; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc09G10410 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc09G10410
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionExtensin
Genome locationClcChr09:9189874..9191084
RNA-Seq ExpressionClc09G10410
SyntenyClc09G10410
Gene Ontology termsGO:0009664 - plant-type cell wall organization (biological process)
GO:0005199 - structural constituent of cell wall (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6592187.1 Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-7671.38Show/hide
Query:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP----KSPPPPVYHSP-------PPPPIYYSPPPPKKQE-----Y
        MG  + SMAYLV  +LVA LS  SVIAT+Y YSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPP    KSPPPPVY+SP       PPPP+Y+SPPPP         Y
Subjt:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP----KSPPPPVYHSP-------PPPPIYYSPPPPKKQE-----Y

Query:  KSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVYH
         SPP  VY SPPPPVYHSPPPPVY S PPPVY+SPPPPVY SPPPP    Y SPPPPVY SPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVY+S PPP+Y SPP P+YH
Subjt:  KSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVYH

Query:  SPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY
        SPPPPVYHSPPP +YYSPPPP    YKSP PPVY+SPPPP    Y SPPPP+Y+S PP VY SPPPP+Y
Subjt:  SPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY

XP_004139745.3 extensin-3 [Cucumis sativus]8.9e-7963.04Show/hide
Query:  SSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP---------------------------------------------KSPP
        S MAYL+  ILVATLSL SV+A  YVYSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPP                                             KSPP
Subjt:  SSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP---------------------------------------------KSPP

Query:  PPVYHSP-------PPPPIYYSPPPPKKQE---------------------YKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKK
        PPVYHSP       PPPP+YYSPPPP                         YKSPP  VY SPPPPVYHSPPPPVY S PPPVYHSPPPPVYHSPPPP  
Subjt:  PPVYHSP-------PPPPIYYSPPPPKKQE---------------------YKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKK

Query:  QEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSP
          YKSPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS PPP+YHSPP PVY SPPPPVYHSPPP +Y+SPPPP    YKSP PPVYYSPPPPKK EYKSP
Subjt:  QEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSP

Query:  PPPIYFSLPPLVYHSPPPPIYE
        PPP+Y+S PP +YHSPPPP+Y+
Subjt:  PPPIYFSLPPLVYHSPPPPIYE

XP_022936196.1 extensin-1-like [Cucurbita moschata]7.0e-7671.48Show/hide
Query:  MAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP------------KSPPPPVYHSP-------PPPPIYYSPPPPKKQEYKSPP
        MAYLV  +LVA LS  SVIAT+Y YSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPP            KSPPPPVY+SP       PPPP+YYSPPPP    YKSPP
Subjt:  MAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP------------KSPPPPVYHSP-------PPPPIYYSPPPPKKQEYKSPP

Query:  SRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQE-----YKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVY
          VY SPPPPVYHSPPPPVYHS PPP+Y SPPPPVYHSPPPP  +      Y SPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVYKSPPPPVYHS PPP+Y SPP PVY
Subjt:  SRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQE-----YKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVY

Query:  HSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY
        +SPPPPVY SPPP IY+SPPPP    Y SP PPVYYSPPPP    YKSPPPP+Y S PP VYHSPPPP+Y
Subjt:  HSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY

XP_022976067.1 extensin-3-like [Cucurbita maxima]7.5e-7869.86Show/hide
Query:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPK----------------------SPPPPVYHSPP-------PPP
        MG  + SMAYLV  +LVA LS  SVIA +Y YSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPPK                      SPPPPVYHSPP       PPP
Subjt:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPK----------------------SPPPPVYHSPP-------PPP

Query:  IYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPP
        +YYSPPP  K+EYKSPP  VY SPPPPVY SPPPPVYHS PPPVYHSPPPPVYHSPPPP    YKSPPP VY+SPPPPVYHSPPPP+YKSPPPPVYHSPP
Subjt:  IYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPP

Query:  P-IYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY
        P +Y SPP PVY+SPPPPVY SPPP +YYSPPPP    YKSP PPVY+SPPPP    Y SPPPP+Y+S PP VY SPPPPIY
Subjt:  P-IYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY

XP_038899768.1 extensin-3-like [Benincasa hispida]8.6e-8265.82Show/hide
Query:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPL---------------------------------PPIYQSPPPP--KSPPPPVYH
        MG+ RSSM YLVVAILVATLS  SVI  +YVYSSPPPPYYVYKSP+                                 PP+Y SPPPP   SP PPVYH
Subjt:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPL---------------------------------PPIYQSPPPP--KSPPPPVYH

Query:  SP-------PPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPV
        SP       PPPP+YYSPPPPKKQEYKSPP  VY SPPPPVYHSPPPPVYHS PPPVYHSPPPPVY+SPPPPKKQEYKSPPPPVY SPPPP+YHSPPPPV
Subjt:  SP-------PPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPV

Query:  YKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVYH-----------SPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQE-----YKSPLPPVYYSP-------PPPKKQEYKSPPPP
        YKSPPPPVY S PPP+YHSPP PVY+           SPPPPVY+SPPP +Y+SPPPP  +      Y SPLPPVY+SP       PPP K+EYKSPPPP
Subjt:  YKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVYH-----------SPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQE-----YKSPLPPVYYSP-------PPPKKQEYKSPPPP

Query:  IYFSLPPLVYHSPPPP
         ++S PP VYHSPPPP
Subjt:  IYFSLPPLVYHSPPPP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6D2HCM3 Extensin_2 domain-containing protein4.6e-6572.38Show/hide
Query:  VYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP--KSPPPPVYHSP-------PPPPIYYSPPPPKKQE-------YKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPP
        VY SPPPP Y+YKSP PP+Y SPPPP  KSPPP VYHSP       PPPP+Y+SPPPP  +        YKSPP  VY SPPPPVYHSPPPPVY S PPP
Subjt:  VYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP--KSPPPPVYHSP-------PPPPIYYSPPPPKKQE-------YKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPP

Query:  VYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPL
        VYHSPPPPVY SPPPP    YKSPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY S PPP+YHSPP PVY SPPPPVYHSPPP +Y SPPPP    YKSP 
Subjt:  VYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPL

Query:  PPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY
        PPVY SPPPP    Y SPPPP+Y S PP VYHSPPPP+Y
Subjt:  PPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY

A0A6J1F6U4 extensin-1-like3.4e-7671.48Show/hide
Query:  MAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP------------KSPPPPVYHSP-------PPPPIYYSPPPPKKQEYKSPP
        MAYLV  +LVA LS  SVIAT+Y YSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPP            KSPPPPVY+SP       PPPP+YYSPPPP    YKSPP
Subjt:  MAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP------------KSPPPPVYHSP-------PPPPIYYSPPPPKKQEYKSPP

Query:  SRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQE-----YKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVY
          VY SPPPPVYHSPPPPVYHS PPP+Y SPPPPVYHSPPPP  +      Y SPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVYKSPPPPVYHS PPP+Y SPP PVY
Subjt:  SRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQE-----YKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVY

Query:  HSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY
        +SPPPPVY SPPP IY+SPPPP    Y SP PPVYYSPPPP    YKSPPPP+Y S PP VYHSPPPP+Y
Subjt:  HSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY

A0A6J1F7A8 extensin-1-like3.8e-6768.68Show/hide
Query:  SSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNY---------------VYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP--KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKSPP
        SS+A LV+AILV  LS+ S IA  Y               +Y SPP P  VY SP PP+Y SPPPP  KSPPPPVY+S PPPP+Y+SPPPP    Y SPP
Subjt:  SSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNY---------------VYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP--KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKSPP

Query:  SRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVYHSPPP
          +Y SPPPPVY+SPPPPVYHS PPPVY SPPPPVY SPPPP    YKSPPPPVY SPPPPVY SPPPPVYKSPPPPVY+S PPP+YHSPP PVY SPPP
Subjt:  SRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVYHSPPP

Query:  PVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY
        PVY+SPPP +Y+SPPPP    YKSP PPVY+SPPPP    YKSPPPP+Y+S PP VYHSPPPP+Y
Subjt:  PVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY

A0A6J1IER1 extensin-3-like3.6e-7869.86Show/hide
Query:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPK----------------------SPPPPVYHSPP-------PPP
        MG  + SMAYLV  +LVA LS  SVIA +Y YSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPPK                      SPPPPVYHSPP       PPP
Subjt:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPK----------------------SPPPPVYHSPP-------PPP

Query:  IYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPP
        +YYSPPP  K+EYKSPP  VY SPPPPVY SPPPPVYHS PPPVYHSPPPPVYHSPPPP    YKSPPP VY+SPPPPVYHSPPPP+YKSPPPPVYHSPP
Subjt:  IYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPP

Query:  P-IYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY
        P +Y SPP PVY+SPPPPVY SPPP +YYSPPPP    YKSP PPVY+SPPPP    Y SPPPP+Y+S PP VY SPPPPIY
Subjt:  P-IYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY

A0A7J6XCN3 Extensin2.0e-6875.64Show/hide
Query:  VYSSPPPPYY------VYKSPLPPIYQSPPPP--KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPV--YHSPP
        VY SPPPP Y      VYKSP PP+Y SPPPP  KSPPPPVYHS PPPP+Y+SPPPP    YKSPP  VY SPPPPVYHSPPPPVY S PPPV  YHSPP
Subjt:  VYSSPPPPYY------VYKSPLPPIYQSPPPP--KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPV--YHSPP

Query:  PPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYS
        PPVYHSPPPP    YKSPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS PPP+YHSPP PVY SPPPPVYHSPPP +Y+SPPPP    Y SP PPVY+S
Subjt:  PPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYS

Query:  PPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIYE
        PPPP    Y SPPPP+Y S PP VYHSPPPP+Y+
Subjt:  PPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIYE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q38913 Extensin-14.0e-5057.69Show/hide
Query:  VYSSPPPP--YY----VYKSPLPPIYQSPPPP----------KSP--------PPPVYHSPP-------PPPIYYSPPPPKKQ-----EYKSPPSRVYPS
        VY SPPPP  YY    VYKSP PP+Y+SPPPP          KSP        PPPVY SPP       PPP+Y SPPPP K       YKSPP  V   
Subjt:  VYSSPPPP--YY----VYKSPLPPIYQSPPPP----------KSP--------PPPVYHSPP-------PPPIYYSPPPPKKQ-----EYKSPPSRVYPS

Query:  PPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSP--------PPPVYHSPPPPKKQ-----EYKSP--------PPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPP-
         PPPVY SPPPPV H +PPPVY SP        PPPVY SPPPP K       YKSP        PPPVY SPPPPV++SPPP VY SPPPPV++SPPP 
Subjt:  PPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSP--------PPPVYHSPPPPKKQ-----EYKSP--------PPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPP-

Query:  IYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPP-----PKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQ-EYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY
        +YHSPP PV++SPPP VYHSPPP ++YSPPP     P    + SP P VY+SPPPPKK  EYKSPPPP+++S PP VYHSPPPP++
Subjt:  IYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPP-----PKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQ-EYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY

Q9FS16 Extensin-31.4e-5562.54Show/hide
Query:  SSMAYLVVAILVATLSLK--SVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPL-----PPIYQSPPPP------KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQ-EYKSPPSRV
        S MA LV  +LV T+SL   S    NY YSSPPPP   Y  P+     PP+Y SPPPP      KSPPPPV H   PPP+Y+SPPPPKK   YKSPP  V
Subjt:  SSMAYLVVAILVATLSLK--SVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPL-----PPIYQSPPPP------KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQ-EYKSPPSRV

Query:  YPSPPPPVYHSPPPP----VYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQ-EYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPP----VYKSPPPPVYH-SPPPIYHSPPTP-
            PPPVYHSPPPP    VY S PPPV H  PPPVYHSPPPPKK   YKSPPPPV +  PPPVYHSPPPP    VYKSPPPPV H SPPP+YHSPP P 
Subjt:  YPSPPPPVYHSPPPP----VYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQ-EYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPP----VYKSPPPPVYH-SPPPIYHSPPTP-

Query:  ---VYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQ-EYKSP--------LPPVYYSPPPPKKQ-EYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPP
           VY SPPPPV H  PP +Y+SPPPPKK   YKSP         PPVY+SPPPPKK   YKSPPPP+    PP VYHSPPPP
Subjt:  ---VYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQ-EYKSP--------LPPVYYSPPPPKKQ-EYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPP

Q9M1G9 Extensin-29.0e-3459.27Show/hide
Query:  YVYSSPPPPYYV------YKSPLPP-IYQSPPPP-KSPPPPV-YHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRV-YPSPPPP-VYHSPPPPVYHSTPPPVYHS
        YVYSSPPPP Y       YKSP PP +Y SPPPP  SP P V Y SPPPP +Y SPPPP    Y SP  +V Y SPPPP VY SPPPP Y  +P   Y S
Subjt:  YVYSSPPPPYYV------YKSPLPP-IYQSPPPP-KSPPPPV-YHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRV-YPSPPPP-VYHSPPPPVYHSTPPPVYHS

Query:  PPPP-VYHSPPPP-----KKQEYKSPPPP-VYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPP-VYHSPPPIYHSP-PTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEY
        PPPP VY SPPPP      K +YKSPPPP VY+SPPPP Y   P   YKSPPPP VY SPPP Y+SP P   Y SPPPP  +S PP  YYSP P  K +Y
Subjt:  PPPP-VYHSPPPP-----KKQEYKSPPPP-VYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPP-VYHSPPPIYHSP-PTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEY

Query:  KSPLPP-VYYSPPPP-----KKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPI
        KSP PP VY SPPPP      K +YKSPPPP  +S PP  Y+SP P +
Subjt:  KSPLPP-VYYSPPPP-----KKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPI

Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 34.3e-2851.54Show/hide
Query:  VYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKSPPPPVYHS-------PPPPPIYYSPPPPK----KQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPP------
        VYS PPPP      P PP+Y  PPPP  PPPP  +S       PPPPP  YSPPPP          SPP    P PPPPVY  PPPPVY S PP      
Subjt:  VYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKSPPPPVYHS-------PPPPPIYYSPPPPK----KQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPP------

Query:  -PVY---------HSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPP--PPVYHSPPPPVYK--SPPPPVYHSPPPIYHSPPTPVYHSPPPPVY---HSPPPS
         PVY         HSPPPP + SPPPP+   Y SPPPP  + PP  PP  HSPPPP+Y   SPPPP    P P+   PPTPVY  PPPP       PPP 
Subjt:  -PVY---------HSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPP--PPVYHSPPPPVYK--SPPPPVYHSPPPIYHSPPTPVYHSPPPPVY---HSPPPS

Query:  IYYSPPPPKKQEYKS--PLPPVYYSPPPPKKQEYKS--PPPPIYFSLPP---LVYHSPPP
        I YSPPPP    + S  P PPVYYS PPP    Y S  PPPP+++S PP   + YHSPPP
Subjt:  IYYSPPPPKKQEYKS--PLPPVYYSPPPPKKQEYKS--PPPPIYFSLPP---LVYHSPPP

Q9XIL9 Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 37.7e-3356.5Show/hide
Query:  SPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP---KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPP
        SPPPP  ++  P PP+Y  PPPP     PPPP  +SPPPPP  +SPPPP      SPP  V+ SPPPPV HSPPPPV HS PPPV HSPPPPVY  PPPP
Subjt:  SPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP---KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPP

Query:  KKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPP--PPK----
              SPPPPV+ SPPPPV HSPPPPVY  PPPP  HSPPP   SPP PV HSPPPPVY SPPP +Y  PPPP     KSP PP  YSPP  PPK    
Subjt:  KKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPP--PPK----

Query:  --------------KQEYKSPPPPIYFSLPPLV---YHSPPPPIYE
                       Q  ++PPP   F +PP +   Y SPPPP+++
Subjt:  --------------KQEYKSPPPPIYFSLPPLV---YHSPPPPIYE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G21310.1 extensin 31.0e-5662.54Show/hide
Query:  SSMAYLVVAILVATLSLK--SVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPL-----PPIYQSPPPP------KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQ-EYKSPPSRV
        S MA LV  +LV T+SL   S    NY YSSPPPP   Y  P+     PP+Y SPPPP      KSPPPPV H   PPP+Y+SPPPPKK   YKSPP  V
Subjt:  SSMAYLVVAILVATLSLK--SVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPL-----PPIYQSPPPP------KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQ-EYKSPPSRV

Query:  YPSPPPPVYHSPPPP----VYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQ-EYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPP----VYKSPPPPVYH-SPPPIYHSPPTP-
            PPPVYHSPPPP    VY S PPPV H  PPPVYHSPPPPKK   YKSPPPPV +  PPPVYHSPPPP    VYKSPPPPV H SPPP+YHSPP P 
Subjt:  YPSPPPPVYHSPPPP----VYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQ-EYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPP----VYKSPPPPVYH-SPPPIYHSPPTP-

Query:  ---VYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQ-EYKSP--------LPPVYYSPPPPKKQ-EYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPP
           VY SPPPPV H  PP +Y+SPPPPKK   YKSP         PPVY+SPPPPKK   YKSPPPP+    PP VYHSPPPP
Subjt:  ---VYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQ-EYKSP--------LPPVYYSPPPPKKQ-EYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPP

AT1G23720.1 Proline-rich extensin-like family protein8.7e-4060.71Show/hide
Query:  TNYVYSSPPPPYY-------VYKSPLPP-IYQSPPPP--KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPP-VYHSPPPPVYHSTPPPVY
        T YVY SPPPP Y        YKS  PP +Y SPPPP     P PVY SPPPP +Y SPPPP    Y   P   Y SPPPP VY SPPPP Y  TP P Y
Subjt:  TNYVYSSPPPPYY-------VYKSPLPP-IYQSPPPP--KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPP-VYHSPPPPVYHSTPPPVY

Query:  HSPPPP-VYHSPPPP-----KKQEYKSPPPP-VYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPP-VYHSPPPIYHSP-PTPVYHSPPPP-VYHSPPPSIYYSPPPPKK
         SPPPP VY SPPPP      K  YKSPPPP VY+SPPPP Y   P P YKSPPPP VY SPPP Y+SP P P Y SPPPP VY SPPP  YYSP P  K
Subjt:  HSPPPP-VYHSPPPP-----KKQEYKSPPPP-VYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPP-VYHSPPPIYHSP-PTPVYHSPPPP-VYHSPPPSIYYSPPPPKK

Query:  QEYKSPLPP-VYYSPPPP-----KKQEYKSPPPP-IYFSLPPLVYHSPPPPI
         EYKSP PP VY SPPPP      K EYKSPPPP +Y S PP  Y+SP P +
Subjt:  QEYKSPLPP-VYYSPPPP-----KKQEYKSPPPP-IYFSLPPLVYHSPPPPI

AT1G26240.1 Proline-rich extensin-like family protein8.4e-4363.74Show/hide
Query:  YVYSSPPPPYYVYKSPLPP--IYQSPPPP----KSPPPP--VYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKS--PPSRVYPSPPPP--VYHSPPPP--VYHSTPPP-
        YVYSSPPPP YVYKSP PP  +Y SPPPP    KSPPPP  VY SPPPPP  Y  PPP    Y S  PP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY S PPP 
Subjt:  YVYSSPPPPYYVYKSPLPP--IYQSPPPP----KSPPPP--VYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKS--PPSRVYPSPPPP--VYHSPPPP--VYHSTPPP-

Query:  -VYHSPPPP--VYHSPPPPKKQEYKSPPPP--VYNSPPPP--VYHSPPPP--VYKSPPPP--VYHSPPP---IYHSPPTP--VYHSPPPP--VYHSPPPS
         VY SPPPP  VY SPPPP    Y SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VYKSPPPP  VY SPPP   +Y SPP P  VY+SPPPP  VY SPPP 
Subjt:  -VYHSPPPP--VYHSPPPPKKQEYKSPPPP--VYNSPPPP--VYHSPPPP--VYKSPPPP--VYHSPPP---IYHSPPTP--VYHSPPPP--VYHSPPPS

Query:  IY-YSPPPPKKQEYKSPLPPVY-YSPPPPKKQEYKSPPPPIYF----SLPPLVYHSPPPPIY
         Y YS PPP    YKSP PP Y YS PPP    YKSPPPP Y       PP VY SPPPP Y
Subjt:  IY-YSPPPPKKQEYKSPLPPVY-YSPPPPKKQEYKSPPPPIYF----SLPPLVYHSPPPPIY

AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein1.6e-4161.94Show/hide
Query:  YVYSSPPPPYYVYKSPLPP--IYQSPPPP----KSPPPP--VYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKS--PPSRVYPSPPPP--VYHSPPPP--VYHSTPPPV
        Y+YSSPPPP YVY SP PP  +Y SPPPP     SPPPP  VY SPPPPP  YS PPP    YKS  PP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY S PPP 
Subjt:  YVYSSPPPPYYVYKSPLPP--IYQSPPPP----KSPPPP--VYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKS--PPSRVYPSPPPP--VYHSPPPP--VYHSTPPPV

Query:  Y-HSPPPP---VYHSPPPPKKQEYKSPPPP--VYNSPPPP--VYHSPPPP--VYKSPPPP--VYHSPPP---IYHSPPTP--VYHSPPPP--VYHSPPPS
        Y +SPPPP   VY SPPPP    Y SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VYKSPPPP  VY SPPP   +Y SPP P  VY SPPPP  VY SPPP 
Subjt:  Y-HSPPPP---VYHSPPPPKKQEYKSPPPP--VYNSPPPP--VYHSPPPP--VYKSPPPP--VYHSPPP---IYHSPPTP--VYHSPPPP--VYHSPPPS

Query:  IY-YSPPPPKKQEYKSPLPPVY-YSPPPPKKQEYKSPPPPIYF----SLPPLVYHSPPPPIYELFTIP
         Y YS PPP    YKSP PP Y YS PPP    Y SPPPP Y       PP VY SPPPP Y ++T P
Subjt:  IY-YSPPPPKKQEYKSPLPPVY-YSPPPPKKQEYKSPPPPIYF----SLPPLVYHSPPPPIYELFTIP

AT3G28550.1 Proline-rich extensin-like family protein9.6e-3960.32Show/hide
Query:  YVYSSPPPPYYV------YKSPLPP-IYQSPPPPKSPPPP--VYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPP-VYHSPPPPVYHSTPPPVYHSP
        YVYSSPPPPYY       YKSP PP +Y SPPPP   P P  VY SPPPP +Y SPPPP    Y   P  VY SPPPP VY SPPPP Y  +P  VY SP
Subjt:  YVYSSPPPPYYV------YKSPLPP-IYQSPPPPKSPPPP--VYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPP-VYHSPPPPVYHSTPPPVYHSP

Query:  PPP-VYHSPPPP-----KKQEYKSPPPP-VYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPP-VYHSPPPIYHSP-PTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYK
        PPP VY SPPPP      K  YKSPPPP VY+SPPPP Y   P  VYKSPPPP VY SPPP Y+SP P  VY SPPPP  +S PP  YYSP P  K +YK
Subjt:  PPP-VYHSPPPP-----KKQEYKSPPPP-VYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPP-VYHSPPPIYHSP-PTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYK

Query:  SPLPP-VYYSPPPP-----KKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPI
        SP PP VY SPPPP      K +YKSPPPP  +S PP  Y+SP P +
Subjt:  SPLPP-VYYSPPPP-----KKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAAGATTTAGGTCATCAATGGCCTACCTAGTAGTAGCAATTTTGGTGGCAACTTTGAGTTTGAAATCGGTAATCGCTACCAATTATGTGTATTCTTCTCCACCACC
TCCTTACTATGTTTACAAATCTCCTCTTCCTCCTATCTATCAATCTCCCCCACCACCAAAATCTCCACCACCTCCTGTTTACCATTCTCCTCCACCACCTCCGATTTATT
ACTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAGGAGTATAAATCACCACCATCTCGTGTATATCCCTCTCCTCCTCCCCCTGTATATCACTCTCCTCCACCTCCAGTTTACCATTCT
ACTCCCCCACCTGTTTATCACTCGCCACCACCTCCGGTTTATCACTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAGGAGTATAAATCACCACCACCTCCTGTTTATAACTCTCCTCC
TCCACCTGTATATCACTCTCCTCCACCTCCAGTTTACAAGTCACCACCACCTCCAGTTTACCATTCTCCTCCACCTATTTATCACTCTCCTCCAACTCCAGTTTACCATT
CTCCTCCTCCACCTGTTTATCACTCCCCACCACCATCAATTTATTATTCTCCACCTCCACCAAAGAAGCAAGAGTATAAATCACCTCTACCTCCAGTTTATTATTCTCCA
CCCCCACCAAAGAAGCAAGAGTATAAATCACCACCTCCTCCAATTTATTTCTCTCTTCCACCACTTGTATACCACTCTCCTCCACCTCCAATCTATGAACTTTTTACCAT
TCCATTGAGAGAAACAAAGAGAATATCAACATCAAATAAAAGTGATGGGCTAATGAAGATTTTTACTACGTACAAATTATGGCCCTCTAATTATTTACTTCGTGTGATGT
ATGTTTCAATATTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAAGATTTAGGTCATCAATGGCCTACCTAGTAGTAGCAATTTTGGTGGCAACTTTGAGTTTGAAATCGGTAATCGCTACCAATTATGTGTATTCTTCTCCACCACC
TCCTTACTATGTTTACAAATCTCCTCTTCCTCCTATCTATCAATCTCCCCCACCACCAAAATCTCCACCACCTCCTGTTTACCATTCTCCTCCACCACCTCCGATTTATT
ACTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAGGAGTATAAATCACCACCATCTCGTGTATATCCCTCTCCTCCTCCCCCTGTATATCACTCTCCTCCACCTCCAGTTTACCATTCT
ACTCCCCCACCTGTTTATCACTCGCCACCACCTCCGGTTTATCACTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAGGAGTATAAATCACCACCACCTCCTGTTTATAACTCTCCTCC
TCCACCTGTATATCACTCTCCTCCACCTCCAGTTTACAAGTCACCACCACCTCCAGTTTACCATTCTCCTCCACCTATTTATCACTCTCCTCCAACTCCAGTTTACCATT
CTCCTCCTCCACCTGTTTATCACTCCCCACCACCATCAATTTATTATTCTCCACCTCCACCAAAGAAGCAAGAGTATAAATCACCTCTACCTCCAGTTTATTATTCTCCA
CCCCCACCAAAGAAGCAAGAGTATAAATCACCACCTCCTCCAATTTATTTCTCTCTTCCACCACTTGTATACCACTCTCCTCCACCTCCAATCTATGAACTTTTTACCAT
TCCATTGAGAGAAACAAAGAGAATATCAACATCAAATAAAAGTGATGGGCTAATGAAGATTTTTACTACGTACAAATTATGGCCCTCTAATTATTTACTTCGTGTGATGT
ATGTTTCAATATTTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHS
TPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSP
PPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIYELFTIPLRETKRISTSNKSDGLMKIFTTYKLWPSNYLLRVMYVSIF