; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc07G08410 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc07G08410
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein ATHB-40
Genome locationClcChr07:22119105..22122048
RNA-Seq ExpressionClc07G08410
SyntenyClc07G08410
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0045893 - positive regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000047 - Helix-turn-helix motif
IPR001356 - Homeobox domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7031239.1 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-40 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.1e-9286.7Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3BY52 homeobox-leucine zipper protein ATHB-403.3e-9787.56Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XDK5 Homeobox-leucine zipper protein HOX127.0e-2847.34Show/hide
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O23208 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-404.4e-4653.12Show/hide
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Q7XI85 Homeobox-leucine zipper protein HOX142.4e-2840.37Show/hide
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Q9LVR0 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-531.7e-3449.48Show/hide
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Q9ZU70 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-211.1e-4147.58Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G69780.1 Homeobox-leucine zipper protein family2.7e-1938.61Show/hide
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         ++  ++ E + + +  +G  S+ S + S +L +D      + D T  G  PP  + V
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AT2G18550.1 homeobox protein 217.9e-4347.58Show/hide
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AT3G01470.1 homeobox 13.8e-2154.64Show/hide
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AT4G36740.1 homeobox protein 403.1e-4753.12Show/hide
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        ++VV+ +C+LE++ILKL EQLSE + E  ++      +      + S S SLS++A + PT     P +  ++ +YM +N  +  ME W   Y+
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TTCGGGAGTGAACATAAATTGGAATCGGAAAGAAAGGACCGTTTAGCGTCGGAGTTGGGGCTGGATCCTCGGCAGGTGGCTGTCTGGTTTCAGAACCGCCGTGCACGGTG
GAAGAACAAGAAACTTGAGGAGGAGTATTCTAACTTGAAGAAGCTTCATGAATCCGTCGTCGTTGAAAAATGTCGTCTAGAAACTGAGATATTGAAGCTGAAAGAACAAC
TATCAGAAGTAGAGAAAGAGAAAGAGAGGGTAATAATGGGAGAAGGGGGCGATGGGGGTTTAAGCAGCAGCAGCCCAAGCCCATCAATGTCATTGTCAATGGATGCGATG
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CCTTTCACTTTTCTCTCTCTAC
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