CuGenDBv2

Gene ID	Clc07G12370
Organism	Citrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Description	DCC family protein At1g52590, chloroplastic
Genome location	ClcChr07:27184359..27186147
RNA-Seq Expression	Clc07G12370
Synteny	Clc07G12370
Gene Ontology terms	GO:0015035 - protein disulfide oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR007263 - DCC1-like thiol-disulfide oxidoreductase family

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6581957.1 DCC family protein, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

1.2e-76

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XP_004152205.1 DCC family protein At1g52590, chloroplastic [Cucumis sativus]

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XP_022153577.1 DCC family protein At1g52590, chloroplastic [Momordica charantia]

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XP_022980169.1 DCC family protein At1g52590, chloroplastic [Cucurbita maxima]

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82.01

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XP_038900615.1 DCC family protein At1g52590, chloroplastic [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A0A0KVF0 Uncharacterized protein

8.8e-78

83.6

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A0A5D3E0H0 DCC family protein

4.8e-76

82.63

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A0A6J1DJB0 DCC family protein At1g52590, chloroplastic

3.0e-78

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A0A6J1GW36 DCC family protein At1g52590, chloroplastic

7.4e-77

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A0A6J1IYJ5 DCC family protein At1g52590, chloroplastic

4.4e-77

82.01

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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

P40761 Uncharacterized protein YuxK

1.3e-17

39.23

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           VP  VR++VY  IA NRY  FG+   C
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Q9SSR1 DCC family protein At1g52590, chloroplastic

1.7e-57

62.09

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        IPA F   + T++A+ R  +++++     + +++DWV+ TS+FFE+D RPIMLFDGVCNLCNGGV+FVR +DRNR               IR EALQSEA
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        GKKLL RSGRAPDDISSVVLVE DRSYIKSEAVL+IM+++DLPFPQLA FLQF PLFVR+ +Y+N+A+NRY +FGRS+SCE+
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G24095.1 Putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC

6.8e-14

33.33

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         F   VP  +R+ VYD +A NRY  FG++E C
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AT1G52590.1 Putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC

1.2e-58

62.09

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGCTTCCACTTTCCGGCGGAATTCCGGCATGTTTTTTCCCGCCATCTACGGCGAAAGCTAGACCACGGCATCTAATTGCTTCCGCCTCATTATCTACGGCAACCAA
AGGCGAAACGATCGATTGGGTCGAAGCAACTTCCAACTTCTTCGAGAAAGATACGAGACCAATTATGCTATTTGACGGTGTGTGCAATTTGTGCAACGGAGGTGTGAGAT
TTGTTCGTGCTAATGATCGAAACAGGTGGGAATCATGGTTTATATGCTTTGATACCTTCATGATCTTAAGAATACGATTAGAGGCTCTCCAAAGTGAAGCTGGTAAGAAG
CTGTTAAGAAGGTCAGGAAGAGCACCGGATGATATTTCGAGTGTTGTACTTGTTGAAAAGGATAGATCTTATATCAAGTCTGAAGCTGTTCTAAGAATAATGGAACATTT
AGACTTACCCTTTCCTCAGCTTGCACTTTTTCTCCAGTTTGTGCCTTTGTTTGTTCGAAATATTGTGTACGACAATATTGCAGATAATCGCTATACACTATTTGGACGCT
CGGAGTCATGTGAAATATAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GGAGAAGCCAATCTGCAACTGCCACTGTCTCCAATGGCGCTTCCACTTTCCGGCGGAATTCCGGCATGTTTTTTCCCGCCATCTACGGCGAAAGCTAGACCACGGCATCT
AATTGCTTCCGCCTCATTATCTACGGCAACCAAAGGCGAAACGATCGATTGGGTCGAAGCAACTTCCAACTTCTTCGAGAAAGATACGAGACCAATTATGCTATTTGACG
GTGTGTGCAATTTGTGCAACGGAGGTGTGAGATTTGTTCGTGCTAATGATCGAAACAGGTGGGAATCATGGTTTATATGCTTTGATACCTTCATGATCTTAAGAATACGA
TTAGAGGCTCTCCAAAGTGAAGCTGGTAAGAAGCTGTTAAGAAGGTCAGGAAGAGCACCGGATGATATTTCGAGTGTTGTACTTGTTGAAAAGGATAGATCTTATATCAA
GTCTGAAGCTGTTCTAAGAATAATGGAACATTTAGACTTACCCTTTCCTCAGCTTGCACTTTTTCTCCAGTTTGTGCCTTTGTTTGTTCGAAATATTGTGTACGACAATA
TTGCAGATAATCGCTATACACTATTTGGACGCTCGGAGTCATGTGAAATATAGAAATTACTTGTACTCTTAGGACATGTATATAATACTTGGGAATTAGAAATTTAGAAG
TTAATATCTTTGTTTGGTAATTAATACTATCAGGAATTGGAGCTGATATCATGGCAAACATAATTAATTTGCAGACCTTTGGTATTGTTATCTGTGTCCTTTAAGGATTC
TCAATGTTTTCTTAGTCAGTTCCTTTCATTGACATTGGCATCACAACATTTCTAATATCACCTTTGACTACAAATGTTTCTTCCTTCATTCACCTGAGTAGAATTAACTT
CCAATGCAAAAATACATGCATTGTCTGTATTTCGATTGTTGCTCCTATAATACAAATCTAAGGAAATTGACC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MALPLSGGIPACFFPPSTAKARPRHLIASASLSTATKGETIDWVEATSNFFEKDTRPIMLFDGVCNLCNGGVRFVRANDRNRWESWFICFDTFMILRIRLEALQSEAGKK
LLRRSGRAPDDISSVVLVEKDRSYIKSEAVLRIMEHLDLPFPQLALFLQFVPLFVRNIVYDNIADNRYTLFGRSESCEI

Clc07G12370 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome