; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc09G03310 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc09G03310
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionF-box/LRR-repeat protein 20
Genome locationClcChr09:2559001..2567694
RNA-Seq ExpressionClc09G03310
SyntenyClc09G03310
Gene Ontology termsGO:0031146 - SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process (biological process)
GO:0019005 - SCF ubiquitin ligase complex (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001611 - Leucine-rich repeat
IPR006553 - Leucine-rich repeat, cysteine-containing subtype
IPR032675 - Leucine-rich repeat domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058734.1 F-box/LRR-repeat protein 20 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-29084.89Show/hide
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XP_004135866.1 F-box/LRR-repeat protein 20 [Cucumis sativus]8.5e-29184.7Show/hide
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XP_008461146.1 PREDICTED: F-box/LRR-repeat protein 20 [Cucumis melo]8.5e-29185.02Show/hide
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XP_038897404.1 F-box/LRR-repeat protein 20 isoform X1 [Benincasa hispida]4.4e-29585.99Show/hide
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XP_038897405.1 F-box/LRR-repeat protein 14 isoform X2 [Benincasa hispida]3.8e-29989.45Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K8P5 Uncharacterized protein4.1e-29184.7Show/hide
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A0A1S3CDL0 F-box/LRR-repeat protein 204.1e-29185.02Show/hide
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Subjt:  -------------LKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGLVGLTHLDLFGA

Query:  RITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRVS
        RITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDK+LELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRVS
Subjt:  RITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRVS

Query:  ASDIRKLQSTDLPNLVSFRPE
        ASDI+KLQSTDLPNLVSFRPE
Subjt:  ASDIRKLQSTDLPNLVSFRPE

A0A5A7UU76 F-box/LRR-repeat protein 205.4e-29184.89Show/hide
Query:  MGGACSRKRDQLDSEDSSPRGVSGKYCKSGSSKWLTTSFSRPFVDIDPRRGKCPSLMDLCIRRICKDIYQYDSFGMLPRDISQLILNELVYSQLLTNISI
        MGGACSRKRDQLD+EDS PRGVSGKYCKSGSSKWLTTSFSRPFVDIDPRRGKCPSLMDLCIRRICKDI QYDSF MLPRDISQLILNELVYSQLL NISI
Subjt:  MGGACSRKRDQLDSEDSSPRGVSGKYCKSGSSKWLTTSFSRPFVDIDPRRGKCPSLMDLCIRRICKDIYQYDSFGMLPRDISQLILNELVYSQLLTNISI

Query:  QAFRDCALQDLHFGECPGVNDAWIDVISSQGSSVLSVDLSGSDVTDCGLMHLRNCSNLQSLNLNFCDHISDRGLVHIGGFSRLTSLSFRKNSEITAQGMN
        QAFRDCALQDLHFGECPGVNDAWIDVISSQGSSVLSVDLSGS+VTD GLM+LRNC+NLQSLNLNFC+HISDRGL HIGGFSRLTSLSFRKNSEIT+QGM+
Subjt:  QAFRDCALQDLHFGECPGVNDAWIDVISSQGSSVLSVDLSGSDVTDCGLMHLRNCSNLQSLNLNFCDHISDRGLVHIGGFSRLTSLSFRKNSEITAQGMN

Query:  VFAHLVNLIRLDLEKCPGIHGGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLSGLTNLKGLQISCSKVTDTGIAYLKGLDGKLTELKTHFSWKFFSFDIFL
        VFAHLVNLIRLDLEKCPGIHGGLIHLQGL KLESLNIKWCNCITDSDIKPLSGLTNLKGLQISCSKVTD GIAYLK                        
Subjt:  VFAHLVNLIRLDLEKCPGIHGGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLSGLTNLKGLQISCSKVTDTGIAYLKGLDGKLTELKTHFSWKFFSFDIFL

Query:  SHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGCPVTAACLDTLSALGALQYLNLSRCHITDDGS-----LGALKILNLGFNDITDECLVH-----------
                           GLHKLSLLNLEGCPVTAACL+TLSALGALQYLNLSRCHITDDGS     LGALKILNLGFNDITDECLVH           
Subjt:  SHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGCPVTAACLDTLSALGALQYLNLSRCHITDDGS-----LGALKILNLGFNDITDECLVH-----------

Query:  --------------LKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGLVGLTHLDLFG
                      LKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGL NLEKLNLSFTVVTD+GLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITD GLASLTGLVGLTHLDLFG
Subjt:  --------------LKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGLVGLTHLDLFG

Query:  ARITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRV
        ARITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDK+LELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRV
Subjt:  ARITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRV

Query:  SASDIRKLQSTDLPNLVSFRPE
        SASDI+KLQSTDLPNLVSFRPE
Subjt:  SASDIRKLQSTDLPNLVSFRPE

A0A6J1GNG6 F-box/LRR-repeat protein 13-like isoform X18.6e-28181.64Show/hide
Query:  MGGACSRKRDQLDSEDSSPRGVSGKYCKSGSSKWLTTSFSRPFVDIDPRRGKCPSLMDLCIRRICKDIYQYDSFGMLPRDISQLILNELVYSQLLTNISI
        MGGACSRKRDQL +ED   RGVSGKYCKSGSSKWLTTSFSRPF+D+DPRRGKCPSL+DL +RR+C DI Q+DSF MLPRDI+QLILNELVYSQ +T+ISI
Subjt:  MGGACSRKRDQLDSEDSSPRGVSGKYCKSGSSKWLTTSFSRPFVDIDPRRGKCPSLMDLCIRRICKDIYQYDSFGMLPRDISQLILNELVYSQLLTNISI

Query:  QAFRDCALQDLHFGECPGVNDAWIDVISSQGSSVLSVDLSGSDVTDCGLMHLRNCSNLQSLNLNFCDHISDRGLVHIGGFSRLTSLSFRKNSEITAQGMN
        QAFRDCALQD H GECPGVND WIDVISSQGSSVLSVDLSGSDVTD GLMHLRNCSN+Q+LNLNFC+HISDRGL HIGGFSRLTSLSFRKN+EITAQGM+
Subjt:  QAFRDCALQDLHFGECPGVNDAWIDVISSQGSSVLSVDLSGSDVTDCGLMHLRNCSNLQSLNLNFCDHISDRGLVHIGGFSRLTSLSFRKNSEITAQGMN

Query:  VFAHLVNLIRLDLEKCPGIHGGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLSGLTNLKGLQISCSKVTDTGIAYLKGLDGKLTELKTHFSWKFFSFDIFL
        VFAHLVNLIRLDLEKCPGIHGGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSD+KPLSGLTNLKGLQISCSKVTD GIAYLK                        
Subjt:  VFAHLVNLIRLDLEKCPGIHGGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLSGLTNLKGLQISCSKVTDTGIAYLKGLDGKLTELKTHFSWKFFSFDIFL

Query:  SHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGCPVTAACLDTLSALGALQYLNLSRCHITDDGS-----LGALKILNLGFNDITDEC--------------
                           GLHKLSLLNLEGCPVTAACL+TLSALG LQYLNLSRCHITDDGS     LGALKILNLGFNDITD+C              
Subjt:  SHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGCPVTAACLDTLSALGALQYLNLSRCHITDDGS-----LGALKILNLGFNDITDEC--------------

Query:  ----------LVHLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGLVGLTHLDLFGA
                  LV+LKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFT+VTDVGLK+LSGLSSLKSLNLDTRQITD GLASLTGLVGLTHLDLFGA
Subjt:  ----------LVHLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGLVGLTHLDLFGA

Query:  RITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRVS
        RITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQN NLTDKTLEL+SGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRVS
Subjt:  RITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRVS

Query:  ASDIRKLQSTDLPNLVSFRPE
        ASDI+KLQSTDLPNL SFRPE
Subjt:  ASDIRKLQSTDLPNLVSFRPE

A0A6J1JVY7 F-box/LRR-repeat protein 13-like isoform X15.0e-28181.64Show/hide
Query:  MGGACSRKRDQLDSEDSSPRGVSGKYCKSGSSKWLTTSFSRPFVDIDPRRGKCPSLMDLCIRRICKDIYQYDSFGMLPRDISQLILNELVYSQLLTNISI
        MGGACSRKRDQL +ED   RGVSGKYCKSGSSKWLTTSFSRPF+D+DPRRGKCPSL+DL +RR+C DI Q+DSFGMLPRDI+QLILNELVYSQ +T+ISI
Subjt:  MGGACSRKRDQLDSEDSSPRGVSGKYCKSGSSKWLTTSFSRPFVDIDPRRGKCPSLMDLCIRRICKDIYQYDSFGMLPRDISQLILNELVYSQLLTNISI

Query:  QAFRDCALQDLHFGECPGVNDAWIDVISSQGSSVLSVDLSGSDVTDCGLMHLRNCSNLQSLNLNFCDHISDRGLVHIGGFSRLTSLSFRKNSEITAQGMN
        QAFRDCALQD H GECPGVND WIDVISSQGSSVLSVDLSGSDVTD GLMHLRNCSN+Q+LNLNFC+HISDRGL HIGGFSRLTSLSFRKN+EITAQGM+
Subjt:  QAFRDCALQDLHFGECPGVNDAWIDVISSQGSSVLSVDLSGSDVTDCGLMHLRNCSNLQSLNLNFCDHISDRGLVHIGGFSRLTSLSFRKNSEITAQGMN

Query:  VFAHLVNLIRLDLEKCPGIHGGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLSGLTNLKGLQISCSKVTDTGIAYLKGLDGKLTELKTHFSWKFFSFDIFL
        VFAHLVNLIRLDLEKCPGIHGGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSD+KPLSGLT+LKGLQISCSKVTD GIAYLK                        
Subjt:  VFAHLVNLIRLDLEKCPGIHGGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLSGLTNLKGLQISCSKVTDTGIAYLKGLDGKLTELKTHFSWKFFSFDIFL

Query:  SHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGCPVTAACLDTLSALGALQYLNLSRCHITDDGS-----LGALKILNLGFNDITDEC--------------
                           GLHKLSLLNLEGCPVTAACL+TLSALG LQYLNLSRCHITDDGS     LGALKILNLGFNDITD+C              
Subjt:  SHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGCPVTAACLDTLSALGALQYLNLSRCHITDDGS-----LGALKILNLGFNDITDEC--------------

Query:  ----------LVHLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGLVGLTHLDLFGA
                  LV+LKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFT+VTDVGLK+LSGLSSLKSLNLDTRQITD GLASLTGLVGLTHLDLFGA
Subjt:  ----------LVHLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGLVGLTHLDLFGA

Query:  RITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRVS
        RITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQN NLTDKTLEL+SGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRVS
Subjt:  RITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRVS

Query:  ASDIRKLQSTDLPNLVSFRPE
        ASDI+KLQSTDLPNL SFRPE
Subjt:  ASDIRKLQSTDLPNLVSFRPE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q17R01 F-box/LRR-repeat protein 149.0e-1729.87Show/hide
Query:  ALQDLHFGECPGVNDAWIDVISSQGSSVLSVDLSG-SDVTDCGLMHLR-NCSNLQSLNLNFCDHISDRGLVHIGGFSR--------LTSLSFRKNSEITA
        +L+ L+   C  + D+ +  I+     +  ++L G S++T+ GL+ +      L+SLNL  C H+SD G+ H+ G +R        L  L+ +   ++T 
Subjt:  ALQDLHFGECPGVNDAWIDVISSQGSSVLSVDLSG-SDVTDCGLMHLR-NCSNLQSLNLNFCDHISDRGLVHIGGFSR--------LTSLSFRKNSEITA

Query:  QGM-NVFAHLVNLIRLDLEKCPGI-HGGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLS-GLTNLKGLQIS-CSKVTDTGIAYL-KGLDG--KLTELKTHF
          + ++   L  L  L+L  C GI   GL+HL  +  L SLN++ C+ I+D+ I  L+ G   L GL +S C KV D  +AY+ +GLDG   L+    H 
Subjt:  QGM-NVFAHLVNLIRLDLEKCPGI-HGGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLS-GLTNLKGLQIS-CSKVTDTGIAYL-KGLDG--KLTELKTHF

Query:  SWKFFSFDIFLSHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGC-PVTAACLDTLSA-LGALQYLNLSRC-HITDDG-----SLGALKILNLGFNDITD
        S      D  ++ ++                +H L  LN+  C  +T   L+ ++  L  L  ++L  C  IT  G      L  LK+LNLG   +TD
Subjt:  SWKFFSFDIFLSHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGC-PVTAACLDTLSA-LGALQYLNLSRC-HITDDG-----SLGALKILNLGFNDITD

Q8BID8 F-box/LRR-repeat protein 149.0e-1729.87Show/hide
Query:  ALQDLHFGECPGVNDAWIDVISSQGSSVLSVDLSG-SDVTDCGLMHLR-NCSNLQSLNLNFCDHISDRGLVHIGGFSR--------LTSLSFRKNSEITA
        +L+ L+   C  + D+ +  I+     +  ++L G S++T+ GL+ +      L+SLNL  C H+SD G+ H+ G +R        L  L+ +   ++T 
Subjt:  ALQDLHFGECPGVNDAWIDVISSQGSSVLSVDLSG-SDVTDCGLMHLR-NCSNLQSLNLNFCDHISDRGLVHIGGFSR--------LTSLSFRKNSEITA

Query:  QGM-NVFAHLVNLIRLDLEKCPGI-HGGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLS-GLTNLKGLQIS-CSKVTDTGIAYL-KGLDG--KLTELKTHF
          + ++   L  L  L+L  C GI   GL+HL  +  L SLN++ C+ I+D+ I  L+ G   L GL +S C KV D  +AY+ +GLDG   L+    H 
Subjt:  QGM-NVFAHLVNLIRLDLEKCPGI-HGGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLS-GLTNLKGLQIS-CSKVTDTGIAYL-KGLDG--KLTELKTHF

Query:  SWKFFSFDIFLSHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGC-PVTAACLDTLSA-LGALQYLNLSRC-HITDDG-----SLGALKILNLGFNDITD
        S      D  ++ ++                +H L  LN+  C  +T   L+ ++  L  L  ++L  C  IT  G      L  LK+LNLG   +TD
Subjt:  SWKFFSFDIFLSHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGC-PVTAACLDTLSA-LGALQYLNLSRC-HITDDG-----SLGALKILNLGFNDITD

Q8N1E6 F-box/LRR-repeat protein 149.0e-1729.87Show/hide
Query:  ALQDLHFGECPGVNDAWIDVISSQGSSVLSVDLSG-SDVTDCGLMHLR-NCSNLQSLNLNFCDHISDRGLVHIGGFSR--------LTSLSFRKNSEITA
        +L+ L+   C  + D+ +  I+     +  ++L G S++T+ GL+ +      L+SLNL  C H+SD G+ H+ G +R        L  L+ +   ++T 
Subjt:  ALQDLHFGECPGVNDAWIDVISSQGSSVLSVDLSG-SDVTDCGLMHLR-NCSNLQSLNLNFCDHISDRGLVHIGGFSR--------LTSLSFRKNSEITA

Query:  QGM-NVFAHLVNLIRLDLEKCPGI-HGGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLS-GLTNLKGLQIS-CSKVTDTGIAYL-KGLDG--KLTELKTHF
          + ++   L  L  L+L  C GI   GL+HL  +  L SLN++ C+ I+D+ I  L+ G   L GL +S C KV D  +AY+ +GLDG   L+    H 
Subjt:  QGM-NVFAHLVNLIRLDLEKCPGI-HGGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLS-GLTNLKGLQIS-CSKVTDTGIAYL-KGLDG--KLTELKTHF

Query:  SWKFFSFDIFLSHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGC-PVTAACLDTLSA-LGALQYLNLSRC-HITDDG-----SLGALKILNLGFNDITD
        S      D  ++ ++                +H L  LN+  C  +T   L+ ++  L  L  ++L  C  IT  G      L  LK+LNLG   +TD
Subjt:  SWKFFSFDIFLSHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGC-PVTAACLDTLSA-LGALQYLNLSRC-HITDDG-----SLGALKILNLGFNDITD

Q9BXB1 Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 44.0e-0928.44Show/hide
Query:  DGSLGALKILNLGFNDITDECLVHLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGL
        +G     + L++  N+IT       K    L+ L+L+  D+     + LSGL  L+ L L    +  V  + + GLS+L+SL LD   IT     S  GL
Subjt:  DGSLGALKILNLGFNDITDECLVHLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGL

Query:  VGLTHLDLFGARITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNL
        V L HL L    +T+   + L N   LQ+L +    ++        +LSSL+VL+L  N  +   +     GL  L +L+++ + +     + +K L +L
Subjt:  VGLTHLDLFGARITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNL

Query:  KQLTLEACRVS
        K+L   +  +S
Subjt:  KQLTLEACRVS

Q9Z2H4 Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 41.1e-0928.44Show/hide
Query:  DGSLGALKILNLGFNDITDECLVHLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGL
        +G     + L++  N+IT       K+   L+ L+L+  D+     + LSGL  L+ L L    +  V  + + GLS+L+SL LD   IT     S  GL
Subjt:  DGSLGALKILNLGFNDITDECLVHLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGL

Query:  VGLTHLDLFGARITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNL
        V L HL L    +T+     L N   LQ+L +    ++        +LSSL+VL+L  N  +   +     GL  L +L+++ + +     + +K L +L
Subjt:  VGLTHLDLFGARITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNL

Query:  KQLTLEACRVS
        K+L   +  +S
Subjt:  KQLTLEACRVS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G15740.1 Leucine-rich repeat family protein6.4e-22064.63Show/hide
Query:  MGGACSRKRDQLDSEDSSPRGVSGKYCKSGSSKWLTTSFSRPFVDIDPRRGKCPSLMDLCIRRICKDIYQYDSFGMLPRDISQLILNELVYSQLLTNISI
        MGGACSRKRDQ   ED   RGVSGKY KS SSKWL TS SR   D+  + G+CPSLM+LC+R+I +DI +Y  F  LPRDISQ I +ELVYSQ LT  S+
Subjt:  MGGACSRKRDQLDSEDSSPRGVSGKYCKSGSSKWLTTSFSRPFVDIDPRRGKCPSLMDLCIRRICKDIYQYDSFGMLPRDISQLILNELVYSQLLTNISI

Query:  QAFRDCALQDLHFGECPGVNDAWIDVISSQGSSVLSVDLSGSDVTDCGLMHLRNCSNLQSLNLNFCDHISDRGLVHIGGFSRLTSLSFRKNSEITAQGMN
        +AFRDCA+QDL+ GE PGVND W+DVISSQ +S+LSVD SGSD+TD GL+ L+ C+NL+SLN NFCD IS+RGLVH+ G S LTSLSFR+N+ ITAQGM 
Subjt:  QAFRDCALQDLHFGECPGVNDAWIDVISSQGSSVLSVDLSGSDVTDCGLMHLRNCSNLQSLNLNFCDHISDRGLVHIGGFSRLTSLSFRKNSEITAQGMN

Query:  VFAHLVNLIRLDLEKCPGIHGGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLSGLTNLKGLQISCSKVTDTGIAYLKGLDGKLTELKTHFSWKFFSFDIFL
          ++LVNL +LDLEKCPGI GGL+HL+ LTKLESLNIKWCNCITD+D++PLS LTNL+ LQI CSK+TD GI+YLK                        
Subjt:  VFAHLVNLIRLDLEKCPGIHGGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLSGLTNLKGLQISCSKVTDTGIAYLKGLDGKLTELKTHFSWKFFSFDIFL

Query:  SHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGC-PVTAACLDTLSALGALQYLNLSRCHITDDG-----SLGALKILNLGFNDITDECLVHLKALHR----
                           GL+KL+LLNLEGC  VTAACLDTL+AL  L YLNL+RC+ +D G      L  LKILNLG N+IT+ CLVHLK L +    
Subjt:  SHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGC-PVTAACLDTLSALGALQYLNLSRCHITDDG-----SLGALKILNLGFNDITDECLVHLKALHR----

Query:  --------------------LKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGLVGLTHLDLFG
                            LK LELSDT+VGSNGLRHLSGL NLE +NLSFTVVTD GL+KLSGL+SL++LNLD R +TD GL++LT L GLTHLDLFG
Subjt:  --------------------LKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGLVGLTHLDLFG

Query:  ARITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRV
        ARITDSGTN+LRN K LQSLEICGGGLTD GVKNIKDLSSL +LNLSQN NLTDKTLELISGLTGLVSLN+SNSR++S+GLRHLK LKNL+ LTLE+C++
Subjt:  ARITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRV

Query:  SASDIRKLQSTDLPNLVSFRPE
        SA+DIRKLQ+TDLPNLV+FRPE
Subjt:  SASDIRKLQSTDLPNLVSFRPE

AT1G75640.1 Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein4.1e-0926.82Show/hide
Query:  ITGLHKLSLLNLEGCPVTAACLDTLSALGALQYLNLSRCHITDD-----GSLGALKILNLGFNDITDECLVHLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGL
        +  L+ L  LNL    +T A    ++ L  L  LNLS    + +     G L +L +LN+    +T    V +  L +L+ L++S   +       L GL
Subjt:  ITGLHKLSLLNLEGCPVTAACLDTLSALGALQYLNLSRCHITDD-----GSLGALKILNLGFNDITDECLVHLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGL

Query:  LNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGLVGLTHLDLFGARITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLM
         +L+ + L   ++  V  +  S L SLK LNL +   +     +   L  L  L L   RI+ +    + N  +L+ LE+    L       +  LS L 
Subjt:  LNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGLVGLTHLDLFGARITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLM

Query:  VLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRVSAS
         L+LS N +LT    + IS  + L SL ++++ ++      L  L NL  L L + R++++
Subjt:  VLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRVSAS

AT3G05360.1 receptor like protein 307.1e-0927.71Show/hide
Query:  LSALGALQYLNLSRCHITDD-----GSLGALKILNLGFNDITDECLVHLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLK-KLSG
        L  L  LQ L LS CH+  +     G+L  L  L+L  N +T E L  +  L++L+ L LS+     N     + L  L  L++S    T       L  
Subjt:  LSALGALQYLNLSRCHITDD-----GSLGALKILNLGFNDITDECLVHLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLK-KLSG

Query:  LSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGLVGLTHLDLFGARITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGG-LTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLT
        L+SL SLN+ +     T  + ++GL  L + D+       +    L    +LQ + + G   +      NI   S L  LNL+ N        E IS + 
Subjt:  LSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGLVGLTHLDLFGARITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGG-LTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLT

Query:  GLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTL
         L+ L++S++ +       +  L NL+ L+L
Subjt:  GLVSLNISNSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTL

AT4G23840.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein1.3e-2626.91Show/hide
Query:  SLSFRKNSEITAQGMNVFAHLVNLIRLDLEKCPGIHGG-LIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLSGLTNLKGLQISCSKVTDTGIAYLKGLDGKLT
        ++  R  S + A+ M      VNLI L+L  C  I+   L  + GLT L  L++  C  +TD+ +K L  + NLK L IS + VT+ GI+ L        
Subjt:  SLSFRKNSEITAQGMNVFAHLVNLIRLDLEKCPGIHGG-LIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLSGLTNLKGLQISCSKVTDTGIAYLKGLDGKLT

Query:  ELKTHFSWKFFSFDIFLSHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGCPVTAACLDTLSALGALQYLNLSRCHITDDGSLGALKILNLGFNDITDECLV
                                             L KLSLL+L G PVT   L +L AL  L+YL++   ++T+ G++  LK  NL F +++   + 
Subjt:  ELKTHFSWKFFSFDIFLSHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGCPVTAACLDTLSALGALQYLNLSRCHITDDGSLGALKILNLGFNDITDECLV

Query:  HLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLS---FTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGLVGLTHLDLFGARITDSGTNY
            +  L+CL ++   + S    H S L +L+KL LS   F+  T+     LS  +      LD  + +    + L  +  L HLDL      D    +
Subjt:  HLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLS---FTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLNLDTRQITDTGLASLTGLVGLTHLDLFGARITDSGTNY

Query:  LRNF-KNLQSLEICGGGLTDAGVKN-----------------IKDLSSLMV---------LNLSQNGNL-----------TDKTLELISGLTGLVSLNIS
        +    +NL++L +    +T +GV N                 + DLS L++         L+L  N  L            +K+L  +  LT L +L++ 
Subjt:  LRNF-KNLQSLEICGGGLTDAGVKN-----------------IKDLSSLMV---------LNLSQNGNL-----------TDKTLELISGLTGLVSLNIS

Query:  NSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRVSASDIRKLQSTDLPNLVS
        +  +    L  L +L  L  L+L +  ++ S +  L S  LPNLVS
Subjt:  NSRITSAGLRHLKTLKNLKQLTLEACRVSASDIRKLQSTDLPNLVS

AT5G01720.1 RNI-like superfamily protein3.4e-1126.04Show/hide
Query:  DSFGMLPRDISQLILNELVYSQLLTNISIQAFRDCA--LQDLHFGECPGVNDAWIDVISS--QGSSVLSVDLSGSDVTDCGLMHLRN-CSNLQSLNLNFC
        DS   L  D   L   +    Q LT+  + +    A  LQ L    C  V    +D  SS  + S++ S+ L G  VT  GL  +   C++L+ ++L+ C
Subjt:  DSFGMLPRDISQLILNELVYSQLLTNISIQAFRDCA--LQDLHFGECPGVNDAWIDVISS--QGSSVLSVDLSGSDVTDCGLMHLRN-CSNLQSLNLNFC

Query:  DHISDRGL----VHIGGFSRLTSLSFRKNSEITAQGMNVFAHLVNLIRLDLEKCPGIHGGLIHL--QGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLSGLTNLKGL
          ++D GL    + +    +L     RK S ++   +     L  L+ L +E C  +      L  Q    LE L++   N I D  +K +S   +L  L
Subjt:  DHISDRGL----VHIGGFSRLTSLSFRKNSEITAQGMNVFAHLVNLIRLDLEKCPGIHGGLIHL--QGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLSGLTNLKGL

Query:  QIS-CSKVTDTGIAYLKGLDGKLTELKTHFSWKFFSFDIFLSHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGC-PVTAACLDTLSALGALQYLNLSRCHI
        ++  C  +TD G++Y+      L EL  + S      D+ +S +                G   L  +N+  C  +T   L +LS    LQ         
Subjt:  QIS-CSKVTDTGIAYLKGLDGKLTELKTHFSWKFFSFDIFLSHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLEGC-PVTAACLDTLSALGALQYLNLSRCHI

Query:  TDDGSLGALKILNLGFNDITDECLVHLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLN-LDTRQITDTGL-AS
            S G   I + G   I   C   L  +   KC  ++  D G   L H S   NL+++N+S T VT+VGL  L+ +  L+++  +++  +  +G+ A+
Subjt:  TDDGSLGALKILNLGFNDITDECLVHLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLKSLN-LDTRQITDTGL-AS

Query:  LTGLVGL
        L G  GL
Subjt:  LTGLVGL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGGGAGCTTGTTCTAGGAAGAGAGACCAGCTAGATAGTGAAGATAGTTCGCCTAGGGGAGTATCTGGAAAATACTGCAAAAGTGGGAGTTCCAAATGGTTGACAAC
TTCATTTTCTCGACCTTTTGTAGACATTGATCCTCGAAGAGGGAAGTGCCCTTCTCTTATGGACTTATGCATCCGGAGAATATGCAAGGATATATATCAATATGATAGTT
TTGGTATGCTCCCAAGGGATATTAGTCAGCTGATCCTCAATGAATTGGTGTATTCTCAGCTTCTAACTAATATTTCAATCCAAGCTTTTCGAGATTGTGCTCTCCAGGAT
CTTCACTTTGGAGAATGTCCAGGGGTGAACGATGCTTGGATTGATGTCATCTCCTCACAGGGATCCTCTGTACTTTCTGTGGATCTTTCTGGCTCGGATGTAACTGATTG
TGGATTGATGCACCTCAGGAATTGCTCAAATCTCCAATCCTTAAATTTAAACTTCTGTGACCATATATCAGATCGAGGACTGGTACATATTGGAGGCTTCTCAAGGTTGA
CAAGTTTGAGTTTTAGGAAAAACAGTGAAATTACTGCTCAAGGGATGAACGTTTTTGCTCATCTTGTAAACTTGATCAGATTGGACTTAGAGAAATGTCCTGGCATTCAT
GGGGGACTTATTCATCTCCAAGGATTAACGAAGTTGGAGTCTCTTAATATCAAATGGTGTAATTGCATCACAGATTCTGATATAAAGCCTCTCTCCGGGCTAACAAACTT
GAAAGGATTGCAAATTTCATGCAGTAAGGTCACAGATACTGGTATTGCCTACTTGAAAGGGCTGGACGGGAAGCTAACTGAGCTGAAGACTCACTTTAGCTGGAAGTTTT
TTAGTTTTGACATATTCTTATCTCATGTTATCCATTACCTTTGTTTTGCTTGGTCTCCTAATTTTGCTTGCATTACAGGACTGCACAAACTTTCGCTTTTGAACTTAGAG
GGTTGTCCAGTTACGGCTGCTTGTTTGGACACTCTCTCAGCTCTTGGTGCCCTTCAATATTTGAACCTTAGCAGATGTCATATAACTGATGATGGAAGCCTTGGGGCTTT
GAAGATATTGAACTTGGGGTTCAATGACATAACAGATGAATGTTTGGTTCACTTGAAAGCCCTCCACCGTTTGAAATGTTTGGAGTTGTCTGACACTGATGTTGGAAGCA
ATGGTCTACGTCATCTATCTGGTCTGCTTAATCTGGAGAAATTAAATCTCTCATTCACCGTAGTGACTGACGTTGGCTTAAAAAAGCTTTCTGGACTCTCATCTCTTAAA
TCACTTAATTTGGATACTCGCCAAATTACAGACACTGGACTTGCTTCCCTAACTGGTTTGGTAGGATTGACTCATCTAGATCTTTTTGGAGCTCGTATTACAGACTCTGG
GACAAACTATTTGCGAAACTTCAAGAACCTACAGTCCCTGGAAATATGTGGTGGAGGATTGACTGATGCTGGTGTGAAGAACATTAAAGACCTTTCTTCCTTGATGGTAC
TCAATCTATCACAAAATGGCAATCTGACTGATAAAACCTTGGAACTAATTTCAGGTTTAACAGGGTTGGTCTCTTTAAACATTTCGAATTCGAGAATCACCTCTGCGGGA
CTGCGGCACCTGAAAACTCTGAAGAACCTAAAGCAGTTGACGCTGGAGGCTTGCCGGGTTTCGGCAAGTGACATCAGAAAGCTTCAATCTACAGACCTCCCGAATCTGGT
GAGCTTCCGCCCTGAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGATGATCATTTTCTTTTTCTCTTTAGAAAGTTTTTGTTTTTCCTTGGTGGGGTGGAGGGTTTTTGATTGTTGGTAAAAGGGGTGAAGTAACGTGTATATGTTATTTTTT
GGTTATTGCATGGGTTACAATAGTGTTCTGCTGAAGTTTTTATGACATAAATTGACTACGGGATATCTTCTCAATGGGGGGAGCTTGTTCTAGGAAGAGAGACCAGCTAG
ATAGTGAAGATAGTTCGCCTAGGGGAGTATCTGGAAAATACTGCAAAAGTGGGAGTTCCAAATGGTTGACAACTTCATTTTCTCGACCTTTTGTAGACATTGATCCTCGA
AGAGGGAAGTGCCCTTCTCTTATGGACTTATGCATCCGGAGAATATGCAAGGATATATATCAATATGATAGTTTTGGTATGCTCCCAAGGGATATTAGTCAGCTGATCCT
CAATGAATTGGTGTATTCTCAGCTTCTAACTAATATTTCAATCCAAGCTTTTCGAGATTGTGCTCTCCAGGATCTTCACTTTGGAGAATGTCCAGGGGTGAACGATGCTT
GGATTGATGTCATCTCCTCACAGGGATCCTCTGTACTTTCTGTGGATCTTTCTGGCTCGGATGTAACTGATTGTGGATTGATGCACCTCAGGAATTGCTCAAATCTCCAA
TCCTTAAATTTAAACTTCTGTGACCATATATCAGATCGAGGACTGGTACATATTGGAGGCTTCTCAAGGTTGACAAGTTTGAGTTTTAGGAAAAACAGTGAAATTACTGC
TCAAGGGATGAACGTTTTTGCTCATCTTGTAAACTTGATCAGATTGGACTTAGAGAAATGTCCTGGCATTCATGGGGGACTTATTCATCTCCAAGGATTAACGAAGTTGG
AGTCTCTTAATATCAAATGGTGTAATTGCATCACAGATTCTGATATAAAGCCTCTCTCCGGGCTAACAAACTTGAAAGGATTGCAAATTTCATGCAGTAAGGTCACAGAT
ACTGGTATTGCCTACTTGAAAGGGCTGGACGGGAAGCTAACTGAGCTGAAGACTCACTTTAGCTGGAAGTTTTTTAGTTTTGACATATTCTTATCTCATGTTATCCATTA
CCTTTGTTTTGCTTGGTCTCCTAATTTTGCTTGCATTACAGGACTGCACAAACTTTCGCTTTTGAACTTAGAGGGTTGTCCAGTTACGGCTGCTTGTTTGGACACTCTCT
CAGCTCTTGGTGCCCTTCAATATTTGAACCTTAGCAGATGTCATATAACTGATGATGGAAGCCTTGGGGCTTTGAAGATATTGAACTTGGGGTTCAATGACATAACAGAT
GAATGTTTGGTTCACTTGAAAGCCCTCCACCGTTTGAAATGTTTGGAGTTGTCTGACACTGATGTTGGAAGCAATGGTCTACGTCATCTATCTGGTCTGCTTAATCTGGA
GAAATTAAATCTCTCATTCACCGTAGTGACTGACGTTGGCTTAAAAAAGCTTTCTGGACTCTCATCTCTTAAATCACTTAATTTGGATACTCGCCAAATTACAGACACTG
GACTTGCTTCCCTAACTGGTTTGGTAGGATTGACTCATCTAGATCTTTTTGGAGCTCGTATTACAGACTCTGGGACAAACTATTTGCGAAACTTCAAGAACCTACAGTCC
CTGGAAATATGTGGTGGAGGATTGACTGATGCTGGTGTGAAGAACATTAAAGACCTTTCTTCCTTGATGGTACTCAATCTATCACAAAATGGCAATCTGACTGATAAAAC
CTTGGAACTAATTTCAGGTTTAACAGGGTTGGTCTCTTTAAACATTTCGAATTCGAGAATCACCTCTGCGGGACTGCGGCACCTGAAAACTCTGAAGAACCTAAAGCAGT
TGACGCTGGAGGCTTGCCGGGTTTCGGCAAGTGACATCAGAAAGCTTCAATCTACAGACCTCCCGAATCTGGTGAGCTTCCGCCCTGAGTAGCTGTGAAGAAGATGTCCT
GTGATCCAACCTGCCATAAAGGCAGTGTTGTAAATAATGATATCCAGGCAACAAGTTCTTATCAAATTGTGCATAGTTTTGGATTTGCTTCAGGCCATGAGCTTTCAGAG
ACCAAGTGTTTTTAGTGGAGTCTAAAAAGCTTTCTTTCTTTTCAATCTAGTTCATTGGAAAAATTGGATAAGAATAGTAGAAGCTTGCAAGCCATGGCAGAAAAAGTCGT
ACAAAAAAAAAGAAACTTTTGTAAATATATCTTCCTTCTCTGCTAAGGCAGTGGAGAATGTGAATAATGCAGTTTTTAAGTTATTTGGTTATATGTTCTGTTCATGTACA
AAACTGGAAATGGATGCTCTTCCACTTTATGAACTTCCATCTTATTATAATTTATTGTCATATCATTGTACAGAGAAGTGATCTTGTCACAGTTTGCTGTCTTGTTAGTT
CTCAATATCTTATTTTTCTTGTGCTAATGTTTAAACTGGAAAGATGTTATTGTTATCATTGTTGAAATTAATGTTCACGTTATTCGTTGCACTGATTATTGAATTATGAC
TATAAACACAAGGCAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGGACSRKRDQLDSEDSSPRGVSGKYCKSGSSKWLTTSFSRPFVDIDPRRGKCPSLMDLCIRRICKDIYQYDSFGMLPRDISQLILNELVYSQLLTNISIQAFRDCALQD
LHFGECPGVNDAWIDVISSQGSSVLSVDLSGSDVTDCGLMHLRNCSNLQSLNLNFCDHISDRGLVHIGGFSRLTSLSFRKNSEITAQGMNVFAHLVNLIRLDLEKCPGIH
GGLIHLQGLTKLESLNIKWCNCITDSDIKPLSGLTNLKGLQISCSKVTDTGIAYLKGLDGKLTELKTHFSWKFFSFDIFLSHVIHYLCFAWSPNFACITGLHKLSLLNLE
GCPVTAACLDTLSALGALQYLNLSRCHITDDGSLGALKILNLGFNDITDECLVHLKALHRLKCLELSDTDVGSNGLRHLSGLLNLEKLNLSFTVVTDVGLKKLSGLSSLK
SLNLDTRQITDTGLASLTGLVGLTHLDLFGARITDSGTNYLRNFKNLQSLEICGGGLTDAGVKNIKDLSSLMVLNLSQNGNLTDKTLELISGLTGLVSLNISNSRITSAG
LRHLKTLKNLKQLTLEACRVSASDIRKLQSTDLPNLVSFRPE