; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc06G16910 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc06G16910
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Description50S ribosomal protein L7/L12
Genome locationClcChr06:27590151..27593587
RNA-Seq ExpressionClc06G16910
SyntenyClc06G16910
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000206 - Ribosomal protein L7/L12
IPR013823 - Ribosomal protein L7/L12, C-terminal
IPR014719 - Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008450561.1 PREDICTED: 50S ribosomal protein L7/L12 [Cucumis melo]4.2e-8790.1Show/hide
Query:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG
        +LTVVARSLQ RSTL KIIGLSQVRFFQPDF PRDP AKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPS+KII LAERIAALPA ERSQIGPTLGE+LRHPKLQ ISVDG
Subjt:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG

Query:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME
        LD GSEGGA AG+S +EEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEK+KAAGGVAVME
Subjt:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME

XP_011651634.1 uncharacterized protein LOC101206962 [Cucumis sativus]6.1e-8689.06Show/hide
Query:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG
        +LTVVA+SLQVRST AKIIGLSQVRFFQPDF PRDPNAKPK+YKYP FYDPYGPRPPPS+KIIELAERI ALPA ER QIGPTLGE+LRHPKLQ ISVDG
Subjt:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG

Query:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME
        LD G EGGA AG+S +EEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEK+KAAGGVAVME
Subjt:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME

XP_022155073.1 uncharacterized protein LOC111022207 [Momordica charantia]1.8e-8588.02Show/hide
Query:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG
        +L  VARSLQV STL K+IG  QVRFFQPDFAPRD  AKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPS+KII+LAE+I ALP DER QIGP L ERLRHPKLQPISVDG
Subjt:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG

Query:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME
        LD GSEGGAGAG+SK+EEKKEKTAFDVKLEKFDAA+KIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEK+KAAGGVAVME
Subjt:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME

XP_022998047.1 uncharacterized protein LOC111492812 [Cucurbita maxima]4.8e-8384.9Show/hide
Query:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG
        ++  VA+SLQ RS L KIIGL QVRFFQPDF PRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKII+LAERIAALP DER QIGP L ERL+HPKL+ ISVDG
Subjt:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG

Query:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME
        +D GSEGGA  G+SK+EEKKEKTAFDVKLEKF+AA+KIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEK+KAAGGVAVME
Subjt:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME

XP_038905834.1 50S ribosomal protein L7/L12 [Benincasa hispida]1.2e-8992.71Show/hide
Query:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG
        +LTVVARSLQVRST AKIIGLSQVRFFQ DFA RDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPS+KIIELAERIAALPA++R QIGPTL ERL+HPKLQPISVDG
Subjt:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG

Query:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME
        LD GSEGGAGAG+SK+EEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEK+KAAGGVAVME
Subjt:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L907 Ribosomal_L12 domain-containing protein3.0e-8689.06Show/hide
Query:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG
        +LTVVA+SLQVRST AKIIGLSQVRFFQPDF PRDPNAKPK+YKYP FYDPYGPRPPPS+KIIELAERI ALPA ER QIGPTLGE+LRHPKLQ ISVDG
Subjt:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG

Query:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME
        LD G EGGA AG+S +EEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEK+KAAGGVAVME
Subjt:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME

A0A1S3BPI3 50S ribosomal protein L7/L122.1e-8790.1Show/hide
Query:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG
        +LTVVARSLQ RSTL KIIGLSQVRFFQPDF PRDP AKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPS+KII LAERIAALPA ERSQIGPTLGE+LRHPKLQ ISVDG
Subjt:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG

Query:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME
        LD GSEGGA AG+S +EEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEK+KAAGGVAVME
Subjt:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME

A0A5A7U2A3 50S ribosomal protein L7/L122.1e-8790.1Show/hide
Query:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG
        +LTVVARSLQ RSTL KIIGLSQVRFFQPDF PRDP AKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPS+KII LAERIAALPA ERSQIGPTLGE+LRHPKLQ ISVDG
Subjt:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG

Query:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME
        LD GSEGGA AG+S +EEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEK+KAAGGVAVME
Subjt:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME

A0A6J1DM08 uncharacterized protein LOC1110222078.6e-8688.02Show/hide
Query:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG
        +L  VARSLQV STL K+IG  QVRFFQPDFAPRD  AKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPS+KII+LAE+I ALP DER QIGP L ERLRHPKLQPISVDG
Subjt:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG

Query:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME
        LD GSEGGAGAG+SK+EEKKEKTAFDVKLEKFDAA+KIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEK+KAAGGVAVME
Subjt:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME

A0A6J1K6S5 uncharacterized protein LOC1114928122.3e-8384.9Show/hide
Query:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG
        ++  VA+SLQ RS L KIIGL QVRFFQPDF PRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKII+LAERIAALP DER QIGP L ERL+HPKL+ ISVDG
Subjt:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG

Query:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME
        +D GSEGGA  G+SK+EEKKEKTAFDVKLEKF+AA+KIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEK+KAAGGVAVME
Subjt:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B3PW58 50S ribosomal protein L7/L121.3e-1443.75Show/hide
Query:  IIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDGLDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEK
        + ++ E +++L   E +++   L E+       P++V  +     GGAG  A+  EE  EKT FDV L     A+KI VIKEVR+ T LGLKEAKDLVE 
Subjt:  IIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDGLDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEK

Query:  VPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVA
         P  +K+GV+K EA DI +KL+ AG  A
Subjt:  VPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVA

O22386 50S ribosomal protein L12, chloroplastic7.7e-1540.77Show/hide
Query:  SNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERL--RHPKLQPISVDGLDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAK
        S K++EL + IA L  +E   +   L ERL        P +V      + G  GAGA+  E   EKT FDV +E+  ++++I  IK VR+ TNL LKEAK
Subjt:  SNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERL--RHPKLQPISVDGLDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAK

Query:  DLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAG
        DL+E +P  +K+GV+K+EA D  ++L+  G
Subjt:  DLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAG

P41189 50S ribosomal protein L7/L122.0e-1539.39Show/hide
Query:  NKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDGLDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLV
        + I  + E++++L   + +++   L E        P++V     G    A A         EKT F+V LE FDA  KI VIKEVR+ T LGLKEAKD V
Subjt:  NKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDGLDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLV

Query:  EKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVM
        E  P  LK GV+K+EA ++ +KL+AAG   ++
Subjt:  EKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVM

Q2JM48 50S ribosomal protein L7/L123.4e-1541.09Show/hide
Query:  PSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDGLDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKD
        PS ++ ++ E + AL   E S++   + E        P     +       A A A+  E  +E+TAFDV LE   A  KI ++K VR  T LGLK+AKD
Subjt:  PSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDGLDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKD

Query:  LVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAG
        LVE  P  +K+GV KEEANDI +KL+ AG
Subjt:  LVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAG

Q2S1Q4 50S ribosomal protein L7/L121.7e-1442.86Show/hide
Query:  IIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDGLDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEK
        I ELAE++  L   E +++   L E      +QP S  G+   ++GG GA     EE  E+TAFDV L      +KI+VIKEVRS T +GLKEAK LV++
Subjt:  IIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDGLDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEK

Query:  VPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGG
         P  + +GV++EEA+D+  +++ AGG
Subjt:  VPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70190.1 Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation;Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like1.5e-2644.23Show/hide
Query:  PPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDGLDTGSEGGAGAGAS---------KMEEKKEKTAFDVKLEKFDAAS
        P  +DP   R PP++++  L + I++L   E S++G  + ++    +L  ++V  +  G+ GG G G             E K EKT F++KLE F+A++
Subjt:  PPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDGLDTGSEGGAGAGAS---------KMEEKKEKTAFDVKLEKFDAAS

Query:  KIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME
        KIK+IKE+RSFT+LGLKEAK LVEK PAILK G++KEE   I+EKLKA G   V+E
Subjt:  KIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME

AT1G70190.2 Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation;Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like1.5e-2644.23Show/hide
Query:  PPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDGLDTGSEGGAGAGAS---------KMEEKKEKTAFDVKLEKFDAAS
        P  +DP   R PP++++  L + I++L   E S++G  + ++    +L  ++V  +  G+ GG G G             E K EKT F++KLE F+A++
Subjt:  PPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDGLDTGSEGGAGAGAS---------KMEEKKEKTAFDVKLEKFDAAS

Query:  KIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME
        KIK+IKE+RSFT+LGLKEAK LVEK PAILK G++KEE   I+EKLKA G   V+E
Subjt:  KIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME

AT3G06040.1 Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein5.8e-5864.58Show/hide
Query:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG
        +L  + R+++ R    ++I   QVRF Q D   +   AKPK+YKYP  YDPYGPRP PS+KI+ELAERIAAL  +ER QIGP L E LR PK Q IS DG
Subjt:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG

Query:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME
        +    + GAG     +EEKKEKTAFDVKLEKF+A+ KIKVIKEVR+FT+LGLKEAK+LVEKVPAILKQGVTKEEAN+II K+KA GG+AVME
Subjt:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME

AT3G06040.2 Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein5.8e-5864.58Show/hide
Query:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG
        +L  + R+++ R    ++I   QVRF Q D   +   AKPK+YKYP  YDPYGPRP PS+KI+ELAERIAAL  +ER QIGP L E LR PK Q IS DG
Subjt:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG

Query:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME
        +    + GAG     +EEKKEKTAFDVKLEKF+A+ KIKVIKEVR+FT+LGLKEAK+LVEKVPAILKQGVTKEEAN+II K+KA GG+AVME
Subjt:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME

AT3G06040.3 Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein5.8e-5864.58Show/hide
Query:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG
        +L  + R+++ R    ++I   QVRF Q D   +   AKPK+YKYP  YDPYGPRP PS+KI+ELAERIAAL  +ER QIGP L E LR PK Q IS DG
Subjt:  QLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDG

Query:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME
        +    + GAG     +EEKKEKTAFDVKLEKF+A+ KIKVIKEVR+FT+LGLKEAK+LVEKVPAILKQGVTKEEAN+II K+KA GG+AVME
Subjt:  LDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCGTTGGGTGCCCAAGCCTTTTCCACAAGGATTCTTGCGTTTTCGCTTCACTCTTCATTTCTGAAGTTCACGATATTGCAACTCTCCCTCTCTCTATTGGACTCCGC
CGTTCGCCGTCGAAGAGCTGGTTTTGCTGCCACTCACTTCTCTCAGCTGACTGTAGTTGCACGATCCCTTCAAGTCCGTTCCACACTTGCTAAAATAATTGGGTTGTCGC
AGGTCCGCTTCTTTCAGCCTGATTTTGCTCCCAGAGACCCAAATGCCAAGCCAAAAAGATACAAGTATCCACCATTTTATGATCCATATGGCCCTAGGCCCCCACCCTCT
AATAAAATCATTGAGCTTGCTGAAAGGATTGCAGCACTGCCTGCCGATGAGCGTTCCCAGATTGGTCCCACGCTTGGTGAAAGACTTAGACATCCTAAGCTGCAGCCAAT
TTCAGTGGATGGCTTGGACACGGGTTCCGAAGGAGGGGCAGGGGCAGGAGCTTCCAAGATGGAGGAGAAAAAAGAAAAAACTGCTTTCGATGTGAAGCTAGAGAAGTTTG
ACGCTGCTTCAAAAATTAAGGTGATTAAAGAAGTAAGGTCTTTCACTAATCTGGGTCTGAAGGAGGCAAAAGACTTGGTAGAGAAAGTACCTGCAATTCTTAAGCAAGGG
GTGACCAAGGAGGAAGCAAATGACATCATTGAAAAACTCAAAGCTGCTGGAGGAGTTGCTGTGATGGAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTGCGATTTTCAAACCATTCGAACCTGAATGCCGTTGGGTGCCCAAGCCTTTTCCACAAGGATTCTTGCGTTTTCGCTTCACTCTTCATTTCTGAAGTTCACGATATTGC
AACTCTCCCTCTCTCTATTGGACTCCGCCGTTCGCCGTCGAAGAGCTGGTTTTGCTGCCACTCACTTCTCTCAGCTGACTGTAGTTGCACGATCCCTTCAAGTCCGTTCC
ACACTTGCTAAAATAATTGGGTTGTCGCAGGTCCGCTTCTTTCAGCCTGATTTTGCTCCCAGAGACCCAAATGCCAAGCCAAAAAGATACAAGTATCCACCATTTTATGA
TCCATATGGCCCTAGGCCCCCACCCTCTAATAAAATCATTGAGCTTGCTGAAAGGATTGCAGCACTGCCTGCCGATGAGCGTTCCCAGATTGGTCCCACGCTTGGTGAAA
GACTTAGACATCCTAAGCTGCAGCCAATTTCAGTGGATGGCTTGGACACGGGTTCCGAAGGAGGGGCAGGGGCAGGAGCTTCCAAGATGGAGGAGAAAAAAGAAAAAACT
GCTTTCGATGTGAAGCTAGAGAAGTTTGACGCTGCTTCAAAAATTAAGGTGATTAAAGAAGTAAGGTCTTTCACTAATCTGGGTCTGAAGGAGGCAAAAGACTTGGTAGA
GAAAGTACCTGCAATTCTTAAGCAAGGGGTGACCAAGGAGGAAGCAAATGACATCATTGAAAAACTCAAAGCTGCTGGAGGAGTTGCTGTGATGGAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPLGAQAFSTRILAFSLHSSFLKFTILQLSLSLLDSAVRRRRAGFAATHFSQLTVVARSLQVRSTLAKIIGLSQVRFFQPDFAPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPS
NKIIELAERIAALPADERSQIGPTLGERLRHPKLQPISVDGLDTGSEGGAGAGASKMEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQG
VTKEEANDIIEKLKAAGGVAVME