; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc08G16030 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc08G16030
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionThylakoidal processing peptidase 1
Genome locationClcChr08:26686145..26690056
RNA-Seq ExpressionClc08G16030
SyntenyClc08G16030
Gene Ontology termsGO:0006465 - signal peptide processing (biological process)
GO:0010027 - thylakoid membrane organization (biological process)
GO:0005887 - integral component of plasma membrane (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0004252 - serine-type endopeptidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000223 - Peptidase S26A, signal peptidase I
IPR019533 - Peptidase S26
IPR019756 - Peptidase S26A, signal peptidase I, serine active site
IPR019758 - Peptidase S26A, signal peptidase I, conserved site
IPR036286 - LexA/Signal peptidase-like superfamily


Homology Show/hide homology
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A0A5A7VHF7 Thylakoidal processing peptidase 16.7e-18191.57Show/hide
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A0A6J1CT20 thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic-like9.4e-17588.3Show/hide
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A0A6J1GIQ5 thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic-like isoform X11.9e-16784.92Show/hide
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O04348 Thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic2.9e-9656.46Show/hide
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        +LKS       +    GVSSFKA+SIIPFLQGSKW+        V DDVDKGG TVC D D   S+         S WV++LLS  SEDAKA FTA+TVS
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        EP++YEM+P+ VP+GYV+V+GDNRN S DSH+WGPLPIENIVGRS+F+YWPPSK S
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P72660 Probable signal peptidase I-16.5e-4048.17Show/hide
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Query:  GVVQDEDFVLEPIAYEMDPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWPPSK
        G    E+++LEP  Y +  + VP+G V+VMGDNRNNS DSH WG LP +NI+G +LF+++P S+
Subjt:  GVVQDEDFVLEPIAYEMDPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWPPSK

P73157 Probable signal peptidase I-25.3e-3442.42Show/hide
Query:  STYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGK
        +T+ E  K + TA+ +++  ++F+AE + IPSSSM PTL++ DR++ EK+SY  R PE  +IV+F     L+    + ++ FIKR++   GD V V +G 
Subjt:  STYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGK

Query:  LVVNGVVQDEDFVLEPIAYEMDPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWP
        + VNG + DE+++  P AYE  P+ VP+    V+GDNRNNS DSH WG +P E ++GR+  ++WP
Subjt:  LVVNGVVQDEDFVLEPIAYEMDPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWP

Q8H0W1 Chloroplast processing peptidase3.1e-5858.15Show/hide
Query:  EKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATS
        EK+      L   S+DA+ +F A+ VS+ F+ F+AEP+ IPS SM PT +VGDR++AEKVSY+FRKP  +DIVIF++P +LQE G +  +VFIKR+VA  
Subjt:  EKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATS

Query:  GDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVLEPIAYEMDPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWPPSKGSGMKL
        GD+V V  GKL+VNGV ++E F+LEP  YEM P+ VPE  V+VMGDNRNNS DSH WGPLP++NI+GRS+F+YWPP++ SG  L
Subjt:  GDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVLEPIAYEMDPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWPPSKGSGMKL

Q9M9Z2 Probable thylakoidal processing peptidase 2, chloroplastic2.1e-9454.4Show/hide
Query:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLR--AGNCRVFQEFWVRSCIFGSTHNPEL--KSAGSARNYRSDSRRFKPGDSVEKPTSMYSTLAGERVGESPKNPMVL
        MAIRVT +YS YVA+++ASS G R   G+ R   E WVR    G    P++  KS GS     S   R +P       +SMYST+A E + E  K+P+VL
Subjt:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLR--AGNCRVFQEFWVRSCIFGSTHNPEL--KSAGSARNYRSDSRRFKPGDSVEKPTSMYSTLAGERVGESPKNPMVL

Query:  GLMSMLKSMADSSVISTGTFGVSSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSRVSDD---VDKGGTTVCYDYDLCGSKQFYENDFEKSS----WVSRLLSTYSED
        G++S++              G+S FK +S+IPFL+GSKW+P   I + +S D   VD+GG        +C  K   E   + S+    WV++LL+  SED
Subjt:  GLMSMLKSMADSSVISTGTFGVSSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSRVSDD---VDKGGTTVCYDYDLCGSKQFYENDFEKSS----WVSRLLSTYSED

Query:  AKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGV
        AKA FTA+TVS+LF+S LAEPKSIPS+SM PTL+VGDR++AEKVSYFFRKPEVSDIVIF+AP IL E G S  +VFIKR+VA+ GD V V  GKL+VN  
Subjt:  AKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGV

Query:  VQDEDFVLEPIAYEMDPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWPPSKGS
        VQ EDFVLEPI YEM+P+ VPEGYV+V+GDNRN S DSH+WGPLPI+NI+GRS+F+YWPPSK S
Subjt:  VQDEDFVLEPIAYEMDPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWPPSKGS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06870.1 Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein1.5e-9554.4Show/hide
Query:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLR--AGNCRVFQEFWVRSCIFGSTHNPEL--KSAGSARNYRSDSRRFKPGDSVEKPTSMYSTLAGERVGESPKNPMVL
        MAIRVT +YS YVA+++ASS G R   G+ R   E WVR    G    P++  KS GS     S   R +P       +SMYST+A E + E  K+P+VL
Subjt:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLR--AGNCRVFQEFWVRSCIFGSTHNPEL--KSAGSARNYRSDSRRFKPGDSVEKPTSMYSTLAGERVGESPKNPMVL

Query:  GLMSMLKSMADSSVISTGTFGVSSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSRVSDD---VDKGGTTVCYDYDLCGSKQFYENDFEKSS----WVSRLLSTYSED
        G++S++              G+S FK +S+IPFL+GSKW+P   I + +S D   VD+GG        +C  K   E   + S+    WV++LL+  SED
Subjt:  GLMSMLKSMADSSVISTGTFGVSSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSRVSDD---VDKGGTTVCYDYDLCGSKQFYENDFEKSS----WVSRLLSTYSED

Query:  AKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGV
        AKA FTA+TVS+LF+S LAEPKSIPS+SM PTL+VGDR++AEKVSYFFRKPEVSDIVIF+AP IL E G S  +VFIKR+VA+ GD V V  GKL+VN  
Subjt:  AKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGV

Query:  VQDEDFVLEPIAYEMDPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWPPSKGS
        VQ EDFVLEPI YEM+P+ VPEGYV+V+GDNRN S DSH+WGPLPI+NI+GRS+F+YWPPSK S
Subjt:  VQDEDFVLEPIAYEMDPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWPPSKGS

AT1G23465.1 Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein2.2e-1435.88Show/hide
Query:  SMCPTLE-VGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVLEPI-AYEMDPLLVPEGYV
        SM PTL   G+ +LAE++S  ++KP   DIV+ R+P+       + N+  IKRVV   GD ++                FV++P+ + E   ++VP+G+V
Subjt:  SMCPTLE-VGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVLEPI-AYEMDPLLVPEGYV

Query:  YVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFK
        +V GD  +NS DS ++GP+P   I GR L++
Subjt:  YVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFK

AT1G29960.1 Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein3.1e-1332.48Show/hide
Query:  LFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLE-VGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGVVQ
        L+  L V+  +  F+A        SM PTL   G+ +LAE++S  ++KP   DIV+ R+P+       + N+  IKRV+   GD ++      V++    
Subjt:  LFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLE-VGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGVVQ

Query:  DEDFVLEPIAYEMDPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWP
        DE             ++VP+G+V+V GD  +NS DS ++G +P   I GR L++ WP
Subjt:  DEDFVLEPIAYEMDPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWP

AT2G30440.1 thylakoid processing peptide2.0e-9756.46Show/hide
Query:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLRAGNCRVFQEFWVRSCIFGSTHNPELKSAGSARNYRSDSRRFKPGDSVEKPTSMYSTLAGERVGESPKNPMVLGLMS
        MAIR+T +YS +VA+NL    G R G      E  VR   F  +H  +     S RN               +P SMY ++A E +GE  ++P+V+GL+S
Subjt:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLRAGNCRVFQEFWVRSCIFGSTHNPELKSAGSARNYRSDSRRFKPGDSVEKPTSMYSTLAGERVGESPKNPMVLGLMS

Query:  MLKSMADSSVISTGTFGVSSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSRVSDDVDKGGTTVCYDYDLCGSKQFYENDFEKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVS
        +LKS       +    GVSSFKA+SIIPFLQGSKW+        V DDVDKGG TVC D D   S+         S WV++LLS  SEDAKA FTA+TVS
Subjt:  MLKSMADSSVISTGTFGVSSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSRVSDDVDKGGTTVCYDYDLCGSKQFYENDFEKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVS

Query:  VLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQIL---QEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVL
        +LF+S LAEPKSIPS+SM PTL+ GDR++AEKVSYFFRKPEVSDIVIF+AP IL    E+G SSN+VFIKR+VA+ GD V V+ GKL VN +VQ+EDFVL
Subjt:  VLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQIL---QEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVL

Query:  EPIAYEMDPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWPPSKGS
        EP++YEM+P+ VP+GYV+V+GDNRN S DSH+WGPLPIENIVGRS+F+YWPPSK S
Subjt:  EPIAYEMDPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWPPSKGS

AT3G24590.1 plastidic type i signal peptidase 12.2e-5958.15Show/hide
Query:  EKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATS
        EK+      L   S+DA+ +F A+ VS+ F+ F+AEP+ IPS SM PT +VGDR++AEKVSY+FRKP  +DIVIF++P +LQE G +  +VFIKR+VA  
Subjt:  EKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATS

Query:  GDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVLEPIAYEMDPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWPPSKGSGMKL
        GD+V V  GKL+VNGV ++E F+LEP  YEM P+ VPE  V+VMGDNRNNS DSH WGPLP++NI+GRS+F+YWPP++ SG  L
Subjt:  GDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVLEPIAYEMDPLLVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWPPSKGSGMKL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTATTCGTGTTACTCTCTCCTACTCTGGCTATGTCGCCCAAAACCTAGCCTCCTCCACCGGCCTTCGGGCCGGTAACTGCCGCGTCTTTCAGGAGTTTTGG
GTCCGATCTTGTATTTTTGGATCGACCCATAATCCGGAGCTCAAATCTGCTGGAAGCGCGCGCAATTATCGGTCCGATAGCCGGCGGTTCAAGCCTGGTGACTCT
GTCGAGAAGCCAACTTCTATGTACAGCACTCTCGCCGGAGAAAGGGTTGGGGAAAGCCCTAAGAATCCCATGGTTTTGGGTTTGATGTCGATGTTGAAATCGATG
GCCGATTCTTCTGTGATCAGTACGGGGACTTTTGGGGTTTCTTCGTTTAAAGCCACTTCGATTATACCCTTTTTACAAGGATCGAAGTGGCTTCCGGGTTATGAT
ATACGATCTCGTGTAAGCGACGATGTGGATAAAGGCGGAACAACGGTTTGTTATGATTATGATCTATGTGGGAGTAAACAGTTTTATGAGAATGATTTTGAGAAG
AGCAGCTGGGTTTCGCGCTTGTTGAGTACTTATTCCGAGGACGCAAAGGCCCTCTTTACGGCTTTGACTGTTAGTGTGCTCTTTAAATCTTTCTTGGCGGAGCCG
AAATCGATTCCTTCTTCTTCCATGTGTCCTACTCTGGAAGTAGGGGATCGTATTTTAGCAGAAAAGGTTTCGTACTTTTTCAGGAAACCTGAAGTTTCAGATATA
GTGATCTTTAGGGCTCCTCAAATCTTGCAGGAATTTGGAGTTAGTTCAAATGAAGTGTTTATTAAGAGAGTTGTGGCTACATCTGGGGACGTGGTTGCAGTTCAA
AAAGGGAAATTGGTGGTAAATGGTGTAGTTCAAGATGAGGACTTTGTCTTAGAGCCAATTGCTTATGAGATGGATCCATTGCTTGTGCCTGAAGGTTATGTGTAT
GTAATGGGGGACAACCGTAACAACAGTTGTGATTCTCATGACTGGGGTCCACTCCCAATAGAAAATATTGTAGGTAGATCATTATTCAAGTATTGGCCTCCCTCC
AAGGGATCCGGGATGAAATTGCCCCTTTTCGGTACCAACCGCTGCAATATCTTTGCATATAAAACTTGGATTGGACTTCATGTCCGAATGGTGTGTATTAATGGA
AGTAACTCCTGTACCTTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGTTTCACCTTCTCGTCGTCTTCCTCCGTCTGCGGCGGGCGTTGATTCTTCATATATCATTTCTTTTTCATTCTTTCAGTTTGGGTTTCTCGTGTTTTTCCTCTC
TCTTTCCTCTTATCGATCATCTACTGGAAACCGAGCTCCCCCTCTTCTCAGATTCCTCTCCGTTGACTTCCCCTAAAACCCCATCTCCGTTCATCCATACTTGGC
TCATCCTTTGATTTTCCCATACTCGATCCAACCCCCTCCGGTTTGTAGTTCCACTTTCAATTCCCCGCTTCGGACGCCGATTCTCTGTTTTCCGAAGAAGAAATG
GCGTTTATCCTTCTCTAGGCTGTTGTGATTCTTCCCTCCTCGTCTCTGCAACCAACCTGCTTCAAATCCTAATCCACCTACTCAAATTTGCAGTCATGGCTATTC
GTGTTACTCTCTCCTACTCTGGCTATGTCGCCCAAAACCTAGCCTCCTCCACCGGCCTTCGGGCCGGTAACTGCCGCGTCTTTCAGGAGTTTTGGGTCCGATCTT
GTATTTTTGGATCGACCCATAATCCGGAGCTCAAATCTGCTGGAAGCGCGCGCAATTATCGGTCCGATAGCCGGCGGTTCAAGCCTGGTGACTCTGTCGAGAAGC
CAACTTCTATGTACAGCACTCTCGCCGGAGAAAGGGTTGGGGAAAGCCCTAAGAATCCCATGGTTTTGGGTTTGATGTCGATGTTGAAATCGATGGCCGATTCTT
CTGTGATCAGTACGGGGACTTTTGGGGTTTCTTCGTTTAAAGCCACTTCGATTATACCCTTTTTACAAGGATCGAAGTGGCTTCCGGGTTATGATATACGATCTC
GTGTAAGCGACGATGTGGATAAAGGCGGAACAACGGTTTGTTATGATTATGATCTATGTGGGAGTAAACAGTTTTATGAGAATGATTTTGAGAAGAGCAGCTGGG
TTTCGCGCTTGTTGAGTACTTATTCCGAGGACGCAAAGGCCCTCTTTACGGCTTTGACTGTTAGTGTGCTCTTTAAATCTTTCTTGGCGGAGCCGAAATCGATTC
CTTCTTCTTCCATGTGTCCTACTCTGGAAGTAGGGGATCGTATTTTAGCAGAAAAGGTTTCGTACTTTTTCAGGAAACCTGAAGTTTCAGATATAGTGATCTTTA
GGGCTCCTCAAATCTTGCAGGAATTTGGAGTTAGTTCAAATGAAGTGTTTATTAAGAGAGTTGTGGCTACATCTGGGGACGTGGTTGCAGTTCAAAAAGGGAAAT
TGGTGGTAAATGGTGTAGTTCAAGATGAGGACTTTGTCTTAGAGCCAATTGCTTATGAGATGGATCCATTGCTTGTGCCTGAAGGTTATGTGTATGTAATGGGGG
ACAACCGTAACAACAGTTGTGATTCTCATGACTGGGGTCCACTCCCAATAGAAAATATTGTAGGTAGATCATTATTCAAGTATTGGCCTCCCTCCAAGGGATCCG
GGATGAAATTGCCCCTTTTCGGTACCAACCGCTGCAATATCTTTGCATATAAAACTTGGATTGGACTTCATGTCCGAATGGTGTGTATTAATGGAAGTAACTCCT
GTACCTTGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLRAGNCRVFQEFWVRSCIFGSTHNPELKSAGSARNYRSDSRRFKPGDSVEKPTSMYSTLAGERVGESPKNPMVLGLMSMLKSM
ADSSVISTGTFGVSSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSRVSDDVDKGGTTVCYDYDLCGSKQFYENDFEKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEP
KSIPSSSMCPTLEVGDRILAEKVSYFFRKPEVSDIVIFRAPQILQEFGVSSNEVFIKRVVATSGDVVAVQKGKLVVNGVVQDEDFVLEPIAYEMDPLLVPEGYVY
VMGDNRNNSCDSHDWGPLPIENIVGRSLFKYWPPSKGSGMKLPLFGTNRCNIFAYKTWIGLHVRMVCINGSNSCTL