CuGenDBv2

Gene ID	Clc06G03210
Organism	Citrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Description	nuclear pore complex protein NUP62
Genome location	ClcChr06:3322992..3345089
RNA-Seq Expression	Clc06G03210
Synteny	Clc06G03210
Gene Ontology terms	GO:0006913 - nucleocytoplasmic transport (biological process) GO:0015031 - protein transport (biological process) GO:0005643 - nuclear pore (cellular component) GO:0017056 - structural constituent of nuclear pore (molecular function)
InterPro domains	IPR007758 - Nucleoporin, NSP1-like, C-terminal IPR026010 - Nucleoporin NSP1/NUP62

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6575234.1 Nuclear pore complex protein NUP62, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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XP_008459731.1 PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo]

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XP_022959228.1 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata]

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XP_023006514.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita maxima]

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XP_023548092.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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Query:  -------------------------------------------------------------TASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNA
                                                                     ++SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NA
Subjt:  -------------------------------------------------------------TASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNA

Query:  ASTGGPSTPSTTASKPTFLSFSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPGFSSSSSAATTLSIAASSAPSASSSGSVSSFTGFGVTNTAASSSAIG
        ASTGG S PSTTA+KPT L                SASTPAANSTTQPSFSVP FSSSSSAATTLSIAASSAPSA+SSG+VSSFTGFGVT++A+SSSAIG
Subjt:  ASTGGPSTPSTTASKPTFLSFSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPGFSSSSSAATTLSIAASSAPSASSSGSVSSFTGFGVTNTAASSSAIG

Query:  SLSLPTKPSTAASSSQAPASFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGK
        SLSLPTK STAASSSQAPASFGFPSLAS+STAATTTSGFSASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEII EWNAELQERTGK
Subjt:  SLSLPTKPSTAASSSQAPASFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGK

Query:  FRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQ
        FRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQ
Subjt:  FRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQ

Query:  MTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
        MTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQK WMS
Subjt:  MTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS

A0A1S3CAD4 nuclear pore complex protein NUP62

2.7e-261

80.27

Show/hide

Query:  MSGFTFGSSFSQSSSSSSSSSSSSSPFSSTTGFSFGSTPAFSFGSSSSSPLSL-SSSSSSNPTSSSSPFSNLTSN-PASSSSFGFGSSSFPSSTSPSFAF
        MSGF FGSS SQ        SSSSSPFSSTTGFSFGST  FSFG SS+SPLSL SSSSSSNPTSSSSPF N TSN P+SSSSFGFGSSSF SSTS  F+F
Subjt:  MSGFTFGSSFSQSSSSSSSSSSSSSPFSSTTGFSFGSTPAFSFGSSSSSPLSL-SSSSSSNPTSSSSPFSNLTSN-PASSSSFGFGSSSFPSSTSPSFAF

Query:  SLPAASTAA-----PSSSATPASSFFGISSSSAGLTSFGFGASSSSGNSSAPSFGAAPSSGTSFGATPSSGSSSAPLFGAAPSSGSSSAPLFGAAPSSGS
        SL +AST A     PSSSA  ASS FG+SSSS G  SFGFGASSSS N                                      SSAPLFGAA SSG+
Subjt:  SLPAASTAA-----PSSSATPASSFFGISSSSAGLTSFGFGASSSSGNSSAPSFGAAPSSGTSFGATPSSGSSSAPLFGAAPSSGSSSAPLFGAAPSSGS

Query:  SSAPLFGAGPSSASSPVPSFGAASSSGSSLVPSFGALPSS-GSSSAPLVGVAPSTAASAA-SLFGGISSATTSSAPLFGTSASTASPGSTLFGASAAAAT
        SSA LFGAG    SSP PSFGAA SSGSS+ PSFGAL SS G+SSAPL G APS  AS+A SLFGG SSATTSSAPLFGT+AS AS GS LFGAS A A+
Subjt:  SSAPLFGAGPSSASSPVPSFGAASSSGSSLVPSFGALPSS-GSSSAPLVGVAPSTAASAA-SLFGGISSATTSSAPLFGTSASTASPGSTLFGASAAAAT

Query:  ASSSPLFGTST-SSGSAGSALFGSSPFGA-----SSSVSTSNLFGSSSLSAPTTPFQNAFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSSSSGFSFSTTSLSKTTSIT-
         S + LFGTS  SSGS GS LFGSSPFGA     SSSVSTSNLF SS  S   +PFQ++ SSSSSQNL+SSSPFAA    S SGFSF T++LSKTTSIT 
Subjt:  ASSSPLFGTST-SSGSAGSALFGSSPFGA-----SSSVSTSNLFGSSSLSAPTTPFQNAFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSSSSGFSFSTTSLSKTTSIT-

Query:  --TASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGPSTPSTTASKPTFLSFSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPGFSSSS
          ++SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAASTGG S PSTTA+KPT LS SNSVAPLFSTVTTTSASTPAA+STTQPSFSVP FSSSS
Subjt:  --TASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGPSTPSTTASKPTFLSFSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPGFSSSS

Query:  SAATTLSIAASSAPSASSSGSVSSFTGFGVTNTAASSSAIGSLSLPTKPSTAASSSQAPASFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSG
        SAATTLSIAASSAPSA+SSG+VSSFTGFGVT++A+SSSAIGSLSLPTK STAASSSQAPASFGFPSLAS+STAATTTSGFSASSQSQTSS LVVASSSSG
Subjt:  SAATTLSIAASSAPSASSSGSVSSFTGFGVTNTAASSSAIGSLSLPTKPSTAASSSQAPASFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSG

Query:  TTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQS
        TTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL S
Subjt:  TTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQS

Query:  VEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK
        VE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK
Subjt:  VEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK

Query:  LAATEGPAADRELLGQKFWMS
        LAATEGPAADRELLGQKFWMS
Subjt:  LAATEGPAADRELLGQKFWMS

A0A6J1DSI7 nuclear pore complex protein NUP62

1.1e-209

79.68

Show/hide

Query:  FGAAPSSGSSSAPLFGAGPSSASSPVPSFGAASSSGSSLVPSFGALPSSGSSSAPLVGVAPSTAASAASLFGGISSATTSSAPLFGTSASTASPGSTLFG
        FGAA ++GSSS  +FGA PS +S+                       S+GSSS  L G APS  ASA SLFGG+SSAT+SS PLFG+SA TA+PGS L G
Subjt:  FGAAPSSGSSSAPLFGAGPSSASSPVPSFGAASSSGSSLVPSFGALPSSGSSSAPLVGVAPSTAASAASLFGGISSATTSSAPLFGTSASTASPGSTLFG

Query:  ASAAAATASSSPLFGTSTSSGSAGSALFG----SSPFGASS-SVSTSNLFGSSSLSAPTTPFQNAFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSSSSGFSFSTTSLSK
        AS AA    S  LFGT++SSGSAGSALFG    ++ FG+++   S+S LF SS  SA T+ FQN+FSSSSSQ+LSSSSPFAA   SSSSGFSF TTSLSK
Subjt:  ASAAAATASSSPLFGTSTSSGSAGSALFG----SSPFGASS-SVSTSNLFGSSSLSAPTTPFQNAFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSSSSGFSFSTTSLSK

Query:  TT-SITTASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGPSTPSTTASKPTFLSFSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPGF
        TT S+T +SSSS LTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFS SNAAST   + P TTA+KPT LSFS SVAPLFSTVTTTSASTP A+STTQPSFSVP F
Subjt:  TT-SITTASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGPSTPSTTASKPTFLSFSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPGF

Query:  SSSSSAATTLSIAASSAPSASSSGSVSSFTGFGVTNTAASSSAIGSLSLPTKPSTAASSSQAPASFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVAS
        S SSSAATT+S AASS PSA+SSG+ SSFTGFGVTNTA+SSS I SLSLPTK  TAASSSQ PASFGFPSL S+STAATT+SGFSA SQSQTSSTLVVAS
Subjt:  SSSSSAATTLSIAASSAPSASSSGSVSSFTGFGVTNTAASSSAIGSLSLPTKPSTAASSSQAPASFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVAS

Query:  SSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDK
        SSSGTTSTVSA VS+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQAELE+KLELIETHQQEVDK
Subjt:  SSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDK

Query:  ALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSS
        AL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSS
Subjt:  ALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSS

Query:  RIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
        RIQK+AAT+GPAADRELLGQKFWMS
Subjt:  RIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS

A0A6J1H5C8 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1

2.1e-274

81.44

Show/hide

Query:  MSGFTFGSSFSQSSSSSSSSSSSSSPFSSTTGFSFGSTPAFSFGSSSSSPLSLSSSSSSNPTSSSSPFSNLTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSPSFAFSL
        MSGF+FG       SSSS +SSSSSPFSSTTGFSFGST AFSFG   SSPLSLSSSSSSNP+SSSS FSN TSNP SS+ FGF SSSFPSS S  F+FSL
Subjt:  MSGFTFGSSFSQSSSSSSSSSSSSSPFSSTTGFSFGSTPAFSFGSSSSSPLSLSSSSSSNPTSSSSPFSNLTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSPSFAFSL

Query:  PAASTAAPSSSATPASSFFGISSSSAGLTSFGFGASSSSGNSSAPSFGAAPSSGT----SFGATPSSGSSSAPLFGAAPSSGSSSAPLFGAAPSSGSSSA
        PAAST A  SS +  SS F  SSSS GL+SFGFG SSSSG SSAPSFGAAP+SG+    SFGA  +SG+S APLFG+APSSGSS  P FGAAP SGSS A
Subjt:  PAASTAAPSSSATPASSFFGISSSSAGLTSFGFGASSSSGNSSAPSFGAAPSSGT----SFGATPSSGSSSAPLFGAAPSSGSSSAPLFGAAPSSGSSSA

Query:  PLFGAGPSSASSPVPSFGAASSSGSSLVPSFGALPSSGSSSAPLVGVAPSTAASAASLFGGISS-ATTSSAPLFGTSASTASPGSTLFGASAAAATASSS
        PLFG+ PSS SSP+PSFGAA              PS+GSSS+P  G APS   SA SLFGG+SS ATTSSAPLFGTSA TASPGS++FGAS AA+ +SSS
Subjt:  PLFGAGPSSASSPVPSFGAASSSGSSLVPSFGALPSSGSSSAPLVGVAPSTAASAASLFGGISS-ATTSSAPLFGTSASTASPGSTLFGASAAAATASSS

Query:  PLFGTSTSSGSAGSALFGSSPFGASSSVSTSNLFGSSSLSAPTTPFQNAFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSSSSGFSFSTTSLSKTTSITTASSSSSLTSA
                       LFGS+PF +SSSVSTSNLFGSSS SA TTPFQN+FSSSSSQNLSSSSPFAA    SSSGFSFSTTSLSKTTSIT ASSSSSLTSA
Subjt:  PLFGTSTSSGSAGSALFGSSPFGASSSVSTSNLFGSSSLSAPTTPFQNAFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSSSSGFSFSTTSLSKTTSITTASSSSSLTSA

Query:  STSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGPSTPSTTASKPTFLSFSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPGFSSSSSAATTLSIAASSA
        STSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGG S P TTA+KPT LSFS SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+P FS SSSAATTLSIAASS 
Subjt:  STSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGPSTPSTTASKPTFLSFSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPGFSSSSSAATTLSIAASSA

Query:  PSASSSGSVSSFTGFGVTNTAASSSAIGSLSLPTKPSTAASSSQAPASFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSSTP
        PS +SSG+ SSFTGFGVT+TAASSSAI SLSLPTK  TAASSSQAPASFGF SLA +STAATTTSG +ASSQSQTSSTLV+ASSSSGTTSTVS TVS+TP
Subjt:  PSASSSGSVSSFTGFGVTNTAASSSAIGSLSLPTKPSTAASSSQAPASFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSSTP

Query:  KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDER
        KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDER
Subjt:  KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDER

Query:  GLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADREL
        GLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT+GPAADREL
Subjt:  GLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADREL

Query:  LGQKFWMS
        LGQKFWMS
Subjt:  LGQKFWMS

A0A6J1L2D4 nuclear pore complex protein NUP62

3.2e-278

82.55

Show/hide

Query:  MSGFTFGSSFSQSSSSSSSSSSSSSPFSSTTGFSFGSTPAFSFGSSSSSPLSLSSSSSSNPTSSSSPFSNLTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSPSFAFSL
        MSGF+FG       SSSS SSSSSSPFSSTTGFSFGST AFSFG   SSPLSLSSSSSSNP+SSSS FSN TSNP SS+ FGF SSSFPSS S  F+FSL
Subjt:  MSGFTFGSSFSQSSSSSSSSSSSSSPFSSTTGFSFGSTPAFSFGSSSSSPLSLSSSSSSNPTSSSSPFSNLTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSPSFAFSL

Query:  PAASTAAPSSSATPASSFFGISSSSAGLTSFGFGASSSSGNSSAPSFGAAPSSGT----SFGATPSSGSSSAPLFGAAPSSGSSSAPLFGAAPSSGSSSA
        PAAST A  SS    S+ F  SSSS GL+SFGFG SSSSG SSAPSFGAAP+SG+    SFGA  +SG+S APLFG+APSSGSS  P FGAAP+SGSS A
Subjt:  PAASTAAPSSSATPASSFFGISSSSAGLTSFGFGASSSSGNSSAPSFGAAPSSGT----SFGATPSSGSSSAPLFGAAPSSGSSSAPLFGAAPSSGSSSA

Query:  PLFGAGPSSASSPVPSFGAASSSGSSLVPSFGALPSSGSSSAPLVGVAPSTAASAASLFGGISS-ATTSSAPLFGTSASTASPGSTLFGASAAAATASSS
        PLFG+ PSS SSP+PSFGA+ S+GSS +PSFGA  SSGSSS+P  G APS   SA SLFGG+SS ATTSSAPLFGTSA TASPGS++FGAS AAA+ SSS
Subjt:  PLFGAGPSSASSPVPSFGAASSSGSSLVPSFGALPSSGSSSAPLVGVAPSTAASAASLFGGISS-ATTSSAPLFGTSASTASPGSTLFGASAAAATASSS

Query:  PLFGTSTSSGSAGSALFGSSPFGASSSVSTSNLFGSSSLSAPTTPFQNAFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSSSSGFSFSTTSLSKTTSITTASSSSSLTSA
         LFG+++         F SS  G  SSVSTSNLFGSSS SA TTPFQN+FSSSSSQNLSSSSPFAA    SSSGFSFSTTSLSKTTSIT ASSSSSLTSA
Subjt:  PLFGTSTSSGSAGSALFGSSPFGASSSVSTSNLFGSSSLSAPTTPFQNAFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSSSSGFSFSTTSLSKTTSITTASSSSSLTSA

Query:  STSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGPSTPSTTASKPTFLSFSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPGFSSSSSAATTLSIAASSA
        STSSSSFSFGTPASSASQSSFGF+ISNAAS  G S P TTA+KPT LSFS SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+P FS SSSAATTLSIAASSA
Subjt:  STSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGPSTPSTTASKPTFLSFSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPGFSSSSSAATTLSIAASSA

Query:  PSASSSGSVSSFTGFGVTNTAASSSAIGSLSLPTKPSTAASSSQAPASFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSSTP
        PSA+SSG+ SSFTGFG+T+TAASSSAI SLSLPTK  TAASSSQAPASFGF SLAS+S AATTTSG +ASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVS+TP
Subjt:  PSASSSGSVSSFTGFGVTNTAASSSAIGSLSLPTKPSTAASSSQAPASFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSSTP

Query:  KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDER
        KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDER
Subjt:  KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDER

Query:  GLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADREL
        GLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT+GPAADREL
Subjt:  GLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADREL

Query:  LGQKFWMS
        LGQKFWMS
Subjt:  LGQKFWMS

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

G0SBQ3 Nucleoporin NSP1

1.1e-12

29.86

Show/hide

Query:  SFGFGASSSSGNSSAPSFGAAPSSGTSFGATPSSGSSSAPLFGAAPSSGSSSAPLFGAAPSSGSSSAPLFGAGPSSASSPVPS---FGAASSSGSSLVPS
        SF FG  S+SG S   +   AP+SG  FG+T     SS P F    +SG+ S  LFG A +   +S  LFG   S+  +  P+   FG ++SS S   PS
Subjt:  SFGFGASSSSGNSSAPSFGAAPSSGTSFGATPSSGSSSAPLFGAAPSSGSSSAPLFGAAPSSGSSSAPLFGAGPSSASSPVPS---FGAASSSGSSLVPS

Query:  FGALPSSGSSSAPLVGVAPSTAASAASLFGGISSATTSSAPLFGTSASTASPGSTLFGASAAAATASSSPLFGTSTSSGSAGSALFGSSPFGASSSVSTS
               G++S P   +  +T+ SAA      SS    +  LFG+  +T S G++   ++  AATA S  LFG++T++    S    +  FG SS+ S S
Subjt:  FGALPSSGSSSAPLVGVAPSTAASAASLFGGISSATTSSAPLFGTSASTASPGSTLFGASAAAATASSSPLFGTSTSSGSAGSALFGSSPFGASSSVSTS

Query:  NLFGSSSLSA------PTTPFQNAFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSSSSG-------FSFSTTSLSKTTSITTASSSSS------LTSASTSSSSFSFGTP
         LFGS++  A       TTP +  F S  S   + + P  A+ ++   G          ST +L  +TS TT   SS+          ST++++    TP
Subjt:  NLFGSSSLSA------PTTPFQNAFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSSSSG-------FSFSTTSLSKTTSITTASSSSS------LTSASTSSSSFSFGTP

Query:  ASSASQSSF-----GFSISNAASTGGPSTPSTTASKPTFLSFSNSVAPLFSTVTTTSA-------STPAANSTTQPSFSVPGFSSSSSA------ATTLS
        A+SA  S+      G +++++A     ST + TAS P       +  PLF    TTSA       +TP   STT  + +  G S+++S       ATT +
Subjt:  ASSASQSSF-----GFSISNAASTGGPSTPSTTASKPTFLSFSNSVAPLFSTVTTTSA-------STPAANSTTQPSFSVPGFSSSSSA------ATTLS

Query:  IAASSAPSASSSGSVSSFTGFGVTNTAASSSAIGSLSLPTKPSTAASSSQAPASFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSA
         AASS P+A+S+ S+     FG    + ++ A G+   PT  +  AS+S    +   P+  +S+TA+TTT+G  A +                T    ++
Subjt:  IAASSAPSASSSGSVSSFTGFGVTNTAASSSAIGSLSLPTKPSTAASSSQAPASFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSA

Query:  TVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAER
        TV    +LP  +  KT++EII  W  +L +   +F++QA  + EWDR +++N + + +L     +      E+E++L  +E+ Q+E+   L   E + + 
Subjt:  TVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAER

Query:  IYKDERGLLLDDEAA---STRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI-
        +Y  + G    ++AA     R+  Y+ AE +  +L++M + +  +I+ +N      ++G + D      PL  +VR+LN  L+ L WID  A    +++ 
Subjt:  IYKDERGLLLDDEAA---STRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI-

Query:  --QKLAATEG
          QK A + G
Subjt:  --QKLAATEG

Q8L7F7 Nuclear pore complex protein NUP62

2.6e-112

50.12

Show/hide

Query:  MSGFTFGSSFSQSSSSSSSSSSSSSPFSSTTGFSFGSTPA--FSFGSSSSSPLSLSSSSSSNPTSSSSPF-SNLTSNPASSS--SFGFGSSSFP------
        MSGF FG S                  +S  GFSFGS+ A   S  SS++SPLS S + SSNP+S+   F S+++S PASS+  SFGFG+SS P      
Subjt:  MSGFTFGSSFSQSSSSSSSSSSSSSPFSSTTGFSFGSTPA--FSFGSSSSSPLSLSSSSSSNPTSSSSPF-SNLTSNPASSS--SFGFGSSSFP------

Query:  --SSTSPSFAFSLPAASTAAPSSSATPASSFFGISSSSAGLTSFGFGASSSSGNSSAPS---FGAAPSSGTSFGATPSSGSSSAPLFGAAPSSGS--SSA
          SS++PSF F   A+ T A   S TP+  F   +SSSA   S  FG+S+++ +S+AP    FG   SS +S  ATPSS      LFGA  SS +  SS+
Subjt:  --SSTSPSFAFSLPAASTAAPSSSATPASSFFGISSSSAGLTSFGFGASSSSGNSSAPS---FGAAPSSGTSFGATPSSGSSSAPLFGAAPSSGS--SSA

Query:  PLFGAAPSSGSSSAPLFGAGPSSASSPVPS-------FGAASSSGSSLVPSFGALPSSGSSSAPLVGVAPSTAASAASLFGGISSATTSSAPLFGTSAST
        P FGAAP+SGS+  PLFG+ PS  S+P  +       FGA+SS+ +S  P FGA PSS + + P   VA S   S++S+FG      T S+P F  ++S 
Subjt:  PLFGAAPSSGSSSAPLFGAGPSSASSPVPS-------FGAASSSGSSLVPSFGALPSSGSSSAPLVGVAPSTAASAASLFGGISSATTSSAPLFGTSAST

Query:  ASPGSTLFGASAAAATASSSPLFGTSTSSGSAGSALFGSSPFGASSSVSTSNLFGSSSLSAPTTPFQNAFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSSSSGFSFSTT
        +    ++FGA+       SSP FG+S+S+GS  S LF SS  GA++  S+ + FG S+           F+SSS+ N S++S   AS  S+S+GFSF  +
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Query:  SLSKTTSITTASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGPSTPSTTASKPTFLSFSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSV
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        P  + +  +    S A ++ P  +SS +  S TGFG+ ++  ++ +  S +    P T+  +S +      P+ + S  ++T+T+  + SS + T +TLV
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Arabidopsis top hits

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        +    ++FGA+       SSP FG+S+S+GS  S LF SS  GA++  S+ + FG S+           F+SSS+ N S++S   AS  S+S+GFSF  +
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TTCTGGGTTTTCATTTTCGACCACATCTTTGTCCAAAACTACTAGTATTACCACTGCATCTTCTTCTTCTTCTCTTACATCAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCAT
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TTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACTTTGTCCATCGCAGCATCCTCCGCTCCCTCGGCTTCTTCTTCGGGTTCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTCGGTGTCACAA
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TCCTCTTCCACTGCTGCTACCACCACGTCTGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAAACTTCATCAACTCTTGTTGTAGCAAGTAGTAGTAGCGGTACAACTTCAACTGT
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AATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCATTTTCCTCAACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACCCCCGCCTTCTCCTTCGGATCATCATCATCA
TCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCATCCTCAAACCCTACCTCCTCTTCCTCTCCCTTTTCCAATCTAACCTCCAATCCTGCTTCTTCTTCTTCCTTCGGCTTTGGCTC
TTCCTCTTTCCCCTCCTCCACTTCCCCTTCCTTCGCTTTCTCCCTCCCCGCCGCTTCCACTGCCGCACCTTCCTCTTCAGCAACTCCAGCTTCTTCCTTCTTTGGGATTT
CTTCATCCTCAGCTGGATTGACTTCTTTCGGATTTGGGGCTTCATCTTCATCAGGAAACTCGTCTGCGCCCTCGTTTGGGGCGGCTCCGTCCTCTGGGACCTCATTTGGG
GCTACTCCCTCCTCTGGGAGCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGAGCTGCTCCCTCTTCTGGGAGCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGGAGCTCATC
TGCGCCCTTGTTTGGGGCTGGTCCCTCCTCTGCGAGCTCACCTGTGCCCTCGTTTGGGGCTGCTTCCTCCTCTGGGAGCTCACTTGTGCCCTCCTTTGGGGCTCTTCCGT
CCTCTGGGAGCTCATCTGCGCCCTTGGTTGGGGTTGCTCCATCTACAGCTGCCTCGGCTGCGTCCTTGTTTGGAGGGATATCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTG
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AGAACGCTTTTTCTTCGAGTTCTTCCCAGAATTTGAGTTCGTCTTCACCGTTTGCGGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGGGTTTTCATTTTCGACCACATCTTTGTCC
AAAACTACTAGTATTACCACTGCATCTTCTTCTTCTTCTCTTACATCAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTTGGAACACCTGCTTCGTCGGCATCTCAATCTTC
TTTCGGGTTTAGTATTAGCAATGCAGCATCGACGGGAGGACCTTCTACTCCGAGCACTACAGCTTCGAAGCCTACTTTTCTATCGTTTTCAAATTCTGTGGCACCTTTGT
TCTCCACAGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCAAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGGTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACTTTG
TCCATCGCAGCATCCTCCGCTCCCTCGGCTTCTTCTTCGGGTTCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTCGGTGTCACAAACACGGCTGCTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTT
ATCACTGCCGACCAAACCATCAACTGCTGCTTCATCATCGCAAGCACCAGCCTCTTTCGGTTTCCCTTCTCTGGCTTCCTCTTCCACTGCTGCTACCACCACGTCTGGTT
TCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAAACTTCATCAACTCTTGTTGTAGCAAGTAGTAGTAGCGGTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTGTCTTCTACACCAAAATTACCA
TCTGAGATAACAGGGAAGACTGTTGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTTCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGGAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAATGGGA
TAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATCCTCCTTAGACTTGAGATTGAAGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGCTGATCGAAACTC
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GCCTTAATGCATTCACATTTGTGATTTTTTGTCCAAAAGGATGTATCCATTCTTTTTTTTCCTTCTCTTTTTTTAGAAAACATGAATATAGGGCGAGCATTCAAATTTAC
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Show/hide protein sequence

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ELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWID
EKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS

Clc06G03210 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome