; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc07G01870 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc07G01870
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionCyclin-dependent kinase inhibitor
Genome locationClcChr07:1938559..1942476
RNA-Seq ExpressionClc07G01870
SyntenyClc07G01870
Gene Ontology termsGO:0045736 - negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity (biological process)
GO:0005654 - nucleoplasm (cellular component)
GO:0004861 - cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003175 - Cyclin-dependent kinase inhibitor domain
IPR044275 - Cyclin-dependent kinase inhibitor, plant
IPR044898 - Cyclin-dependent kinase inhibitor domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606319.1 Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.6e-8376.37Show/hide
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XP_004144379.2 cyclin-dependent kinase inhibitor 3 [Cucumis sativus]2.0e-8175.32Show/hide
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XP_022931099.1 cyclin-dependent kinase inhibitor 3-like [Cucurbita moschata]9.8e-8174.68Show/hide
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XP_023533323.1 cyclin-dependent kinase inhibitor 3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-8175.11Show/hide
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XP_038888693.1 cyclin-dependent kinase inhibitor 3-like [Benincasa hispida]9.7e-10588.94Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LBN0 Cyclin-dependent kinase inhibitor9.5e-8275.32Show/hide
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A0A5A7UBT3 Cyclin-dependent kinase inhibitor 31.8e-8074.47Show/hide
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A0A5D3DZV8 Cyclin-dependent kinase inhibitor 38.1e-8174.89Show/hide
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A0A6J1ETD6 cyclin-dependent kinase inhibitor 3-like4.7e-8174.68Show/hide
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A0A6J1K6K7 cyclin-dependent kinase inhibitor 3-like1.1e-8075.53Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q283L0 Cyclin-dependent kinase inhibitor 51.4e-1332.07Show/hide
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        +   +     A  E               +VE  F +N L+  G+     T      SL R S    T  ST     S S++ R+E  + +  P++ ++E
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        EFFA  E    + F ++YNF   +D PL GRYEW ++
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Q7XDH8 Cyclin-dependent kinase inhibitor 41.7e-1131.54Show/hide
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Query:  TLECSSTDSLLKRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKSRVEMELLKS-FPTA
        T   ++ D+      A S + ++  G               EN LE       T      SL RD  T  T  ST   + SSS   +V+  +  +  P +
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         ++E FFA EE   ++ FI KYNFD  +D PL GR+EWV++
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Q8GYJ3 Cyclin-dependent kinase inhibitor 41.2e-0933.1Show/hide
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        MGKY +KSK+  A                 IA M+V   S  SS G+ TR AK+LALQ+      L K SS SS   +S+S +  S              
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         SYLQLRSRRL+ KPPI+     + +K Q   E C GR     S+ DS+     R  + SE    G  +     + + +  F +N  +   E     N  
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        T      SL R      T  S+    I  S  ++ E  L +S    PT  +++EFF+  E   Q+ FI+KYNFD  ++ PL GR+EW +V
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Q9FKB5 Cyclin-dependent kinase inhibitor 32.3e-2441.56Show/hide
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        MGKY KKSK+T  I+ MEVS  +  SPG+RTRAAKTLAL+RLN      SS++ S+  + SS YLQLRSRRLEKP  L + +  QP      G       
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Query:  STDSLLKRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKS--RVEMELLKS----FPTA
         + S  + D  NS      V   QS N  +  D F    +  G  + G   +   S    +  N   +   M T  SST+S  R   E  +      PT 
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        +++EEFFA+ E   QR F++KYNFD  +D+PL GRYEWVQV P
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Q9LRY0 Cyclin-dependent kinase inhibitor 54.3e-1535.02Show/hide
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        MGKY KKSK+  A++  + S   + G RTR  AAK LAL RL           S S  + S +YLQLRSRRL K P+L   +K Q        +  L  S
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              K   A+S   K    +T +       +  S +   FG                D   +  S +  M + S S +S              +IE+F
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        FA  E   QR FIQKYNFD  SD PL GRYEWV+V+P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G32710.1 Cyclin-dependent kinase inhibitor family protein8.7e-1133.1Show/hide
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         SYLQLRSRRL+ KPPI+     + +K Q   E C GR     S+ DS+     R  + SE    G  +     + + +  F +N  +   E     N  
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Query:  TAGKIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKSRVEMELLKSF---PTANDIEEFFAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQV
        T      SL R      T  S+    I  S  ++ E  L +S    PT  +++EFF+  E   Q+ FI+KYNFD  ++ PL GR+EW +V
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AT2G32710.2 Cyclin-dependent kinase inhibitor family protein1.1e-1033.1Show/hide
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Query:  -SYLQLRSRRLE-KPPIL----RQHQKAQPDGECCRGRLTLECSSTDSLL---KRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENW--GTAG
         SYLQLRSRRL+ KPPI+     + +K Q   E C GR     S+ DS+     R  + SE    G  +     + + +  F +N  +   E+    T  
Subjt:  -SYLQLRSRRLE-KPPIL----RQHQKAQPDGECCRGRLTLECSSTDSLL---KRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENW--GTAG

Query:  KIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKSRVEMELLKSF---PTANDIEEFFAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQV
            SL R      T  S+    I  S  ++ E  L +S    PT  +++EFF+  E   Q+ FI+KYNFD  ++ PL GR+EW +V
Subjt:  KIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKSRVEMELLKSF---PTANDIEEFFAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQV

AT3G24810.1 Cyclin-dependent kinase inhibitor family protein3.1e-1635.02Show/hide
Query:  MGKYFKKSKLTAAIADMEVSPHSSPGLRTR--AAKTLALQRLNKSSSSSSSSSSSSSSSSSSSYLQLRSRRLEKPPILRQHQKAQPDGECCRGRLTLECS
        MGKY KKSK+  A++  + S   + G RTR  AAK LAL RL           S S  + S +YLQLRSRRL K P+L   +K Q        +  L  S
Subjt:  MGKYFKKSKLTAAIADMEVSPHSSPGLRTR--AAKTLALQRLNKSSSSSSSSSSSSSSSSSSSYLQLRSRRLEKPPILRQHQKAQPDGECCRGRLTLECS

Query:  STDSLLKRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKSRVEMELLKSFPTANDIEEF
              K   A+S   K    +T +       +  S +   FG                D   +  S +  M + S S +S              +IE+F
Subjt:  STDSLLKRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKSRVEMELLKSFPTANDIEEF

Query:  FAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQVVP
        FA  E   QR FIQKYNFD  SD PL GRYEWV+V+P
Subjt:  FAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQVVP

AT5G48820.1 inhibitor/interactor with cyclin-dependent kinase1.6e-2541.56Show/hide
Query:  MGKYFKKSKLTAAIADMEVSPHS--SPGLRTRAAKTLALQRLNKSSSSSSSSSSSSSSSSSSSYLQLRSRRLEKPPILRQHQKAQPDGECCRGRLTLECS
        MGKY KKSK+T  I+ MEVS  +  SPG+RTRAAKTLAL+RLN      SS++ S+  + SS YLQLRSRRLEKP  L + +  QP      G       
Subjt:  MGKYFKKSKLTAAIADMEVSPHS--SPGLRTRAAKTLALQRLNKSSSSSSSSSSSSSSSSSSSYLQLRSRRLEKPPILRQHQKAQPDGECCRGRLTLECS

Query:  STDSLLKRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKS--RVEMELLKS----FPTA
         + S  + D  NS      V   QS N  +  D F    +  G  + G   +   S    +  N   +   M T  SST+S  R   E  +      PT 
Subjt:  STDSLLKRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKS--RVEMELLKS----FPTA

Query:  NDIEEFFAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQVVP
        +++EEFFA+ E   QR F++KYNFD  +D+PL GRYEWVQV P
Subjt:  NDIEEFFAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQVVP

AT5G48820.2 inhibitor/interactor with cyclin-dependent kinase2.6e-2339.38Show/hide
Query:  MGKYFKKSKLTAAIADMEVSPHS--SPGLRTRAAKTLALQRLNKSSSSSSSSSSSSSSSSSSSYLQLRSRRLEKPPILRQHQKAQPDGECCRGRLTLECS
        MGKY KKSK+T  I+ MEVS  +  SPG+RTRAAKTLAL+RLN      SS++ S+  + SS YLQLRSRRLEKP  L + +  QP      G       
Subjt:  MGKYFKKSKLTAAIADMEVSPHS--SPGLRTRAAKTLALQRLNKSSSSSSSSSSSSSSSSSSSYLQLRSRRLEKPPILRQHQKAQPDGECCRGRLTLECS

Query:  STDSLLKRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSL---------------ARDSS-TNETSNSTRMETISSSTKS--R
         + S  + D  NS      V   QS N  +  D F    +  G  + G   +    +                R+S+  N   +   M T  SST+S  R
Subjt:  STDSLLKRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSL---------------ARDSS-TNETSNSTRMETISSSTKS--R

Query:  VEMELLKS----FPTANDIEEFFAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQVVP
           E  +      PT +++EEFFA+ E   QR F++KYNFD  +D+PL GRYEWVQV P
Subjt:  VEMELLKS----FPTANDIEEFFAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQVVP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAAAGTACTTCAAGAAATCCAAACTTACTGCCGCCATTGCTGATATGGAAGTCTCACCGCACTCCTCTCCGGGACTCCGTACTCGAGCAGCTAAAACCCTTGCCTT
ACAACGCCTCAACAAATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTACTTGCAGCTTCGGAGCCGCCGGCTTGAAAAGCCGC
CGATACTCAGGCAGCACCAGAAAGCGCAGCCGGACGGCGAGTGTTGTAGAGGTCGCTTGACTCTTGAATGTTCCTCGACGGACTCTCTTTTGAAGCGGGATTTAGCGAAC
TCGGAGAAGAGGAAGCTTGGTGTGGGAGAAACACAGAGTGGAAATGTTTGGGATGTAGAGGATTGTTTTAGCGAGAACTGTCTCGAATTCGGAGGTGAAAATTGGGGAAC
TGCAGGAAAAATACATAGCAGCTTGGCTAGGGATTCAAGCACCAACGAAACATCTAACTCAACAAGGATGGAGACGATTTCAAGTTCAACCAAATCAAGAGTAGAGATGG
AGTTGCTAAAAAGTTTCCCTACCGCAAATGATATAGAGGAGTTCTTTGCACACGAAGAGCTATGGCATCAAAGAACGTTTATTCAGAAGTATAACTTCGACTTCACAAGC
GATATGCCTCTCCAAGGACGATATGAATGGGTGCAAGTGGTTCCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAATTGTTCCCCCAATCCCCAACCCTAAGTTTTCCCAATTTCTCCCGCGCTCTCTCTCTCGTCTCTTTCCTACAAACTTCCCTCCCTATTTCTCTCTCTCACAGTCCTCT
GTTCATTCAGAACGGAAGAAAGAGAACCCTCAAAACCCTATTCTCACTCTTCAGTTTGACACATTTATGGGAAAGTACTTCAAGAAATCCAAACTTACTGCCGCCATTGC
TGATATGGAAGTCTCACCGCACTCCTCTCCGGGACTCCGTACTCGAGCAGCTAAAACCCTTGCCTTACAACGCCTCAACAAATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTACTTGCAGCTTCGGAGCCGCCGGCTTGAAAAGCCGCCGATACTCAGGCAGCACCAGAAAGCGCAGCCGGACGGCGAGTGT
TGTAGAGGTCGCTTGACTCTTGAATGTTCCTCGACGGACTCTCTTTTGAAGCGGGATTTAGCGAACTCGGAGAAGAGGAAGCTTGGTGTGGGAGAAACACAGAGTGGAAA
TGTTTGGGATGTAGAGGATTGTTTTAGCGAGAACTGTCTCGAATTCGGAGGTGAAAATTGGGGAACTGCAGGAAAAATACATAGCAGCTTGGCTAGGGATTCAAGCACCA
ACGAAACATCTAACTCAACAAGGATGGAGACGATTTCAAGTTCAACCAAATCAAGAGTAGAGATGGAGTTGCTAAAAAGTTTCCCTACCGCAAATGATATAGAGGAGTTC
TTTGCACACGAAGAGCTATGGCATCAAAGAACGTTTATTCAGAAGTATAACTTCGACTTCACAAGCGATATGCCTCTCCAAGGACGATATGAATGGGTGCAAGTGGTTCC
TTAAGTAGCTATGATCTTATCAAGCTCGGTTTGAAGACGGGCATTCAGAAGAATTGAGATGAACGGATGAGCAAAGTTCCGTGGTAATCAAACTTGTCGGCATGCACTTA
CTTCGATGCAATGCTTAGCAGTATTCACGTGGCTCATTGCACGGTTCTGCATTTTACGGTTGTACAACTGCAACTGCATCCTTGTTAAACCATGAGCATGGGCAAAAATT
TGATTTCCAGTACTGTTAAAACTTGTTAAGACTTGAGATACCAAAATGCATGGTTTGGTGGTTCTATGGAGATGGTGGACATACAGAAGTTAAATGTGATGCAGTATTCG
TTTCTGACATTTCAACTTCATATGGAGTGCAGTTGGAAGGTTCCTCATTCTCTGAAGCCATCCGCCTAAGTTTATCAAGTTGAATTGCACGCATTTCATATCTGTCACAA
TAGAAACAATAGGATGAATGCTGTGCTAAATGCGCAGGACAGTAGAGAACAATGGCAATTTTCCACATTATCTTGGGAATTTCCAGAGAACAAAAGAAAATAAGAGATCT
TGGCCTATAATACGCACACCAGAAGCATAAAACATAAAGATTAAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGKYFKKSKLTAAIADMEVSPHSSPGLRTRAAKTLALQRLNKSSSSSSSSSSSSSSSSSSSYLQLRSRRLEKPPILRQHQKAQPDGECCRGRLTLECSSTDSLLKRDLAN
SEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKSRVEMELLKSFPTANDIEEFFAHEELWHQRTFIQKYNFDFTS
DMPLQGRYEWVQVVP