; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc08G17010 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc08G17010
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionAdenine phosphoribosyltransferase
Genome locationClcChr08:27354756..27358006
RNA-Seq ExpressionClc08G17010
SyntenyClc08G17010
Gene Ontology termsGO:0006168 - adenine salvage (biological process)
GO:0009116 - nucleoside metabolic process (biological process)
GO:1901137 - carbohydrate derivative biosynthetic process (biological process)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0003999 - adenine phosphoribosyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000836 - Phosphoribosyltransferase domain
IPR005764 - Adenine phosphoribosyl transferase
IPR029057 - Phosphoribosyltransferase-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060947.1 adenine phosphoribosyltransferase 1 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]3.2e-11173.12Show/hide
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KAG6598340.1 Adenine phosphoribosyltransferase 1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.6e-11072.47Show/hide
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XP_004142889.1 adenine phosphoribosyltransferase 1 [Cucumis sativus]1.2e-11072.5Show/hide
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XP_008444565.1 PREDICTED: adenine phosphoribosyltransferase 1 isoform X1 [Cucumis melo]3.2e-11173.12Show/hide
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XP_038886497.1 adenine phosphoribosyltransferase 3-like [Benincasa hispida]7.4e-11675.79Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LN96 Adenine phosphoribosyltransferase5.9e-11172.5Show/hide
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A0A1S3BAN4 Adenine phosphoribosyltransferase1.6e-11173.12Show/hide
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A0A5A7V262 Adenine phosphoribosyltransferase1.6e-11173.12Show/hide
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A0A6J1HEI1 Adenine phosphoribosyltransferase1.5e-10972.15Show/hide
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A0A6J1KCC0 Adenine phosphoribosyltransferase4.0e-10771.2Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P31166 Adenine phosphoribosyltransferase 1, chloroplastic1.1e-7260.38Show/hide
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Q43199 Adenine phosphoribosyltransferase 13.1e-6459.21Show/hide
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        ECACVIEL  LKGR++LG  P+FVLV A
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Q9LFP0 Adenine phosphoribosyltransferase 56.2e-5753.48Show/hide
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        GP IALAIGAKF+P+RKP KLPG+VISE Y LEYG D++EMHVGAVE  ER ++IDDL+ATGGTLSAA+ LL                    E  G +VV
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        ECACVI L  +KG+ +L G+PL+VLV  +G
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Q9SU38 Adenine phosphoribosyltransferase 49.9e-6357.51Show/hide
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        M+    +DPRI  I   IRV+PDFPK                                   GI+FQDITTLLLD KAFKDTIDLFVERYR  +ISVVAGI
Subjt:  MASTNEQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGTHLVFIETSNGRFWLRDPFLLSLCSFGFCSCVMGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYRGKDISVVAGI

Query:  EARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLSAAIRLLGRAVISKTCSVLGLSLFFESE
        EARGFIFG PIALAIGAKFVP+RKPKKLPG++I EEY LEYG+D++EMHV AV++G+RALV+DDLIATGGTL AA+ LL                    +
Subjt:  EARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLSAAIRLLGRAVISKTCSVLGLSLFFESE

Query:  RVGVDVVECACVIELDGLKGREQLGGRPLFVLV
        RVG +V+ECACVIEL  LKGRE+L G+PL+VLV
Subjt:  RVGVDVVECACVIELDGLKGREQLGGRPLFVLV

Q9SUW2 Adenine phosphoribosyltransferase 34.7e-6560.53Show/hide
Query:  EQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGTHLVFIETSNGRFWLRDPFLLSLCSFGFCSCVMGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYRGKDISVVAGIEARGF
        E+DPRI  I   IRV+PDFPK                                   GI+FQDITT+LLD KAFKDTIDLFVERYR K+ISVVAGIEARGF
Subjt:  EQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGTHLVFIETSNGRFWLRDPFLLSLCSFGFCSCVMGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYRGKDISVVAGIEARGF

Query:  IFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLSAAIRLLGRAVISKTCSVLGLSLFFESERVGVD
        +FGPPIALAIGAKFVP+RKPKKLPGE I EEY LEYG D++EMH+GAVEAG+RALV+DDLIATGGTL AAI LL                    ERVG +
Subjt:  IFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLSAAIRLLGRAVISKTCSVLGLSLFFESERVGVD

Query:  VVECACVIELDGLKGREQLGGRPLFVLV
        VVECACVIEL  LKGR++L G+PL +LV
Subjt:  VVECACVIELDGLKGREQLGGRPLFVLV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G27450.1 adenine phosphoribosyl transferase 17.5e-7460.38Show/hide
Query:  RFPQHRSSFSPLRCNVRETVPDQEMASTNEQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGTHLVFIETSNGRFWLRDPFLLSLCSFGFCSCVMGILFQDITTLLLDTK
        R   HRS+ S    +      D EMA+ + QDPRIAKI+ +IRVIPDFPKP                                  GI+FQDITTLLLDT+
Subjt:  RFPQHRSSFSPLRCNVRETVPDQEMASTNEQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGTHLVFIETSNGRFWLRDPFLLSLCSFGFCSCVMGILFQDITTLLLDTK

Query:  AFKDTIDLFVERYRGKDISVVAGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLSAAI
        AFKDTI LFV+RY+ K ISVVAG+EARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPG+VISEEYSLEYGTD IEMHVGAVE GERA++IDDLIATGGTL+AAI
Subjt:  AFKDTIDLFVERYRGKDISVVAGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLSAAI

Query:  RLLGRAVISKTCSVLGLSLFFESERVGVDVVECACVIELDGLKGREQLGGRPLFVLVNAA
        RLL                    ERVGV +VECACVIEL  LKG+E+LG   LFVLV +A
Subjt:  RLLGRAVISKTCSVLGLSLFFESERVGVDVVECACVIELDGLKGREQLGGRPLFVLVNAA

AT1G27450.2 adenine phosphoribosyl transferase 17.0e-7263.56Show/hide
Query:  MASTNEQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGTHLVFIETSNGRFWLRDPFLLSLCSFGFCSCVMGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYRGKDISVVAGI
        MA+ + QDPRIAKI+ +IRVIPDFPKP                                  GI+FQDITTLLLDT+AFKDTI LFV+RY+ K ISVVAG+
Subjt:  MASTNEQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGTHLVFIETSNGRFWLRDPFLLSLCSFGFCSCVMGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYRGKDISVVAGI

Query:  EARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLSAAIRLLGRAVISKTCSVLGLSLFFESE
        EARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPG+VISEEYSLEYGTD IEMHVGAVE GERA++IDDLIATGGTL+AAIRLL                    E
Subjt:  EARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLSAAIRLLGRAVISKTCSVLGLSLFFESE

Query:  RVGVDVVECACVIELDGLKGREQLGGRPLFVLVNAA
        RVGV +VECACVIEL  LKG+E+LG   LFVLV +A
Subjt:  RVGVDVVECACVIELDGLKGREQLGGRPLFVLVNAA

AT1G27450.3 adenine phosphoribosyl transferase 17.2e-6957.58Show/hide
Query:  DQEMASTNEQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGTHLVFIETSNGRFWLRDPFLLSLCSFGFCSCVMGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYRGKDISVV
        D EMA+ + QDPRIAKI+ +IRVIPDFPKP                                  GI+FQDITTLLLDT+AFKDTI LFV+RY+ K ISVV
Subjt:  DQEMASTNEQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGTHLVFIETSNGRFWLRDPFLLSLCSFGFCSCVMGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYRGKDISVV

Query:  AGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPG-------------------------EVISEEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTL
        AG+EARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPG                         +VISEEYSLEYGTD IEMHVGAVE GERA++IDDLIATGGTL
Subjt:  AGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPG-------------------------EVISEEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTL

Query:  SAAIRLLGRAVISKTCSVLGLSLFFESERVGVDVVECACVIELDGLKGREQLGGRPLFVLVNAA
        +AAIRLL                    ERVGV +VECACVIEL  LKG+E+LG   LFVLV +A
Subjt:  SAAIRLLGRAVISKTCSVLGLSLFFESERVGVDVVECACVIELDGLKGREQLGGRPLFVLVNAA

AT4G12440.2 adenine phosphoribosyl transferase 47.0e-6457.51Show/hide
Query:  MASTNEQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGTHLVFIETSNGRFWLRDPFLLSLCSFGFCSCVMGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYRGKDISVVAGI
        M+    +DPRI  I   IRV+PDFPK                                   GI+FQDITTLLLD KAFKDTIDLFVERYR  +ISVVAGI
Subjt:  MASTNEQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGTHLVFIETSNGRFWLRDPFLLSLCSFGFCSCVMGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYRGKDISVVAGI

Query:  EARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLSAAIRLLGRAVISKTCSVLGLSLFFESE
        EARGFIFG PIALAIGAKFVP+RKPKKLPG++I EEY LEYG+D++EMHV AV++G+RALV+DDLIATGGTL AA+ LL                    +
Subjt:  EARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLSAAIRLLGRAVISKTCSVLGLSLFFESE

Query:  RVGVDVVECACVIELDGLKGREQLGGRPLFVLV
        RVG +V+ECACVIEL  LKGRE+L G+PL+VLV
Subjt:  RVGVDVVECACVIELDGLKGREQLGGRPLFVLV

AT4G22570.1 adenine phosphoribosyl transferase 33.4e-6660.53Show/hide
Query:  EQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGTHLVFIETSNGRFWLRDPFLLSLCSFGFCSCVMGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYRGKDISVVAGIEARGF
        E+DPRI  I   IRV+PDFPK                                   GI+FQDITT+LLD KAFKDTIDLFVERYR K+ISVVAGIEARGF
Subjt:  EQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGTHLVFIETSNGRFWLRDPFLLSLCSFGFCSCVMGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYRGKDISVVAGIEARGF

Query:  IFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLSAAIRLLGRAVISKTCSVLGLSLFFESERVGVD
        +FGPPIALAIGAKFVP+RKPKKLPGE I EEY LEYG D++EMH+GAVEAG+RALV+DDLIATGGTL AAI LL                    ERVG +
Subjt:  IFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLSAAIRLLGRAVISKTCSVLGLSLFFESERVGVD

Query:  VVECACVIELDGLKGREQLGGRPLFVLV
        VVECACVIEL  LKGR++L G+PL +LV
Subjt:  VVECACVIELDGLKGREQLGGRPLFVLV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAAGCAGTCTCCAATCTCACTTCCTCACTTCCTCTTTCGCCCTCACCGTCACCGTCACCGTCACCTTCGCACTACAGGACCACCGCGGTCTTCACTCCTCGTCGACG
GATCGCTTCCTCGTTAGCCATCGGCGGCGCTTTCTCGTCGTGTCGTACACATTTGACTCGGTTTCCACAGCATCGATCTTCGTTTTCGCCTCTGCGATGCAATGTGAGAG
AGACGGTGCCGGATCAAGAAATGGCGTCCACCAATGAACAAGACCCACGCATAGCCAAAATCTCCAAGGCCATTCGAGTTATCCCAGATTTTCCTAAACCAGGTACCCAT
CTTGTTTTCATTGAAACCTCGAATGGTCGTTTCTGGCTGAGAGATCCATTTTTGCTGTCTTTATGCTCATTTGGGTTTTGTTCGTGTGTGATGGGGATTTTGTTTCAGGA
TATTACAACTTTGCTTCTTGATACAAAGGCCTTCAAGGACACTATCGATTTGTTCGTGGAGAGGTACAGAGGGAAGGATATCTCTGTCGTCGCTGGAATTGAGGCGAGGG
GTTTCATTTTTGGCCCTCCGATAGCTCTGGCTATTGGTGCAAAATTTGTTCCCATGAGAAAACCCAAGAAGTTGCCTGGTGAAGTCATTTCAGAAGAGTACTCTTTAGAG
TATGGAACCGATAAAATAGAGATGCATGTAGGAGCTGTTGAAGCTGGGGAACGTGCTCTTGTGATAGATGATCTCATTGCAACTGGGGGAACCTTGTCTGCAGCAATAAG
GCTACTTGGTAGGGCTGTGATTTCCAAAACTTGCTCAGTTCTAGGCCTCAGCTTATTCTTTGAATCTGAGCGAGTTGGCGTTGATGTGGTCGAGTGTGCATGTGTGATTG
AGCTGGACGGACTAAAGGGCCGTGAACAATTGGGAGGCAGACCTCTATTCGTTCTAGTTAATGCAGCAGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTAATTCAGATCAGAGCCGGCGATGAAAGCAGTCTCCAATCTCACTTCCTCACTTCCTCTTTCGCCCTCACCGTCACCGTCACCGTCACCTTCGCACTACAGGACCACCG
CGGTCTTCACTCCTCGTCGACGGATCGCTTCCTCGTTAGCCATCGGCGGCGCTTTCTCGTCGTGTCGTACACATTTGACTCGGTTTCCACAGCATCGATCTTCGTTTTCG
CCTCTGCGATGCAATGTGAGAGAGACGGTGCCGGATCAAGAAATGGCGTCCACCAATGAACAAGACCCACGCATAGCCAAAATCTCCAAGGCCATTCGAGTTATCCCAGA
TTTTCCTAAACCAGGTACCCATCTTGTTTTCATTGAAACCTCGAATGGTCGTTTCTGGCTGAGAGATCCATTTTTGCTGTCTTTATGCTCATTTGGGTTTTGTTCGTGTG
TGATGGGGATTTTGTTTCAGGATATTACAACTTTGCTTCTTGATACAAAGGCCTTCAAGGACACTATCGATTTGTTCGTGGAGAGGTACAGAGGGAAGGATATCTCTGTC
GTCGCTGGAATTGAGGCGAGGGGTTTCATTTTTGGCCCTCCGATAGCTCTGGCTATTGGTGCAAAATTTGTTCCCATGAGAAAACCCAAGAAGTTGCCTGGTGAAGTCAT
TTCAGAAGAGTACTCTTTAGAGTATGGAACCGATAAAATAGAGATGCATGTAGGAGCTGTTGAAGCTGGGGAACGTGCTCTTGTGATAGATGATCTCATTGCAACTGGGG
GAACCTTGTCTGCAGCAATAAGGCTACTTGGTAGGGCTGTGATTTCCAAAACTTGCTCAGTTCTAGGCCTCAGCTTATTCTTTGAATCTGAGCGAGTTGGCGTTGATGTG
GTCGAGTGTGCATGTGTGATTGAGCTGGACGGACTAAAGGGCCGTGAACAATTGGGAGGCAGACCTCTATTCGTTCTAGTTAATGCAGCAGGATGATCGTAGAGCCTTCA
TATGCAATATGCCATGTTTGGAAATGGTGATACTAAGATTGTATCACTGCTAGAAGTTGAAGTTTCCAAGTAGTGCATAATTTTGAAGCGGAGTCTGGCTAGAAATAAAG
GGGTTGGTATTTATTTGAGAGTTGAAGAGGTTTAAACAAAAAGAAGAAGAAAGGTCTGTAGAGACTATTAGCTTTTGATTATTCTGGTGGTAATGTATTTGTTCTTTGTT
AATTGTTCTGTTGTCTCTTTTCTGCCTATCTGTTGAAGATGGTAAGGAGAAAGAGAAGTGGTTGATGTTAATTTTGAATATCTGCATAAACTTCCTTATTTTGCAGTCAA
TTAGTTTTTATATCAAATAAAAATGCCTACTACACCCAATCCCAGTGCAAGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKAVSNLTSSLPLSPSPSPSPSPSHYRTTAVFTPRRRIASSLAIGGAFSSCRTHLTRFPQHRSSFSPLRCNVRETVPDQEMASTNEQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGTH
LVFIETSNGRFWLRDPFLLSLCSFGFCSCVMGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYRGKDISVVAGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLE
YGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLSAAIRLLGRAVISKTCSVLGLSLFFESERVGVDVVECACVIELDGLKGREQLGGRPLFVLVNAAG