; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc09G03460 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc09G03460
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionPPPDE domain-containing protein
Genome locationClcChr09:2653847..2655498
RNA-Seq ExpressionClc09G03460
SyntenyClc09G03460
Gene Ontology termsGO:0016579 - protein deubiquitination (biological process)
GO:0101005 - ubiquitinyl hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008580 - PPPDE peptidase domain
IPR042266 - PPPDE peptidase domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038899104.1 deSI-like protein At4g17486 [Benincasa hispida]2.8e-11795.61Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBP9 PPPDE domain-containing protein1.8e-11794.74Show/hide
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A0A1S3CEJ5 deSI-like protein At4g174864.7e-11894.74Show/hide
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A0A5A7UYX3 DeSI-like protein5.5e-11995.61Show/hide
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A0A6J1H916 deSI-like protein At4g174861.2e-11391.56Show/hide
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A0A6J1KRJ3 deSI-like protein At4g174865.0e-11290.67Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
H2KZK4 Desumoylating isopeptidase 1 homolog8.7e-2942.45Show/hide
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Q5PQ09 Deubiquitinase DESI27.4e-2838.62Show/hide
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        KNCNHF +     L G  IP WVNRLA     + FL +C+    L    ++         ++ E + EL  E  +  ++S+S+S T+ P
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Q5R456 Deubiquitinase DESI21.8e-2638.02Show/hide
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        G    V LNVYD+  +N Y    G+GVFHSG++V+G E+A+G H Y  +GIFE  P       + F+F++ V++G TD    ++  ++EEL + YKGNAY
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        +L+ KNCNHF +     L G  IP W+NRLA     I FL +C+    L    ++         V+ E + EL        S+S++S+A  S
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Q5ZIV7 Deubiquitinase DESI24.1e-2639.04Show/hide
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        V LNVYD+  +N Y    G+GVFHSG++V+G E+A+G H Y  +GIFE  P       + F+F++ V++G TD    ++  ++EEL + +KGNAY+L+ K
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Q93VG8 DeSI-like protein At4g174868.4e-4854.23Show/hide
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        PVYLNVYDLT +N Y YWFG+G+FHSG++ H +EY +GAHEY T+G++E  P+ C GF FR++VL+G T M  ++ R+ ME+L++ Y G+ Y+LI KNCN
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        HF  + C++LTG  IP W+NRLAR+G  CNC+LP ++  T +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G47740.1 PPPDE putative thiol peptidase family protein2.8e-5452.11Show/hide
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        G  PVYLNVYDLT INGY YW GLG+FHSGV+VHGVEYAFGAH+Y+T+G+FE  P+QC GF+F+K++ +G T++ PT+VR  ME++A  Y GN Y+LI K
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        NCNHFC D C KLTG  IP WVNRLA+IG +C+C+LP +L  T + H    + ++   E +K     S    SS S      S    F Q  S  R   P
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        P     S S+SSS
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AT1G80690.1 PPPDE putative thiol peptidase family protein2.0e-7363.44Show/hide
Query:  LLLKKPIGKTTGGTVPVYLNVYDLTAINGYAYWFGLGVFHSGVQVHGVEYAFGAHEYSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTVLVGKTDMKPTEVRALMEELAQ
        +L +K       G VPVYLNVYDLT INGYAYW GLGV+HSGV+VHG+EYA+GAHEY +TGIFEG PKQC+GF FRK++L+GKTD+ P EVRA ME+LA 
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         YKG++YNLITKNCNHFC++ CIKLTGN IP+WVNRLARIGF+CNCVLP T+N+TR  ++   +DK    E  KK+LTS S++  S+ ++ SS++SSP +
Subjt:  IYKGNAYNLITKNCNHFCNDACIKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHRIEDKVVTMET-KKELTSESTKTPSS-SSSSSATSSPCL

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          R GRSR R  RA  PSSPL   SSS
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AT2G25190.1 PPPDE putative thiol peptidase family protein1.5e-6056.88Show/hide
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        K   G+VPVYLNVYDLT +N Y YW GLGVFHSGV+VHGVEYAFGAHE S+TGIFE  PK+C GF FRK++LVGKTD+   EVR  ME+LA+ Y+GN Y+
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        LIT+NCNHFCN+ C+KL   SIP WVNRLAR+G LCNCVLP  LN  ++R   R+    ++   KK+L + S   P  SSS S++     T    RS  R
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             + P  S SSSS S
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AT4G31980.1 unknown protein7.0e-5853.21Show/hide
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        K   GTVPVYLNVYDLT +N Y YW G+G++HSG++VHGVEY +GAHE S++GIFE  PK+C GF FRK++LVG+T+MK  EVR+ ME+L++ Y+GN Y+
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Query:  LITKNCNHFCNDACIKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHR-----IEDKVVTMETKKELTSESTKTPSSSSSSSATSSPCLTFRQG
        LIT+NCNHFCN   +KLT  SIP+WVNRLAR+GFLCNCVLP  LN T+++   +     +E +    + +K+    S   P SSSSS+A      T    
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Query:  RSRTRRAPP----PSSPL
        RS +   PP    PS PL
Subjt:  RSRTRRAPP----PSSPL

AT5G25170.1 PPPDE putative thiol peptidase family protein9.2e-6659.24Show/hide
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        K   G+VPVYLNVYDLT INGYAYW GLG++HSGV+VHGVEY FGAH++STTGIFE  PKQC GF FRK++L+G+TD+ P  VR  ME+LA+ Y GN+Y+
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        LITKNCNHFCND C++LT  SIP+WVNRLAR G  CNCVLP  LN T++R     E+K+  +E KK+L S S++ P   S SS+ S      R  R   R
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Query:  RAPPPSSPLFS
        R   P SP  S
Subjt:  RAPPPSSPLFS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCTCATTCTTCGTCCTCATCTTCATGA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SHSSSSSS