; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc09G20970 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc09G20970
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionsirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like
Genome locationClcChr09:34489829..34497109
RNA-Seq ExpressionClc09G20970
SyntenyClc09G20970
Gene Ontology termsGO:0005488 - binding (molecular function)
GO:0016829 - lyase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002762 - Sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0037556.1 sirohydrochlorin ferrochelatase [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-7270.22Show/hide
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XP_022939639.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]6.4e-7371.81Show/hide
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XP_022993758.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]3.4e-7472.69Show/hide
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XP_023551685.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.5e-7472.25Show/hide
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XP_038890885.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]2.3e-8675.72Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KP17 Uncharacterized protein3.4e-7269.33Show/hide
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A0A1S3C8S9 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic5.3e-7370.22Show/hide
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        M+SLS+TPQI+ KS S VETR  YTI ASQ+SP+ IGRLS+FRNFTSR RMS+DNG SN    RIGAGDAVIIVDHGSRRRESN ML             
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A0A5D3BY55 Sirohydrochlorin ferrochelatase5.3e-7370.22Show/hide
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A0A6J1FHT5 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like3.1e-7371.81Show/hide
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A0A6J1K384 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like1.6e-7472.69Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P61817 Sirohydrochlorin ferrochelatase2.8e-0729.41Show/hide
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        DAV+ V HGSR +E            A+  V          F+   +     PI E   +ELA P+I+  F +C+EQGA RI  +P L   AA       
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Query:  -------KDHPGISYIITAPLGLHEQLVDVVNDRIS
               + +P +  +   P G+ E++VD++ +RI+
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Q58380 Sirohydrochlorin cobaltochelatase3.8e-0432.22Show/hide
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        +A+++V HGSR   S  +L KL   +                    +++  +PIVE   ME +EP+I  +    +EQGAKRII +P   A
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Q84JH7 Sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic2.3e-4146.88Show/hide
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        G    ++L    +++  S     T R++ +  S   +K  L  GR  R           V NG        IG  D +IIVDHGSRRRESNLML      
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                      +EFV MF++KTGYPIVEPAHMELAEPSIKD+F+ CV+QGAKR++              DIPSLTA+AAK+  GISY+ITAPLG H 
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         L+DVVNDRI HCLSH  G A+EC
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G50170.1 sirohydrochlorin ferrochelatase B1.6e-4246.88Show/hide
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        G    ++L    +++  S     T R++ +  S   +K  L  GR  R           V NG        IG  D +IIVDHGSRRRESNLML      
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         L+DVVNDRI HCLSH  G A+EC
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCCGTATGAGTGTTGATAATGGAGGCTCTAATCGGAGCGGAGATCGGATTGGTGCGGGAGATGCTGTGATCATCGTCGACCACGGCTCGCGCCGTCGGGAATCTAACCTC
ATGCTGAGTAAGCTAGGTTCTTCGCTGGCTAATCCTCTTGTGATTCTGAATTTGTTGAAAATTTCAGATGAGTTCGTTGCTATGTTTAGGGATAAAACTGGTTACCCTAT
AGTGGAGCCTGCTCACATGGAGCTGGCCGAACCTTCAATAAAAGACTCGTTTGCATCGTGTGTTGAACAAGGGGCCAAGCGTATCATCGATATTCCTTCCTTAACGGCTG
AAGCAGCAAAGGATCACCCAGGAATATCGTATATAATAACCGCTCCTCTCGGTCTTCATGAACAACTTGTGGATGTTGTGAATGACAGAATAAGTCACTGCTTAAGCCAT
GCTGCTGGGGTTGCAGAAGAATGTGAATTTTCCAAACACACTTCGAGATTTAGTGATGGAAAATCAGAGCTTTTCATGAACCTACCTATCACCAAAAACTTGTTTTACCC
AATTCCAAACTCCATAGAACTTCTCCCTCTCTGCTTGGTGAAGGCCTTGGCCGCCATAAAGACATTGGCTGGAATTTCCCAGCCGCCTCCAAACACGCCATATCCTTCCT
TGGGCAGTGGCTGCATCAAATACTCCAACACTTCCAGTTCCTCCTTTTCTACCCAATATATGCAATTCACAGGACACGATTCCACTGAAACCTGTCAGAATGAAACAAAA
CGACGCTGTTTAATGTTATTCTATCTCTCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TCCGTATGAGTGTTGATAATGGAGGCTCTAATCGGAGCGGAGATCGGATTGGTGCGGGAGATGCTGTGATCATCGTCGACCACGGCTCGCGCCGTCGGGAATCTAACCTC
ATGCTGAGTAAGCTAGGTTCTTCGCTGGCTAATCCTCTTGTGATTCTGAATTTGTTGAAAATTTCAGATGAGTTCGTTGCTATGTTTAGGGATAAAACTGGTTACCCTAT
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AAGCAGCAAAGGATCACCCAGGAATATCGTATATAATAACCGCTCCTCTCGGTCTTCATGAACAACTTGTGGATGTTGTGAATGACAGAATAAGTCACTGCTTAAGCCAT
GCTGCTGGGGTTGCAGAAGAATGTGAATTTTCCAAACACACTTCGAGATTTAGTGATGGAAAATCAGAGCTTTTCATGAACCTACCTATCACCAAAAACTTGTTTTACCC
AATTCCAAACTCCATAGAACTTCTCCCTCTCTGCTTGGTGAAGGCCTTGGCCGCCATAAAGACATTGGCTGGAATTTCCCAGCCGCCTCCAAACACGCCATATCCTTCCT
TGGGCAGTGGCTGCATCAAATACTCCAACACTTCCAGTTCCTCCTTTTCTACCCAATATATGCAATTCACAGGACACGATTCCACTGAAACCTGTCAGAATGAAACAAAA
CGACGCTGTTTAATGTTATTCTATCTCTCGTAATTTACCCTTTTTTTTCCTTTACCTGAATTTTCTGATCATTGTCTCCATATTGAACCTTCACTCGTGCACGGCCAAGA
GTCTCATCCATGGTGAATGTATTACTTGCATTGTGTACGCATTCCCTGCACCCTGTGAGAAATTATGCAGACCTCTCATGCTCATATTAGTAAGTAGGTTGTAATTATTG
ATTAAGAATAGCCAGTTTGAATCCTCTTTACTATTTCTTATCTATGAGACATAGTGAGTTAAATCTAACCAGACGAAATTAATACCTTAAAACTGAATTTAAATTTTTTT
TAAGAAAACAACAATTCAGCCATAAAAATCAAACACAGTTAATATATATATTGTTTCCTGGCTACAAGATCTCCTTGCACTGCTTAGATTCCATTTTGATCCACAAACTA
AGTTTCTCAAATTTTAGTCCTCTAATTTTTAAAATATTTATTTTGGTCTATAAACTTTTGTGCTTGTTCAATTTTGGTCCATAAACGCTCATAATGTCTATTATAATATC
TAAACATTTAAAAACAATCATTTTGATCCTTGTTATATTGTTTTTCCATTTGATTTTTATTTGTCTGATACTCTTATCTAATCCATATGGTTTGATTTTGAAAATTATTG
TCTCATTAAGATGGTAGTACACATATTCAAAGTTACGTCCTTAATTTGTTAAAAAGGTTTAAATCAACAATAAAAATGTTTTTTATTTTGAAAATTCGAAATATATACAT
TCAAAAAGTTCATAGACTGAAACGTACGGAAACGGGATGTAAGCTTAAAAATATATAATATTCCTCACAATTTTGTTGTTTAGTAAAAGTTCATTTGCACAATGAATATT
GAAGGAGGAACACAACCATACCTATACAAGCATTCCCGTCAACAAACAAAGCCTGAGGTCTCACAGGCCCTTTCCAGGAACTGTAACCCAATCCGGGGCCATAATTCCCA
AACCTCACCCTCATCCCACCCATGGAAGTGTCATATTCCTTCCTTTGATCGTCTCTCATCAGAACCCGGTACGCCTCGTTCAGCCTCAGCGCATACTCGTGGCCCTAACA
AAGTTCAAAAATCATCAGACAGTAATTAATGTGTTTCGCGAACAATTCTGGAAGAAATAAGTAACCTCTTGGCCCGCAATATCCGGATGATATTTCTTCTGCAACTTTCT
GTAGGCATCTTTGATTTCTTGAGCATTTGAATCAGCAGAAACTCCAAGCAGCTCGTAATAGTTCGTCTCGTTCGTTCTCTCTCTTACGCTACATCTAATCGCCGTCCATC
TCTGCCTCCTTCCGACCAAAATTCTTCCATCAGAAGTATAAATTAGCAGTAAAATTGAAAGTGTTAAGATTCAAACCTATATTTAAGCTTGTCAAGTTAAAGATCGCTTC
GCTCCGAAGTAAACGAATGAAGAAGACGAAAAAGATATAACTCTTTACGATCGATCTCTGTTTAGAAAATTACCTTAAGATGTGCTTGTTATGATCATTAGGATGCGCAA
GAGATGGAGAAGAAGCCATTGGCGGCATTGAGTGGTGGATAGATGGAACAATAGACATGGCCATGAGGTATGAAACTGCAAATTCTCTATGGAGGTTTTCGGGAGGAGAA
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TTTGCATATTTGTTCCCACGGACTTCGGTGGTATATTCTCACTTGGAACTTAGAAGTATCTCAATTTTTGTTTTATTCATAAAATAAAAAATTGAACTTAAAATATTACT
TTTTATTTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLVNHSNQVRKTSSSCLSLCKGSEPMTSLSITPQITLKSSSAVETRRTYTITASQKSPLLIGRLSRFRNFTSRFRMSVDNGGSNRSGDRIGAGDAVIIVDHGSRRRESNL
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AAGVAEECEFSKHTSRFSDGKSELFMNLPITKNLFYPIPNSIELLPLCLVKALAAIKTLAGISQPPPNTPYPSLGSGCIKYSNTSSSSFSTQYMQFTGHDSTETCQNETK
RRCLMLFYLS