; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc09G12880 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc09G12880
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionAuxin responsive SAUR protein
Genome locationClcChr09:12253080..12253889
RNA-Seq ExpressionClc09G12880
SyntenyClc09G12880
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0038583.1 Auxin responsive SAUR protein [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-5279.72Show/hide
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XP_008465964.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503536 [Cucumis melo]1.5e-5279.72Show/hide
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XP_011652654.1 auxin-responsive protein SAUR78 [Cucumis sativus]3.7e-5179.45Show/hide
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XP_022931160.1 uncharacterized protein LOC111437423 [Cucurbita moschata]1.6e-3057.53Show/hide
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XP_038888374.1 uncharacterized protein LOC120078224 [Benincasa hispida]7.7e-5783.69Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LK59 Uncharacterized protein1.8e-5179.45Show/hide
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A0A1S3CQ48 uncharacterized protein LOC1035035367.3e-5379.72Show/hide
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A0A5D3E5S1 Auxin responsive SAUR protein7.3e-5379.72Show/hide
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A0A6J1EYP5 uncharacterized protein LOC1114374237.8e-3157.53Show/hide
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B9S1G2 Uncharacterized protein3.0e-3058.04Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G35290.1 unknown protein1.5e-1840.43Show/hide
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        V+++D VD+ILFEHLLWL+ ND S+   L+V EI++FYAQD
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TGGAGCGGAGAGTAGTCTAGTGAAGGTTGTGGCGGGAAAAGAAAAGAGAGAATTCTTAGTAGACCCTATTGTGTTGGAAGAAAATCCGTTTCGAATTTTGATCGAAAAGG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TTGCTTGGTCCTCCCTTGCTACATCATGAAGAGACGACAACGGAGATCAAGCCGATCGCGTCTCGGCTACCACCGTCTCAACAAATCCGACCTCGGCCGCATCGATGGAG
CGGAGAGTAGTCTAGTGAAGGTTGTGGCGGGAAAAGAAAAGAGAGAATTCTTAGTAGACCCTATTGTGTTGGAAGAAAATCCGTTTCGAATTTTGATCGAAAAGGGAGGA
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GCACTTGCTGTGGCTCATGTACAACGATTGTTCTTCTTTGTTTAAGCTCAATGTAGAGGAAATTCTTGACTTTTATGCTCAAGATTTTTAGAGTGAGACAGATAGAATTC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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