; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc06G05190 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc06G05190
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionmultiple organellar RNA editing factor 3, mitochondrial-like
Genome locationClcChr06:5357630..5359927
RNA-Seq ExpressionClc06G05190
SyntenyClc06G05190
Gene Ontology termsGO:0006397 - mRNA processing (biological process)
GO:0016554 - cytidine to uridine editing (biological process)
GO:0080156 - mitochondrial mRNA modification (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
InterPro domainsIPR039206 - MORF/ORRM1/DAG-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6575083.1 Multiple organellar RNA editing factor 3, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.5e-7089.94Show/hide
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XP_004150496.2 multiple organellar RNA editing factor 3, mitochondrial [Cucumis sativus]3.8e-7493.29Show/hide
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XP_008458407.1 PREDICTED: multiple organellar RNA editing factor 3, mitochondrial-like [Cucumis melo]1.9e-7393.25Show/hide
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XP_022959433.1 multiple organellar RNA editing factor 3, mitochondrial [Cucurbita moschata]7.5e-7089.94Show/hide
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XP_038906658.1 multiple organellar RNA editing factor 3, mitochondrial [Benincasa hispida]3.7e-7795.71Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCH1 Uncharacterized protein1.9e-7493.29Show/hide
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A0A1S3C8E0 multiple organellar RNA editing factor 3, mitochondrial-like9.2e-7493.25Show/hide
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A0A6J1C9B1 multiple organellar RNA editing factor 3, mitochondrial-like5.2e-6987.12Show/hide
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A0A6J1H5X4 multiple organellar RNA editing factor 3, mitochondrial3.6e-7089.94Show/hide
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A0A6J1L4U9 multiple organellar RNA editing factor 3, mitochondrial6.4e-6786.79Show/hide
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        A RR   TVLSRS SSSS  S      SSISSRLR AFPLL+R  QIIPNSFN P+RF+ SGSGYSPLNDPSPNWSNRPPKETILLDGCDYEHWLIVMEF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22793 Multiple organellar RNA editing factor 2, chloroplastic5.4e-2353.21Show/hide
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        E S K++ L
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Q38732 DAG protein, chloroplastic4.6e-2243.14Show/hide
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        L++L ++L   +P+S +     SI S    +F    R   I   S   P     +   YS   + + N S    +ETI+L GCDY HWLIVMEFP DP P
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        + E+M+++Y+ TLA V+GS EEAKK +Y+ STTTYTGF   ++EE S K K L
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Q84JZ6 Multiple organellar RNA editing factor 3, mitochondrial2.8e-5169.09Show/hide
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        LIVMEF  DPKP+EEEM+NSYVKTL +V+G EEEAKKKIYSV T+TYTGFGALISEELS KVK L
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Q9LKA5 Multiple organellar RNA editing factor 8, chloroplastic/mitochondrial9.9e-3349.37Show/hide
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        ++L  + +RS +SS+P + S   +SS+ SR R   PL+     +      + ++  ++ +  S LNDP+PNWSNRPPKETILLDGCD+EHWL+V+E P  
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         +P+ +E+++SY+KTLA +VGSE+EA+ KIYSVST  Y  FGAL+SE+LS+K+KEL++
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Q9LPZ1 Multiple organellar RNA editing factor 9, chloroplastic7.1e-2363.29Show/hide
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        +ETI+L GCDY HWLIVMEFP DP PS ++M+++Y+ TLA V+GS EEAKK +Y+ STTTYTGF   I EE S K K L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G11430.1 plastid developmental protein DAG, putative5.0e-2463.29Show/hide
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        +ETI+L GCDY HWLIVMEFP DP PS ++M+++Y+ TLA V+GS EEAKK +Y+ STTTYTGF   I EE S K K L
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AT2G33430.1 differentiation and greening-like 13.9e-2453.21Show/hide
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        F++      SGS YSPLN  S N+S+RPP E   L  GCDYEHWLIVM+ P     ++++M++ Y++TLA VVGSEEEAKK+IY+VS   Y GFG  I E
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Query:  ELSYKVKEL
        E S K++ L
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AT3G06790.1 plastid developmental protein DAG, putative7.5e-5268.48Show/hide
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Query:  LIVMEFPNDPKPSEEEMVNSYVKTLAAVVGSEEEAKKKIYSVSTTTYTGFGALISEELSYKVKEL
        LIVMEF  DPKP+EEEM+NSYVKTL +V+G +EEAKKKIYSV T+TYTGFGALISEELS KVK L
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AT3G06790.2 plastid developmental protein DAG, putative2.0e-5269.09Show/hide
Query:  MASSATRRTLLTVLSRSLSSSSPSSSSFFLSSSISSRLRFAFPLLNR--HDQIIPNSFNLPIRFKASGSGYSPLNDPSPNWSNRPPKETILLDGCDYEHW
        MA  +TRRTL T+L+++LSSS+  SSSF    ++SSR RFA PL+ +    +       +  R K SGSGYSPLNDPSPNWSNRPPKETILLDGCDYEHW
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Query:  LIVMEFPNDPKPSEEEMVNSYVKTLAAVVGSEEEAKKKIYSVSTTTYTGFGALISEELSYKVKEL
        LIVMEF  DPKP+EEEM+NSYVKTL +V+G EEEAKKKIYSV T+TYTGFGALISEELS KVK L
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AT3G15000.1 cobalt ion binding7.0e-3449.37Show/hide
Query:  RTLLTVLSRSLSSSSPSSSSFFLSSSISSRLRFAFPLLNRHDQIIPNSFNLPIRFKASGSGYSPLNDPSPNWSNRPPKETILLDGCDYEHWLIVMEFPND
        ++L  + +RS +SS+P + S   +SS+ SR R   PL+     +      + ++  ++ +  S LNDP+PNWSNRPPKETILLDGCD+EHWL+V+E P  
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Query:  PKPSEEEMVNSYVKTLAAVVGSEEEAKKKIYSVSTTTYTGFGALISEELSYKVKELAS
         +P+ +E+++SY+KTLA +VGSE+EA+ KIYSVST  Y  FGAL+SE+LS+K+KEL++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTCCTCAGCCACTCGGCGCACTTTACTCACTGTTCTTAGCCGAAGCCTCTCTTCTTCATCACCATCTTCTTCTTCCTTCTTCCTTTCATCTTCTATTTCTTCTCG
CCTCCGATTCGCTTTTCCTCTGCTCAACAGACACGATCAAATAATCCCTAATTCATTCAATCTTCCTATTCGATTCAAGGCTTCGGGATCCGGATACTCTCCCCTCAACG
ATCCTTCTCCTAATTGGAGCAATCGACCTCCAAAAGAGACGATACTCCTCGATGGCTGCGATTACGAACACTGGCTGATCGTGATGGAGTTTCCAAATGACCCAAAACCA
TCGGAGGAGGAGATGGTGAATTCCTATGTCAAAACACTAGCCGCTGTTGTCGGAAGTGAGGAAGAGGCGAAGAAGAAAATATACTCAGTCAGTACAACTACATATACTGG
CTTTGGTGCCTTGATTTCTGAAGAGCTTTCTTACAAAGTGAAAGAATTGGCATCTGACTTGAGCTATTCATTCCGGATGAAACAGAATTGCCAGGTGTTCTATGGGTTTT
ACCAGATTCATATCTTGATGTTCCAAACAAAGATTACGGAGGCGATCTGTTTATCGATGGAAAGGTCATCCCCAGACCGCAGTATAGGTACAACGATAGGGAACCATCTG
GTAGAAACAGGCCTCGTCCACGGTACGATAGACGCCGAGAAACTATGCAAGTTGAACGGAGACAACCGTTTCAGAGACAAAACTGGGGTCGAGACCAGAGAGATCCAATT
CAACCACCAACCTCCATGGATGGTCAAAATACAGCTCGAAGTGGTGTTGGAGATTTCTCGACAAATCCAGGCGAGTTTAATCGGAGCAATCACTGATAGTGGATGTTTTA
AAATGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGCTCTCAACAATGGCGTCCTCAGCCACTCGGCGCACTTTACTCACTGTTCTTAGCCGAAGCCTCTCTTCTTCATCACCATCTTCTTCTTCCTTCTTCCTTTCATCTTC
TATTTCTTCTCGCCTCCGATTCGCTTTTCCTCTGCTCAACAGACACGATCAAATAATCCCTAATTCATTCAATCTTCCTATTCGATTCAAGGCTTCGGGATCCGGATACT
CTCCCCTCAACGATCCTTCTCCTAATTGGAGCAATCGACCTCCAAAAGAGACGATACTCCTCGATGGCTGCGATTACGAACACTGGCTGATCGTGATGGAGTTTCCAAAT
GACCCAAAACCATCGGAGGAGGAGATGGTGAATTCCTATGTCAAAACACTAGCCGCTGTTGTCGGAAGTGAGGAAGAGGCGAAGAAGAAAATATACTCAGTCAGTACAAC
TACATATACTGGCTTTGGTGCCTTGATTTCTGAAGAGCTTTCTTACAAAGTGAAAGAATTGGCATCTGACTTGAGCTATTCATTCCGGATGAAACAGAATTGCCAGGTGT
TCTATGGGTTTTACCAGATTCATATCTTGATGTTCCAAACAAAGATTACGGAGGCGATCTGTTTATCGATGGAAAGGTCATCCCCAGACCGCAGTATAGGTACAACGATA
GGGAACCATCTGGTAGAAACAGGCCTCGTCCACGGTACGATAGACGCCGAGAAACTATGCAAGTTGAACGGAGACAACCGTTTCAGAGACAAAACTGGGGTCGAGACCAG
AGAGATCCAATTCAACCACCAACCTCCATGGATGGTCAAAATACAGCTCGAAGTGGTGTTGGAGATTTCTCGACAAATCCAGGCGAGTTTAATCGGAGCAATCACTGATA
GTGGATGTTTTAAAATGTGAATATTTATAGACTCCTTTAATGAATGAAGTCTAGGCAACATATGTCTAGATTAGCCTAGATTTTTATCACTCCTCAATGCATGACAAAGC
TAGGAGATTTTAGAATCCTTACACATCAACATTCGAAATATTCAAGTATGAAATTTCTATCAGTCCTTAAATCTAGCATCTAAATGCATTGAAGGGGTGCATATTTAGTT
TGTTGACTAGATTCCTTAATGTTTTATCTCTAATTTCCTTCTTTCATTAGCAATAGGTCCAAAGATTAAAAAGAAACTATTGGGAATGATCGAACTGTTCCTTCTTGGAT
GTGATGAAATTCGACCAATACCCAGGCATTTAGTTTTATTTGAATAATGAATGATCTATGAATTATGGGGGTTTTGATCTTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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VETGLVHGTIDAEKLCKLNGDNRFRDKTGVETREIQFNHQPPWMVKIQLEVVLEISRQIQASLIGAITDSGCFKM