; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc07G00640 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc07G00640
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionhistone H1
Genome locationClcChr07:667925..668850
RNA-Seq ExpressionClc07G00640
SyntenyClc07G00640
Gene Ontology termsGO:0006334 - nucleosome assembly (biological process)
GO:0016584 - nucleosome positioning (biological process)
GO:0030261 - chromosome condensation (biological process)
GO:0045910 - negative regulation of DNA recombination (biological process)
GO:0000786 - nucleosome (cellular component)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003690 - double-stranded DNA binding (molecular function)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
GO:0031492 - nucleosomal DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR005818 - Linker histone H1/H5, domain H15
IPR005819 - Linker histone H1/H5
IPR036388 - Winged helix-like DNA-binding domain superfamily
IPR036390 - Winged helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057394.1 histone H1 [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-10993.38Show/hide
Query:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL
        MATEEPVVPVESAAEP N EQAEENP NKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKK+L
Subjt:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPA+PAKKKPVAAKPK KAVAKPKAVAKS AKPKAAAKPKPKT AKPKAAPKPK AP KSKSSAVAKPKA
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA

Query:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK
        A KTKAA KPKAKEKPAK ARTSTRTSPGRKAPAPKP VKKAPAAKKAP+KSVKAKKVKS AKKAP+KRG K
Subjt:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK

XP_004140078.1 histone H1 [Cucumis sativus]2.0e-10690.81Show/hide
Query:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL
        MATEEPVVPVESAAEP N EQAEENPANK+ +SKKSKEPK+KKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLP NFKK+L
Subjt:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA
        LFHLKKLV SGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPA+PAKKKPVAAKPK K VAKPKAVAKS AKPKAAAKPKPK   KPKAAPKPK APAKSKSSAVAKPKA
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA

Query:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK
        A KTKAA KPKAKEKPAK ARTSTRTSPGRKAPAPKP VKKAPAAKKAP+KSVKAKKVKS AKK+PAKRG K
Subjt:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK

XP_008449373.1 PREDICTED: histone H1 [Cucumis melo]1.5e-10993.38Show/hide
Query:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL
        MATEEPVVPVESAAEP N EQAEENP NKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKK+L
Subjt:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPA+PAKKKPVAAKPK KAVAKPKAVAKS AKPKAAAKPKPKT AKPKAAPKPK AP KSKSSAVAKPKA
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA

Query:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK
        A KTKAA KPKAKEKPAK ARTSTRTSPGRKAPAPKP VKKAPAAKKAP+KSVKAKKVKS AKKAP+KRG K
Subjt:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK

XP_022145924.1 histone H1 [Momordica charantia]3.1e-11093.38Show/hide
Query:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL
        MATEEPVVPVESAAEP + E AEENP NKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMI DAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQK LPSNFKK+L
Subjt:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKP +PAKKKP AAKPKPKA AK KAVAKS AKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA

Query:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK
        ATKTKAA KPKAKEKPAKVARTSTRTSPGR+APAPKPA KKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRG+K
Subjt:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK

XP_038888055.1 histone H1-like [Benincasa hispida]4.4e-10993.75Show/hide
Query:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL
        MATEEPVVPVESAAEP+N EQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAA +K RNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEK+KQLP NFKKIL
Subjt:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA
        LFHLKKLVASGKLVKVK+SFKLKPAKSA+VKPAAPAKKKPVAAKPK KAVAKPKAVAKS AKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPA AKSKSSAVAKPKA
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA

Query:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK
        A KTKAA KPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKA A KKAPAKSVKAKKVKSPAKKA AKRGRK
Subjt:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KDR2 H15 domain-containing protein9.9e-10790.81Show/hide
Query:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL
        MATEEPVVPVESAAEP N EQAEENPANK+ +SKKSKEPK+KKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLP NFKK+L
Subjt:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA
        LFHLKKLV SGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPA+PAKKKPVAAKPK K VAKPKAVAKS AKPKAAAKPKPK   KPKAAPKPK APAKSKSSAVAKPKA
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA

Query:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK
        A KTKAA KPKAKEKPAK ARTSTRTSPGRKAPAPKP VKKAPAAKKAP+KSVKAKKVKS AKK+PAKRG K
Subjt:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK

A0A1S3BL93 histone H17.3e-11093.38Show/hide
Query:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL
        MATEEPVVPVESAAEP N EQAEENP NKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKK+L
Subjt:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPA+PAKKKPVAAKPK KAVAKPKAVAKS AKPKAAAKPKPKT AKPKAAPKPK AP KSKSSAVAKPKA
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA

Query:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK
        A KTKAA KPKAKEKPAK ARTSTRTSPGRKAPAPKP VKKAPAAKKAP+KSVKAKKVKS AKKAP+KRG K
Subjt:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK

A0A5A7UQL0 Histone H17.3e-11093.38Show/hide
Query:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL
        MATEEPVVPVESAAEP N EQAEENP NKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKK+L
Subjt:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPA+PAKKKPVAAKPK KAVAKPKAVAKS AKPKAAAKPKPKT AKPKAAPKPK AP KSKSSAVAKPKA
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA

Query:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK
        A KTKAA KPKAKEKPAK ARTSTRTSPGRKAPAPKP VKKAPAAKKAP+KSVKAKKVKS AKKAP+KRG K
Subjt:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK

A0A6J1CWP2 histone H11.5e-11093.38Show/hide
Query:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL
        MATEEPVVPVESAAEP + E AEENP NKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMI DAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQK LPSNFKK+L
Subjt:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKP +PAKKKP AAKPKPKA AK KAVAKS AKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA

Query:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK
        ATKTKAA KPKAKEKPAKVARTSTRTSPGR+APAPKPA KKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRG+K
Subjt:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK

A0A6J1ES19 histone H11.5e-10288.6Show/hide
Query:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL
        MATEEPVVPVESAAEP N E AEENPANKAAKSKKSK+PKEKKPAA RK RNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKK+L
Subjt:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKIL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLK AKSA+VKPA+PA K+P AAKPKPKA AK KAVAKS+AKPKAAAKPKPKTAAKPKAA KPKP  AKSKSS VAKPKA
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKA

Query:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK
        A+KTKAA KPKAKEKPAK +RTSTRTSPG+KAPAPKPAVKKAPA+KKAPAKSV AKKVKSPA+KAPA+R +K
Subjt:  ATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P08283 Histone H11.7e-4758.36Show/hide
Query:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQA---------EENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQ
        MATEEP+V VE+  EP  TE           +E P  +  K+KK+K  K KK +   KPRNP +HP YEEMIKDAIV+LKE+ GSSQYAI KFIEEKQKQ
Subjt:  MATEEPVVPVESAAEPNNTEQA---------EENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQ

Query:  LPSNFKKILLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAV-AKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKA-APKPKPAPAK
        LP+NFKK+LL +LKK VASGKL+KVK SFKL           + A KKP  AKPK K  AK K+V AK AAKPKA A  KPK A+K KA A KPK A AK
Subjt:  LPSNFKKILLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAV-AKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKA-APKPKPAPAK

Query:  SKSSAVAKPKAATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRG
         K+ A      A K KA  KPK+K KPAKVA+TS +T+PG+K      AVKK  AAKK P KSVKAK VKSP KK   KRG
Subjt:  SKSSAVAKPKAATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRG

P26568 Histone H1.15.9e-3251.15Show/hide
Query:  SAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKP-AAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKILLFHLKKLVAS
        +A  P      E+ PA K  K+K  KE KEKK  AA  K R   +HP YEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAI KFIEEK+K+LP  F+K+LL +LK+LVAS
Subjt:  SAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKP-AAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKILLFHLKKLVAS

Query:  GKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKK-PVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKAATKTKAASK
        GKLVKVK+SFKL  A +    P A A+K  P   KP   AV K K    +A+K K     KPKTAA  K   K K  P    ++A  K KA       +K
Subjt:  GKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKK-PVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKAATKTKAASK

Query:  PKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKS-VKAKKVKSPAKKAPAK
        PKAK +PAK A+T+  TSP +KA A    V      KK P K  VK K VKSPAK+A ++
Subjt:  PKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKS-VKAKKVKSPAKKAPAK

P26569 Histone H1.21.3e-4257.34Show/hide
Query:  MATEEPVVP--VESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPK-EKKP---AAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPS
        M+ EE  VP  V+S A     +  E+ PA K  KSKK+   K  KKP   AAP K +   +HP YEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAI KFIEEK K LP 
Subjt:  MATEEPVVP--VESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPK-EKKP---AAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPS

Query:  NFKKILLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVV-KPAAPAKKK-PVAAKPKPK-----AVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAP
         F+K+LL +LK+LVAS KLVKVK+SFK+  A+SA   KPAAP KKK  V AKPK K     A AK KA AK   KP A    K K  AKPKA    K   
Subjt:  NFKKILLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVV-KPAAPAKKK-PVAAKPKPK-----AVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAP

Query:  AKSKSSAVAKPKAATKTKA-ASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK
        AK KS +VA   A +KTKA A+KPKAKE+PAK +RTSTRTSPG+K  AP    KK    KKAPAKSV   KVKSPAK+A  ++ +K
Subjt:  AKSKSSAVAKPKAATKTKA-ASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK

P37218 Histone H13.1e-4961.95Show/hide
Query:  MATEEPVV---PVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFK
        MATEEPV+    VE  A P  T + E NP  K+ K+K  KE K KKPAAPRK    PTHPPY EMIKDAIVTLKERTGSSQ+AITKFIEEKQK LPSNFK
Subjt:  MATEEPVV---PVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFK

Query:  KILLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKP--------KAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKP----KTAAKPKAAPKPKP
        K+LL  LKK VAS KLVKVK+S+KL P+ S     A PAKKKP AAK KP        K  AKP A AK AAK K AAK KP    K AAK K A K KP
Subjt:  KILLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKP--------KAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKP----KTAAKPKAAPKPKP

Query:  -APAKSKSSAVAKPKAA-------TKTKAASKP--KAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK
         A AK K++A AKPKAA        KTKAA KP  KAK   AKVA+T+TRT+P RKA AP     KA  AKK P K   AK VKSPAKKA  KRGRK
Subjt:  -APAKSKSSAVAKPKAA-------TKTKAASKP--KAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK

Q9M5W4 Histone H11.2e-2953.06Show/hide
Query:  PVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPA-APRKPRNPPT--HPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKILLFHLK
        PV +   P  TE+     + +  K+   K PKEKK   A +KP++  T  HP + EMI DAI TLKERTGSSQYAI KF+E+K KQLPSNF+K+LLFHLK
Subjt:  PVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPA-APRKPRNPPT--HPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKILLFHLK

Query:  KLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKAATKTK
        KLVASGKLVKVK+SFKL  A++A   PA    KKP    PKPK  AKPK  AK  AKPKA AK   KT A  K   K  PA         AKPKA    K
Subjt:  KLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKAATKTK

Query:  AASKPK-AKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVK--KAPAAKK
         A KPK    KPAKVA+T+   SPG+K   P   VK  K+PA K+
Subjt:  AASKPK-AKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVK--KAPAAKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06760.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein4.2e-3351.15Show/hide
Query:  SAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKP-AAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKILLFHLKKLVAS
        +A  P      E+ PA K  K+K  KE KEKK  AA  K R   +HP YEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAI KFIEEK+K+LP  F+K+LL +LK+LVAS
Subjt:  SAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKP-AAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKILLFHLKKLVAS

Query:  GKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKK-PVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKAATKTKAASK
        GKLVKVK+SFKL  A +    P A A+K  P   KP   AV K K    +A+K K     KPKTAA  K   K K  P    ++A  K KA       +K
Subjt:  GKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKK-PVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKAATKTKAASK

Query:  PKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKS-VKAKKVKSPAKKAPAK
        PKAK +PAK A+T+  TSP +KA A    V      KK P K  VK K VKSPAK+A ++
Subjt:  PKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKS-VKAKKVKSPAKKAPAK

AT2G18050.1 histone H1-34.2e-0940.48Show/hide
Query:  KKPAAPRKPRNP--PTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQ-LPSNFKKILLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKK
        KK  A +KPR P   THPPY +MIK+A++ LKE+ GSS YAI K IEEK K  LP +F+K L   LK  VA GKLVK+++S+KL      + +      K
Subjt:  KKPAAPRKPRNP--PTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQ-LPSNFKKILLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKK

Query:  KPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKAATKTKA
        K +  K + K + K +  + S    K  +  K +   K K A +P     KS  S+V K KA   + A
Subjt:  KPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKAATKTKA

AT2G18050.2 histone H1-31.8e-0438.36Show/hide
Query:  MIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQ-LPSNFKKILLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSA
        MIK+A++ LKE+ GSS YAI K IEEK K  LP +F+K L   LK  VA GKLVK+++S+KL      + +      KK +  K + K + K +  + S 
Subjt:  MIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQ-LPSNFKKILLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSA

Query:  AKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKAATKTKA
           K  +  K +   K K A +P     KS  S+V K KA   + A
Subjt:  AKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKAATKTKA

AT2G30620.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein9.0e-4457.34Show/hide
Query:  MATEEPVVP--VESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPK-EKKP---AAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPS
        M+ EE  VP  V+S A     +  E+ PA K  KSKK+   K  KKP   AAP K +   +HP YEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAI KFIEEK K LP 
Subjt:  MATEEPVVP--VESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPK-EKKP---AAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPS

Query:  NFKKILLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVV-KPAAPAKKK-PVAAKPKPK-----AVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAP
         F+K+LL +LK+LVAS KLVKVK+SFK+  A+SA   KPAAP KKK  V AKPK K     A AK KA AK   KP A    K K  AKPKA    K   
Subjt:  NFKKILLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVV-KPAAPAKKK-PVAAKPKPK-----AVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAP

Query:  AKSKSSAVAKPKAATKTKA-ASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK
        AK KS +VA   A +KTKA A+KPKAKE+PAK +RTSTRTSPG+K  AP    KK    KKAPAKSV   KVKSPAK+A  ++ +K
Subjt:  AKSKSSAVAKPKAATKTKA-ASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK

AT2G30620.2 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein3.7e-2944.96Show/hide
Query:  MATEEPVVP--VESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPK-EKKP---AAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPS
        M+ EE  VP  V+S A     +  E+ PA K  KSKK+   K  KKP   AAP K +   +HP YEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAI KFIEEK K LP 
Subjt:  MATEEPVVP--VESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPK-EKKP---AAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPS

Query:  NFKKILLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSA
         F+K+LL +LK+LVAS KLVKVK+SFK+  A+SA                                                  A PKP  AP K K++ 
Subjt:  NFKKILLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSA

Query:  VAKPKAATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK
        VAKPKA                   +RTSTRTSPG+K  AP    KK    KKAPAKSV   KVKSPAK+A  ++ +K
Subjt:  VAKPKAATKTKAASKPKAKEKPAKVARTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTACTGAAGAACCGGTGGTGCCGGTGGAGTCGGCGGCAGAGCCGAACAACACCGAACAAGCGGAAGAAAATCCGGCGAACAAGGCTGCGAAGTCTAAGAAGTCCAA
AGAACCTAAAGAGAAGAAACCTGCTGCTCCTAGGAAACCTAGAAATCCCCCAACTCATCCTCCATATGAAGAGATGATTAAGGATGCGATTGTTACGTTGAAGGAGAGGA
CTGGTTCGAGTCAGTATGCGATCACTAAGTTTATTGAGGAGAAGCAAAAGCAACTTCCATCGAACTTTAAGAAGATTTTGTTATTCCATTTGAAGAAACTTGTGGCTTCC
GGGAAGTTGGTGAAGGTTAAGAGCTCGTTCAAGCTTAAACCAGCGAAGTCGGCAGTTGTGAAACCTGCTGCTCCTGCGAAGAAGAAACCCGTAGCTGCTAAGCCGAAGCC
TAAAGCCGTGGCTAAGCCCAAGGCTGTGGCTAAATCTGCTGCGAAGCCGAAAGCAGCTGCAAAGCCAAAGCCAAAGACGGCTGCCAAACCCAAAGCTGCTCCTAAACCTA
AACCTGCTCCAGCTAAGTCAAAGAGCAGTGCTGTTGCGAAGCCCAAAGCTGCAACAAAGACTAAAGCCGCTTCCAAGCCGAAAGCCAAGGAAAAGCCTGCCAAGGTTGCG
AGGACATCGACGAGAACCTCACCAGGAAGGAAGGCACCGGCGCCGAAACCGGCGGTGAAGAAAGCGCCGGCAGCCAAGAAGGCTCCGGCGAAAAGTGTCAAGGCTAAGAA
AGTGAAATCTCCGGCGAAAAAGGCTCCCGCTAAAAGAGGAAGGAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTACTGAAGAACCGGTGGTGCCGGTGGAGTCGGCGGCAGAGCCGAACAACACCGAACAAGCGGAAGAAAATCCGGCGAACAAGGCTGCGAAGTCTAAGAAGTCCAA
AGAACCTAAAGAGAAGAAACCTGCTGCTCCTAGGAAACCTAGAAATCCCCCAACTCATCCTCCATATGAAGAGATGATTAAGGATGCGATTGTTACGTTGAAGGAGAGGA
CTGGTTCGAGTCAGTATGCGATCACTAAGTTTATTGAGGAGAAGCAAAAGCAACTTCCATCGAACTTTAAGAAGATTTTGTTATTCCATTTGAAGAAACTTGTGGCTTCC
GGGAAGTTGGTGAAGGTTAAGAGCTCGTTCAAGCTTAAACCAGCGAAGTCGGCAGTTGTGAAACCTGCTGCTCCTGCGAAGAAGAAACCCGTAGCTGCTAAGCCGAAGCC
TAAAGCCGTGGCTAAGCCCAAGGCTGTGGCTAAATCTGCTGCGAAGCCGAAAGCAGCTGCAAAGCCAAAGCCAAAGACGGCTGCCAAACCCAAAGCTGCTCCTAAACCTA
AACCTGCTCCAGCTAAGTCAAAGAGCAGTGCTGTTGCGAAGCCCAAAGCTGCAACAAAGACTAAAGCCGCTTCCAAGCCGAAAGCCAAGGAAAAGCCTGCCAAGGTTGCG
AGGACATCGACGAGAACCTCACCAGGAAGGAAGGCACCGGCGCCGAAACCGGCGGTGAAGAAAGCGCCGGCAGCCAAGAAGGCTCCGGCGAAAAGTGTCAAGGCTAAGAA
AGTGAAATCTCCGGCGAAAAAGGCTCCCGCTAAAAGAGGAAGGAAGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATEEPVVPVESAAEPNNTEQAEENPANKAAKSKKSKEPKEKKPAAPRKPRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPSNFKKILLFHLKKLVAS
GKLVKVKSSFKLKPAKSAVVKPAAPAKKKPVAAKPKPKAVAKPKAVAKSAAKPKAAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPAPAKSKSSAVAKPKAATKTKAASKPKAKEKPAKVA
RTSTRTSPGRKAPAPKPAVKKAPAAKKAPAKSVKAKKVKSPAKKAPAKRGRK