| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6575671.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 4.3e-94 | 78.21 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIHSS KP EIP NLSTQFLRPISFHP +T LR+SP LQTSA KR TRLFAVAE AV+ Q +SVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV+DANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEK + VSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_022954328.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita moschata] | 7.4e-94 | 78.21 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIHSS KP EIP LSTQFLRPISFHP +T LR+SP LQTSA KR TRLFAVAEAAV+ Q +SVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV+DANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEK + VSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_022954329.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita moschata] | 7.4e-94 | 78.21 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIHSS KP EIP LSTQFLRPISFHP +T LR+SP LQTSA KR TRLFAVAEAAV+ Q +SVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV+DANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEK + VSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_022991923.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] | 1.5e-94 | 78.6 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIHSS KP EIP NLSTQFLRPISFHP +T LR+SP LQTSA KR TRLFAVAEAAV+ Q +SVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV+DANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEK + VSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_023548333.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 3.7e-93 | 77.82 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLI SS KP EIP NLSTQFLRPISFHP +T LR+SP LQTSA KR TRLFAVAEAAV+ Q +SVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV+DANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEK + VST+TLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3CEQ4 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 1.8e-90 | 77.43 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+PTNLIH+S KP EI LS+QFLRPISFHPPH LRISP A + PTRLFAVAEAA +QGA+SVA RKLYIGNIPRNV+NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGR IKVNITEK + VSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A5A7UYL6 30S ribosomal protein 2 | 1.8e-90 | 77.43 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+PTNLIH+S KP EI LS+QFLRPISFHPPH LRISP A + PTRLFAVAEAA +QGA+SVA RKLYIGNIPRNV+NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGR IKVNITEK + VSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1GQT6 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X1 | 3.6e-94 | 78.21 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIHSS KP EIP LSTQFLRPISFHP +T LR+SP LQTSA KR TRLFAVAEAAV+ Q +SVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV+DANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEK + VSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1GSN8 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X2 | 3.6e-94 | 78.21 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIHSS KP EIP LSTQFLRPISFHP +T LR+SP LQTSA KR TRLFAVAEAAV+ Q +SVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV+DANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEK + VSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1JXN0 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like | 7.2e-95 | 78.6 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIHSS KP EIP NLSTQFLRPISFHP +T LR+SP LQTSA KR TRLFAVAEAAV+ Q +SVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV+DANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEK + VSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEK-------------------------------TFVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P19682 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 1.6e-22 | 36.9 | Show/hide |
Query: VAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVN---------
V EA T + KL++GN+P ++D+E L ++ Q+ G VE AEV+Y++ + RSR F FVTM TVE+A+ A+E ++ ++ GR + VN
Subjt: VAEAAVTSQGATSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVN---------
Query: -ITEKTF--------------VSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
+TF + L+ FSE GKV+SA+V + +S G+GFVT SSE E+ AI++ + L+G+ IRVN A
Subjt: -ITEKTF--------------VSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| P19683 31 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 9.3e-23 | 39.41 | Show/hide |
Query: KLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNIT----------EKTF----------
KL++GN+P +VD+E L R+ ++ G VE AEV+Y++ + +SR F FVTM TVE+A A+E N +V GR + VN +TF
Subjt: KLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNIT----------EKTF----------
Query: ----VSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
+ L+ FSE GKV+SA+V T +S G+GFVT +SE E+ AI++ + L+G+ IRVN A
Subjt: ----VSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| P28644 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 2.4e-23 | 40.59 | Show/hide |
Query: KLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKT---------------------
KL++GN+P +VD+E+L I G VE AEV+Y++ + RSR F FVTM TVE+A A+E LN ++ GR + VN
Subjt: KLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKT---------------------
Query: ---FVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
V T L+ FSE GKV+SA+V T +S G+GFVT SSE EV AI++ + L+G+ +RVN A
Subjt: ---FVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| P82277 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 7.0e-55 | 51.54 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLI-HSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATS---VAARKLYIGNIPRNVDNEEL
MA+ISSIL L+ H S+ S+Q L + L++ + T+ R E + +S ++S AR+LY+GNIPRN++N+EL
Subjt: MASISSILSPTNLI-HSSTKPPEIPLNLSTQFLRPISFHPPHTPLRISPALQTSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGATS---VAARKLYIGNIPRNVDNEEL
Query: TRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKTF------------------------------VSTETL
IV+EHGA+E AEVMYDKYSGRSRRF FVTMKTVEDANA IEKLN+TE+GGR IKVNITEK V+ E L
Subjt: TRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKTF------------------------------VSTETL
Query: KNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
K+FFSEKGKVL AKV R PGTSKS+G+GFV+FSSEEEVEAAI + NN++LEGQ IRVNKA
Subjt: KNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| Q8VYM4 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 2.8e-51 | 54.31 | Show/hide |
Query: SFHPPHTPLRI-----SPALQ-TSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGA----TSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAF
SF P HT + + P+L T + TR A + A +S AAR++YIGNIPR V NE+LT++V+EHGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F
Subjt: SFHPPHTPLRI-----SPALQ-TSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGA----TSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAF
Query: VTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKTFVST-------------------------------ETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYG
TMK+VEDANA +EKLN V GR IKVNITEK S+ E L+N FSEKGKV+SAKVSRVPGTSKS+G+G
Subjt: VTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKTFVST-------------------------------ETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYG
Query: FVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FVTFSSEE+VEAAI + NN+LLEGQ IRVNKA
Subjt: FVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G60000.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.6e-25 | 41.07 | Show/hide |
Query: KLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKT---------------------
KLY GN+P NVD+ L +I+Q+ E EV+Y++ +G+SR FAFVTM VED N I+ L+ TE GR +KVN +K
Subjt: KLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKT---------------------
Query: -FVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
V++E+L F E G V+ A+V T +S GYGFV +SS+ E+E A+ S + LEG+ IRVN A
Subjt: -FVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT3G52150.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.0e-52 | 54.31 | Show/hide |
Query: SFHPPHTPLRI-----SPALQ-TSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGA----TSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAF
SF P HT + + P+L T + TR A + A +S AAR++YIGNIPR V NE+LT++V+EHGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F
Subjt: SFHPPHTPLRI-----SPALQ-TSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGA----TSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAF
Query: VTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKTFVST-------------------------------ETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYG
TMK+VEDANA +EKLN V GR IKVNITEK S+ E L+N FSEKGKV+SAKVSRVPGTSKS+G+G
Subjt: VTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKTFVST-------------------------------ETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYG
Query: FVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FVTFSSEE+VEAAI + NN+LLEGQ IRVNKA
Subjt: FVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT3G52150.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.0e-52 | 54.31 | Show/hide |
Query: SFHPPHTPLRI-----SPALQ-TSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGA----TSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAF
SF P HT + + P+L T + TR A + A +S AAR++YIGNIPR V NE+LT++V+EHGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F
Subjt: SFHPPHTPLRI-----SPALQ-TSATKRPTRLFAVAEAAVTSQGA----TSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAF
Query: VTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKTFVST-------------------------------ETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYG
TMK+VEDANA +EKLN V GR IKVNITEK S+ E L+N FSEKGKV+SAKVSRVPGTSKS+G+G
Subjt: VTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKTFVST-------------------------------ETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYG
Query: FVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FVTFSSEE+VEAAI + NN+LLEGQ IRVNKA
Subjt: FVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT3G52380.1 chloroplast RNA-binding protein 33 | 9.5e-23 | 32.96 | Show/hide |
Query: KLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITE------------------KTFV-
+LY+GN+P + + EL++I E G V +++YDK + RSR F FVTM ++E+A A++ N +++GGRT+KVN E +++V
Subjt: KLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITE------------------KTFV-
Query: --------------STETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
+++ LK+ F ++ VL AKV T +S G+GF++F S E V++A+++ N +EG+ +R+N A
Subjt: --------------STETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT5G50250.1 chloroplast RNA-binding protein 31B | 1.9e-23 | 38.24 | Show/hide |
Query: KLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVN--------------ITEKTF------
KL++GN+P +VD++ L + ++ G VE +EV+Y++ + +SR F FVTM TVE+A A+EK N EV GR + VN + + F
Subjt: KLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDANAAIEKLNETEVGGRTIKVN--------------ITEKTF------
Query: ----VSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
V + L+ FSE GKV+ A+V T +S G+GFV S+E EV AI++ + LEG+ I+VN A
Subjt: ----VSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
