; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc07G10170 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc07G10170
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionSerine/arginine repetitive matrix-like protein
Genome locationClcChr07:24752933..24755025
RNA-Seq ExpressionClc07G10170
SyntenyClc07G10170
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0062958.1 putative serine-rich protein [Cucumis melo var. makuwa]6.3e-21790.32Show/hide
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XP_008451820.1 PREDICTED: uncharacterized serine-rich protein C215.13 [Cucumis melo]7.5e-21890.91Show/hide
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XP_022931532.1 homeobox protein prospero-like [Cucurbita moschata]1.0e-21488.36Show/hide
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XP_023551901.1 uncharacterized protein LOC111809733 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.0e-21688.58Show/hide
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XP_038878848.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Benincasa hispida]8.8e-22793.78Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BT64 uncharacterized serine-rich protein C215.133.6e-21890.91Show/hide
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A0A5A7V5R8 Putative serine-rich protein3.1e-21790.32Show/hide
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A0A5D3CZJ6 Putative serine-rich protein3.6e-21890.91Show/hide
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A0A6J1ETX7 homeobox protein prospero-like4.9e-21588.36Show/hide
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A0A6J1JAD5 uncharacterized serine-rich protein C215.138.4e-21588.58Show/hide
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        YFSEANSKALKYFLHR+SKSSL+SS DSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCEN PN NPISLHRNPNH+NPPRMRLVKPR
Subjt:  YFSEANSKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHHNPPRMRLVKPR

Query:  PKSESNPRSTSTADHHPAATRVGRSPIRRTPGESSSSSRLGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPVLNV
        PKSE+NPRSTST DHHP A RVGRSP+RRTPGESSSS   GIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPS+FNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPVLNV
Subjt:  PKSESNPRSTSTADHHPAATRVGRSPIRRTPGESSSSSRLGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPVLNV

Query:  PVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLFTGTGGGGSSSRNHQSSSSGSNNSSNRTTTRRINETDGGGKIH
        PVCSSLRGSSKS SVFGFGPLFTGTGG     R+HQSSSS S  S+NRTTTRRINETDGGGKIH
Subjt:  PVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLFTGTGGGGSSSRNHQSSSSGSNNSSNRTTTRRINETDGGGKIH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56020.1 unknown protein3.7e-6645.55Show/hide
Query:  MASACVNNVGMSSENFLDCSSSVPCHSYGWLSPRISFSRDFPDDSPPSSNLVGPLSKPKPATNPAGESEIRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVSLMLPADEL
        MASACV + G+S E F          SYGW SPR+S +R   DD+  SS++    S P P        EI+D      PV +FEF L+DPV+ ML ADEL
Subjt:  MASACVNNVGMSSENFLDCSSSVPCHSYGWLSPRISFSRDFPDDSPPSSNLVGPLSKPKPATNPAGESEIRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVSLMLPADEL

Query:  FLDGKLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPD-----TAAQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNGGAKNENHKTTTTS
        F DGKLVPL+ S  K +     +T   ++ +        +S RR+E E S    LFSPKAPRC++RWRELLGLK+L            AK +      +S
Subjt:  FLDGKLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPD-----TAAQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNGGAKNENHKTTTTS

Query:  SSYFSEANSKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHH-NPPRMR
        SS  +   + + K FLHR SKSS      ++ S PL K+SD SES+S++SSR+SL SSSSS HE +DL RLSLD + KP+ NP +  R  + + N PR+R
Subjt:  SSYFSEANSKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHH-NPPRMR

Query:  LVKPRPKSESNPRSTSTADHHPAATRVGRSPIRRTPGESSSSSRLGIRGVSV--DSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-NRGMERSYSANV
        L KPR    ++P ST + D                 G SSSS+ +  RG++V  DSPR+N+SGKIVFH LERSSSSP SF GGP+ K + GM RSYSANV
Subjt:  LVKPRPKSESNPRSTSTADHHPAATRVGRSPIRRTPGESSSSSRLGIRGVSV--DSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-NRGMERSYSANV

Query:  RVTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLFTGTGGGGSSS----RNHQSSSSGSNNSSNRT
        R+TPVLNVPVCS   G         FG LF+ +    SSS       Q  S+GS N  NRT
Subjt:  RVTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLFTGTGGGGSSS----RNHQSSSSGSNNSSNRT

AT1G79060.1 unknown protein3.0e-7148.41Show/hide
Query:  MASACVNNVGMSSENFLDCSSSVPCHSYGWLSPRISFSRDFPDDSPPSSNLVGPLSKPKPATNPAGESEIRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVSLMLPADEL
        MAS CVNNV +S +            +YG  +PR SFSRD  D    S ++   + K + A                V   +FEFRL++    MLPADEL
Subjt:  MASACVNNVGMSSENFLDCSSSVPCHSYGWLSPRISFSRDFPDDSPPSSNLVGPLSKPKPATNPAGESEIRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVSLMLPADEL

Query:  FLDGKLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPDTAAQSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNGGAKNENHKTTTTSSSY
        F DGKLV  Q       + G    +C        +    VE E S   D   FSPKAPRCSSRWR+LLGLK+  Q+SS        K+ +  TTTT++  
Subjt:  FLDGKLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPDTAAQSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNGGAKNENHKTTTTSSSY

Query:  FSEANSKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSL--SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPI-----SLHRNP------NH
           +++ +LK FLHRSS+SS SSS D+SL  SLPLLKDSDSESVS+SSSR+SLSSSSSGH+HEDL RLSLD E +PN N I     +L  NP       +
Subjt:  FSEANSKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSL--SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPI-----SLHRNP------NH

Query:  HNPPRMRLVKPRPKSESNPRSTSTADHHPAATRVGRSPIRRTPGESSSSSRLGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK-FKNRGMERS
         NPPRMRLV           STS         RVGRSP+RR+ GE+S+      RGVSVDSPR+NSSGKIVF NLERSSSSPSSFNGG   +++RGMERS
Subjt:  HNPPRMRLVKPRPKSESNPRSTSTADHHPAATRVGRSPIRRTPGESSSSSRLGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK-FKNRGMERS

Query:  YSANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLFTGTGGGGSSSRNHQSSSSGSNNSSNRTTTRRINETD
        YS+NVRVTPVLNVPVC S+RG S    VFG    F  +    SSS+N+++ ++ +N +S   +  R N TD
Subjt:  YSANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLFTGTGGGGSSSRNHQSSSSGSNNSSNRTTTRRINETD

AT3G12970.1 unknown protein5.1e-5542.03Show/hide
Query:  MASACVNNVGMSSENFLDCSSSVPCHSYGWLSPRISFSRDFPDDSPPSSNLVGPLSKPKPATNPAGESEIRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVSLMLPADEL
        MAS CV NVG S           P HS  W S ++S +R+               S+P     PA E+E         PV +FEF L+DPV+ ML ADEL
Subjt:  MASACVNNVGMSSENFLDCSSSVPCHSYGWLSPRISFSRDFPDDSPPSSNLVGPLSKPKPATNPAGESEIRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVSLMLPADEL

Query:  FLDGKLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPDTAAQSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNGGAKNENHKTTTTSSSY
        F DGKLVPL+ S V       +     S   TA +  RR+E E S   DPYLFSP+APRC+ RWRELLGLK+L ++    + +  ++  +      ++S+
Subjt:  FLDGKLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPDTAAQSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNGGAKNENHKTTTTSSSY

Query:  FSEANSKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNT-NPISLHRNPNHHNPPRMRL
                 ++FL+RSSKS+           P  KDSD   S S S+SSSR+SL SSSSSGHE +DL RLSLD +NKP T NP +  R  +HH+      
Subjt:  FSEANSKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNT-NPISLHRNPNHHNPPRMRL

Query:  VKPRPKSESNPRSTSTADHHPAATRVGRSPIRRTPGESSSSSRLGIR--GVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-NRGMERSYSANVR
             ++++ P                R P R T  + S+ S +  R   V+ DSPR+N+SGKIVFH LERSSSSP +F GGP+ K + GM RS+SANVR
Subjt:  VKPRPKSESNPRSTSTADHHPAATRVGRSPIRRTPGESSSSSRLGIR--GVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-NRGMERSYSANVR

Query:  VTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLFTGTGGGGSSSRNHQSSSSGSNNSSNRTTTRRINET
        +TPVLNVPV SSLR   KS  +F FG LF  +    SSS +   +   SNN  NRT   R+  T
Subjt:  VTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLFTGTGGGGSSSRNHQSSSSGSNNSSNRTTTRRINET


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCGCATGCGTTAACAATGTCGGAATGTCGTCTGAAAATTTCCTCGACTGCTCTTCTTCTGTTCCATGCCATTCTTACGGCTGGCTCAGCCCTCGCATCTCCTT
CAGCCGCGACTTCCCTGACGATTCCCCACCTTCTTCCAACCTCGTCGGACCTCTATCTAAGCCTAAGCCTGCCACTAACCCGGCCGGTGAGTCCGAGATTCGAGATCCGG
ATCCTGAACTGGTTCCAGTAAGCGAGTTCGAGTTCCGTCTTCAAGATCCCGTCTCCTTGATGCTCCCTGCAGATGAGCTGTTTTTGGATGGGAAACTCGTGCCGCTTCAG
GTCTCTTCTGTTAAACCCTCAGTCAACGGTTTGAAGTCCACGAGGTGCGTTTCGTCGCCGGATACTGCGGCTCAGTCCCGCCGGAGAGTTGAGGAAGAATGCAGTACGGA
TCCGTATCTGTTTTCTCCGAAGGCGCCGAGGTGTTCCAGTCGATGGAGAGAGCTTTTAGGGCTCAAAAAGCTGTACCAGAGCAGTAGCAATGGCAATGGCAATGGCGGCG
CTAAAAACGAAAACCACAAAACGACGACGACGTCGTCGTCTTACTTCTCGGAAGCAAATTCGAAGGCGCTGAAGTACTTCCTCCACCGGAGTTCGAAATCGTCGTTGTCG
TCTTCGTTGGATTCGTCGCTGAGCCTTCCATTACTGAAGGATTCCGATAGTGAGTCTGTTTCACTATCTTCTTCCCGTGTATCTCTTTCCTCTTCTTCCTCAGGTCACGA
ACACGAAGATCTTCACAGACTCTCACTAGATTGCGAAAATAAGCCAAACACGAATCCGATTTCCCTCCATAGGAACCCTAATCACCACAATCCACCACGGATGAGACTGG
TGAAACCGAGGCCTAAATCGGAGAGCAATCCAAGATCAACTTCAACAGCGGATCATCATCCGGCGGCGACGAGAGTAGGGAGAAGCCCGATTCGGCGTACACCTGGAGAG
TCGTCATCATCCAGTAGATTAGGGATCCGAGGAGTATCTGTAGATAGTCCACGAATGAACTCATCAGGGAAAATCGTGTTCCACAACTTGGAGCGAAGCTCAAGCAGTCC
AAGCAGCTTCAATGGCGGACCGAAATTCAAAAACAGAGGAATGGAACGATCATACTCTGCAAACGTGAGAGTGACTCCAGTCCTAAACGTTCCAGTTTGTTCTTCCTTAA
GAGGATCCTCAAAATCCGTCTCTGTGTTCGGATTCGGACCATTATTCACTGGCACCGGCGGCGGCGGAAGCAGCAGCAGAAACCACCAGAGTAGTAGTAGCGGCAGCAAT
AATAGTAGTAACCGAACAACGACAAGGCGGATCAACGAAACCGACGGCGGAGGGAAAATCCATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAAAAAAGATTATTTTTCCAGATATAAATAGTGGGCTTCCTGTACGGTGGCACCACGGTCCTCTTCCGAAAAGGCCAACTCATCATTTCTCCAAACCCTAGCTCCT
TCTCTCTCCTCCAGATCTCGCCGGATATTCTGCCGATGTGATTTGCGCCATAGACGTTGACCTTCTCCGGCGTCATCCTCTTCCCCATTTTCACCATCACCGGACTTCCA
TTTCACCTTCGCATGGTCGCCGCCGCCATCCATGGCTTCCGCATGCGTTAACAATGTCGGAATGTCGTCTGAAAATTTCCTCGACTGCTCTTCTTCTGTTCCATGCCATT
CTTACGGCTGGCTCAGCCCTCGCATCTCCTTCAGCCGCGACTTCCCTGACGATTCCCCACCTTCTTCCAACCTCGTCGGACCTCTATCTAAGCCTAAGCCTGCCACTAAC
CCGGCCGGTGAGTCCGAGATTCGAGATCCGGATCCTGAACTGGTTCCAGTAAGCGAGTTCGAGTTCCGTCTTCAAGATCCCGTCTCCTTGATGCTCCCTGCAGATGAGCT
GTTTTTGGATGGGAAACTCGTGCCGCTTCAGGTCTCTTCTGTTAAACCCTCAGTCAACGGTTTGAAGTCCACGAGGTGCGTTTCGTCGCCGGATACTGCGGCTCAGTCCC
GCCGGAGAGTTGAGGAAGAATGCAGTACGGATCCGTATCTGTTTTCTCCGAAGGCGCCGAGGTGTTCCAGTCGATGGAGAGAGCTTTTAGGGCTCAAAAAGCTGTACCAG
AGCAGTAGCAATGGCAATGGCAATGGCGGCGCTAAAAACGAAAACCACAAAACGACGACGACGTCGTCGTCTTACTTCTCGGAAGCAAATTCGAAGGCGCTGAAGTACTT
CCTCCACCGGAGTTCGAAATCGTCGTTGTCGTCTTCGTTGGATTCGTCGCTGAGCCTTCCATTACTGAAGGATTCCGATAGTGAGTCTGTTTCACTATCTTCTTCCCGTG
TATCTCTTTCCTCTTCTTCCTCAGGTCACGAACACGAAGATCTTCACAGACTCTCACTAGATTGCGAAAATAAGCCAAACACGAATCCGATTTCCCTCCATAGGAACCCT
AATCACCACAATCCACCACGGATGAGACTGGTGAAACCGAGGCCTAAATCGGAGAGCAATCCAAGATCAACTTCAACAGCGGATCATCATCCGGCGGCGACGAGAGTAGG
GAGAAGCCCGATTCGGCGTACACCTGGAGAGTCGTCATCATCCAGTAGATTAGGGATCCGAGGAGTATCTGTAGATAGTCCACGAATGAACTCATCAGGGAAAATCGTGT
TCCACAACTTGGAGCGAAGCTCAAGCAGTCCAAGCAGCTTCAATGGCGGACCGAAATTCAAAAACAGAGGAATGGAACGATCATACTCTGCAAACGTGAGAGTGACTCCA
GTCCTAAACGTTCCAGTTTGTTCTTCCTTAAGAGGATCCTCAAAATCCGTCTCTGTGTTCGGATTCGGACCATTATTCACTGGCACCGGCGGCGGCGGAAGCAGCAGCAG
AAACCACCAGAGTAGTAGTAGCGGCAGCAATAATAGTAGTAACCGAACAACGACAAGGCGGATCAACGAAACCGACGGCGGAGGGAAAATCCATTGATGAGATTTGAAGA
AAAGGGATTTTTAATTTTGGGTAACACTAACAAACCCCGTTTTTCCATTTTCGTCTCAATGTTTAGGCATTATACTGAAATTTCCCGTTTGTGATAGACGGATTTGGTTT
CAATTTGCTAATTCTTAACACAAAAAACAGGTTCATCATCATCATCATCATGTATGTAAATACGGCGGGGAGATTTTGTTTTTTCATTTTAGTTAATCTCATTTCTCTAA
TCAATTTCTTCACCATTTAAAATTCTCTGTTTTATGAATCATCAATGTTCTCCAAATTTACTATTTCTTCTCAAAAACAACCCACCCCACATGAGAGATTAAAAAAAAAA
GAGATGCTATTGCTGATTGAGAATTTTGTTTTTTCGCTGTTCCATCCAAAAGGAGCGTTTGAAATCCACGCGCTTATCCGGAGCGTCTGAGTTCAGAACTCTTTGTGTCT
TTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASACVNNVGMSSENFLDCSSSVPCHSYGWLSPRISFSRDFPDDSPPSSNLVGPLSKPKPATNPAGESEIRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVSLMLPADELFLDGKLVPLQ
VSSVKPSVNGLKSTRCVSSPDTAAQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNGGAKNENHKTTTTSSSYFSEANSKALKYFLHRSSKSSLS
SSLDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHHNPPRMRLVKPRPKSESNPRSTSTADHHPAATRVGRSPIRRTPGE
SSSSSRLGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLFTGTGGGGSSSRNHQSSSSGSN
NSSNRTTTRRINETDGGGKIH