; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc08G11590 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc08G11590
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationClcChr08:22802898..22803664
RNA-Seq ExpressionClc08G11590
SyntenyClc08G11590
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598702.1 hypothetical protein SDJN03_08480, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-2854.55Show/hide
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        SYYSSS PSSS+SPYFPR K+SISS    LFKRRS  +  TN                      GFWSKLMMNRR K++V  +  RS
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KAG7029644.1 hypothetical protein SDJN02_07984, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.2e-2753.48Show/hide
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XP_008444863.1 PREDICTED: uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Cucumis melo]1.1e-4867.63Show/hide
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        YSSSSPSSSSSPYF  KK SISSMS+LLFKRR      S+S+ TTNTNFF         HHRNN+     GFWSKLMMNRRGKEIVEE TLR S  ++TT
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XP_022131967.1 uncharacterized protein LOC111004952 [Momordica charantia]2.5e-2153.26Show/hide
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        KLKDHAAAAM +      G GG        RCRKHPKH+QSPGVCS+CLREKLS L       NT    S+  KI  S SSSSLSS+SS YSS+S +S  
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        SS P   R+K SIS MS+ LFKRRS++    N    +++SLAD           G WSKL++NRRGK   E+TLRRS S TTDH
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XP_031736533.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Cucumis sativus]1.1e-4566.03Show/hide
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        SYYSSSSPSSSSSPY   KK S+SSMS+LLFKRR      S+++ TTNTNFFT    ADA HHR NN S  GFWSKLMMNRRGKEI+ E  TLR S  ++
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPJ0 Uncharacterized protein5.4e-4666.03Show/hide
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A0A1S3BC83 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like5.2e-4967.63Show/hide
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A0A5B7BTV4 Uncharacterized protein (Fragment)6.2e-1038.46Show/hide
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        + RC+KHPKH+QSPGVCS+CLRE+LS L  S   + T T +SS+     S SSSSLSSLSS+YS    SS SSP   R + +  +  ++ F + + S + 
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             F  +   + + H + + + GFWSKL+  R  +  ++E L  S +  +  T+
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A0A6J1BSJ2 uncharacterized protein LOC1110049521.2e-2153.26Show/hide
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A0A7N2QY54 Uncharacterized protein4.3e-1143.87Show/hide
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        S    N +C+KHPKHKQ+PGVC++CL E+LS L+ +G    T T + S      S  SSSLSS+SSYYSSSS SS SSP   R  TSIS   S  N+L K
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         RS +        F  +  +  D+  N   + GFWS L+  R  ++  EE+L  S
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G22470.1 unknown protein2.4e-0644.05Show/hide
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        K   S+++ N  C+KHPKH+QSPG+CS+CL E LS L+      ++  +SSS  K + S SS+S  S        +SSYYSS S
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AT1G72240.1 unknown protein4.4e-0845.05Show/hide
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        K +  G      SN++NN  C+KH KH+QSPG+CS+CL E+LS L++   +  TK A   T     S S+SS SS+SS YSSSS SS SSP  Y  R+K 
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              + LF+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCAAAGAACAACTTGAGTAGCAAACTAAAGGATCATGCGGCGGCGGCAATGGGAAAAAATTCCAACCACGGCGGCGGAAAGGGCGGCGGTAGCAACAATAAC
AACAATACTCGATGTCGGAAACACCCAAAACACAAGCAATCACCCGGCGTTTGCTCTGTTTGTCTAAGAGAAAAACTCTCGAATTTAGCAATTTCGGGTCCCTTC
AGCAATACTAAAACAGCTTCTTCCTCTACAAAAAAAATAATTCCTTCTTTTTCATCTTCTTCGTTATCATCTTTATCTTCTTATTACTCTTCTTCTTCCCCTTCT
TCTTCCTCTTCCCCATATTTTCCAAGAAAAAAAACCTCAATTTCTTCCATGTCCAACTTGTTATTCAAAAGAAGATCAGCATCATCAACAACAACAAACACTAAT
TTCTTCACAACTAAATCTCTAGCTGATGCAGATCATCATAGAAACAACCATTCCCAGCTTGGGTTTTGGTCAAAATTGATGATGAATCGAAGAGGAAAAGAAATT
GTTGAAGAAACTTTGAGGCGCTCAACTTCTACAACAGATCATCAAACAATTACTACTACCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCTCGAAGTGCACCCACTTTCCACTTTCCACTTTCTTTTTCCCTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAATTCTCCTTTAAATATATTACCATATCAATCGCCAACACCAA
AAAAAAATTCAACTTCCCAAATTCAAAAATGATTGAACAACAACAACAATGCCAAAGAACAACTTGAGTAGCAAACTAAAGGATCATGCGGCGGCGGCAATGGGA
AAAAATTCCAACCACGGCGGCGGAAAGGGCGGCGGTAGCAACAATAACAACAATACTCGATGTCGGAAACACCCAAAACACAAGCAATCACCCGGCGTTTGCTCT
GTTTGTCTAAGAGAAAAACTCTCGAATTTAGCAATTTCGGGTCCCTTCAGCAATACTAAAACAGCTTCTTCCTCTACAAAAAAAATAATTCCTTCTTTTTCATCT
TCTTCGTTATCATCTTTATCTTCTTATTACTCTTCTTCTTCCCCTTCTTCTTCCTCTTCCCCATATTTTCCAAGAAAAAAAACCTCAATTTCTTCCATGTCCAAC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SSSSPYFPRKKTSISSMSNLLFKRRSASSTTTNTNFFTTKSLADADHHRNNHSQLGFWSKLMMNRRGKEIVEETLRRSTSTTDHQTITTT