| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004136874.2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis sativus] | 1.7e-117 | 96.71 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRD+DYRRRSRSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPR
SRSRSRGRSRS+DSGSPGRRSPSPRRSP PRRSLSPRRSPSPR
Subjt: SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPR
|
|
| XP_008455209.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis melo] | 9.9e-118 | 97.53 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPR
SRSRSRGRSRS+DSGSPGRRSPSPRRSP PRRSLSPRRSPSPR
Subjt: SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPR
|
|
| XP_022141921.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Momordica charantia] | 8.4e-109 | 92.68 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRR+RDD RDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: --SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPRG
SRS+SRG+SRS+DS SPGRRS S PRRSLSP+RSPSPRG
Subjt: --SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| XP_023529917.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 4.9e-109 | 93 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RDDYRDRDYRR RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPR
S SRSRGRSRS++S SPGRRSPSPRRS PRRSLSPRRS SPR
Subjt: SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPR
|
|
| XP_038888048.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Benincasa hispida] | 1.9e-116 | 95.53 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER--RSR
IHKGKISEAFPKSRY+SRSRSPRRR+RDDYRDRDYRRRSRSRSRSRS DRSDRDRRGRE+ERER+YRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER--RSR
Query: SRSRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPRG
SRSRSRSRGRSRS+DSGSPGR+SPSPRRSP PRRSLSPRRSPSPRG
Subjt: SRSRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K7C0 RRM domain-containing protein | 8.2e-118 | 96.71 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRD+DYRRRSRSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPR
SRSRSRGRSRS+DSGSPGRRSPSPRRSP PRRSLSPRRSPSPR
Subjt: SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPR
|
|
| A0A1S3C0I4 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 4.8e-118 | 97.53 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPR
SRSRSRGRSRS+DSGSPGRRSPSPRRSP PRRSLSPRRSPSPR
Subjt: SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPR
|
|
| A0A6J1CKN2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 4.1e-109 | 92.68 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRR+RDD RDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: --SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPRG
SRS+SRG+SRS+DS SPGRRS S PRRSLSP+RSPSPRG
Subjt: --SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| A0A6J1EIV3 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 7.0e-109 | 92.59 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RDDYRDRDYRR RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPR
S SRSRGRSRS++S SPGRRSPSPRRS PRRSLSPRRS SP+
Subjt: SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPR
|
|
| A0A6J1JE82 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 2.6e-108 | 92.18 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RD+YRDRDYRR RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPR
S SRSRGRSRS++S SPGRRSPSPRRS PRRSLSPRRS SP+
Subjt: SRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPRRSLSPRRSPSPR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 4.4e-28 | 45.93 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
+G + S Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS SK R R + S SRS
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
Query: RSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSP---RRSPFPRRSLSPRRSPSPRG
RSRSR RSRS RSP P R S RS SP +SP G
Subjt: RSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSP---RRSPFPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.7e-27 | 45.53 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS SK R R + S SRS
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
Query: RSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSP---RRSPFPRRSLSPRRSPSPRG
RSRSR RSRS RSP P R S RS SP +SP G
Subjt: RSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSP---RRSPFPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.7e-27 | 45.53 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS SK R R + S SRS
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
Query: RSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSP---RRSPFPRRSLSPRRSPSPRG
RSRSR RSRS RSP P R S RS SP +SP G
Subjt: RSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSP---RRSPFPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q62093 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.7e-27 | 45.53 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS SK R R + S SRS
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
Query: RSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSP---RRSPFPRRSLSPRRSPSPRG
RSRSR RSRS RSP P R S RS SP +SP G
Subjt: RSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSP---RRSPFPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 5.7e-68 | 65.06 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPR---RSLSPRRSPSPR
SPD K R RGRYD+E RS SRS S S R RS S SP + SP+ SP R RS SPRRS SPR
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPR---RSLSPRRSPSPR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 6.4e-14 | 40.82 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ R
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR
Query: SRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSR
+ R R R R RD RRR+ R SRS RS RRGR R R DY R RSISPR D + R D SR RS + RG+SR
Subjt: SRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSR
Query: SMD-------SGSPGR-RSPSPR--RSPFPRRSL--SPRRSPSPR
S+ S SP R RSPSP+ RS PRRS+ SPRRS SPR
Subjt: SMD-------SGSPGR-RSPSPR--RSPFPRRSL--SPRRSPSPR
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 1.0e-11 | 38.91 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TG D RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ N ++
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
Query: KISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSR
+ R+R R R RD RRR+ R SRS RS RRGR R R DY R RSISPR D + R D SR
Subjt: KISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSR
Query: SRSRSRSRGRSRSMD-------SGSPGR-RSPSPR--RSPFPRRSL--SPRRSPSPR
RS + RG+SRS+ S SP R RSPSP+ RS PRRS+ SPRRS SPR
Subjt: SRSRSRSRGRSRSMD-------SGSPGR-RSPSPR--RSPFPRRSL--SPRRSPSPR
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 8.6e-11 | 35.32 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG---PNAER
FG S D+ SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG ++ GRE+TV FA+ P R
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG---PNAER
Query: IH-KGKISEAFPKSRYR----SRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER
+G S F R SRS PRR R R R Y R +SRS+ D R E+ER Y R SP ++ R R
Subjt: IH-KGKISEAFPKSRYR----SRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER
Query: RSRSRS--RSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRS----PFPRRSLSPRRSPS
+S SRS RS S ++RS +SP PR+S P PR + + RSPS
Subjt: RSRSRS--RSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRS----PFPRRSLSPRRSPS
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 4.1e-69 | 65.06 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPR---RSLSPRRSPSPR
SPD K R RGRYD+E RS SRS S S R RS S SP + SP+ SP R RS SPRRS SPR
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPR---RSLSPRRSPSPR
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 4.1e-69 | 65.06 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPR---RSLSPRRSPSPR
SPD K R RGRYD+E RS SRS S S R RS S SP + SP+ SP R RS SPRRS SPR
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSMDSGSPGRRSPSPRRSPFPR---RSLSPRRSPSPR
|
|
