; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc07G04120 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc07G04120
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionSignal peptidase complex subunit
Genome locationClcChr07:4268111..4270375
RNA-Seq ExpressionClc07G04120
SyntenyClc07G04120
Gene Ontology termsGO:0006465 - signal peptide processing (biological process)
GO:0006862 - nucleotide transport (biological process)
GO:0055085 - transmembrane transport (biological process)
GO:0005787 - signal peptidase complex (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008233 - peptidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR009582 - Signal peptidase complex subunit Spc2/SPCS2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8648015.1 hypothetical protein Csa_021450 [Cucumis sativus]4.9e-6183.01Show/hide
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XP_008463218.1 PREDICTED: probable signal peptidase complex subunit 2 [Cucumis melo]3.9e-5869.57Show/hide
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XP_011654984.1 probable signal peptidase complex subunit 2 [Cucumis sativus]1.9e-5769.02Show/hide
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XP_022996614.1 probable signal peptidase complex subunit 2 [Cucurbita maxima]5.6e-5768.48Show/hide
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XP_038891545.1 probable signal peptidase complex subunit 2 [Benincasa hispida]3.0e-5870.11Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KSD0 Uncharacterized protein1.0e-5665.8Show/hide
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A0A1S3CIQ9 probable signal peptidase complex subunit 21.9e-5869.57Show/hide
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A0A5A7T1V9 Putative signal peptidase complex subunit 26.1e-5764.97Show/hide
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A0A6J1FVT7 probable signal peptidase complex subunit 23.5e-5768.48Show/hide
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A0A6J1K981 probable signal peptidase complex subunit 22.7e-5768.48Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P58684 Probable signal peptidase complex subunit 25.8e-4959.89Show/hide
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        K+ KKANLLDHHS+KH+LDESVS+IVTSRGY ED                                                   I+YTKEKNAILFTYP
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        P GSFTSTGLV+SSKLPRFSD YTLTI S+DPKSISA + VQ TKSVT+WFTKDGVLVEGLFWKDVEALI +YA  EPKK K
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Q5BJI9 Probable signal peptidase complex subunit 22.7e-0640.66Show/hide
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        KEKN  L      PAG        +SS L RF D YTL +S +D K+  + E  +FTKSV+ +F ++G LV   + K V  L D  A E K
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Q5M8Y1 Probable signal peptidase complex subunit 26.1e-0638.54Show/hide
Query:  VYT--KEKNAILFTY--PPAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDYAREPK
        +YT  KEK+  L  +   PAG        +SS L RF D YTL ++    K+  A    +FTKS+ R+F  +G LV  LF  +V  L D  A E K
Subjt:  VYT--KEKNAILFTY--PPAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDYAREPK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39960.1 Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25)4.2e-5059.89Show/hide
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        K+ KKANLLDHHS+KH+LDESVS+IVTSRGY ED                                                   I+YTKEKNAILFTYP
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Query:  PAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDYA-REPKKSK
        P GSFTSTGLV+SSKLPRFSD YTLTI S+DPKSISA + VQ TKSVT+WFTKDGVLVEGLFWKDVEALI +YA  EPKK K
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AT4G04200.1 Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25)4.7e-4656.59Show/hide
Query:  AAKSAKKANLLDHHSLKHLLDESVSEIVTSRGYVED-----------------------------------------------FIVYTKEKNAILFTYPP
        A K+ KK NLLDH ++KHLLDESVS+IVTSRGY ED                                                I+Y KEKNAILFTYP 
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Query:  AGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDY--AREPKKSK
         GSFTSTGLV+SSKLPRFSD YTLTI S+DP+SISA + VQFTKSVT+W TKDGVLVEGLFWKDVEAL+ +Y  A EPKK +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCAAAAGTGCCAAAAAGGCCAATCTCTTGGATCATCACTCCCTCAAACACCTACTCGATGAATCTGTTTCTGAGATTGTCACCAGCCGCGGCTATGTTGAAGA
CTTTATTGTTTACACCAAGGAGAAGAACGCAATTTTGTTCACATATCCTCCTGCAGGATCCTTCACCAGCACTGGACTGGTAATCTCTTCAAAGTTACCAAGATTCTCAG
ATCTGTATACACTGACCATATCTAGTTCAGATCCCAAATCAATCTCCGCTAATGAACCAGTTCAATTTACCAAGAGTGTCACACGCTGGTTTACTAAGGATGGAGTTTTA
GTTGAGGGACTCTTCTGGAAAGATGTCGAAGCATTGATTGATGATTATGCTAGAGAACCGAAGAAGAGCAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCCAAAAGTGCCAAAAAGGCCAATCTCTTGGATCATCACTCCCTCAAACACCTACTCGATGAATCTGTTTCTGAGATTGTCACCAGCCGCGGCTATGTTGAAGA
CTTTATTGTTTACACCAAGGAGAAGAACGCAATTTTGTTCACATATCCTCCTGCAGGATCCTTCACCAGCACTGGACTGGTAATCTCTTCAAAGTTACCAAGATTCTCAG
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GTTGAGGGACTCTTCTGGAAAGATGTCGAAGCATTGATTGATGATTATGCTAGAGAACCGAAGAAGAGCAAGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAKSAKKANLLDHHSLKHLLDESVSEIVTSRGYVEDFIVYTKEKNAILFTYPPAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVL
VEGLFWKDVEALIDDYAREPKKSK