; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc07G00570 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc07G00570
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionTryptophan synthase
Genome locationClcChr07:590651..596419
RNA-Seq ExpressionClc07G00570
SyntenyClc07G00570
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004834 - tryptophan synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002028 - Tryptophan synthase, alpha chain
IPR011060 - Ribulose-phosphate binding barrel
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR018204 - Tryptophan synthase, alpha chain, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057418.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]8.2e-15592.21Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVP
        MD   NSSRL  FNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKR VPMA+LTAS AVGLSETFSKLK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE-VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNS
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFM+TIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIEL   
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE-VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNS

Query:  FAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ
             VLLTTPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVS KVQ LLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ
Subjt:  FAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ

Query:  SPEEGLKALENFTKSLKSALS
        SPEEGLKALENFTKSLKSALS
Subjt:  SPEEGLKALENFTKSLKSALS

XP_004145375.1 tryptophan synthase alpha chain isoform X1 [Cucumis sativus]1.6e-15592.48Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVP
        MDI  NSSRL  FNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKR VPMA+LTAS AVGLSETFSKLK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSF
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFM+TIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKH+IEL    
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSF

Query:  AHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS
            VLLTTPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVS KVQ LLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS
Subjt:  AHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS

Query:  PEEGLKALENFTKSLKSAL
        PEEGLKALENFTKSL SAL
Subjt:  PEEGLKALENFTKSLKSAL

XP_008449352.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo]3.3e-15692.5Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVP
        MD   NSSRL  FNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKR VPMA+LTAS AVGLSETFSKLK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSF
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFM+TIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIEL    
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSF

Query:  AHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS
            VLLTTPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVS KVQ LLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS
Subjt:  AHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS

Query:  PEEGLKALENFTKSLKSALS
        PEEGLKALENFTKSLKSALS
Subjt:  PEEGLKALENFTKSLKSALS

XP_022145935.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Momordica charantia]1.5e-15390.65Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTT-LIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MDIAFNSSRLL FNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KRF PMAA+TAS AVGLSETF+KLK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTT-LIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNS
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFMMTIKDAGV+GLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IEL   
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNS

Query:  FAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ
             VLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVS +VQ LLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSA+VKLLGEA+
Subjt:  FAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ

Query:  SPEEGLKALENFTKSLKSALS
        SPEEGLK LENFTKSLKSALS
Subjt:  SPEEGLKALENFTKSLKSALS

XP_038888258.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Benincasa hispida]2.1e-15893.44Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVP
        MDI+FNSSRLL FNKIPTTLIFP HPCKISVFQ+KRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST+GSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSF
        YSDPLADGPVIQAAATRSLA GTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMM IKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIEL    
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSF

Query:  AHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS
            VLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGAR SV++KVQ LLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS
Subjt:  AHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS

Query:  PEEGLKALENFTKSLKSALS
        PEEGLKALENFTK+LKSALS
Subjt:  PEEGLKALENFTKSLKSALS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKV4 Tryptophan synthase8.0e-15692.48Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVP
        MDI  NSSRL  FNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKR VPMA+LTAS AVGLSETFSKLK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSF
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFM+TIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKH+IEL    
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSF

Query:  AHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS
            VLLTTPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVS KVQ LLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS
Subjt:  AHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS

Query:  PEEGLKALENFTKSLKSAL
        PEEGLKALENFTKSL SAL
Subjt:  PEEGLKALENFTKSLKSAL

A0A1S3BMG6 Tryptophan synthase1.6e-15692.5Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVP
        MD   NSSRL  FNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKR VPMA+LTAS AVGLSETFSKLK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSF
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFM+TIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIEL    
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSF

Query:  AHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS
            VLLTTPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVS KVQ LLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS
Subjt:  AHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS

Query:  PEEGLKALENFTKSLKSALS
        PEEGLKALENFTKSLKSALS
Subjt:  PEEGLKALENFTKSLKSALS

A0A5A7UQL8 Tryptophan synthase4.0e-15592.21Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVP
        MD   NSSRL  FNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKR VPMA+LTAS AVGLSETFSKLK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE-VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNS
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFM+TIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIEL   
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE-VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNS

Query:  FAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ
             VLLTTPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVS KVQ LLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ
Subjt:  FAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ

Query:  SPEEGLKALENFTKSLKSALS
        SPEEGLKALENFTKSLKSALS
Subjt:  SPEEGLKALENFTKSLKSALS

A0A5D3E1Z9 Tryptophan synthase1.6e-15692.5Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVP
        MD   NSSRL  FNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKR VPMA+LTAS AVGLSETFSKLK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSF
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFM+TIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIEL    
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSF

Query:  AHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS
            VLLTTPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVS KVQ LLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS
Subjt:  AHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQS

Query:  PEEGLKALENFTKSLKSALS
        PEEGLKALENFTKSLKSALS
Subjt:  PEEGLKALENFTKSLKSALS

A0A6J1CVV7 Tryptophan synthase7.5e-15490.65Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTT-LIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MDIAFNSSRLL FNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KRF PMAA+TAS AVGLSETF+KLK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLPFNKIPTT-LIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNS
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFMMTIKDAGV+GLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IEL   
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNS

Query:  FAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ
             VLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVS +VQ LLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSA+VKLLGEA+
Subjt:  FAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ

Query:  SPEEGLKALENFTKSLKSALS
        SPEEGLK LENFTKSLKSALS
Subjt:  SPEEGLKALENFTKSLKSALS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B7JUK2 Tryptophan synthase alpha chain2.4e-7755.39Show/hide
Query:  LSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN
        +S+ F  L+ + + A IP+ITAGDPDL TTA+AL++L   G+D+IELGVPYSDPLADGPVIQAAATR+L RG     ++ ++KEV PE+  PI LF+YYN
Subjt:  LSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN

Query:  PILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQIL
        PI  RG+  F+  +K AGV+GLVVPD+PLEE E L K A  H + +         LL  PT+P +R++AI   S+GF+YLVS  GVTG R+ V+ +V+ L
Subjt:  PILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQIL

Query:  LEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        L  ++  T+KP+ VGFGISKPEH  QV +WGAD +IVGSAMVK L E  +PEEGLKA+  F + LK AL
Subjt:  LEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

O22765 Tryptophan synthase alpha chain2.7e-11678.62Show/hide
Query:  TASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI
        T S  VGLSETF++LK QGKVA IPYITAGDPDLSTTA+ALKVL + GSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL +GTNF++IISMLKEVIP+LSCPI
Subjt:  TASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI

Query:  ALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASV
        ALF+YYNPIL+RG+ N+M  IK+AGV GL+VPDVPLEETE LR EA KH IEL        VLLTTPTTPK+RM AIVEASEGF+YLVSSVGVTG R SV
Subjt:  ALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASV

Query:  SEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        +EKVQ LL++IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSAMVK+LGE++SPE+GLK LE FTKSLKSAL
Subjt:  SEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

P42390 Indole-3-glycerol phosphate lyase, chloroplastic5.4e-8558.74Show/hide
Query:  LSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN
        +S+T + L  +GK AFIPYITAGDPDL+TTAEAL++L   G+D+IELGVP SDP  DGP+IQA+  R+LA GT   A++ ML+EV PELSCP+ L SYY 
Subjt:  LSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN

Query:  PILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQIL
        PI+ R +      +K+AGV GL+VPD+P      L  EA  +N+EL        VLLTTP  P+DRMK I +ASEGFVYLVS  GVTG RA+V+ +V+ L
Subjt:  PILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQIL

Query:  LEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        ++E+K+VT KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+I+GSAMV+ LGEA SP++GL+ LE + + +K+AL
Subjt:  LEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

Q10W95 Tryptophan synthase alpha chain1.9e-7755.31Show/hide
Query:  VGLSETFSKLK-QQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFS
        + +S+ F  L+    + A IP+ITAGDPDL TTA+AL+VL   G+++IELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSL RGT   +++ +++ V P+L  PI LF+
Subjt:  VGLSETFSKLK-QQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFS

Query:  YYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKV
        YYNPIL RG+ NF+  I D G RGLVVPD+PLEE +IL + A    IEL         LL  PT+PK+R+KAI   S+GF+YLVS  GVTG RA +  +V
Subjt:  YYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKV

Query:  QILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSALS
        + LL +++EVT+KP+ VGFGIS+PE   QV  WG+D +IVGSA+VK L E  SP+EGLKA+  F ++LK+A++
Subjt:  QILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSALS

Q42529 Tryptophan synthase alpha chain, chloroplastic3.2e-11775.52Show/hide
Query:  KRFVPMAAL-TASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLK
        KRF PMA+L T+SP +GL++TF++LK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVL   GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSL RGTN  +I+ ML 
Subjt:  KRFVPMAAL-TASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLK

Query:  EVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSS
        +V+P++SCPI+LF+YYNPILKRG+G FM +I+  GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+ ++IEL        VLLTTPTTP +RMK IV+ASEGF+YLVSS
Subjt:  EVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSS

Query:  VGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        +GVTGAR+SVS KVQ LL++IKE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+IVGSAMVKLLG+A+SP EGLK LE  TKSLKSAL
Subjt:  VGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54640.1 tryptophan synthase alpha chain2.2e-11875.52Show/hide
Query:  KRFVPMAAL-TASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLK
        KRF PMA+L T+SP +GL++TF++LK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVL   GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSL RGTN  +I+ ML 
Subjt:  KRFVPMAAL-TASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLK

Query:  EVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSS
        +V+P++SCPI+LF+YYNPILKRG+G FM +I+  GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+ ++IEL        VLLTTPTTP +RMK IV+ASEGF+YLVSS
Subjt:  EVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSS

Query:  VGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        +GVTGAR+SVS KVQ LL++IKE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+IVGSAMVKLLG+A+SP EGLK LE  TKSLKSAL
Subjt:  VGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

AT4G02610.1 Aldolase-type TIM barrel family protein1.9e-11778.62Show/hide
Query:  TASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI
        T S  VGLSETF++LK QGKVA IPYITAGDPDLSTTA+ALKVL + GSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL +GTNF++IISMLKEVIP+LSCPI
Subjt:  TASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI

Query:  ALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASV
        ALF+YYNPIL+RG+ N+M  IK+AGV GL+VPDVPLEETE LR EA KH IEL        VLLTTPTTPK+RM AIVEASEGF+YLVSSVGVTG R SV
Subjt:  ALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFAHMAVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASV

Query:  SEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        +EKVQ LL++IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSAMVK+LGE++SPE+GLK LE FTKSLKSAL
Subjt:  SEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACATTGCTTTCAATTCTTCGAGGTTACTTCCATTCAACAAGATACCCACTACCCTTATCTTTCCCCCTCATCCTTGTAAGATTTCAGTCTTCCAATCCAAGCGGTT
TGTTCCAATGGCTGCCCTTACAGCCTCCCCTGCTGTAGGACTGTCCGAAACATTCAGCAAATTGAAGCAACAAGGCAAGGTCGCATTTATCCCCTACATCACTGCTGGTG
ATCCTGATCTTTCCACCACGGCTGAAGCCCTGAAGGTGCTTTCCACTTATGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCGTATTCAGATCCCTTGGCAGATGGTCCTGTT
ATACAGGCTGCGGCTACTCGGTCCTTGGCTAGGGGTACAAACTTTAGTGCAATAATTTCTATGCTGAAGGAGGTTATTCCTGAACTGTCTTGCCCAATTGCCCTTTTTTC
ATACTATAACCCAATTCTTAAGCGTGGCATTGGGAACTTCATGATGACAATAAAAGATGCTGGTGTACGAGGGCTTGTTGTTCCGGATGTTCCTCTTGAGGAGACTGAAA
TTTTGAGAAAAGAAGCTGTAAAGCACAATATTGAGCTGGTGAATTCCTTCGCTCATATGGCTGTACTCTTAACTACACCAACCACGCCTAAAGATAGGATGAAAGCCATC
GTTGAAGCTTCAGAGGGATTTGTATATCTTGTGAGCTCTGTTGGAGTTACTGGCGCCCGTGCATCAGTAAGTGAGAAAGTTCAAATTCTCCTTGAGGAAATCAAAGAGGT
AACGGAAAAACCAGTGGCAGTAGGTTTCGGTATATCAAAACCGGAGCACGTGAAACAGGTGGCTAGCTGGGGGGCTGATGGTATCATAGTTGGTAGTGCTATGGTGAAGC
TGTTGGGTGAAGCCCAGTCTCCTGAAGAAGGATTGAAGGCACTTGAAAACTTCACCAAATCCTTAAAATCTGCACTGTCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAAAACGAGTAAAACCAACAAAAAGTGAACATACAAAAAGTATTGAGCCGCCAAAATTTCTCCTCAGGTTTCTTGTAAGCCCTCGAGACAAATCAGCAGAACAGTG
GCTATGGAATCGCCGTAAGTTCAATTCCGGACAAACCAAGGACGGCCCAATAGAGCTCCCTTCCCCTTTTGATTATCGCTGTCATTGAAAATCGAAACTGAACTTCTCAG
GTTCAATATAAGTGAACTCCCGACCTTCGTTTAGCTCCAAATGGACATTGCTTTCAATTCTTCGAGGTTACTTCCATTCAACAAGATACCCACTACCCTTATCTTTCCCC
CTCATCCTTGTAAGATTTCAGTCTTCCAATCCAAGCGGTTTGTTCCAATGGCTGCCCTTACAGCCTCCCCTGCTGTAGGACTGTCCGAAACATTCAGCAAATTGAAGCAA
CAAGGCAAGGTCGCATTTATCCCCTACATCACTGCTGGTGATCCTGATCTTTCCACCACGGCTGAAGCCCTGAAGGTGCTTTCCACTTATGGATCAGATATAATTGAACT
TGGTGTTCCGTATTCAGATCCCTTGGCAGATGGTCCTGTTATACAGGCTGCGGCTACTCGGTCCTTGGCTAGGGGTACAAACTTTAGTGCAATAATTTCTATGCTGAAGG
AGGTTATTCCTGAACTGTCTTGCCCAATTGCCCTTTTTTCATACTATAACCCAATTCTTAAGCGTGGCATTGGGAACTTCATGATGACAATAAAAGATGCTGGTGTACGA
GGGCTTGTTGTTCCGGATGTTCCTCTTGAGGAGACTGAAATTTTGAGAAAAGAAGCTGTAAAGCACAATATTGAGCTGGTGAATTCCTTCGCTCATATGGCTGTACTCTT
AACTACACCAACCACGCCTAAAGATAGGATGAAAGCCATCGTTGAAGCTTCAGAGGGATTTGTATATCTTGTGAGCTCTGTTGGAGTTACTGGCGCCCGTGCATCAGTAA
GTGAGAAAGTTCAAATTCTCCTTGAGGAAATCAAAGAGGTAACGGAAAAACCAGTGGCAGTAGGTTTCGGTATATCAAAACCGGAGCACGTGAAACAGGTGGCTAGCTGG
GGGGCTGATGGTATCATAGTTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCCAGTCTCCTGAAGAAGGATTGAAGGCACTTGAAAACTTCACCAAATCCTTAAAATC
TGCACTGTCGTAATAAATTTTGATGGTATAACTCAGGCTGTTCCTTTCATTTGTAAACAAGAGATCAACTAAGCCTGCTAGTGGTTAACAGCCATCTTTGAAAGATTTCT
TTGTTCCTTTTAAAATAATAAGACTGTTAGTTTATATTATCATGAGAATATTTTCTAGATTTTTCTTGGTAATCACTGGATGATGATTAAGAGAATAATATTTCAAAGCT
TTAATGCATAATCATTGTCAATGAGGCCCAACTGCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDIAFNSSRLLPFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRFVPMAALTASPAVGLSETFSKLKQQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPV
IQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFAHMAVLLTTPTTPKDRMKAI
VEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSEKVQILLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSALS