; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc06G01930 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc06G01930
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionsmall acidic protein-like isoform X2
Genome locationClcChr06:1795036..1796346
RNA-Seq ExpressionClc06G01930
SyntenyClc06G01930
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036020 - WW domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039848.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold122G001230 [Cucumis melo var. makuwa]3.2e-9691.22Show/hide
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XP_038906838.1 uncharacterized protein LOC120092736 [Benincasa hispida]2.5e-9691.79Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF89 Uncharacterized protein2.9e-9590.78Show/hide
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A0A1S4E3A8 uncharacterized protein LOC1034988821.6e-9391.5Show/hide
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A0A5A7TA84 Uncharacterized protein1.6e-9691.22Show/hide
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A0A6J1GM82 uncharacterized protein LOC1114557806.8e-8483.01Show/hide
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A0A6J1JMX9 uncharacterized protein LOC1114883504.9e-8281.16Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28070.1 unknown protein1.0e-2843.94Show/hide
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AT2G33510.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: WW/Rsp5/WWP (InterPro:IPR001202)2.2e-3447.55Show/hide
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AT2G33510.2 unknown protein2.3e-3144.29Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TGGTAGTAGACAGCAATACCCGGCGGAAAACGTGGAGGATGTGCTGGTGGTGGCCGGATGCAAGAGATGCTTCATGTATTTCATGGTGCCGAAACAGGTCGAAGATTGCC
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGACGATAACACACATTCTTTTCTTCTTCTTATTCTCATTCTTCCTTCCATTTCATCTCTTCTTCTTCTTCTTCATCGAGATGAAATCTCCCGATATGGCGGCGGTTACT
GATTCTCTTGAGCAGTCTTTCCGTAACTTCACCCTCAACCACCGTCTAGCCTCGGCTGCCCCTTCCTCCGCCGGAGTTCGGAGGTCTCCGTCGTCGTTTTCTTCTTCTTC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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