CuGenDBv2

Gene ID	Clc08G09935
Organism	Citrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Description	ribosomal protein L16
Genome location	ClcChr08:21285107..21287253
RNA-Seq Expression	Clc08G09935
Synteny	Clc08G09935
Gene Ontology terms	GO:0032543 - mitochondrial translation (biological process) GO:0005762 - mitochondrial large ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR000114 - Ribosomal protein L16 IPR016180 - Ribosomal protein L10e/L16 IPR020798 - Ribosomal protein L16, conserved site IPR036920 - Ribosomal protein L10e/L16 superfamily

Homology

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AEN56098.1 ribosomal protein L16 [Cucumis melo subsp. melo]

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A0A5J6Y2L9 Ribosomal protein L16

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A0A7D6C0E5 Ribosomal protein L16

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A0A7L9QAD0 Ribosomal protein L16

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D5I3A2 Ribosomal protein L16

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G3EU15 Ribosomal protein L16

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SwissProt top hits

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P27927 60S ribosomal protein L16, mitochondrial

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P46801 60S ribosomal protein L16, mitochondrial

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P49389 60S ribosomal protein L16, mitochondrial

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Q04715 60S ribosomal protein L16, mitochondrial

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Q95747 60S ribosomal protein L16, mitochondrial

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AT2G28830.1 PLANT U-BOX 12

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ATCG00790.1 ribosomal protein L16

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ATMG00080.1 ribosomal protein L16

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCATGAGCTGAGGCTCCCATGTCCCGCCGACCCTCCGAAAAAGTCAGGTCGTCAAACGGCTCATAGGGAGTCAGAAGCAAGCGGAGTCAAAGGCGGGTCAAACTCACA
TAAGCGGAGGGGGAGACACATTCATGAAAAGCAAGAAGCCGCGGGGGACTGGCCAACTATGAATAGATATCTGACTTTCGGCTGTTTCCGTAACTCCACTCTCGACTTGG
ATTATATATCCAAAAAGGTCCGCTCTCGGCCATTCCACACGCTGCCTAGCAGAGGCGTGCGCTTTCGTACGAAATATAGTAAATATCGTAAAGGCAGATGTAGTAGGGGT
TGCAAATCGGACGGTACACAACTTGGTTTTGGAAGATATGGCACTCAAAGTTGTAGAGCTGGTCGTCTTTCATATCGAGCCATTGAAGCAGCGCGTCGGGCTATAATCGG
ACAATTCCGAAGAAATGGTAAAATATGGGTAAGAGTTCTCGCAGATCTCCCTATTTCCGGGAAACCTACAGAAGTTAGAATGGGAAGAGGAAAAGGAAATCCTACGGGTT
GGATTGCTCGTGTGTCCACGGGACAAATCCCATTTGAAATGGATGGTGTGAGTTTGTCAAATGCTCGACAAGCCGCTACATTAGCGGCGCATAAACCATGTTCGTCAACC
AATCGGCGAGATGGGCGGACCCAGGACGGTTCAAGGGGAACTTTCTTGCGGGATGGGTTCTCCAATTCAAGCAAGTCTAGCAAGGTCTCGATCTTTACAAGGCCTTTTTC
GTTATGGTTTCAACAAGGACCAAGATTTGTGGAAGCCTCTGAAAAAGAAACTTACTTAGGAGAGAATTCTGCAGAATTGGAGAGCACAACACTTCTAGTGCCACTGCCAC
TGAGGAAGTCTCGCAAAGGTCACATATTACTTGTTAAGACAGCTGACTATTGGTCAATCAAATCCCAAATTAGTCGAAATTCGAGCTTGGAAAAATTGGTTCCTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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CKSDGTQLGFGRYGTQSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFRRNGKIWVRVLADLPISGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARVSTGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSST
NRRDGRTQDGSRGTFLRDGFSNSSKSSKVSIFTRPFSLWFQQGPRFVEASEKETYLGENSAELESTTLLVPLPLRKSRKGHILLVKTADYWSIKSQISRNSSLEKLVP

Clc08G09935 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome