; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc06G14970 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc06G14970
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein HOX18-like
Genome locationClcChr06:25932207..25933956
RNA-Seq ExpressionClc06G14970
SyntenyClc06G14970
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001356 - Homeobox domain
IPR003106 - Leucine zipper, homeobox-associated
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587716.1 Homeobox-leucine zipper protein HAT4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.6e-6861.73Show/hide
Query:  QDEVCNIS-WLSLGLGFGEYVPKKMQKIN-NKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEIDDEANSSEEDDHHLMKRIRSNNNIVNYDQDS
        QD++CNI   LSLG GFGEYVPKKMQKIN N    +    LSFTL+PK+EL IN++                                            
Subjt:  QDEVCNIS-WLSLGLGFGEYVPKKMQKIN-NKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEIDDEANSSEEDDHHLMKRIRSNNNIVNYDQDS

Query:  SFGIRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSEL-RERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKL
                                TTN        S GSE  RERKKLRLSKEQ+TLLEESFKLHTTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRARTKL
Subjt:  SFGIRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSEL-RERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKL

Query:  KQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPP
        KQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRS+KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT AANAAA D NSPP
Subjt:  KQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPP

XP_004150745.1 homeobox-leucine zipper protein HOX18 [Cucumis sativus]4.0e-10583.04Show/hide
Query:  HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYVPKKMQKINNKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEI-DDEANSSEE-DDHHLMKRIRSNNNIVNYD-
        H+DE+CNISWLSLGLGFG +YVPKK+QK      QQQQQQLSFTLIPKEEL I NN+        NMEI DDEANSSEE DDHHLMKRIRS+NNIVNYD 
Subjt:  HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYVPKKMQKINNKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEI-DDEANSSEE-DDHHLMKRIRSNNNIVNYD-

Query:  --QDSSFG-IRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRR
          QDSSFG IRR SSDH    Y NN++ + TTNHNYKGI SSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRR
Subjt:  --QDSSFG-IRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRR

Query:  ARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPPQ
        ARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKEL+ELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT      AVDANSPPQ
Subjt:  ARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPPQ

XP_008453538.1 PREDICTED: homeobox-leucine zipper protein HOX18-like [Cucumis melo]1.0e-10582.81Show/hide
Query:  HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYVPKKMQKINNKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEI-DDEANSSEE-DDHHLMKRIRSNNNIVNYD-
        H+DE+CNISWLSLGLGFG +YVPKK+QK      Q QQQQ+SFTLIPKEEL I NN+        NMEI DDE NSSEE DDHHLMKRIRSNNNIVNYD 
Subjt:  HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYVPKKMQKINNKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEI-DDEANSSEE-DDHHLMKRIRSNNNIVNYD-

Query:  ---QDSSFG-IRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNR
           QDSSFG IRR SSD    QY NNN+ + +TNHNYKGI SSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNR
Subjt:  ---QDSSFG-IRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNR

Query:  RARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT-AAANAAAVDANSPPQ
        RARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKEL+ELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCD+ITRT AA  AAAVDANSPPQ
Subjt:  RARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT-AAANAAAVDANSPPQ

XP_022931479.1 homeobox-leucine zipper protein HAT3-like [Cucurbita moschata]2.5e-6761.37Show/hide
Query:  QDEVCNIS-WLSLGLGFGEYVPKKMQKIN-NKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEIDDEANSSEEDDHHLMKRIRSNNNIVNYDQDS
        QD++CNI   LSLG GFGEYVPKKMQKIN N    +    LSFTL+PK+EL IN++                                            
Subjt:  QDEVCNIS-WLSLGLGFGEYVPKKMQKIN-NKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEIDDEANSSEEDDHHLMKRIRSNNNIVNYDQDS

Query:  SFGIRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSEL-RERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKL
                                TTN        S GSE  RERKKLRLSKEQ+TLLEESFKLHTTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRARTKL
Subjt:  SFGIRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSEL-RERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKL

Query:  KQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPP
        KQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRS+KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT AANAAA + NSPP
Subjt:  KQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPP

XP_038879995.1 homeobox-leucine zipper protein HOX17-like [Benincasa hispida]1.1e-11888.07Show/hide
Query:  MADHQDEVCNISWLSLGLGFG--EYVPKKMQKINNKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEIDD-EANSSEED-DHHLMKRIRSNNNIV
        M DHQDEVCNISWLSLGLGFG  +YVPKKMQKINN        QLSFTLIPKEELGINNN+    N+NINMEIDD EANSSEED  HHLMKR RSNNNIV
Subjt:  MADHQDEVCNISWLSLGLGFG--EYVPKKMQKINNKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEIDD-EANSSEED-DHHLMKRIRSNNNIV

Query:  NYD-QDSSFGIR-RSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQN
        NYD QDSSFGIR RSSSDHHHHQ  ++NNNIITTNHN+KGISSS  SELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKL+TTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQN
Subjt:  NYD-QDSSFGIR-RSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQN

Query:  RRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPPQ
        RRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL+SLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAA+DANSPPQ
Subjt:  RRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPPQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M012 Homeobox domain-containing protein1.9e-10583.04Show/hide
Query:  HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYVPKKMQKINNKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEI-DDEANSSEE-DDHHLMKRIRSNNNIVNYD-
        H+DE+CNISWLSLGLGFG +YVPKK+QK      QQQQQQLSFTLIPKEEL I NN+        NMEI DDEANSSEE DDHHLMKRIRS+NNIVNYD 
Subjt:  HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYVPKKMQKINNKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEI-DDEANSSEE-DDHHLMKRIRSNNNIVNYD-

Query:  --QDSSFG-IRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRR
          QDSSFG IRR SSDH    Y NN++ + TTNHNYKGI SSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRR
Subjt:  --QDSSFG-IRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRR

Query:  ARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPPQ
        ARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKEL+ELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT      AVDANSPPQ
Subjt:  ARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPPQ

A0A1S3BWH2 homeobox-leucine zipper protein HOX18-like5.0e-10682.81Show/hide
Query:  HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYVPKKMQKINNKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEI-DDEANSSEE-DDHHLMKRIRSNNNIVNYD-
        H+DE+CNISWLSLGLGFG +YVPKK+QK      Q QQQQ+SFTLIPKEEL I NN+        NMEI DDE NSSEE DDHHLMKRIRSNNNIVNYD 
Subjt:  HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYVPKKMQKINNKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEI-DDEANSSEE-DDHHLMKRIRSNNNIVNYD-

Query:  ---QDSSFG-IRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNR
           QDSSFG IRR SSD    QY NNN+ + +TNHNYKGI SSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNR
Subjt:  ---QDSSFG-IRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNR

Query:  RARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT-AAANAAAVDANSPPQ
        RARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKEL+ELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCD+ITRT AA  AAAVDANSPPQ
Subjt:  RARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT-AAANAAAVDANSPPQ

A0A5A7USQ4 Homeobox-leucine zipper protein HOX18-like5.0e-10682.81Show/hide
Query:  HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYVPKKMQKINNKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEI-DDEANSSEE-DDHHLMKRIRSNNNIVNYD-
        H+DE+CNISWLSLGLGFG +YVPKK+QK      Q QQQQ+SFTLIPKEEL I NN+        NMEI DDE NSSEE DDHHLMKRIRSNNNIVNYD 
Subjt:  HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYVPKKMQKINNKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEI-DDEANSSEE-DDHHLMKRIRSNNNIVNYD-

Query:  ---QDSSFG-IRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNR
           QDSSFG IRR SSD    QY NNN+ + +TNHNYKGI SSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNR
Subjt:  ---QDSSFG-IRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNR

Query:  RARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT-AAANAAAVDANSPPQ
        RARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKEL+ELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCD+ITRT AA  AAAVDANSPPQ
Subjt:  RARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT-AAANAAAVDANSPPQ

A0A6J1BYS3 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like1.0e-6667.42Show/hide
Query:  DEVCNISWLSLGLGFG-EYVPKKMQKINNKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEIDDEANSSEEDDHHLMKRIRSNNNIVNYDQDSSF
        DE+CNI  L LGLGFG EYVPKK  KINN    +    LSFTLIPKEE              IN+EI  EA+SS   DH  +KRIRSNNN     QD   
Subjt:  DEVCNISWLSLGLGFG-EYVPKKMQKINNKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEIDDEANSSEEDDHHLMKRIRSNNNIVNYDQDSSF

Query:  GIRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQT
         IR SSS             I+        I+ SS     ERKKLRLSKEQS LLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQT
Subjt:  GIRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQT

Query:  EVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAA
        EVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKE+ ELRSLK+GASQLYIQLPKAATLTICPSC+K+TR AAA AAA
Subjt:  EVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAA

A0A6J1EUD1 homeobox-leucine zipper protein HAT3-like1.2e-6761.37Show/hide
Query:  QDEVCNIS-WLSLGLGFGEYVPKKMQKIN-NKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEIDDEANSSEEDDHHLMKRIRSNNNIVNYDQDS
        QD++CNI   LSLG GFGEYVPKKMQKIN N    +    LSFTL+PK+EL IN++                                            
Subjt:  QDEVCNIS-WLSLGLGFGEYVPKKMQKIN-NKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEIDDEANSSEEDDHHLMKRIRSNNNIVNYDQDS

Query:  SFGIRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSEL-RERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKL
                                TTN        S GSE  RERKKLRLSKEQ+TLLEESFKLHTTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRARTKL
Subjt:  SFGIRRSSSDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSEL-RERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKL

Query:  KQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPP
        KQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRS+KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT AANAAA + NSPP
Subjt:  KQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P46602 Homeobox-leucine zipper protein HAT38.7e-3960.84Show/hide
Query:  SSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKL
        S   +   RKKLRLSKEQ+ +LEE+FK H+TLNP QK ALA+QLNL+TRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L +ENRRL+KE+ ELR+LKL
Subjt:  SSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKL

Query:  GASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAA---VDANSP
         +  LY+ +    TLT+CPSC+++  T+++++ A   ++++SP
Subjt:  GASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAA---VDANSP

P46604 Homeobox-leucine zipper protein HAT222.3e-3973.28Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRL+K+QS LLE++FKLH+TLNP QKQALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCE L +ENRRL+KEL +L++LKL +   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKI
        +P AATLT+CPSC+++
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKI

P92953 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-41.5e-3863.91Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+Q+ +LEE+FK H+TLNP QK ALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CC+ L EENRRL+KE+ ELR+LKL +  LY+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPP
        +    TLT+CPSC++++ +AA   AA    + P
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPP

Q01I23 Homeobox-leucine zipper protein HOX173.3e-3854.66Show/hide
Query:  NNIITTNHNYKGISSSSGSELRE--------RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKC
        + ++       G+    GS+  +        RKKLRLSK+QS +LE+SF+ H TLNP QK  LAQQL L+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK+C
Subjt:  NNIITTNHNYKGISSSSGSELRE--------RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKC

Query:  CERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDAN
        CE L EENRRL+KE+ ELR+LKL +  LY+ +    TLT+CPSC++++ T   ++AA  A+
Subjt:  CERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDAN

Q0JB92 Homeobox-leucine zipper protein HOX173.3e-3854.66Show/hide
Query:  NNIITTNHNYKGISSSSGSELRE--------RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKC
        + ++       G+    GS+  +        RKKLRLSK+QS +LE+SF+ H TLNP QK  LAQQL L+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK+C
Subjt:  NNIITTNHNYKGISSSSGSELRE--------RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKC

Query:  CERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDAN
        CE L EENRRL+KE+ ELR+LKL +  LY+ +    TLT+CPSC++++ T   ++AA  A+
Subjt:  CERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDAN

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44910.1 homeobox-leucine zipper protein 41.1e-3963.91Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+Q+ +LEE+FK H+TLNP QK ALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CC+ L EENRRL+KE+ ELR+LKL +  LY+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPP
        +    TLT+CPSC++++ +AA   AA    + P
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPP

AT3G60390.1 homeobox-leucine zipper protein 36.2e-4060.84Show/hide
Query:  SSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKL
        S   +   RKKLRLSKEQ+ +LEE+FK H+TLNP QK ALA+QLNL+TRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L +ENRRL+KE+ ELR+LKL
Subjt:  SSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKL

Query:  GASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAA---VDANSP
         +  LY+ +    TLT+CPSC+++  T+++++ A   ++++SP
Subjt:  GASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAA---VDANSP

AT4G16780.1 homeobox protein 29.0e-3961.54Show/hide
Query:  KGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL
        +GIS     +   RKKLRLSK+QS +LEE+FK H+TLNP QKQALA+QL L+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL++CCE L EENRRL+KE+ EL
Subjt:  KGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL

Query:  RSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDAN
        R+LKL + Q Y+ +    TLT+CPSC+ ++       AA  A+
Subjt:  RSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDAN

AT4G37790.1 Homeobox-leucine zipper protein family1.6e-4073.28Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRL+K+QS LLE++FKLH+TLNP QKQALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCE L +ENRRL+KEL +L++LKL +   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKI
        +P AATLT+CPSC+++
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKI

AT5G06710.1 homeobox from Arabidopsis thaliana4.0e-3966.92Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+QS  LE+SFK H+TLNP QK ALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L EENRRL+KE+ ELR+LK  ++  Y+Q
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDAN
        LP A TLT+CPSC+++  +AA  + +   N
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDAN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGATCATCAAGATGAGGTATGCAATATCAGCTGGCTTAGCCTTGGTTTGGGATTTGGTGAATATGTCCCAAAAAAGATGCAAAAAATCAACAATAAGCAGCAGCA
GCAGCAACAACAACAACTCTCTTTCACTCTCATTCCAAAAGAAGAATTGGGTATTAACAATAACGACGACGACGACGCCAACAACAACATCAATATGGAAATTGACGATG
AAGCTAATTCAAGTGAAGAAGATGATCATCATTTGATGAAGAGAATTAGAAGCAATAATAATATTGTTAATTATGATCAAGATTCCTCCTTTGGAATTAGAAGATCATCA
TCAGATCATCATCATCATCAGTACACCAACAACAACAACAATATTATTACTACTAATCATAATTATAAGGGGATTAGTAGTAGTAGTGGATCAGAATTAAGGGAGAGAAA
AAAGCTTAGGCTTTCCAAAGAACAATCCACTTTGCTGGAAGAAAGCTTCAAACTTCACACCACTTTGAATCCGGCTCAGAAACAGGCACTTGCCCAACAATTAAACCTCA
AAACTCGACAAGTGGAAGTTTGGTTTCAAAACAGACGTGCAAGGACGAAATTGAAACAAACAGAAGTAGATTGTGAGTTTTTGAAGAAATGTTGTGAAAGATTAAACGAA
GAAAACCGAAGGTTGAAGAAAGAATTGCATGAATTAAGATCCCTTAAACTTGGAGCTTCACAATTGTACATTCAGCTGCCTAAGGCGGCCACACTCACAATTTGCCCTTC
ATGCGACAAAATTACAAGGACGGCCGCCGCCAACGCCGCCGCCGTCGACGCTAATTCTCCGCCACAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTTAATTTTTTTTAAGTCATTAATTACTTCTTTTTTAACTCACAAAACTCAATAATTAACTGATTATTTCGACTTGAAACTTCTCTCCCTTTCTTTACCAATTCTTTTC
TCTTAATATCCCCCACTTACCCCTTCTCTTCTTCCCCAAGACTGCCATGGCAGATCATCAAGATGAGGTATGCAATATCAGCTGGCTTAGCCTTGGTTTGGGATTTGGTG
AATATGTCCCAAAAAAGATGCAAAAAATCAACAATAAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACTCTCTTTCACTCTCATTCCAAAAGAAGAATTGGGTATTAACAATAAC
GACGACGACGACGCCAACAACAACATCAATATGGAAATTGACGATGAAGCTAATTCAAGTGAAGAAGATGATCATCATTTGATGAAGAGAATTAGAAGCAATAATAATAT
TGTTAATTATGATCAAGATTCCTCCTTTGGAATTAGAAGATCATCATCAGATCATCATCATCATCAGTACACCAACAACAACAACAATATTATTACTACTAATCATAATT
ATAAGGGGATTAGTAGTAGTAGTGGATCAGAATTAAGGGAGAGAAAAAAGCTTAGGCTTTCCAAAGAACAATCCACTTTGCTGGAAGAAAGCTTCAAACTTCACACCACT
TTGAATCCGGCTCAGAAACAGGCACTTGCCCAACAATTAAACCTCAAAACTCGACAAGTGGAAGTTTGGTTTCAAAACAGACGTGCAAGGACGAAATTGAAACAAACAGA
AGTAGATTGTGAGTTTTTGAAGAAATGTTGTGAAAGATTAAACGAAGAAAACCGAAGGTTGAAGAAAGAATTGCATGAATTAAGATCCCTTAAACTTGGAGCTTCACAAT
TGTACATTCAGCTGCCTAAGGCGGCCACACTCACAATTTGCCCTTCATGCGACAAAATTACAAGGACGGCCGCCGCCAACGCCGCCGCCGTCGACGCTAATTCTCCGCCA
CAATAATTTAATAACGCCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MADHQDEVCNISWLSLGLGFGEYVPKKMQKINNKQQQQQQQQLSFTLIPKEELGINNNDDDDANNNINMEIDDEANSSEEDDHHLMKRIRSNNNIVNYDQDSSFGIRRSS
SDHHHHQYTNNNNNIITTNHNYKGISSSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNE
ENRRLKKELHELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAANAAAVDANSPPQ