPLPPPFLSKDLHLH-HGLFHHHQNS---------DDDQTAGAKRDRE---DENPTTAAMADSKEL------------SNSSSRRPRGRPAGSKNKPKP

Query:  PIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPAS-PG---AVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLA
        PIIITRDSANAL+SH++E++   D+++S+  FARRRQRG+C+LS  G V NVT+RQPAS PG   +V+ LHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLT+YLA
Subjt:  PIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPAS-PG---AVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLA

Query:  GGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAA-----------------EIAGQQAAPPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSC
        GGQGQVVGG+V+GPL ASGPV+IMAASFGNAAYERLP+++DD+    A                 +   Q       QLM DP      G+  N++N S 
Subjt:  GGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAA-----------------EIAGQQAAPPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSC

Query:  QLPAEAAAAFWGGGRPPY
        QLPAE   A+WG  RP +
Subjt:  QLPAEAAAAFWGGGRPPY

AT3G60870.1 AT-hook motif nuclear-localized protein 181.1e-6855.07Show/hide
Query:  NRPLPPPFLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDDQTAGAKRDREDENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDI
        +R   P FLS D H H    +HHQN+   +    +   E  N             N   RRPRGRPAGSKNKPK PII+TRDSANA R H++EI+ A D+
Subjt:  NRPLPPPFLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDDQTAGAKRDREDENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDI

Query:  VDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFG
        ++SLA FARRRQRGVC+L+  G V NVT+RQP   G V++LHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGL VYLAGGQGQV+GG+V+GPL+AS PV++MAASFG
Subjt:  VDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFG

Query:  NAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQA----APPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY
        NA+YERLP+++++ET    EI G  A         QLM D     F G   N++N S  LP E   A+WG  RP +
Subjt:  NAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQA----APPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY

AT4G12050.1 Predicted AT-hook DNA-binding family protein5.8e-7048.38Show/hide
Query:  MDGITPH--NRPLPPPFLSKDLHLH-----------------HGLFHHHQ------NSDDDQTAGA------KRDRE------DENPTTAAMADSKELS-
        MD +  H     LPPPF ++D  LH                     HHHQ      + D +Q  G+      K DRE      D    T + ++ KE+S 
Subjt:  MDGITPH--NRPLPPPFLSKDLHLH-----------------HGLFHHHQ------NSDDDQTAGA------KRDRE------DENPTTAAMADSKELS-

Query:  -------------NSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPAS-PGAVITL
                        +RRPRGRPAGSKNKPK PIIITRDSANALR+H++EI    DIVD +A FARRRQRGVC++S TG+V NVT+RQP S PG+V++L
Subjt:  -------------NSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPAS-PGAVITL

Query:  HGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSP---AAEIAGQQAAPPPPQLMGDPN
        HGRFEILSLSGSFLPPPAPPAA+GL+VYLAGGQGQVVGG+V+GPL  SGPV++MAASF NAAYERLP+++D+  +P        G       P +MG   
Subjt:  HGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSP---AAEIAGQQAAPPPPQLMGDPN

Query:  GGLFHGMAQNV---VNSSCQL--PAEAAAAFWGGGRPPY
               AQ +   +  S QL  P +    +W  GRPPY
Subjt:  GGLFHGMAQNV---VNSSCQL--PAEAAAAFWGGGRPPY

AT4G22810.1 Predicted AT-hook DNA-binding family protein2.1e-7249.54Show/hide
Query:  MDGITPH--NRPLPPPFLSKDLHLH------HGLFHHHQ----NSDDDQTAGA------KRDRED-----ENPTTAAMADSKEL---------------S
        MD +  H     LPPPF ++D  LH          HHHQ     +D DQ  G+      K DRE+     +N    + ++ K++                
Subjt:  MDGITPH--NRPLPPPFLSKDLHLH------HGLFHHHQ----NSDDDQTAGA------KRDRED-----ENPTTAAMADSKEL---------------S

Query:  NSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPA---SPGAVITLHGRFEILSLSG
        +  +RRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALR+H++EI    D+V+S+A FARRRQRGVC++S TG V NVT+RQP    SPG+V++LHGRFEILSLSG
Subjt:  NSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDSLAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPA---SPGAVITLHGRFEILSLSG

Query:  SFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQAAPPPP----QLMGDPNGGLFH-GMAQ
        SFLPPPAPP A+GL+VYLAGGQGQVVGG+V+GPL  +GPV++MAASF NAAYERLP+++D+  +P     G  +   PP    QL         H G+  
Subjt:  SFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDDETSPAAEIAGQQAAPPPP----QLMGDPNGGLFH-GMAQ

Query:  NVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY
        N++  S QL  +   ++W  GRPPY
Subjt:  NVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY

AT4G35390.1 AT-hook protein of GA feedback 17.5e-6250.75Show/hide
Query:  PFLSKDLHLHH---GLFHHHQNSDDDQTAGAKRDREDENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDS
        P L ++LHL           QN+ +   + A   + +  PT  A + +    +SS RRPRGRPAGSKNKPKPP IITRDS N LRSH++E+++ SDI ++
Subjt:  PFLSKDLHLHH---GLFHHHQNSDDDQTAGAKRDREDENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDS

Query:  LAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASP--GAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGN
        ++ +A RR  GVCI+S TG V NVT+RQPA+P  G VITLHGRF+ILSL+G+ LPPPAPP A GLTVYLAGGQGQVVGGNV G L ASGPV++MAASF N
Subjt:  LAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASP--GAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGN

Query:  AAYERLPIDDDD--------------ETSPAAEIAGQQAAPPPPQLMGDPNGG--LFHGMAQNVVN
        A Y+RLPI++++              E S ++E+ G  A      L G   GG   F+ +  N+ N
Subjt:  AAYERLPIDDDD--------------ETSPAAEIAGQQAAPPPPQLMGDPNGG--LFHGMAQNVVN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGGAATTACACCCCACAATCGCCCTCTTCCTCCTCCTTTCCTTTCCAAAGATCTCCATCTCCACCATGGATTATTCCACCACCACCAAAACTCCGACGACGACCA
AACCGCCGGAGCTAAGAGAGATAGAGAGGACGAAAACCCCACCACGGCGGCGATGGCGGACAGCAAAGAATTATCTAATTCTTCATCTCGACGCCCACGTGGCCGACCAG
CTGGTTCCAAAAACAAGCCAAAGCCACCCATTATAATTACTAGAGACAGCGCTAACGCCCTCAGATCTCATCTCATCGAAATCTCCACTGCCTCCGACATCGTAGATTCC
CTCGCTGCCTTCGCACGCCGCCGCCAGCGTGGCGTTTGTATTCTAAGTGCCACGGGTACCGTCGCCAACGTCACTCTCCGGCAGCCGGCCTCCCCCGGCGCTGTCATCAC
CTTACATGGGAGATTTGAAATTCTCTCCCTCTCCGGCTCTTTCCTCCCACCGCCGGCTCCCCCGGCCGCCTCTGGTCTGACCGTCTACTTGGCTGGCGGGCAGGGGCAGG
TCGTCGGTGGGAATGTAATCGGCCCACTTTCGGCGTCCGGTCCGGTGATTATCATGGCGGCTTCTTTTGGTAATGCTGCGTATGAACGGCTACCCATTGATGACGACGAC
GAAACGTCACCGGCAGCAGAGATTGCCGGACAACAAGCAGCACCGCCGCCGCCACAATTGATGGGGGATCCTAATGGGGGATTGTTTCATGGGATGGCGCAGAATGTTGT
GAATTCTTCATGCCAATTGCCGGCAGAGGCGGCGGCGGCGTTTTGGGGAGGAGGTCGGCCACCGTATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATGGAATTACACCCCACAATCGCCCTCTTCCTCCTCCTTTCCTTTCCAAAGATCTCCATCTCCACCATGGATTATTCCACCACCACCAAAACTCCGACGACGACCA
AACCGCCGGAGCTAAGAGAGATAGAGAGGACGAAAACCCCACCACGGCGGCGATGGCGGACAGCAAAGAATTATCTAATTCTTCATCTCGACGCCCACGTGGCCGACCAG
CTGGTTCCAAAAACAAGCCAAAGCCACCCATTATAATTACTAGAGACAGCGCTAACGCCCTCAGATCTCATCTCATCGAAATCTCCACTGCCTCCGACATCGTAGATTCC
CTCGCTGCCTTCGCACGCCGCCGCCAGCGTGGCGTTTGTATTCTAAGTGCCACGGGTACCGTCGCCAACGTCACTCTCCGGCAGCCGGCCTCCCCCGGCGCTGTCATCAC
CTTACATGGGAGATTTGAAATTCTCTCCCTCTCCGGCTCTTTCCTCCCACCGCCGGCTCCCCCGGCCGCCTCTGGTCTGACCGTCTACTTGGCTGGCGGGCAGGGGCAGG
TCGTCGGTGGGAATGTAATCGGCCCACTTTCGGCGTCCGGTCCGGTGATTATCATGGCGGCTTCTTTTGGTAATGCTGCGTATGAACGGCTACCCATTGATGACGACGAC
GAAACGTCACCGGCAGCAGAGATTGCCGGACAACAAGCAGCACCGCCGCCGCCACAATTGATGGGGGATCCTAATGGGGGATTGTTTCATGGGATGGCGCAGAATGTTGT
GAATTCTTCATGCCAATTGCCGGCAGAGGCGGCGGCGGCGTTTTGGGGAGGAGGTCGGCCACCGTATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDGITPHNRPLPPPFLSKDLHLHHGLFHHHQNSDDDQTAGAKRDREDENPTTAAMADSKELSNSSSRRPRGRPAGSKNKPKPPIIITRDSANALRSHLIEISTASDIVDS
LAAFARRRQRGVCILSATGTVANVTLRQPASPGAVITLHGRFEILSLSGSFLPPPAPPAASGLTVYLAGGQGQVVGGNVIGPLSASGPVIIMAASFGNAAYERLPIDDDD
ETSPAAEIAGQQAAPPPPQLMGDPNGGLFHGMAQNVVNSSCQLPAEAAAAFWGGGRPPY