; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc08G11630 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc08G11630
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationClcChr08:22815156..22820812
RNA-Seq ExpressionClc08G11630
SyntenyClc08G11630
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_011649671.1 uncharacterized protein LOC105434653 isoform X1 [Cucumis sativus]3.2e-4959.53Show/hide
Query:  MSILSISSSSSSTYLRSTFQSHRHLHGSNLKTT----PTSLP-FPTTK-NPKNSTFHIINFRDKMAIYSGDA-GGLPPLPPLPNTP--LPLWVAGVLLSA
        MSILSISSSS+   L +    H H HGSNL  T      SLP  PTTK NPK+ST         MAIYS D+  GLP LPP  +TP   PLW+AGV+LSA
Subjt:  MSILSISSSSSSTYLRSTFQSHRHLHGSNLKTT----PTSLP-FPTTK-NPKNSTFHIINFRDKMAIYSGDA-GGLPPLPPLPNTP--LPLWVAGVLLSA

Query:  ILSIWKTKNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAENELSSFIKQ
        +LSIWKTKNYW PFLTLKEK+D+VV+  EDVAEM  +AA++VDK AE+I  +LP+GS+LQK A  V++ AE+I KDAD+AGD+ +K + AE+ELSS +  
Subjt:  ILSIWKTKNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAENELSSFIKQ

Query:  SGESKEEDDAKQKND
        SGES EEDD KQKND
Subjt:  SGESKEEDDAKQKND

XP_011649672.1 uncharacterized protein LOC105434653 isoform X2 [Cucumis sativus]9.9e-5160.09Show/hide
Query:  MSILSISSSSSSTYLRSTFQSHRHLHGSNLKTT----PTSLP-FPTTK-NPKNSTFHIINFRDKMAIYSGDA-GGLPPLPPLPNTPLPLWVAGVLLSAIL
        MSILSISSSS+   L +    H H HGSNL  T      SLP  PTTK NPK+ST         MAIYS D+  GLP LPP  +TP PLW+AGV+LSA+L
Subjt:  MSILSISSSSSSTYLRSTFQSHRHLHGSNLKTT----PTSLP-FPTTK-NPKNSTFHIINFRDKMAIYSGDA-GGLPPLPPLPNTPLPLWVAGVLLSAIL

Query:  SIWKTKNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAENELSSFIKQSG
        SIWKTKNYW PFLTLKEK+D+VV+  EDVAEM  +AA++VDK AE+I  +LP+GS+LQK A  V++ AE+I KDAD+AGD+ +K + AE+ELSS +  SG
Subjt:  SIWKTKNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAENELSSFIKQSG

Query:  ESKEEDDAKQKND
        ES EEDD KQKND
Subjt:  ESKEEDDAKQKND

XP_038886505.1 uncharacterized protein LOC120076681 isoform X1 [Benincasa hispida]1.1e-7881.19Show/hide
Query:  MSILSISSSSSSTYLRST-FQSHRHLHGSNLKTTPTSLPFPTTKNPKNSTFHIINFRDKMAIY-SGDAGGLPPLPPLPNTPLPLWVAGVLLSAILSIWKT
        MSI+SI  SSSST+LRST  QSHR  HGSNL TT   LPFPTT NPK ST    N    MAIY SGDA GLPPLPPLP+TP PLWVAGVL+SA+LSIW+T
Subjt:  MSILSISSSSSSTYLRST-FQSHRHLHGSNLKTTPTSLPFPTTKNPKNSTFHIINFRDKMAIY-SGDAGGLPPLPPLPNTPLPLWVAGVLLSAILSIWKT

Query:  KNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAENELSSFIKQSGESKEE
        K+YWGPFLTLKEKVD+VVDVVE+VAEMVETAAERVDKVAEEI EHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDK+EAAE ELSSFIKQ+GESKE 
Subjt:  KNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAENELSSFIKQSGESKEE

Query:  DDAKQKNDQTEALNEQSK
        +D+KQKNDQTEAL+EQS+
Subjt:  DDAKQKNDQTEALNEQSK

XP_038886506.1 uncharacterized protein LOC120076681 isoform X2 [Benincasa hispida]4.6e-6478.72Show/hide
Query:  MSILSISSSSSSTYLRST-FQSHRHLHGSNLKTTPTSLPFPTTKNPKNSTFHIINFRDKMAIY-SGDAGGLPPLPPLPNTPLPLWVAGVLLSAILSIWKT
        MSI+SI  SSSST+LRST  QSHR  HGSNL TT   LPFPTT NPK ST    N    MAIY SGDA GLPPLPPLP+TP PLWVAGVL+SA+LSIW+T
Subjt:  MSILSISSSSSSTYLRST-FQSHRHLHGSNLKTTPTSLPFPTTKNPKNSTFHIINFRDKMAIY-SGDAGGLPPLPPLPNTPLPLWVAGVLLSAILSIWKT

Query:  KNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAENELS
        K+YWGPFLTLKEKVD+VVDVVE+VAEMVETAAERVDKVAEEI EHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDK +     LS
Subjt:  KNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAENELS

XP_038886507.1 uncharacterized protein LOC120076681 isoform X3 [Benincasa hispida]7.8e-6481.11Show/hide
Query:  MSILSISSSSSSTYLRST-FQSHRHLHGSNLKTTPTSLPFPTTKNPKNSTFHIINFRDKMAIY-SGDAGGLPPLPPLPNTPLPLWVAGVLLSAILSIWKT
        MSI+SI  SSSST+LRST  QSHR  HGSNL TT   LPFPTT NPK ST    N    MAIY SGDA GLPPLPPLP+TP PLWVAGVL+SA+LSIW+T
Subjt:  MSILSISSSSSSTYLRST-FQSHRHLHGSNLKTTPTSLPFPTTKNPKNSTFHIINFRDKMAIY-SGDAGGLPPLPPLPNTPLPLWVAGVLLSAILSIWKT

Query:  KNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKI
        K+YWGPFLTLKEKVD+VVDVVE+VAEMVETAAERVDKVAEEI EHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDK+
Subjt:  KNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKI

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BDR2 uncharacterized protein LOC1034885521.2e-3858.6Show/hide
Query:  MSILSISSSSSSTYLRS-TFQSHR-HLHGSNLKT-----TPTSLPFPTTK-NPKNSTFHIINFRDKMAIYSGDAGGLPPLPPLPNTPLPLWVAGVLLSAI
        M ILSI  SSSSTY  S T +SH  H  GS+L          SL  PTTK N KNST         MAI+S D+ GLPP  P  NTP  LW+AGV+LSAI
Subjt:  MSILSISSSSSSTYLRS-TFQSHR-HLHGSNLKT-----TPTSLPFPTTK-NPKNSTFHIINFRDKMAIYSGDAGGLPPLPPLPNTPLPLWVAGVLLSAI

Query:  LSIWKTKNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKI
        LSIWKTKNYW PFL LKEKVD VV+  E+ AEM ET A+ VDK AE+I EHLP+GS LQK A  V++AA++I KDADLAGD  +K+
Subjt:  LSIWKTKNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKI

A0A5A7VBX0 Uncharacterized protein1.2e-3858.6Show/hide
Query:  MSILSISSSSSSTYLRS-TFQSHR-HLHGSNLKT-----TPTSLPFPTTK-NPKNSTFHIINFRDKMAIYSGDAGGLPPLPPLPNTPLPLWVAGVLLSAI
        M ILSI  SSSSTY  S T +SH  H  GS+L          SL  PTTK N KNST         MAI+S D+ GLPP  P  NTP  LW+AGV+LSAI
Subjt:  MSILSISSSSSSTYLRS-TFQSHR-HLHGSNLKT-----TPTSLPFPTTK-NPKNSTFHIINFRDKMAIYSGDAGGLPPLPPLPNTPLPLWVAGVLLSAI

Query:  LSIWKTKNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKI
        LSIWKTKNYW PFL LKEKVD VV+  E+ AEM ET A+ VDK AE+I EHLP+GS LQK A  V++AA++I KDADLAGD  +K+
Subjt:  LSIWKTKNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKI

A0A6J1BVN6 uncharacterized protein LOC1110051381.1e-3651.17Show/hide
Query:  MSILSISSSSSSTYLRSTFQSHRHLHGSNLKTTPTSLPFPTTKNP--KNSTFH---IINFRDKMAIYSGDAGGLPPLPPLP-NTPLPLWVAGVLLSAILS
        MSI+S+ SS  S          RH    NL      LPF +T     K S+ H   I  +R +MAIYSG+  G P LP LP   P PLW+ G+L+SAIL 
Subjt:  MSILSISSSSSSTYLRSTFQSHRHLHGSNLKTTPTSLPFPTTKNP--KNSTFH---IINFRDKMAIYSGDAGGLPPLPPLP-NTPLPLWVAGVLLSAILS

Query:  IWKTKNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAENELSSFIKQSGE
            K  W PFL L + VD+VVD VE+VAEMVETAAE V+KVAEE+ EHLP+G +LQKAALF+ENAA+ ++KDA +A  I+ KIE  E+++ S  K++GE
Subjt:  IWKTKNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAENELSSFIKQSGE

Query:  SKEEDDAKQKNDQ
        +KEE+DA+QK DQ
Subjt:  SKEEDDAKQKNDQ

A0A6J1HCK6 uncharacterized protein LOC1114627543.7e-4357.55Show/hide
Query:  MSILSISSSSSSTYLRSTFQSHRH---LHGSNLKTTPTSLPFPTTKNPKNSTFHIINFRDKMAIYSGDAGGLP-----PLPPLPNTPLPLWVAGVLLSAI
        MSI+S+SS S++  LRS   S RH   L+ S+L     SLP P T  PKN   HI  +RD MA+Y G  GGL      P PP P TP PLWVAG +LSAI
Subjt:  MSILSISSSSSSTYLRSTFQSHRH---LHGSNLKTTPTSLPFPTTKNPKNSTFHIINFRDKMAIYSGDAGGLP-----PLPPLPNTPLPLWVAGVLLSAI

Query:  LSIWKTKNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAENELSSFIKQS
        LSIWKT  YW PFL LK++V++VV V EDV +MVETAAE VDKVAEEI +HLP+ S LQK A+ VEN AE +AKDA+LA DII K+E  ++ L+S IK+ 
Subjt:  LSIWKTKNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAENELSSFIKQS

Query:  GESKEEDDAKQK
        G SK E DAK K
Subjt:  GESKEEDDAKQK

A0A6J1K717 uncharacterized protein LOC1114922234.6e-4658.88Show/hide
Query:  MSILSISSSSSSTYLRSTFQSHRH---LHGSNLKTTPTSLPFPTTKNPKNSTFHIINFRDKMAIYSGDAGG------LP-PLPPLPNTPLPLWVAGVLLS
        MSI+S+S SS+S  LRST QS RH   L+ S+L     SLPFP T  PKN   HI  +RD MA+Y G  GG      LP P PP P TP PLWVAG +LS
Subjt:  MSILSISSSSSSTYLRSTFQSHRH---LHGSNLKTTPTSLPFPTTKNPKNSTFHIINFRDKMAIYSGDAGG------LP-PLPPLPNTPLPLWVAGVLLS

Query:  AILSIWKTKNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAENELSSFIK
        AILSIWKT  YWGPFL LK++V++VV V EDV +MVETAA+ VDKV+EEI +HLP+ S LQK A+ VEN AE +AKDA+LA +II K+E  ++ LSS IK
Subjt:  AILSIWKTKNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAENELSSFIK

Query:  QSGESKEEDDAKQK
        + G SK E DAK K
Subjt:  QSGESKEEDDAKQK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G14095.1 unknown protein1.0e-0833.81Show/hide
Query:  WVAGVLLSAILSIWKTKNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAE
        WV G  +S +LS W  +        ++ + + VV+ VE VAEMVE  A   D++AEE+ E LPE +KL++ AL +E+ +E  A +A L  D + K+E   
Subjt:  WVAGVLLSAILSIWKTKNYWGPFLTLKEKVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAE

Query:  NELSSFIKQSGESKEEDDAKQKNDQTEALNEQSKEQSLN
         ++          K   D K  N +T+   +Q+KE+  N
Subjt:  NELSSFIKQSGESKEEDDAKQKNDQTEALNEQSKEQSLN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCATTCTTTCGATTTCTTCTTCTTCTTCTTCAACCTACCTTCGTTCCACCTTCCAATCCCACCGCCACCTCCATGGATCAAACCTTAAAACAACTCCCACAAGCTT
GCCTTTCCCAACCACCAAAAATCCCAAAAACTCAACTTTCCATATCATCAATTTTAGAGATAAAATGGCCATTTACAGCGGCGACGCCGGTGGACTTCCACCTCTTCCTC
CTCTCCCCAACACTCCTTTGCCATTATGGGTAGCTGGGGTGCTATTGTCTGCAATTCTATCAATTTGGAAGACCAAGAACTATTGGGGGCCTTTTCTTACGTTAAAGGAG
AAAGTGGATCAAGTGGTGGATGTGGTGGAGGACGTGGCGGAAATGGTGGAGACGGCAGCGGAGAGAGTGGATAAGGTGGCGGAAGAGATTGGTGAACATCTTCCGGAAGG
CAGCAAACTCCAAAAGGCTGCATTATTCGTCGAAAATGCAGCCGAAAGGATTGCTAAAGATGCTGATTTGGCAGGAGATATTATTGACAAGATTGAGGCAGCGGAAAACG
AGTTGAGTTCATTTATTAAGCAAAGTGGAGAAAGTAAAGAAGAAGACGACGCAAAGCAAAAGAATGATCAAACTGAAGCCCTTAACGAACAAAGCAAGGAGCAATCTCTT
AATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTAATCATAACAATAATCCTTTAGAAAATGTCCATTCTTTCGATTTCTTCTTCTTCTTCTTCAACCTACCTTCGTTCCACCTTCCAATCCCACCGCCACCTCCATGGAT
CAAACCTTAAAACAACTCCCACAAGCTTGCCTTTCCCAACCACCAAAAATCCCAAAAACTCAACTTTCCATATCATCAATTTTAGAGATAAAATGGCCATTTACAGCGGC
GACGCCGGTGGACTTCCACCTCTTCCTCCTCTCCCCAACACTCCTTTGCCATTATGGGTAGCTGGGGTGCTATTGTCTGCAATTCTATCAATTTGGAAGACCAAGAACTA
TTGGGGGCCTTTTCTTACGTTAAAGGAGAAAGTGGATCAAGTGGTGGATGTGGTGGAGGACGTGGCGGAAATGGTGGAGACGGCAGCGGAGAGAGTGGATAAGGTGGCGG
AAGAGATTGGTGAACATCTTCCGGAAGGCAGCAAACTCCAAAAGGCTGCATTATTCGTCGAAAATGCAGCCGAAAGGATTGCTAAAGATGCTGATTTGGCAGGAGATATT
ATTGACAAGATTGAGGCAGCGGAAAACGAGTTGAGTTCATTTATTAAGCAAAGTGGAGAAAGTAAAGAAGAAGACGACGCAAAGCAAAAGAATGATCAAACTGAAGCCCT
TAACGAACAAAGCAAGGAGCAATCTCTTAATTAAATGATATAAAATTATATGGTTGGATTATATAATGATCGACGTACCATTCATTTGGAACATAATATATTCATTTGTG
TGCATAGTAACTTTAATAGGGGCTACCTCCCAATCTAAACAATTGTTTTCGTATATAAAGTGCACCTATTACCACTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSILSISSSSSSTYLRSTFQSHRHLHGSNLKTTPTSLPFPTTKNPKNSTFHIINFRDKMAIYSGDAGGLPPLPPLPNTPLPLWVAGVLLSAILSIWKTKNYWGPFLTLKE
KVDQVVDVVEDVAEMVETAAERVDKVAEEIGEHLPEGSKLQKAALFVENAAERIAKDADLAGDIIDKIEAAENELSSFIKQSGESKEEDDAKQKNDQTEALNEQSKEQSL
N