; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc07G17090 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc07G17090
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionlate embryogenesis abundant protein At5g17165-like
Genome locationClcChr07:31570007..31575486
RNA-Seq ExpressionClc07G17090
SyntenyClc07G17090
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR039291 - Late embryogenesis abundant protein At5g17165-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6576842.1 Late embryogenesis abundant protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-5585.27Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRA
        MAANSRSAGAIAGL KRITDQIWN DPLRNS ISS+APKFRRAAHTS YDKN DEQVRPS+VPDDVIQ Q+ADKYWAPHPQTGVFGPAT NP A   N  
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRA

Query:  ADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
        A+GG+YS VEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
Subjt:  ADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG

XP_004146886.1 late embryogenesis abundant protein At5g17165 [Cucumis sativus]1.6e-5687.22Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQ-AADKYWAPHPQTGVFGPATENPA--ADAG
        MAANSRS GAIAGLGKRITDQIW  DPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKN +EQVRPS+VPDDVIQ Q AAD YWAPHPQTGVFGPA++NPA  A A 
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQ-AADKYWAPHPQTGVFGPATENPA--ADAG

Query:  NRAADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
        NRAADGG+YS VEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
Subjt:  NRAADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL

XP_008453829.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103494437 [Cucumis melo]1.8e-5587.12Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIW-NSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAA-DAGN
        MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIW +SD LRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKN +EQVRPS+VPDDVIQ QAADKYWAPHPQTGVFGP ++NPAA  A N
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIW-NSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAA-DAGN

Query:  RAADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
        RAAD G+YS  EEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
Subjt:  RAADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL

XP_022984594.1 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like [Cucurbita maxima]3.9e-5585.27Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRA
        MAANSRSAGAIAGL KRITDQIW  DPLRNS ISS+APKFRRAAHTS YDKN DEQVRPS+VPDDVIQ Q+ADKYWAPHPQTGVFGPAT NP A   N  
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRA

Query:  ADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
        ADGG+YS VEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
Subjt:  ADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG

XP_038901450.1 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like [Benincasa hispida]3.1e-6090.77Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRA
        MAANSRSAG IAGLGKRITDQIW SDPLRNSVISSSAPK RRAAHTS YDKN DEQVRPSVVPDDVIQ+QAADKYWAPHPQTGVFGPA++NPAA A NRA
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRA

Query:  ADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
        ADGG+YS VEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
Subjt:  ADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BYE5 uncharacterized protein LOC1034944378.5e-5687.12Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIW-NSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAA-DAGN
        MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIW +SD LRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKN +EQVRPS+VPDDVIQ QAADKYWAPHPQTGVFGP ++NPAA  A N
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIW-NSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAA-DAGN

Query:  RAADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
        RAAD G+YS  EEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
Subjt:  RAADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL

A0A6J1CHE9 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like6.3e-5182.95Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRA
        MAANSRSAGAIAGLGKRIT+QIW SDPLRNS ISSSAPKFRRAAHTSVYDKN DEQ RPS+VPD+VIQ Q  DKYWAPHPQTGVFGP T++P A A  +A
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRA

Query:  ADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
        A+GG Y+ VEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
Subjt:  ADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG

A0A6J1E3E9 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like2.1e-5483.72Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRA
        MAANSRSAGAIAGL KRITDQIWN DPLRNS ISS+APKFRRAAH+S YDKN DEQVRPS+VPDDVIQ Q+ADKYWAP+PQTGVFGPAT NP A   N  
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRA

Query:  ADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
        A+GG+YS VEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
Subjt:  ADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG

A0A6J1FNH5 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like isoform X14.1e-5079.84Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRA
        MAANSRSAGAIAGLGKRIT+QIW SD    S ISSSA KFRRAAHTS YDKN DEQVRPS+VPDDVIQ QAA+KYWAPHP TGVFGP  + P A AG+RA
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRA

Query:  ADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
        ADGG+++  EEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
Subjt:  ADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG

A0A6J1JAZ8 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like1.9e-5585.27Show/hide
Query:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRA
        MAANSRSAGAIAGL KRITDQIW  DPLRNS ISS+APKFRRAAHTS YDKN DEQVRPS+VPDDVIQ Q+ADKYWAPHPQTGVFGPAT NP A   N  
Subjt:  MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRA

Query:  ADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
        ADGG+YS VEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
Subjt:  ADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4KFM8 Late embryogenesis abundant protein At5g171655.5e-2056.32Show/hide
Query:  RAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRAADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH
        R  HTS YDKN++E+++PS VPD++I+   +DKYW+PHPQTGVFGP++ +  A    R   GG    V EEKAWFRPTSLED +K H
Subjt:  RAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRAADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G03150.1 unknown protein8.8e-2153.93Show/hide
Query:  RRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRAADGGHY-SGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH
        RR+ H+S YDKN+++++  S VPD+VI+   +DKYW+PHP+TGVFGP+T   +A      A+G H  + V EE AWFRPTSLEDS+K H
Subjt:  RRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRAADGGHY-SGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH

AT5G17165.1 unknown protein3.9e-2156.32Show/hide
Query:  RAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRAADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH
        R  HTS YDKN++E+++PS VPD++I+   +DKYW+PHPQTGVFGP++ +  A    R   GG    V EEKAWFRPTSLED +K H
Subjt:  RAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRAADGGHYSGVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGCTAATTCGAGGAGCGCAGGAGCGATCGCCGGCTTGGGGAAACGAATCACTGACCAGATCTGGAACAGCGATCCACTTCGCAACTCTGTGATCTCTTCCTCTGC
TCCGAAGTTCAGGAGAGCAGCTCACACCTCAGTGTATGACAAGAACCTGGACGAGCAAGTTCGACCAAGTGTAGTCCCAGATGATGTGATTCAGGCTCAAGCTGCAGATA
AATACTGGGCTCCTCATCCACAAACCGGGGTTTTTGGGCCAGCCACTGAGAACCCTGCTGCAGACGCGGGCAACCGTGCAGCAGATGGTGGCCATTACTCTGGTGTGGAG
GAGGAAAAGGCTTGGTTCCGACCAACAAGTCTGGAGGATTCGGAGAAGCCCCACGGGTTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCGCTAATTCGAGGAGCGCAGGAGCGATCGCCGGCTTGGGGAAACGAATCACTGACCAGATCTGGAACAGCGATCCACTTCGCAACTCTGTGATCTCTTCCTCTGC
TCCGAAGTTCAGGAGAGCAGCTCACACCTCAGTGTATGACAAGAACCTGGACGAGCAAGTTCGACCAAGTGTAGTCCCAGATGATGTGATTCAGGCTCAAGCTGCAGATA
AATACTGGGCTCCTCATCCACAAACCGGGGTTTTTGGGCCAGCCACTGAGAACCCTGCTGCAGACGCGGGCAACCGTGCAGCAGATGGTGGCCATTACTCTGGTGTGGAG
GAGGAAAAGGCTTGGTTCCGACCAACAAGTCTGGAGGATTCGGAGAAGCCCCACGGGTTGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAANSRSAGAIAGLGKRITDQIWNSDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNLDEQVRPSVVPDDVIQAQAADKYWAPHPQTGVFGPATENPAADAGNRAADGGHYSGVE
EEKAWFRPTSLEDSEKPHGL