; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc06G12820 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc06G12820
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionSerine-rich protein-related
Genome locationClcChr06:23726503..23727305
RNA-Seq ExpressionClc06G12820
SyntenyClc06G12820
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LYY6 Uncharacterized protein1.4e-3879.65Show/hide
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A0A5A7U6S1 Serine-rich protein-related2.4e-3880.36Show/hide
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A0A6J1E1K3 uncharacterized protein LOC1114299441.1e-4383.93Show/hide
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A0A6J1EG01 uncharacterized protein LOC1114339804.6e-4280.36Show/hide
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A0A6J1KSU0 uncharacterized protein LOC1114972771.7e-4180.36Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G67910.1 unknown protein9.9e-0552.63Show/hide
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AT5G11090.1 serine-rich protein-related1.4e-1142.71Show/hide
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AT5G20370.1 serine-rich protein-related1.5e-0840.2Show/hide
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        RF
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AT5G25280.1 serine-rich protein-related6.0e-1040.62Show/hide
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AT5G25280.2 serine-rich protein-related6.0e-1040.62Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTCGAAATATGGATCCTCCAATCCGAAATTGCAAAGCATCGCCGGTTCAAGGAAGTGTCTTTGTTCTCCGACCACCCATCCCGGCTCTTTCCGCTGCAGT
TTTCACCGGAACCGCCGCAAGGTCTCCTCCGCTAGGTCGTCTTCATCCATTTCCGCCATTACCACTGCGCAATTGGAGCTTGCGATGTTCGCGAAGGCGAATGCG
TTGAGAGCGTTTCTTCTGCAGATGATTAAGCCGTCGAGTAACGATCTACAACGGCGAAGGAATTTTCATCCTAGACCTTCCAGGTTTTGTTTGATGAACAATCAT
GGAACTGGATTGACTGTTTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGAAGAACCTCAAACTCAATACAGCAATCTTGTTCCACAAGTTTTCCCTCACAAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAATCACTCCACAAAAATCAC
TCCCAAATTCCACAAACTCTCTTCCACTGTTCAATTCAATGGCGTCGAAATATGGATCCTCCAATCCGAAATTGCAAAGCATCGCCGGTTCAAGGAAGTGTCTTT
GTTCTCCGACCACCCATCCCGGCTCTTTCCGCTGCAGTTTTCACCGGAACCGCCGCAAGGTCTCCTCCGCTAGGTCGTCTTCATCCATTTCCGCCATTACCACTG
CGCAATTGGAGCTTGCGATGTTCGCGAAGGCGAATGCGTTGAGAGCGTTTCTTCTGCAGATGATTAAGCCGTCGAGTAACGATCTACAACGGCGAAGGAATTTTC
ATCCTAGACCTTCCAGGTTTTGTTTGATGAACAATCATGGAACTGGATTGACTGTTTCTTGAAATCGATTTTAGTTTCTTAGTCGTAGTAGATCTGGATGTTTGA
TTTGTTCGTTGTTTCGATCTTATCTCTTCGCCGAATTTCCAAATGAGTTTGTAGATATAGCATTTGTGTATAGATTCCAGAGGACATTGCTATTACTTCACTTTG
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TCGCAATAAACGAACGATAATTCATTCATTACATCTGAAATGCTTTAATTTCTTTATCAAGAAACCGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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