; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc09G06360 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc09G06360
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionrapid alkalinization factor-like
Genome locationClcChr09:4919873..4924525
RNA-Seq ExpressionClc09G06360
SyntenyClc09G06360
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7014377.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.1e-4478.81Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAK+S LLPF FIAA L V ST V AT+TK PSWVLD A A CHGSMA+CMMD+IEF+M+SEINRRIL D+NYISYDAL+ N VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

XP_011659776.1 rapid alkalinization factor [Cucumis sativus]2.3e-4277.97Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MA  VS LLP F + AIL VSSTA      KTPSWVLD A A CHGSMAECMM++IEF+M+SEINRRIL DLNYISYDALK N+VPCSRKGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGC+AISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

XP_022153599.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]1.5e-4683.05Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVS LLPF  I AIL VSSTAVFA ST++PSWVLD ARA CHGSMAECMMD IE+EMNSEINRRIL   NYISY+ALK NTVPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

XP_022953165.1 rapid alkalinization factor-like [Cucurbita moschata]2.4e-4479.66Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAK+S LLPF FIAA L V STAV AT+TK PSWVLD A A CHGSMA+CMMD+IEF+M+SEINRRIL D+NYISYDAL+ N VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

XP_038896330.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]1.5e-4986.44Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVS LLPFF +AAIL VSSTAV  TSTKTPSWVLD ARA CHGSMAECMM +IEFEMNS+INRRIL DLNYISYDALK NTVPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGC+AISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K607 Uncharacterized protein1.1e-4277.97Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MA  VS LLP F + AIL VSSTA      KTPSWVLD A A CHGSMAECMM++IEF+M+SEINRRIL DLNYISYDALK N+VPCSRKGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGC+AISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

A0A1S3BRF1 rapid alkalinization factor-like1.2e-4177.12Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVS LLP F + AIL VSSTA       TPSWVL  A A CHGSMAECM ++IEFEM+SEINRRIL DLNYISYDAL+ N+VPCSRKGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGC+AISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

A0A5A7VLB3 Rapid alkalinization factor-like1.2e-4177.12Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVS LLP F + AIL VSSTA       TPSWVL  A A CHGSMAECM ++IEFEM+SEINRRIL DLNYISYDAL+ N+VPCSRKGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGC+AISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

A0A6J1DJJ4 protein RALF-like 337.3e-4783.05Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVS LLPF  I AIL VSSTAVFA ST++PSWVLD ARA CHGSMAECMMD IE+EMNSEINRRIL   NYISY+ALK NTVPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

A0A6J1GNW5 rapid alkalinization factor-like1.2e-4479.66Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAK+S LLPF FIAA L V STAV AT+TK PSWVLD A A CHGSMA+CMMD+IEF+M+SEINRRIL D+NYISYDAL+ N VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 334.9e-2455.75Show/hide
Query:  SLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNI--EFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN
        S  P   I AIL V    +FA  T   S       + C+G++AEC +     EFEM+SEINRRIL    YISY AL+ NTVPCSR+GASYYNC+ GA+AN
Subjt:  SLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNI--EFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN

Query:  PYNRGCSAISRCR
        PY+RGCSAI+RCR
Subjt:  PYNRGCSAISRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor5.8e-2563.53Show/hide
Query:  WVLDA-ARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCRS
        WV+ A +   C GS+ EC+ +  EFE++SE NRRIL    YISY AL+ N+VPCSR+GASYYNC+PGA+ANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  WVLDA-ARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 236.7e-2146.51Show/hide
Query:  SSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTP-SWVLDAARAHCHGSMAECMMD----------------NIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCS
        S     F I  IL V + +V  +S  T  +         C G++AEC +                   EFEM+SEINRRIL    YISY AL+ NT+PCS
Subjt:  SSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTP-SWVLDAARAHCHGSMAECMMD----------------NIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCS

Query:  RKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCR
        R+GASYYNC+ GA+ANPY+RGCSAI+RCR
Subjt:  RKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 221.0e-2151.33Show/hide
Query:  FFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARA-------HCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN
        + + AIL +  +AV +T     S  LD  RA        C GS+AEC+ +  E E +S+I+RRIL    YISY A++ N+VPCSR+GASYYNCQ GA+AN
Subjt:  FFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARA-------HCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN

Query:  PYNRGCSAISRCR
        PY+RGCS I+RCR
Subjt:  PYNRGCSAISRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 17.1e-2355.05Show/hide
Query:  IAAILMVSSTAV---FATSTKTPSWVLDAAR-AHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRG
        I  + ++SS  V   FA      +W       + CHGS+AEC+    E EM+SEINRRIL    YISY +LK N+VPCSR+GASYYNCQ GA+ANPY+RG
Subjt:  IAAILMVSSTAV---FATSTKTPSWVLDAAR-AHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRG

Query:  CSAISRCRS
        CS I+RCRS
Subjt:  CSAISRCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 15.0e-2455.05Show/hide
Query:  IAAILMVSSTAV---FATSTKTPSWVLDAAR-AHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRG
        I  + ++SS  V   FA      +W       + CHGS+AEC+    E EM+SEINRRIL    YISY +LK N+VPCSR+GASYYNCQ GA+ANPY+RG
Subjt:  IAAILMVSSTAV---FATSTKTPSWVLDAAR-AHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRG

Query:  CSAISRCRS
        CS I+RCRS
Subjt:  CSAISRCRS

AT3G05490.1 ralf-like 227.3e-2351.33Show/hide
Query:  FFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARA-------HCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN
        + + AIL +  +AV +T     S  LD  RA        C GS+AEC+ +  E E +S+I+RRIL    YISY A++ N+VPCSR+GASYYNCQ GA+AN
Subjt:  FFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARA-------HCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN

Query:  PYNRGCSAISRCR
        PY+RGCS I+RCR
Subjt:  PYNRGCSAISRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 234.7e-2246.51Show/hide
Query:  SSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTP-SWVLDAARAHCHGSMAECMMD----------------NIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCS
        S     F I  IL V + +V  +S  T  +         C G++AEC +                   EFEM+SEINRRIL    YISY AL+ NT+PCS
Subjt:  SSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTP-SWVLDAARAHCHGSMAECMMD----------------NIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCS

Query:  RKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCR
        R+GASYYNC+ GA+ANPY+RGCSAI+RCR
Subjt:  RKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCR

AT3G62730.1 unknown protein6.2e-1457.53Show/hide
Query:  QNVVIRTLLYQRANEIVVPY-NLTVAKSTNLTSTLANQLGKCGLKDEGIVVPRSLVVENQTESNILATDVNSL
        Q+ VIRTLLY+R NE V  Y  +TVA+ TN  S L N+LG CG+KDEG+ VP  L  EN+T SNIL+ D  SL
Subjt:  QNVVIRTLLYQRANEIVVPY-NLTVAKSTNLTSTLANQLGKCGLKDEGIVVPRSLVVENQTESNILATDVNSL

AT4G15800.1 ralf-like 333.5e-2555.75Show/hide
Query:  SLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNI--EFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN
        S  P   I AIL V    +FA  T   S       + C+G++AEC +     EFEM+SEINRRIL    YISY AL+ NTVPCSR+GASYYNC+ GA+AN
Subjt:  SLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNI--EFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN

Query:  PYNRGCSAISRCR
        PY+RGCSAI+RCR
Subjt:  PYNRGCSAISRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
atggtagcactcgatgttaaagtttttcgatttgcttcaaattttgagtaccttgaaggaccacctcctattggtgctcaaaaggctaatttagatcatgtctacgctaa
catcttcgaggaatttggataccaagaacttggacaactaggcggcctcgctgcttggtggcaaaatgtcgttatacgaacattgttgtaccaaagggctaacgagattg
tggttccatataacctaaccgtggcaaagtccactaacctcacctcaacgctagcaaaccagcttgggaaatgtgggctcaaagacgaagggattgtggtccctcgatcg
ctcgtggtagagaatcaaaccgagagcaacattctcgctaccgacgttaactctcttcgtattctcgaacaatacaagagatcttacggatattgtatggaagtggtagt
gaaactaaggctggtgcctttttttccaagggtgctgatgattaaagaagtgggttgtatagacataccaaggagagcagagaaagcaacaatggcagccaaggtttctt
ctctcctaccatttttctttatcgctgcaatcctgatggtctcctccactgcggtatttgccaccagcaccaagaccccaagctgggtcctcgatgcagctcgagctcac
tgtcacggctccatggcagagtgcatgatggacaatattgaatttgagatgaactctgagatcaatagacgcatattgacagatttaaactacataagctacgacgcgct
caaggtcaacacagtgccatgctcacgcaaaggagcatcttactacaattgtcagccaggtgccgaagccaacccctacaaccgtggctgcagtgctatttctcgttgcc
gaagctaa
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
atggtagcactcgatgttaaagtttttcgatttgcttcaaattttgagtaccttgaaggaccacctcctattggtgctcaaaaggctaatttagatcatgtctacgctaa
catcttcgaggaatttggataccaagaacttggacaactaggcggcctcgctgcttggtggcaaaatgtcgttatacgaacattgttgtaccaaagggctaacgagattg
tggttccatataacctaaccgtggcaaagtccactaacctcacctcaacgctagcaaaccagcttgggaaatgtgggctcaaagacgaagggattgtggtccctcgatcg
ctcgtggtagagaatcaaaccgagagcaacattctcgctaccgacgttaactctcttcgtattctcgaacaatacaagagatcttacggatattgtatggaagtggtagt
gaaactaaggctggtgcctttttttccaagggtgctgatgattaaagaagtgggttgtatagacataccaaggagagcagagaaagcaacaatggcagccaaggtttctt
ctctcctaccatttttctttatcgctgcaatcctgatggtctcctccactgcggtatttgccaccagcaccaagaccccaagctgggtcctcgatgcagctcgagctcac
tgtcacggctccatggcagagtgcatgatggacaatattgaatttgagatgaactctgagatcaatagacgcatattgacagatttaaactacataagctacgacgcgct
caaggtcaacacagtgccatgctcacgcaaaggagcatcttactacaattgtcagccaggtgccgaagccaacccctacaaccgtggctgcagtgctatttctcgttgcc
gaagctaa
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVALDVKVFRFASNFEYLEGPPPIGAQKANLDHVYANIFEEFGYQELGQLGGLAAWWQNVVIRTLLYQRANEIVVPYNLTVAKSTNLTSTLANQLGKCGLKDEGIVVPRS
LVVENQTESNILATDVNSLRILEQYKRSYGYCMEVVVKLRLVPFFPRVLMIKEVGCIDIPRRAEKATMAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAH
CHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCRS