; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc08G17070 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc08G17070
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionDNA excision repair protein ERCC-8-like isoform X2
Genome locationClcChr08:27421565..27426677
RNA-Seq ExpressionClc08G17070
SyntenyClc08G17070
Gene Ontology termsGO:0000209 - protein polyubiquitination (biological process)
GO:0006283 - transcription-coupled nucleotide-excision repair (biological process)
GO:0043161 - proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process (biological process)
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GO:0031464 - Cul4A-RING E3 ubiquitin ligase complex (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001680 - WD40 repeat
IPR015943 - WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily
IPR019775 - WD40 repeat, conserved site
IPR020472 - G-protein beta WD-40 repeat
IPR036322 - WD40-repeat-containing domain superfamily
IPR042238 - DNA excision repair protein Rad28/ERCC8/Ckn1/ATCSA-1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004142893.1 WD repeat-containing protein ATCSA-1 isoform X2 [Cucumis sativus]9.7e-23787.21Show/hide
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XP_008444557.1 PREDICTED: DNA excision repair protein ERCC-8-like isoform X4 [Cucumis melo]4.8e-23687Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3BA40 DNA excision repair protein ERCC-8-like isoform X42.3e-23687Show/hide
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A0A1S3BAM3 DNA excision repair protein ERCC-8-like isoform X12.0e-23292.82Show/hide
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A0A1S3BBB8 DNA excision repair protein ERCC-8-like isoform X24.6e-23296.83Show/hide
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        S QDR+VSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVN+ETMRLQTNKPLQLATS+DS+LVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLT SGHYEGV
Subjt:  SSQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATSEDSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYEGV

Query:  NCCWYNFPDQ
        NCCWYNFPDQ
Subjt:  NCCWYNFPDQ

A0A1S3BBE7 DNA excision repair protein ERCC-8-like isoform X31.0e-23687.21Show/hide
Query:  MWKDIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGH
        MWKDIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGH
Subjt:  MWKDIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGH

Query:  QYAVSSAIWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSASS
        +YA+SSAIWYPVDTGLFVTGS+DHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSV WSASS
Subjt:  QYAVSSAIWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSASS

Query:  EWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPGLL
        EWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQG NMKSRIPHKKL NGNATKPS+TGKLPAKGSTRQRLHPGLL
Subjt:  EWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPGLL

Query:  SSQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATSEDSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYEGV
        S QDR+VSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVN+ETMRLQTNKPLQLATS+DS+LVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLT SGHYEGV
Subjt:  SSQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATSEDSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYEGV

Query:  NCCWYNFPDQANSRLVTIPKLYRTGTPSELIPIHGIELTLNPAYSSNNTIEDALVAYSISVDSQDWESTADRDNWSD
        NCCWYNFPDQ       +P+   TG     I      L  +P+ +S                  DWESTAD+DNWSD
Subjt:  NCCWYNFPDQANSRLVTIPKLYRTGTPSELIPIHGIELTLNPAYSSNNTIEDALVAYSISVDSQDWESTADRDNWSD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q13216 DNA excision repair protein ERCC-87.9e-5630.54Show/hide
Query:  REAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHQYAVSSA
        R+ G   P        + R   L+L+  +D+   H G +N+L ++  EGRY+LSG SD    ++D++ ++       K  C  ++ + H   H+Y+V + 
Subjt:  REAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHQYAVSSA

Query:  IWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSASSEWVLITG
         WYP DTG+F + S+D  + VWDTNT Q    F     VY   MS ++T H L+A GT   +V+LCD+ SG+ SH L GHR  +++V+WS   +++L T 
Subjt:  IWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSASSEWVLITG

Query:  GCDGAIRFWDIRRA-GCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPGLLSSQDRA
          D  ++ WD+RRA GC   LDQ                                             N  K  A                     +   
Subjt:  GCDGAIRFWDIRRA-GCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPGLLSSQDRA

Query:  VSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATS--EDSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYEGVNCCW
         +H G V GL  T DG++LL+ G+D+R++LW+  +G NTLVNY  +   + K L+   S    S  VF P  +T+  + +++G+      GHY+ V+CC 
Subjt:  VSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATS--EDSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYEGVNCCW

Query:  Y--NFPD-QANSR----LVTIPKLY-------RTGTPSELIP
        +  NF +  + SR    L  +P LY        T T S+L P
Subjt:  Y--NFPD-QANSR----LVTIPKLY-------RTGTPSELIP

Q5BIM8 DNA excision repair protein ERCC-87.9e-5631.58Show/hide
Query:  REAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHQYAVSSA
        R+AG   P        + R   L+L+  +D+   H   VN+L ++  EGRY+LSG SD    ++D++ ++       K  C  +V + H   H+Y+V + 
Subjt:  REAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHQYAVSSA

Query:  IWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSASSEWVLITG
         WYP DTG+F + S+D  + VWDTNT Q+   F     VY   MS +AT H L+A GT   +V+LCD+ SG+ SH L GHR  +++V+WS   E++L T 
Subjt:  IWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSASSEWVLITG

Query:  GCDGAIRFWDIRRA-GCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPGLLSSQDRA
          D   + WD+RRA GC   LDQ                      K   A++ +N                                             
Subjt:  GCDGAIRFWDIRRA-GCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPGLLSSQDRA

Query:  VSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATSE--DSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYEGVNCC
         +H G V GL  T DG++LL+ G+D+R++LW+  +G NTLVNY  +   + K L+   S    S  VF P  +T+  + +++G+      GHY+ V+CC
Subjt:  VSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATSE--DSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYEGVNCC

Q8CFD5 DNA excision repair protein ERCC-86.0e-5632.08Show/hide
Query:  REAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHQYAVSSA
        R++G   P        + R   L+L+  +D+   H   VN+L ++  EGRY+LSG SD    ++D++ A+       K  C  +V + H   H+Y+V + 
Subjt:  REAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHQYAVSSA

Query:  IWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSASSEWVLITG
         WYP DTG+F + S+D  + VWDTNT Q    F     VY   MS  AT H L+A GT   +V+LCD+ SG+ SH L GHR  +++V+WS   +++L T 
Subjt:  IWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSASSEWVLITG

Query:  GCDGAIRFWDIRRA-GCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPGLLSSQDRA
          D  ++ WD+RRA GC   LDQ                      K   A++ +N                                             
Subjt:  GCDGAIRFWDIRRA-GCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPGLLSSQDRA

Query:  VSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATS--EDSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYEGVNCC
         +H G V GL  T DG++LL+ G+D+R++LW+  SG NTLVNY  +   + K LQ A S    S  VF P  +T+  + + +G+      GHY+ V+CC
Subjt:  VSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATS--EDSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYEGVNCC

Q93ZG3 WD repeat-containing protein ATCSA-14.8e-17064.09Show/hide
Query:  MWKDIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSE--GLIAKHQCIFAVDKQHEH
        MW+ I+DRE G++R NSFANR KS R  SLQLSN KD VSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGA+D SAAVFD+QRAT  E  GLIAKH+CIF VDKQHE+
Subjt:  MWKDIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSE--GLIAKHQCIFAVDKQHEH

Query:  GHQYAVSSAIWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSA
        GH+YA+SSAIWYP+DTGLF+TGS+DH++ VWDTNT Q VV+FK+PGKVYRTAMSS+A SH LIAAGTEDVQVRLCDI+SGAFSHTLSGHRDGVMSV WS 
Subjt:  GHQYAVSSAIWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSA

Query:  SSEWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPG
        SSEWVL TGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQ+QLG RPPI   TA     S    +S G   + +    K     + K S++ K   + S ++R+HPG
Subjt:  SSEWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPG

Query:  LLSSQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATSEDSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYE
        +LS+ DRA +HYGAVTGLK T DGMYLLSAGSDSR++LWD+ESG NTLVN+ET R+QTNK +QL TS+D ALVF PCM TVKAF MW+G+T+L   GHYE
Subjt:  LLSSQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATSEDSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYE

Query:  GVNCCWYNFPDQANSRLVTIPKLYRTGTPSELIPIHGIELTLNPAYSSNNTIEDALVAYSISVDSQDWESTADRDNWSD
         VN C +N  DQ         +LY +G+  +++            +S   T+ED +V        QD E   D+DNWSD
Subjt:  GVNCCWYNFPDQANSRLVTIPKLYRTGTPSELIPIHGIELTLNPAYSSNNTIEDALVAYSISVDSQDWESTADRDNWSD

Q9USR0 DNA excision repair protein ckn13.7e-3730.32Show/hide
Query:  REAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPH----RGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHQYA
        RE G+   +SF  ++   R   L L+    I   H     GSVN+L +D T  + ++SG +++S  V+D+Q     E        + AV  +    H++ 
Subjt:  REAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPH----RGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHQYA

Query:  VSSAIWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSASSEWV
        ++   W+P D G+F + S+DH + VWD +T Q    F +   +Y  A S +A SH LIA       +RLCD+ SG+++H+LSGH   V++V W   +E+V
Subjt:  VSSAIWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSASSEWV

Query:  LITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPGLLSSQ
        L +G  DG  R WDIR                           K+S+S + +                                       LH   L S 
Subjt:  LITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPGLLSSQ

Query:  DRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTL
           +SHYG V GL  T D  YL S G+D R+++W++ESG NTL
Subjt:  DRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G19750.1 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein2.6e-16361.17Show/hide
Query:  MWKDIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSE--GLIAKHQCIFAVDKQHEH
        MWK  +DRE G+ R NSFANR KS R  SLQLSN KD VSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGA+D SAAVFD++RAT  E  GLIAKH+CIF V KQHE+
Subjt:  MWKDIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSE--GLIAKHQCIFAVDKQHEH

Query:  GHQYAVSSAIWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSA
        GH+YA+SSAIWYP+DTG+F+TGS+DH++ VWDTNT+QVVV+FK+PGKVYRTAMSS+A SH LIAAGT+DVQVRLCDI+SGAFSHTLSGHRDGVMSV WS 
Subjt:  GHQYAVSSAIWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSA

Query:  SSEWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPG
        SSEWVL TGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLD SQ+QLG RPPI    A       +  +S G     +    K     + K S++ K   + S ++R+HPG
Subjt:  SSEWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPG

Query:  LLSSQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATSEDSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYE
        +LS+ DRA +HYG VTGLK T DGMYLLSAGS SR++LWD+ESG NTLVN+ET R+QT++ +QL TS+D ALVF PCM TVK F MW+G+T+L   GHYE
Subjt:  LLSSQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATSEDSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYE

Query:  GVNCCWYNFPDQANSRLVTIPKLYRTGTPSELIPIHGIELTLNPAYSSNNTIEDALVAYSISVDSQDWESTADRDNWSD
         VN C +N  DQ         +LY +G   ++I            +S   ++ED +            E   D+DNWSD
Subjt:  GVNCCWYNFPDQANSRLVTIPKLYRTGTPSELIPIHGIELTLNPAYSSNNTIEDALVAYSISVDSQDWESTADRDNWSD

AT1G27840.1 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein3.4e-17164.09Show/hide
Query:  MWKDIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSE--GLIAKHQCIFAVDKQHEH
        MW+ I+DRE G++R NSFANR KS R  SLQLSN KD VSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGA+D SAAVFD+QRAT  E  GLIAKH+CIF VDKQHE+
Subjt:  MWKDIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSE--GLIAKHQCIFAVDKQHEH

Query:  GHQYAVSSAIWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSA
        GH+YA+SSAIWYP+DTGLF+TGS+DH++ VWDTNT Q VV+FK+PGKVYRTAMSS+A SH LIAAGTEDVQVRLCDI+SGAFSHTLSGHRDGVMSV WS 
Subjt:  GHQYAVSSAIWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSA

Query:  SSEWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPG
        SSEWVL TGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQ+QLG RPPI   TA     S    +S G   + +    K     + K S++ K   + S ++R+HPG
Subjt:  SSEWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPG

Query:  LLSSQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATSEDSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYE
        +LS+ DRA +HYGAVTGLK T DGMYLLSAGSDSR++LWD+ESG NTLVN+ET R+QTNK +QL TS+D ALVF PCM TVKAF MW+G+T+L   GHYE
Subjt:  LLSSQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATSEDSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYE

Query:  GVNCCWYNFPDQANSRLVTIPKLYRTGTPSELIPIHGIELTLNPAYSSNNTIEDALVAYSISVDSQDWESTADRDNWSD
         VN C +N  DQ         +LY +G+  +++            +S   T+ED +V        QD E   D+DNWSD
Subjt:  GVNCCWYNFPDQANSRLVTIPKLYRTGTPSELIPIHGIELTLNPAYSSNNTIEDALVAYSISVDSQDWESTADRDNWSD

AT1G27840.2 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein1.9e-13455.35Show/hide
Query:  MWKDIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGH
        MW+ I+DRE G++R NSFANR KS R  SLQLSN KD VSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGA+D SAAVFD+QRAT  E                    
Subjt:  MWKDIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGH

Query:  QYAVSSAIWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSASS
                                            VV+FK+PGKVYRTAMSS+A SH LIAAGTEDVQVRLCDI+SGAFSHTLSGHRDGVMSV WS SS
Subjt:  QYAVSSAIWYPVDTGLFVTGSYDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVAWSASS

Query:  EWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPGLL
        EWVL TGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQ+QLG RPPI   TA     S    +S G   + +    K     + K S++ K   + S ++R+HPG+L
Subjt:  EWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPGLL

Query:  SSQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATSEDSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYEGV
        S+ DRA +HYGAVTGLK T DGMYLLSAGSDSR++LWD+ESG NTLVN+ET R+QTNK +QL TS+D ALVF PCM TVKAF MW+G+T+L   GHYE V
Subjt:  SSQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATSEDSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYEGV

Query:  NCCWYNFPDQANSRLVTIPKLYRTGTPSELIPIHGIELTLNPAYSSNNTIEDALVAYSISVDSQDWESTADRDNWSD
        N C +N  DQ         +LY +G+  +++            +S   T+ED +V        QD E   D+DNWSD
Subjt:  NCCWYNFPDQANSRLVTIPKLYRTGTPSELIPIHGIELTLNPAYSSNNTIEDALVAYSISVDSQDWESTADRDNWSD

AT1G27840.3 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein8.4e-17063.96Show/hide
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        MW+ I+DRE G++R NSFANR KS R  SLQLSN KD VSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGA+D SAAVFD+QRAT  E  GLIAKH+CIF VDKQHE+
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        GH+YA+SSAIWYP+DTGLF+TGS+DH++ VWDTNT Q VV+FK+PGKVYRTAMSS+A SH LIAAGTEDVQVRLCDI+SGAFSHTLSGHRDGVMSV WS 
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        SSEWVL TGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQ+QLG RPPI   TA     S    +S G   + +    K     + K S++ K   + S ++R+HPG
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        +LS+ DRA +HYGAVTGLK T DGMYLLSAGSDSR++LWD+ESG NTLVN+ET R+QTNK +QL TS+D ALVF PCM TVK AF MW+G+T+L   GHY
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        E VN C +N  DQ         +LY +G+  +++            +S   T+ED +V        QD E   D+DNWSD
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AT5G50230.1 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein9.7e-0922.87Show/hide
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        H H+    S + +  ++G   TG  D  + +WDTN+  ++ +  L G +      ++   +  + A T    + + D+SSG   HTL+GH D V +V  S
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Query:  ASSEWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANK-----------LSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLA-NGNATKPSATGKL
          S   +++   D  I+ WD+ +  C   +  + +       I G T              + T K  L S+ +   S +    L+ NGN    S    +
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Query:  PAKGSTRQRLHPGLL-SSQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESG
             TR     G L +S +R  S++       ++ D  Y+ +  +D  + +W +  G
Subjt:  PAKGSTRQRLHPGLL-SSQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGGAAGGATATTAGAGATAGAGAAGCGGGAAAACTCCGCCCAAATTCTTTCGCAAATCGTGTTAAATCCGATCGAACCAGCTCTTTGCAACTTTCCAATCACAAGGA
CATTGTCTCTCCCCATAGAGGTTCCGTCAACTCACTTCAGGTTGATTTGACAGAGGGGAGATATTTGTTGTCTGGAGCATCAGATGCATCAGCTGCTGTTTTTGATATTC
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CCCGTTGATACTGGATTGTTTGTCACTGGCTCATATGATCATCACATTAATGTCTGGGATACAAATACAACTCAGGTGGTGGTGAATTTTAAATTGCCTGGAAAAGTTTA
TAGGACAGCCATGTCCTCTTTGGCAACATCACACATGCTGATTGCTGCTGGAACAGAAGATGTTCAAGTTCGCCTTTGTGATATTTCTTCTGGAGCATTTTCTCACACAT
TATCTGGACATCGTGATGGTGTAATGAGTGTAGCATGGTCAGCTTCTAGCGAGTGGGTTTTGATTACTGGAGGATGTGATGGAGCTATACGCTTTTGGGACATCAGACGA
GCTGGATGCTTTCGTGTTCTAGATCAGTCTCAATCTCAGCTTGGGAGACGTCCCCCTATTTCAGGATGGACTGCAAATAAGCTCTCAACATCTAAGTCCCTCTTGGCCAG
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GGCTACACCCAGGGCTTTTGTCCAGTCAGGATCGAGCAGTTTCTCACTATGGTGCTGTCACTGGATTAAAAGTAACTGGAGATGGCATGTACCTTCTCAGTGCAGGTTCT
GATTCAAGGTTAAAGTTATGGGACGTTGAATCCGGGTGCAATACACTCGTGAATTATGAAACCATGCGGTTACAGACCAATAAACCATTGCAATTAGCCACATCTGAGGA
TTCAGCCCTTGTATTTGCCCCATGCATGGCGACTGTTAAAGCATTTGATATGTGGACAGGGAAGACATCCCTGACATTCAGCGGCCACTATGAAGGTGTGAACTGTTGCT
GGTATAATTTCCCAGATCAGGCAAATTCTCGTCTGGTCACCATCCCGAAACTCTACCGAACTGGTACACCTTCTGAACTCATACCCATTCATGGAATTGAATTGACTCTC
AACCCTGCATATTCTTCCAATAATACCATTGAAGATGCCCTGGTAGCTTATTCCATTTCAGTGGACTCGCAGGATTGGGAATCGACTGCAGACAGGGATAACTGGAGCGA
CTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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AAAACTCCGCCCAAATTCTTTCGCAAATCGTGTTAAATCCGATCGAACCAGCTCTTTGCAACTTTCCAATCACAAGGACATTGTCTCTCCCCATAGAGGTTCCGTCAACT
CACTTCAGGTTGATTTGACAGAGGGGAGATATTTGTTGTCTGGAGCATCAGATGCATCAGCTGCTGTTTTTGATATTCAACGTGCAACTCACTCCGAGGGTCTTATTGCA
AAGCACCAATGCATTTTTGCAGTTGATAAGCAGCATGAACATGGACATCAATATGCAGTATCCTCAGCCATATGGTATCCCGTTGATACTGGATTGTTTGTCACTGGCTC
ATATGATCATCACATTAATGTCTGGGATACAAATACAACTCAGGTGGTGGTGAATTTTAAATTGCCTGGAAAAGTTTATAGGACAGCCATGTCCTCTTTGGCAACATCAC
ACATGCTGATTGCTGCTGGAACAGAAGATGTTCAAGTTCGCCTTTGTGATATTTCTTCTGGAGCATTTTCTCACACATTATCTGGACATCGTGATGGTGTAATGAGTGTA
GCATGGTCAGCTTCTAGCGAGTGGGTTTTGATTACTGGAGGATGTGATGGAGCTATACGCTTTTGGGACATCAGACGAGCTGGATGCTTTCGTGTTCTAGATCAGTCTCA
ATCTCAGCTTGGGAGACGTCCCCCTATTTCAGGATGGACTGCAAATAAGCTCTCAACATCTAAGTCCCTCTTGGCCAGCCAAGGTTCAAATATGAAATCTCGCATACCTC
ATAAGAAACTAGCCAATGGAAATGCAACAAAGCCATCAGCCACAGGTAAACTGCCGGCTAAGGGATCCACAAGGCAGAGGCTACACCCAGGGCTTTTGTCCAGTCAGGAT
CGAGCAGTTTCTCACTATGGTGCTGTCACTGGATTAAAAGTAACTGGAGATGGCATGTACCTTCTCAGTGCAGGTTCTGATTCAAGGTTAAAGTTATGGGACGTTGAATC
CGGGTGCAATACACTCGTGAATTATGAAACCATGCGGTTACAGACCAATAAACCATTGCAATTAGCCACATCTGAGGATTCAGCCCTTGTATTTGCCCCATGCATGGCGA
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CTGGTCACCATCCCGAAACTCTACCGAACTGGTACACCTTCTGAACTCATACCCATTCATGGAATTGAATTGACTCTCAACCCTGCATATTCTTCCAATAATACCATTGA
AGATGCCCTGGTAGCTTATTCCATTTCAGTGGACTCGCAGGATTGGGAATCGACTGCAGACAGGGATAACTGGAGCGACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MWKDIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHQYAVSSAIWY
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AGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLANGNATKPSATGKLPAKGSTRQRLHPGLLSSQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGS
DSRLKLWDVESGCNTLVNYETMRLQTNKPLQLATSEDSALVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFSGHYEGVNCCWYNFPDQANSRLVTIPKLYRTGTPSELIPIHGIELTL
NPAYSSNNTIEDALVAYSISVDSQDWESTADRDNWSD