; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc08G17640 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc08G17640
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationClcChr08:27922670..27923547
RNA-Seq ExpressionClc08G17640
SyntenyClc08G17640
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0061000.1 LOB domain-containing protein 22-like [Cucumis melo var. makuwa]8.4e-5966.34Show/hide
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XP_022997547.1 LOB domain-containing protein 22-like [Cucurbita maxima]1.2e-5767.55Show/hide
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XP_038886742.1 LOB domain-containing protein 22-like [Benincasa hispida]3.3e-7179.06Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNK6 LOB domain-containing protein2.1e-5564.14Show/hide
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A0A1S3B9X0 LOB domain-containing protein 22-like4.5e-5865.84Show/hide
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A0A5A7V0Z4 LOB domain-containing protein 22-like4.1e-5966.34Show/hide
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A0A6J1HFG0 LOB domain-containing protein 22-like1.0e-5767.02Show/hide
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A0A6J1K5C4 LOB domain-containing protein 22-like5.9e-5867.55Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 22.8e-1745.26Show/hide
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Q9LRW1 LOB domain-containing protein 227.7e-2346.15Show/hide
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Q9SHE9 LOB domain-containing protein 41.3e-1738.46Show/hide
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Q9SSM9 LOB domain-containing protein 73.6e-2035.1Show/hide
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        +  CR  A        +  +  N    L+ +D     N +  D   M + +
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Q9STS6 LOB domain-containing protein 271.8e-1944.44Show/hide
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        T  ACAACK+QRR+C+ADCPLAPYFPA + + FQNV +LFGV++++K L  L+   + +A++ IIF++  R      GC  +  +LQ  I   E + + V
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          QL+  R
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31320.1 LOB domain-containing protein 49.1e-1938.46Show/hide
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AT1G65620.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.0e-1845.26Show/hide
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AT1G72980.1 LOB domain-containing protein 72.5e-2135.1Show/hide
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AT3G13850.1 LOB domain-containing protein 225.5e-2446.15Show/hide
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AT3G47870.1 LOB domain-containing protein 271.3e-2044.44Show/hide
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Query:  LRQLRYCR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATATCAGCGGAGATTCCAGCGGAACCGCCGCCGAGGAAGGCGGAGTCAAGGACAACAACAATCATCCGACTACTCAGGCGGCTTGTGCTGCCTGCAAATTTCAGAG
AAGAAAATGCTCTGCCGATTGTCCTTTGGCTCCCTATTTTCCTGCGCATCGTGTTCAAGATTTTCAAAACGTCCGCAAATTATTCGGCGTAAAGAACGTCCTCAAAACCC
TAGCCGATTTGGAGCCTGATAACAGATTTAAAGCGGTTGAGTGTATAATTTTCGAAGCCAATTGTCGCGCCAGTGATCTCGCTGGTGGATGTTACAAAATCATCTGTGAA
TTGCAGAGTGAAATTACTCTTCTGGAGGCTCAGCATCGAATCGTCCTCCGTCAGCTCCGATATTGCCGACAGACGGCGGCGATTTCACAAAGTGGTGCGACTAGTTCGGA
ATTTGATTTTAATTGGAAGCCGGGGCTTATTTCAGAAGATTGGATACGAAAAGAAAACTGCAATTTGAATGATCGGTTGACTATGATGGAGAATGAAGTTTCTTTTTTCA
AAGCCCTAACCCATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAATATTGAAAATCCCTAATAAGTTGCGCTCCCAAAAGAAACCCACCACTAAGGTGGGTCAGTTACGTACTTTTCGTCCTCTCTGGCTCTCTTTTTCTTCTCCTCTCCT
CCGACTTTTCATCTGCCATGAATATCAGCGGAGATTCCAGCGGAACCGCCGCCGAGGAAGGCGGAGTCAAGGACAACAACAATCATCCGACTACTCAGGCGGCTTGTGCT
GCCTGCAAATTTCAGAGAAGAAAATGCTCTGCCGATTGTCCTTTGGCTCCCTATTTTCCTGCGCATCGTGTTCAAGATTTTCAAAACGTCCGCAAATTATTCGGCGTAAA
GAACGTCCTCAAAACCCTAGCCGATTTGGAGCCTGATAACAGATTTAAAGCGGTTGAGTGTATAATTTTCGAAGCCAATTGTCGCGCCAGTGATCTCGCTGGTGGATGTT
ACAAAATCATCTGTGAATTGCAGAGTGAAATTACTCTTCTGGAGGCTCAGCATCGAATCGTCCTCCGTCAGCTCCGATATTGCCGACAGACGGCGGCGATTTCACAAAGT
GGTGCGACTAGTTCGGAATTTGATTTTAATTGGAAGCCGGGGCTTATTTCAGAAGATTGGATACGAAAAGAAAACTGCAATTTGAATGATCGGTTGACTATGATGGAGAA
TGAAGTTTCTTTTTTCAAAGCCCTAACCCATTAGGGCACTTTTAGTCTTTAAATTTAGATTATAATTTTCTTTTTCTTTTTTTTCTTTGAAACAGATATAGATATACAGA
TTATGATTTGAATGTGTTAATGTGTTAGCAAAGAAACTAAATTGGAAATATTTTACATTCCTACAATTGGGAAAAATTACCCTTTAATTTGTTTAACTTAATTAATTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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