; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc07G03760 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc07G03760
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionEncodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).
Genome locationClcChr07:3838640..3841196
RNA-Seq ExpressionClc07G03760
SyntenyClc07G03760
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
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KAA0051570.1 TPRXL protein [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-6389.19Show/hide
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XP_038892195.1 uncharacterized protein LOC120081420 isoform X1 [Benincasa hispida]5.4e-6590.54Show/hide
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XP_038892196.1 uncharacterized protein LOC120081420 isoform X2 [Benincasa hispida]5.4e-6590.54Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KNZ9 Uncharacterized protein3.1e-6687.18Show/hide
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A0A1S4E4X0 uncharacterized protein LOC1035026538.4e-6489.19Show/hide
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A0A5A7U8T9 TPRXL protein8.4e-6489.19Show/hide
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A0A6J1CC52 uncharacterized protein LOC1110101329.9e-5779.59Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39855.1 unknown protein5.6e-1246.61Show/hide
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AT2G39855.2 unknown protein2.9e-1643.71Show/hide
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AT3G55646.1 unknown protein1.7e-1641.72Show/hide
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AT5G02020.1 Encodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).1.8e-1036.77Show/hide
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AT5G05965.1 unknown protein4.3e-1238.51Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TAA
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ATTTATCCTTATTATCTATTATTGTAATGACCATGTTCACTCAGTATATGATGAGTTTAGTTCAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MWAHGAKESSICSAFWGLINGIELLSGLVSEIFTWVCSISFCFCLHIICLFVSLTGKQKASSVSTMENKKKVATSSSSSLDHIFGPMDSNSASSTSTTGYFGSIFPPPVV
ERESKKDVGNQVSTGELGNPDNASINGKKGTGGAFGNDESSMYQNETMEPSYFSSSIFYGGQENYSPRTNASEIHHNFKTEGKDNDANESNSNSASRGNWWKDYHIGLRQ