; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc06G04600 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc06G04600
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationClcChr06:4792643..4793925
RNA-Seq ExpressionClc06G04600
SyntenyClc06G04600
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8637117.1 hypothetical protein CSA_004594 [Cucumis sativus]1.1e-1247.93Show/hide
Query:  VVDNGDGKRALTGIRNSHAVFSTHKLEIPTNFTQTASDSSTPFCCRRRGLWIRGHLLRRPAPTLSLSPYSSPAAVAEPNSSSAASTSSLLTPQVFFRLGR
        VVDNGDG+ ALTGIR+SH VFSTH+L+    F      +STP   R    WI+ HL   P PTLSLSPYSS                     +VFFRL  
Subjt:  VVDNGDGKRALTGIRNSHAVFSTHKLEIPTNFTQTASDSSTPFCCRRRGLWIRGHLLRRPAPTLSLSPYSSPAAVAEPNSSSAASTSSLLTPQVFFRLGR

Query:  SFLTSIGVLVLKFEVSLFHFC
        +FLTSIGVL+LK E ++   C
Subjt:  SFLTSIGVLVLKFEVSLFHFC
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KI41 Uncharacterized protein2.8e-0949.51Show/hide
Query:  VVDNGDGKRALTGIRNSHAVFSTHKLEI----------PTNFTQTASDSSTPFCCRRRGLWIRGHLLRRPAPTLSLSPY-SSPAAVAEPNSSSAASTSSL
        VVDNGDG+ ALTGIR+SH VFSTH+L+           PT  + +  DSS P                   PTLSLSPY SSP  VA+PNSSS A+TS L
Subjt:  VVDNGDGKRALTGIRNSHAVFSTHKLEI----------PTNFTQTASDSSTPFCCRRRGLWIRGHLLRRPAPTLSLSPY-SSPAAVAEPNSSSAASTSSL

Query:  LTP
         TP
Subjt:  LTP
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTTGTCGTTGATAATGGGGACGGGAAGAGAGCTTTAACCGGCATACGGAATTCTCACGCCGTGTTTTCAACGCACAAATTGGAAATTCCGACTAATTTCACCCAAAC
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CTTGTGCTGAAATTTGAGGTTTCCTTATTTCATTTCTGTATCTTTTGTTGGCATTTGAGTTGGTCGGTGGGGAATGTATGTGAAATAAGCTTTGTTATTGATCTTTGTCA
CTCGTATTCATCGGTCTACTACATTAGTACTGGAAATGAGAATGCTCTTCGCCACAGCTGCACTCTGCAAAATGGGTACTCCTGTCTGTGGTTCTGTGTGGTTCATGAAA
TTAAAAGGGAAAAGGGTGTGACCGTTAGGTGCACCTTTGTGAAACCTCATCATCAAAATGTGCAAGTTTTGCCTCTAACAACACTGGTTATGAATGTTTACACAATTGTT
TTCCCTGTATTAGAAAGTTTTTCTGTCTGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TTCCCTGTATTAGAAAGTTTTTCTGTCTGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLVVDNGDGKRALTGIRNSHAVFSTHKLEIPTNFTQTASDSSTPFCCRRRGLWIRGHLLRRPAPTLSLSPYSSPAAVAEPNSSSAASTSSLLTPQVFFRLGRSFLTSIGV
LVLKFEVSLFHFCIFCWHLSWSVGNVCEISFVIDLCHSYSSVYYISTGNENALRHSCTLQNGYSCLWFCVVHEIKREKGVTVRCTFVKPHHQNVQVLPLTTLVMNVYTIV
FPVLESFSVC