CuGenDBv2

Gene ID	Clc08G07670
Organism	Citrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Description	Protein of unknown function (DUF1997)
Genome location	ClcChr08:19255805..19260260
RNA-Seq Expression	Clc08G07670
Synteny	Clc08G07670
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR018971 - Protein of unknown function DUF1997

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_008456550.1 PREDICTED: uncharacterized protein SYNPCC7002_A1590 isoform X1 [Cucumis melo]

2.9e-106

95.69

Show/hide

Query:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL
        S  +DS RPSL ISTNSNPKARF+ARRSESVTVRQL RPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVE+QPNGCCIKL
Subjt:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL

Query:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
        LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRF AQLVKDYQAWASGDTS
Subjt:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS

Query:  RQPLGTGEI
        RQPLGTGEI
Subjt:  RQPLGTGEI

XP_022939661.1 uncharacterized protein LOC111445487 isoform X1 [Cucurbita moschata]

4.9e-106

96.6

Show/hide

Query:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL
        S  DDSPRPSLRIS NSNPKARF+ARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVL+VRVEVQPNGCCIKL
Subjt:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL

Query:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
        LSCKLEGSPIVVAQNDKFDA MVNQISYDVNRG+SPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
Subjt:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS

Query:  RQPLGT
        RQPLGT
Subjt:  RQPLGT

XP_022939662.1 uncharacterized protein LOC111445487 isoform X2 [Cucurbita moschata]

6.8e-108

96.65

Show/hide

Query:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL
        S  DDSPRPSLRIS NSNPKARF+ARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVL+VRVEVQPNGCCIKL
Subjt:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL

Query:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
        LSCKLEGSPIVVAQNDKFDA MVNQISYDVNRG+SPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
Subjt:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS

Query:  RQPLGTGEI
        RQPLGTGEI
Subjt:  RQPLGTGEI

XP_022992978.1 uncharacterized protein LOC111489142 isoform X2 [Cucurbita maxima]

8.9e-108

96.17

Show/hide

Query:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL
        S  DDSPRPSLRIS NSNPKARF+ARRSES+TVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVL+VRVEVQPNGCCIKL
Subjt:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL

Query:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
        LSCKLEGSPIVVAQNDKFDA MVNQISYDVNRG+SPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
Subjt:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS

Query:  RQPLGTGEI
        RQPLGTGEI
Subjt:  RQPLGTGEI

XP_038883978.1 uncharacterized protein SYNPCC7002_A1590 isoform X1 [Benincasa hispida]

4.0e-108

96.65

Show/hide

Query:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL
        S  DDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIER+DD TFRCYVYRFKFFAFEVCPVL+VRVEVQPNGCCIKL
Subjt:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL

Query:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
        LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTS+TVIEVNIEIPFAFRAIP+QAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
Subjt:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS

Query:  RQPLGTGEI
        RQPLGTGEI
Subjt:  RQPLGTGEI

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3C468 uncharacterized protein SYNPCC7002_A1590 isoform X1

1.4e-106

95.69

Show/hide

Query:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL
        S  +DS RPSL ISTNSNPKARF+ARRSESVTVRQL RPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVE+QPNGCCIKL
Subjt:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL

Query:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
        LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRF AQLVKDYQAWASGDTS
Subjt:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS

Query:  RQPLGTGEI
        RQPLGTGEI
Subjt:  RQPLGTGEI

A0A5D3BDM7 Uncharacterized protein

1.4e-106

95.69

Show/hide

Query:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL
        S  +DS RPSL ISTNSNPKARF+ARRSESVTVRQL RPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVE+QPNGCCIKL
Subjt:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL

Query:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
        LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRF AQLVKDYQAWASGDTS
Subjt:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS

Query:  RQPLGTGEI
        RQPLGTGEI
Subjt:  RQPLGTGEI

A0A6J1FGJ8 uncharacterized protein LOC111445487 isoform X1

2.4e-106

96.6

Show/hide

Query:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL
        S  DDSPRPSLRIS NSNPKARF+ARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVL+VRVEVQPNGCCIKL
Subjt:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL

Query:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
        LSCKLEGSPIVVAQNDKFDA MVNQISYDVNRG+SPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
Subjt:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS

Query:  RQPLGT
        RQPLGT
Subjt:  RQPLGT

A0A6J1FHF9 uncharacterized protein LOC111445487 isoform X2

3.3e-108

96.65

Show/hide

Query:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL
        S  DDSPRPSLRIS NSNPKARF+ARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVL+VRVEVQPNGCCIKL
Subjt:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL

Query:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
        LSCKLEGSPIVVAQNDKFDA MVNQISYDVNRG+SPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
Subjt:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS

Query:  RQPLGTGEI
        RQPLGTGEI
Subjt:  RQPLGTGEI

A0A6J1K0U6 uncharacterized protein LOC111489142 isoform X2

4.3e-108

96.17

Show/hide

Query:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL
        S  DDSPRPSLRIS NSNPKARF+ARRSES+TVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVL+VRVEVQPNGCCIKL
Subjt:  SGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKL

Query:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
        LSCKLEGSPIVVAQNDKFDA MVNQISYDVNRG+SPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS
Subjt:  LSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTS

Query:  RQPLGTGEI
        RQPLGTGEI
Subjt:  RQPLGTGEI

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G04440.1 Protein of unknown function (DUF1997)

3.8e-88

74.66

Show/hide

Query:  SGSGFDDSPRPS----------LRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVR
        S S FD+SP+PS          +R+S++S PKARFIAR+ +SV+VRQL RPL EYMSLPASQYSVLDAERIER+DD TFRCYVY FKFF FEVCPVL+VR
Subjt:  SGSGFDDSPRPS----------LRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPASQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVR

Query:  VEVQPNGCCIKLLSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLV
        VE QPNGCCIKLLSCKLEGSP+VVAQNDKFDA MVN++S D  +  S  Q++TSD VIEVNIEIPFAFR  PV AIE+ GTQVL+QILKLMLPRF +QL 
Subjt:  VEVQPNGCCIKLLSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRAIPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLV

Query:  KDYQAWASGDTSRQPLGTGEI
        KDY AWASGDTSRQPLGTGEI
Subjt:  KDYQAWASGDTSRQPLGTGEI

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGATCAACAGAGCGATTGGGGCTACATTGATGGCTTTGTTCCTCGTGGACCTCGCCTTCGCTGCCCGATCGCCGAGGAGAGGGTTTGGTGAAGGAGGCGGTGGCGG
AAGTGGCGGTGGAGGAGGAGGAGGACTGCTTCCAGGTTCGGGTTACGGTTCTGGTTTTGGTTCTGGCGGAGGCGAAGGATACGATGAGGGAGAAGGCGACGGAGCGTTCG
GCAGAGGCGGTGGCGGTGGCGGAGGAAGCGGTGGTGGAGGTGGGGGCGGAACAGGGTCTGGATCCGGATTCGGGTCTGGATTCGGATCAGGAAGCGGTTCCGGGTTTGGA
AGAGGCGGCGGAGGCGGAGGCGGTGGGGGCAGAGGAGGAGGGGGAGGTGGAGGTTCCGGAGGCGGAAATGGATCAGGCTACGGCTCGGGATACGGCAGCGGAGGCGGATA
TGGCAGTGGGAGCGGCAAAGGAGGCGGTGGAGGAGGAGGAGGAGGTGGCGGGGGCGGAGGTTCTACCGGGAGTGGCTCTGGATTTGACGATTCTCCCAGGCCTTCGCTTC
GGATCTCCACGAATTCCAATCCAAAAGCGCGTTTCATTGCCCGGAGGAGTGAGTCCGTCACGGTTCGGCAGTTGGCGCGGCCTCTAAATGAGTATATGAGTTTGCCGGCT
AGTCAATACTCGGTGTTGGATGCGGAGAGGATTGAGCGGATTGATGACTGCACCTTTAGGTGTTATGTTTATAGATTTAAATTCTTTGCGTTTGAGGTTTGCCCTGTTTT
GGTTGTTAGAGTTGAAGTGCAGCCTAATGGGTGTTGTATCAAGCTGCTGTCGTGTAAGCTTGAGGGCTCCCCAATCGTGGTTGCACAGAATGATAAATTTGATGCTTATA
TGGTGAACCAGATATCTTATGATGTGAATCGAGGCAACTCACCCTTGCAGAAGCTCACATCGGATACTGTCATCGAGGTTAACATTGAGATTCCTTTCGCCTTCCGTGCA
ATTCCTGTACAAGCAATTGAATCAGCTGGGACCCAAGTCCTTGAACAAATATTGAAGCTCATGCTTCCCCGCTTCACAGCCCAGCTTGTGAAGGACTATCAAGCATGGGC
CTCTGGCGATACATCAAGGCAACCTCTTGGAACGGGTGAGATCTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAINRAIGATLMALFLVDLAFAARSPRRGFGEGGGGGSGGGGGGGLLPGSGYGSGFGSGGGEGYDEGEGDGAFGRGGGGGGGSGGGGGGGTGSGSGFGSGFGSGSGSGFG
RGGGGGGGGGRGGGGGGGSGGGNGSGYGSGYGSGGGYGSGSGKGGGGGGGGGGGGGGSTGSGSGFDDSPRPSLRISTNSNPKARFIARRSESVTVRQLARPLNEYMSLPA
SQYSVLDAERIERIDDCTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLVVRVEVQPNGCCIKLLSCKLEGSPIVVAQNDKFDAYMVNQISYDVNRGNSPLQKLTSDTVIEVNIEIPFAFRA
IPVQAIESAGTQVLEQILKLMLPRFTAQLVKDYQAWASGDTSRQPLGTGEI

Clc08G07670 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome