; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc08G12380 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc08G12380
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionoxidative stress 3
Genome locationClcChr08:23673672..23674266
RNA-Seq ExpressionClc08G12380
SyntenyClc08G12380
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0065056.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold82G003850 [Cucumis melo var. makuwa]7.5e-5681.99Show/hide
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XP_022961691.1 uncharacterized protein LOC111462384 [Cucurbita moschata]6.6e-3666.67Show/hide
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XP_022996858.1 uncharacterized protein LOC111491976 [Cucurbita maxima]7.3e-3566.87Show/hide
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XP_031737345.1 uncharacterized protein LOC105434656 [Cucumis sativus]3.6e-5884.47Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LLW5 Uncharacterized protein2.7e-2784.21Show/hide
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A0A1S3BBN3 uncharacterized protein LOC1034881654.3e-5783.23Show/hide
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A0A5A7VFF0 Uncharacterized protein3.6e-5681.99Show/hide
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A0A6J1HB27 uncharacterized protein LOC1114623843.2e-3666.67Show/hide
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A0A6J1KC75 uncharacterized protein LOC1114919763.5e-3566.87Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G43850.1 unknown protein7.1e-0432.17Show/hide
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        K +++     +F+   S  S+ SIG  S     DDD        SS+        +  L   E  E+ LPIK+ +SKFY+GKS++F SLS+  S  ++DL
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         K E  Y ++       RI  +  ISKK  +S  A    + D+
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AT4G26288.1 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown1.5e-0638.64Show/hide
Query:  KEEKSILSHSQFSVSCSEGSTSSIGSISSSSVCD----DDALSSFSPSSSFSSLSLSSTSSLLSQSELHEQQLPIKKGLSKFYEGKSRTFSSLSDVKSIE
        KEE+ ++  S        GS++ + S SS S+C     +DA SS S SSS S+      S L+SQ  + + +   K GLSK+Y+GKS++F+SL++V S++
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Query:  DLAKKEKNYK---KKDSRISPKAAISKKHGRS
        DL K+    K   K+D    PKA IS K  R+
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AT5G56550.1 oxidative stress 32.5e-0939.86Show/hide
Query:  DHWNIKEEKSILSHSQFSVSCSEGSTSSIGSISSSSVCDDDALSSFSPSSSFSSLSLSSTSSLLSQSELHEQQLPIKKGLSKFYEGKSRTFSSLSDVKSI
        D   I+EE+ I+     + S  E ++SS     SSS+C D     F+       +S SS++  L         LPIK+GLSKFYEGKS++F+SL +VKS+
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Query:  EDLAK---KEKNY--KKKDSR-------------ISPKAAISKKHGRS
        EDL K   K +NY  K+K SR              SPKA ISKK  R+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTTTGTCCTCAACTTCATCTTTGTTATCTCAAAGTGAACTTCATGAGCAACAACTTCCTATCAAAAAAGGGTTGTCAAAATTTTATGAAGGAAAATCACGAACCTTTTCA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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