; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc09G09730 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc09G09730
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionglycine-rich protein 23-like
Genome locationClcChr09:8411556..8412475
RNA-Seq ExpressionClc09G09730
SyntenyClc09G09730
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0050560.1 acanthoscurrin-1-like [Cucumis melo var. makuwa]6.1e-3280.3Show/hide
Query:  MTKLFMALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLG--GGGL
        M KLFMALLLALVATHALARPTP D TF+DQKNFLTYGG+GGYSGIG NGLPFGGVGG +GG GLGGGLGGG+ G  G   G+GGLGG GGGLG  GG  
Subjt:  MTKLFMALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLG--GGGL

Query:  GGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
        GG  GG  GGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
Subjt:  GGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP

KAE8646236.1 hypothetical protein Csa_016187 [Cucumis sativus]2.2e-3483.33Show/hide
Query:  MTKLFMALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGI-GGLGGVGGGLGG-GGL
        M KLFMALLLALVATHALARPTP D TF+DQKNFLTYGG+GGYSGIG NGLPFGG+GG +GG GLGGGLGGG+ GGLGG TGI GGLGG+GG  GG GG+
Subjt:  MTKLFMALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGI-GGLGGVGGGLGG-GGL

Query:  GGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
        GGT GG  GGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
Subjt:  GGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP

XP_008462124.1 PREDICTED: acanthoscurrin-1-like [Cucumis melo]7.4e-3080.31Show/hide
Query:  MALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLG--GGGLGGTVG
        MALLLALVATHALARPTP D TF+DQKNFLTYGG+GGYSGIG NGLPFGGVGG +GG GLGGGLGGG+ G  G   G+GGLGG GGGLG  GG  GG  G
Subjt:  MALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLG--GGGLGGTVG

Query:  GATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
        G  GGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
Subjt:  GATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP

XP_011659762.1 glycine-rich protein 5 [Cucumis sativus]2.2e-3483.33Show/hide
Query:  MTKLFMALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGI-GGLGGVGGGLGG-GGL
        M KLFMALLLALVATHALARPTP D TF+DQKNFLTYGG+GGYSGIG NGLPFGG+GG +GG GLGGGLGGG+ GGLGG TGI GGLGG+GG  GG GG+
Subjt:  MTKLFMALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGI-GGLGGVGGGLGG-GGL

Query:  GGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
        GGT GG  GGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
Subjt:  GGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP

XP_038898765.1 acanthoscurrin-1-like [Benincasa hispida]1.2e-4088.72Show/hide
Query:  MTKLFMALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGI---GGLGGVGGGLGGGG
        M KLFMALLLALVAT  LARPTPN+ATFNDQKNFLTYGG+GGYSGIGGNGLPFGGVGG +GG GLGGGLGGG+ GGLGGATGI   GGLGGVGGGLGGGG
Subjt:  MTKLFMALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGI---GGLGGVGGGLGGGG

Query:  LGGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
        LGGT+GG TGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
Subjt:  LGGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K9U1 Uncharacterized protein1.1e-3483.33Show/hide
Query:  MTKLFMALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGI-GGLGGVGGGLGG-GGL
        M KLFMALLLALVATHALARPTP D TF+DQKNFLTYGG+GGYSGIG NGLPFGG+GG +GG GLGGGLGGG+ GGLGG TGI GGLGG+GG  GG GG+
Subjt:  MTKLFMALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGI-GGLGGVGGGLGG-GGL

Query:  GGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
        GGT GG  GGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
Subjt:  GGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP

A0A1S3CGR1 acanthoscurrin-1-like3.6e-3080.31Show/hide
Query:  MALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLG--GGGLGGTVG
        MALLLALVATHALARPTP D TF+DQKNFLTYGG+GGYSGIG NGLPFGGVGG +GG GLGGGLGGG+ G  G   G+GGLGG GGGLG  GG  GG  G
Subjt:  MALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLG--GGGLGGTVG

Query:  GATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
        G  GGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
Subjt:  GATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP

A0A5A7U5T7 Acanthoscurrin-1-like2.9e-3280.3Show/hide
Query:  MTKLFMALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLG--GGGL
        M KLFMALLLALVATHALARPTP D TF+DQKNFLTYGG+GGYSGIG NGLPFGGVGG +GG GLGGGLGGG+ G  G   G+GGLGG GGGLG  GG  
Subjt:  MTKLFMALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLG--GGGL

Query:  GGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
        GG  GG  GGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
Subjt:  GGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP

A0A6J1CPV7 glycine-rich protein 23-like1.2e-2875.37Show/hide
Query:  MTKLFMALLLALVATHALAR--PTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLGG--G
        M K+FM LLLALVATHA+AR  PTP DATF DQKNF TYGGLGGYSGIG NGLPFGGVGG VGG GLGGGLGGG+ GG G   G+GGLGG GGGLGG  G
Subjt:  MTKLFMALLLALVATHALAR--PTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLGG--G

Query:  GLGGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
        G+GGT+GG  GG  GGLGGGLGGG+GG S + YP
Subjt:  GLGGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP

A0A6J1KVV3 acanthoscurrin-1-like2.7e-2573.91Show/hide
Query:  MTKLFMALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGL----GGATGIGG--LGGVGGGLG
        M KLFMA+LLAL+ATHALARPTP DATF DQKNFLTYGGLGGYSGIG NGLPFGG+GG VGG G  GG+GGGI GGL    GG  G+GG   GG+GGGLG
Subjt:  MTKLFMALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGL----GGATGIGG--LGGVGGGLG

Query:  GGGLGGTVGGAT--GGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP
        GGGLGGT+GG    GGLGG +GGGLGGGVGG  G   P
Subjt:  GGGLGGTVGGAT--GGLGGGLGGGLGGGVGGASGVTYP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G32690.1 glycine-rich protein 235.7e-0464.44Show/hide
Query:  GGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLGGGGLGGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGV
        GGLGG  G+GG G   GG GG+ GG GLGGG G G  GGLGG +G+GG GG+GGG GGGGLGG  GG  GG GGG GGG GGG+GG  G+
Subjt:  GGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLGGGGLGGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGV

AT2G32690.2 glycine-rich protein 234.4e-0465.17Show/hide
Query:  GGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLGGGGLGGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASG
        GGLGG  G+GG G   GG GG+ GG GLGGG G G  GGLGG +G+GG GG+GGGLGGG  GG  GGA GGLGGG G G GGG GG  G
Subjt:  GGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLGGGGLGGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASG

AT3G20470.1 glycine-rich protein 55.7e-0464Show/hide
Query:  DQKNFLTY--GGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLG-GGGLGGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASG
        DQK F  +  GGLGG  GIGG G   GG GG  GG GLGGG GGG  GGLGG  G G  GG GGG G GGGLGG  GGA GG GGG GGG GGG GG +G
Subjt:  DQKNFLTY--GGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLG-GGGLGGTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASG

AT4G29030.1 Putative membrane lipoprotein1.6e-0651.16Show/hide
Query:  MTKLFMALLLALVATHALARPTPN-DATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLGGGGLG
        M K F  + L      ALA    N     +DQKN+L YG  GGYSG+G NGLPFGGVGG V G               GG  G GG GG GGGL GGGLG
Subjt:  MTKLFMALLLALVATHALARPTPN-DATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLGGGGLG

Query:  GTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVT
           GGA  GLGGGLGGG G G G + G T
Subjt:  GTVGGATGGLGGGLGGGLGGGVGGASGVT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACCAAATTGTTCATGGCTTTGCTCTTGGCTCTTGTGGCCACTCATGCCCTAGCTAGACCTACGCCAAATGATGCCACCTTCAATGACCAAAAGAACTTCCTCACCTA
CGGTGGCCTCGGTGGCTACTCCGGCATTGGCGGCAATGGCCTCCCGTTCGGTGGTGTGGGGGGTGTCGTTGGAGGAAATGGCCTCGGTGGCGGTCTCGGAGGTGGTATTG
TTGGTGGCCTCGGTGGCGCTACGGGAATCGGTGGACTAGGAGGTGTTGGAGGCGGTTTGGGTGGGGGTGGCCTTGGTGGAACCGTTGGCGGAGCTACTGGTGGTCTTGGT
GGTGGTCTCGGTGGTGGTCTTGGTGGCGGTGTTGGTGGAGCTTCTGGTGTTACTTATCCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCAAAAATGTCCAAAAACTCCTCATTAAAAGCTTTCAACCAGACGAACACTGAGCCCCACTTGGTAATTTCACACAGCCAGGCTCTGGCTTAGCATTTAAACTCATTTAC
TTCTCTCAACTGTCTCTCAACGCTCTCTGCCCTTTAAAACCCTAAGCTCACAGCTCCATTGGCCAACAACACACACAAACACAAGTGTAAGTGTTAGAGAAGTGAGAAAA
AGAAGAAGAAAATGACCAAATTGTTCATGGCTTTGCTCTTGGCTCTTGTGGCCACTCATGCCCTAGCTAGACCTACGCCAAATGATGCCACCTTCAATGACCAAAAGAAC
TTCCTCACCTACGGTGGCCTCGGTGGCTACTCCGGCATTGGCGGCAATGGCCTCCCGTTCGGTGGTGTGGGGGGTGTCGTTGGAGGAAATGGCCTCGGTGGCGGTCTCGG
AGGTGGTATTGTTGGTGGCCTCGGTGGCGCTACGGGAATCGGTGGACTAGGAGGTGTTGGAGGCGGTTTGGGTGGGGGTGGCCTTGGTGGAACCGTTGGCGGAGCTACTG
GTGGTCTTGGTGGTGGTCTCGGTGGTGGTCTTGGTGGCGGTGTTGGTGGAGCTTCTGGTGTTACTTATCCTTGAAAAATTATTTAGTTATGCTTTGATTTTTACTCGAAC
AATCCTTGCAGTTTGAAGTTTGTTTAATTAATAGTGTCAAAAGATGTACTTGTTGAGATGTTGTTTAGTGACCTTATAAACATTTGGTTGTGTTTGGTTTTTCTATTTAA
ATTTGGTTGTGATTATCTTTTGGTTGTTCACTTTCTCAGTATAAAACAAACATATGTTTTACTTGTTCATTGTTATTAGTTTATATATATATATATATATATATATATAT
ATATATATTATATTTAATGAAAAATGAATGGGTTGTATTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTKLFMALLLALVATHALARPTPNDATFNDQKNFLTYGGLGGYSGIGGNGLPFGGVGGVVGGNGLGGGLGGGIVGGLGGATGIGGLGGVGGGLGGGGLGGTVGGATGGLG
GGLGGGLGGGVGGASGVTYP