; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc08G06400 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc08G06400
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptiondormancy-associated protein 2-like isoform X2
Genome locationClcChr08:17862521..17864133
RNA-Seq ExpressionClc08G06400
SyntenyClc08G06400
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578909.1 hypothetical protein SDJN03_23357, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.0e-3876.72Show/hide
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KAG7016430.1 hypothetical protein SDJN02_21539, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.0e-3872.44Show/hide
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XP_022939479.1 dormancy-associated protein 2-like isoform X2 [Cucurbita moschata]3.3e-3775Show/hide
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XP_022993935.1 P granule abnormality protein 1-like [Cucurbita maxima]7.0e-4074.02Show/hide
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XP_023551561.1 N66 matrix protein-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.6e-3875.86Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0D9YLK2 Uncharacterized protein3.6e-1351.49Show/hide
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        L L LL+    VAA L   + +  + G G         P+GRSGYN   P+GRSGYN   P+GRSGYN   PDGRSGYN   PNGR GYN   P GR GY
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        N
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A0A0E0JUX0 Uncharacterized protein3.6e-1368.85Show/hide
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A0A6J1FHA4 dormancy-associated protein 2-like isoform X21.6e-3775Show/hide
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A0A6J1FLR8 N66 matrix protein-like isoform X18.7e-3673.28Show/hide
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A0A6J1JZW6 P granule abnormality protein 1-like3.4e-4074.02Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAACTCTAAGGCTGCCGGAGTCATGGCCATGGCCGCGTTCCTTGCCCTCTTCCTCCTCATATCCACCGGCAACGTGGCGGCCGCTCTGCCCTATCAGTCGATGTT
ACCACAACAATTTGGACTTGGACGAAAGGTTCTTGAAGAGAAATATGAACCCAACGGTAGAAGTGGATATAACAAATATGAACCCAACGGCAGAAGTGGATATAACAAAT
ATGAACCCAACGGCAGAAGTGGATATAACAAATATGAACCCGATGGCAGAAGTGGATATAACAAATATGAACCCAATGGCAGAAGTGGCTACAATGGCAACAAGCCCACG
GGAAGGGGAGGATATAATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGAACTCTAAGGCTGCCGGAGTCATGGCCATGGCCGCGTTCCTTGCCCTCTTCCTCCTCATATCCACCGGCAACGTGGCGGCCGCTCTGCCCTATCAGTCGATGTT
ACCACAACAATTTGGACTTGGACGAAAGGTTCTTGAAGAGAAATATGAACCCAACGGTAGAAGTGGATATAACAAATATGAACCCAACGGCAGAAGTGGATATAACAAAT
ATGAACCCAACGGCAGAAGTGGATATAACAAATATGAACCCGATGGCAGAAGTGGATATAACAAATATGAACCCAATGGCAGAAGTGGCTACAATGGCAACAAGCCCACG
GGAAGGGGAGGATATAATTAAACTTTATAATCTCTTCTACAAAATCATCCCTCTTTAATTATAATACTTTCTATAATATATAAATATATACACATATATATCATATGTGT
GTTGATATAGAAAAATAAATAAATGTTTGGGTTTGAATTTGTGTGTGTTTCTAATCTACATGTAAATTTGTGGTGTATATTATAATAATATGGATAGACTTCAACTAGAA
GTCTAACTATAACAGTGGAGATTCGAACATTTAAACCTTTAGTTGAAATATAGTATATTTTCTGTAGTACATTTATAATATCTTCTTTATTGTGTGTTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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