; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc06G02060 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc06G02060
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionPollen Ole e 1 allergen and extensin family protein
Genome locationClcChr06:1960493..1962464
RNA-Seq ExpressionClc06G02060
SyntenyClc06G02060
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039837.1 extensin [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-19392.35Show/hide
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XP_004140544.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Cucumis sativus]8.8e-19691.46Show/hide
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XP_008459888.1 PREDICTED: extensin [Cucumis melo]2.4e-19392.35Show/hide
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XP_023515622.1 formin-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-18584.82Show/hide
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XP_038906532.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 5 [Benincasa hispida]3.6e-19794.85Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAD5 Uncharacterized protein4.3e-19691.46Show/hide
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A0A6J1GPH0 formin-2-like1.3e-18484.34Show/hide
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A0A6J1JLM5 extensin-like4.3e-18083.54Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 32.1e-0642.64Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G26960.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein1.2e-3342.2Show/hide
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           C D  ++ S CQASLIG    S + CN+PG RTT++++  KS+Q N C++  NAL++RP K++ +LCG K
Subjt:  GINCVDGMTMQSFCQASLIGS---SSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNK

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein1.5e-0742.64Show/hide
Query:  FFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPVPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPP----SPPPPSTPPPPPP-FSLNDPRTWIPYVSPFSPPPPP
        F  P +L  P PP PP P +  PP PP PP  Y P P  P PP  P   PP PP  P PP    SPPPPS PPPPPP +S   P    P    +SPPPPP
Subjt:  FFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPVPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPP----SPPPPSTPPPPPP-FSLNDPRTWIPYVSPFSPPPPP

Query:  PLSPPPFSLSDPRTWI----PHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPP
          S PP   S   T +    P  PP   PPPP F P  P  +    PP   S PP   P  P +  P I P+  PPPP   +  P     + PP PP
Subjt:  PLSPPPFSLSDPRTWI----PHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPP

AT4G18670.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein7.6e-0437.27Show/hide
Query:  PFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPVPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSP------PSPPPPSTP-----PPPPPFSLNDPRTWIPYVSP
        P  P  S P P PP P  P  P+ P    PP+   P  T P+PPS   P PPLPP++PSP      PS PPPSTP     PPPP      P  +  Y  P
Subjt:  PFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPVPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSP------PSPPPPSTP-----PPPPPFSLNDPRTWIPYVSP

Query:  FSPPPPPPLSPPPFSL--SDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP----------PFSPSPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDP
          PPPPPP   P  S+    P+T+ P  PP  PPP   + P+   +  P  P          P+ PSPP    P  P  +    P   PPPPP + L  P
Subjt:  FSPPPPPPLSPPPFSL--SDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP----------PFSPSPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDP

Query:  RTWIPHFPPSPPQGPQNQKP
             +  P PP  P +  P
Subjt:  RTWIPHFPPSPPQGPQNQKP

AT5G13140.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein3.5e-4945.02Show/hide
Query:  ISLLLLLFLTSFFTNLF-------GLTAEALTSVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEI
        + LL LLFL S  T+              +L   +RITVVG VYCDTC  N+ S+ SYFL GV+VH+ C+F+A +PK AE++  SVNRTT++ GVY+LEI
Subjt:  ISLLLLLFLTSFFTNLF-------GLTAEALTSVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEI

Query:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSST---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGN-------KKEKIPDPLTSSKFFLP
        P VDGI+CVDG+ + S C A ++ +SS     C++P  +T + E+S+KSKQD +CI+SL+ALSY+P  KN SLCGN       K EK+      SKFF P
Subjt:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSST---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGN-------KKEKIPDPLTSSKFFLP

Query:  FFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPVPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPPPSTPPPPPPFSLNDPRTWIPYVSPFSP
        +  PY  P+P+P         LPPLP LPP P FP       PSLPF  P L                   P F   +P TWIPY+  F P
Subjt:  FFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPVPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPPPSTPPPPPPFSLNDPRTWIPYVSPFSP

AT5G41050.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein1.5e-3644.58Show/hide
Query:  LLLLLFLTSFFTNLFGLTAEALTSVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCV
        ++LLL L     N   L   +     +ITV+G VYCD C +NS S HSYF+PGV+V + C+F + + +  E + FS NRTT++ G+Y+L+I S++G+ C 
Subjt:  LLLLLFLTSFFTNLFGLTAEALTSVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCV

Query:  DGM---TMQSFCQASLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG
              ++ + CQASLIG S   CNVPG RTT+E++  KSK  NLC++   AL++RP++KN  LCG
Subjt:  DGM---TMQSFCQASLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTCTTATGGATCCCACCATTTCTCTCCTTCTTCTCCTTTTTTTAACATCTTTCTTCACTAACTTGTTTGGCCTAACAGCTGAAGCCTTAACGTCGGTCACTCGAAT
CACAGTAGTGGGTGCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTGTCCAAACACAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTCCATTTACAGTGCAAATTCAGAGCAG
TTGCTCCCAAAATGGCTGAGCAAATGGCCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGAT
GGTATGACAATGCAGTCATTTTGCCAGGCAAGCTTAATTGGAAGCTCATCTACAGTTTGCAATGTCCCAGGTTTAAGAACTACTTCAGAAGAGATATCAGTCAAGTCTAA
GCAAGATAATCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTACAGGCCAATGAAGAAGAATGAGAGCTTATGTGGGAATAAGAAAGAGAAAATTCCAGATCCCTTGACCT
CCTCAAAGTTTTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCCTTCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCACCATTCCCTTCCTTTCCTTTGCCTCCACTGCCTCCATTACCCCCC
GTTCCATATTTTCCTCTCCCTACATGTCCTAACCCACCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCTTTGCCCCCTTTACTTCCTTCACCTCCAAGTCCACCTCCGCCGTCTAC
ACCACCTCCACCACCTCCATTTAGTCTCAATGATCCAAGGACCTGGATACCCTATGTTTCTCCATTTTCTCCTCCACCACCTCCGCCATTGTCGCCACCTCCATTCAGTC
TCAGCGATCCAAGGACGTGGATACCCCATGTTCCTCCATTTTCTCCTCCCCCACCTCCTGCTTTCGACCCCCGAGACCCAAGAACCTGGATTCCCCATATCCCTCCATTT
TCTCCTTCCCCACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCACCCCCACCTCCAGCATTCGACCTGAGAGACCCCAG
AACATGGATACCTCATTTCCCCCCATCCCCTCCACAGGGCCCTCAAAATCAAAAGCCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGCAAACAGTATATAACAAACAAACGCTTGAAAATTTTAAGGCCTTACCCATTGATGCTTCTCTCACAACCTCCTCTTCTTCATTGAATGTTTCTTATGGATCCCACCAT
TTCTCTCCTTCTTCTCCTTTTTTTAACATCTTTCTTCACTAACTTGTTTGGCCTAACAGCTGAAGCCTTAACGTCGGTCACTCGAATCACAGTAGTGGGTGCAGTTTATT
GTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTGTCCAAACACAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTCCATTTACAGTGCAAATTCAGAGCAGTTGCTCCCAAAATGGCTGAGCAA
ATGGCCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGATGGTATGACAATGCAGTCATTTTG
CCAGGCAAGCTTAATTGGAAGCTCATCTACAGTTTGCAATGTCCCAGGTTTAAGAACTACTTCAGAAGAGATATCAGTCAAGTCTAAGCAAGATAATCTCTGTATATTCA
GCTTAAATGCTTTGAGTTACAGGCCAATGAAGAAGAATGAGAGCTTATGTGGGAATAAGAAAGAGAAAATTCCAGATCCCTTGACCTCCTCAAAGTTTTTTCTCCCTTTC
TTCCCTCCTTATTCCCTTCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCACCATTCCCTTCCTTTCCTTTGCCTCCACTGCCTCCATTACCCCCCGTTCCATATTTTCCTCTCCCTAC
ATGTCCTAACCCACCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCTTTGCCCCCTTTACTTCCTTCACCTCCAAGTCCACCTCCGCCGTCTACACCACCTCCACCACCTCCATTTA
GTCTCAATGATCCAAGGACCTGGATACCCTATGTTTCTCCATTTTCTCCTCCACCACCTCCGCCATTGTCGCCACCTCCATTCAGTCTCAGCGATCCAAGGACGTGGATA
CCCCATGTTCCTCCATTTTCTCCTCCCCCACCTCCTGCTTTCGACCCCCGAGACCCAAGAACCTGGATTCCCCATATCCCTCCATTTTCTCCTTCCCCACCTCCTGCATT
TGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCACCCCCACCTCCAGCATTCGACCTGAGAGACCCCAGAACATGGATACCTCATTTCCCCC
CATCCCCTCCACAGGGCCCTCAAAATCAAAAGCCCTAATATTGTGCTTTGTCTTCCCTCCTTTTTACCTCTACAAATTTTCTTTCAATATGATATTGTTTGATGTGTGCT
TATGTATTTTTTCGATACCCTGTCCATTCAGGCAAAACAACAAACATCTAGTGTGCCAATGTTATTTCTAGCAAAAACCACTATAATTCATGTACAGAAAACAAAAGGGG
ATTTGTCTGTTTATATTATAAATCAAGAAGCTGGATATCATCAATGTATTGTTTAATTAATCTTCAAATTTGCAAGAAAGTTTACATTCTCAAGTATTTAGTGAATGATG
CTAAAAGGAAAAGAGAACAAGTACAAGAAAGAAACCCTTGAACTGTCCGTACCTTGCGCTTCCGGATAATACCACCGCAACGAAGCAGCGCCAAAGGGAAAAATGAGAGA
AGGAATTGAATTGCCTTAGTACCTTTTCTACCTAATTTAGGCGGTGGCAATGGCGGATAATATCATTCACTTCCTGTTTTTTTTCCTTCTTTTTCTGATTCTGATGCTTT
TTTTGACAATTCACCATTCCAAACTAAATTCCTTCTAAAGTTGGGCTTTTTGCCTCCTCATGTATGTTCTAAACGGATCACGTTCTTCCCTGCTTTTTGCCTCCTCATTG
ATGAGCTCATTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNLFGLTAEALTSVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVD
GMTMQSFCQASLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPP
VPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPPPSTPPPPPPFSLNDPRTWIPYVSPFSPPPPPPLSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPF
SPSPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP