; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc09G22030 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc09G22030
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionChlorophyll A-B binding protein
Genome locationClcChr09:35399081..35399990
RNA-Seq ExpressionClc09G22030
SyntenyClc09G22030
Gene Ontology termsGO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK05751.1 uncharacterized protein E5676_scaffold98G002400 [Cucumis melo var. makuwa]2.7e-7887.57Show/hide
Query:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPES-GSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSL+FPNSL LPSNSK HKP+ LTF+TRAADPES  +D E  GSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGS  +ASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPES-GSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSER+NGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
XP_004149820.1 uncharacterized protein LOC101221723 [Cucumis sativus]2.5e-7988.65Show/hide
Query:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPES-GSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSL+FPNSL LPSNSKP KPK LTF+TRAADPESPA D E  GSDGDDFEDRLAKVR+RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GS  +ASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPES-GSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSER+NGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
XP_022133568.1 uncharacterized protein LOC111006119 [Momordica charantia]6.3e-8389.25Show/hide
Query:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPESGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASA--SSVYLPPVP
        MAAIPSSSL+FPNSL  PSNSKPHK KPLTFVTRAADPE+PAADPE GSDGDDFE+RLAKVRL+YRSGTGKKAEIRKARKS KGS A A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPESGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASA--SSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SER+NGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAA+Y+K+EKEKVSVWPP+E+KN
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
XP_023550096.1 uncharacterized protein LOC111808391 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.2e-7989.13Show/hide
Query:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPESGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPLK
        MAAIPSSSL+FPNSLA  SNSKPHKPK LTFVTRAADPESPAAD E  SDGDDFEDRLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS+KGS A+ASSVYLPPVPLK
Subjt:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPESGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPLK

Query:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        EAVSGGLKVEFGFSPYSER+NGWIAILG+SALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAA AALYIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
XP_038890345.1 uncharacterized protein LOC120079944 [Benincasa hispida]3.1e-8292.39Show/hide
Query:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPESGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPLK
        MAAIPSSSL+FPNSL L     P KPK LTFVTRAADPESPAAD ESGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGS A+ SSVYLPPVPLK
Subjt:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPESGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPLK

Query:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        EAVSGGLKVEFGFSPYSER+NGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
Subjt:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS45 Uncharacterized protein1.2e-7988.65Show/hide
Query:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPES-GSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSL+FPNSL LPSNSKP KPK LTF+TRAADPESPA D E  GSDGDDFEDRLAKVR+RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GS  +ASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPES-GSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSER+NGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
A0A1S3CJX9 uncharacterized protein LOC1035016673.8e-7887.03Show/hide
Query:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPES-GSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSL+FPNSL LPSNSK HKP+ LTF+TRAADPES  +D E  GSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGS  +ASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPES-GSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSER+NGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAV A+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
A0A5D3C1D6 Uncharacterized protein1.3e-7887.57Show/hide
Query:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPES-GSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSL+FPNSL LPSNSK HKP+ LTF+TRAADPES  +D E  GSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGS  +ASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPES-GSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSER+NGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
A0A6J1BZH5 uncharacterized protein LOC1110061193.0e-8389.25Show/hide
Query:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPESGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASA--SSVYLPPVP
        MAAIPSSSL+FPNSL  PSNSKPHK KPLTFVTRAADPE+PAADPE GSDGDDFE+RLAKVRL+YRSGTGKKAEIRKARKS KGS A A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPESGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASA--SSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SER+NGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAA+Y+K+EKEKVSVWPP+E+KN
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
A0A6J1JUJ1 uncharacterized protein LOC1114890226.5e-7888.04Show/hide
Query:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPESGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPLK
        MAAIPSSSL+FPNSLAL SNSKPHKPK LTFV RAADPESPAAD E  SDGDDFEDRLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS+KGS A+ASSVYLPPVPLK
Subjt:  MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPESGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPLK

Query:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        EAVSGGLKVEFGFSPYSER+NGWIAILG+ ALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQ YFVAA AALYIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G12345.1 unknown protein1.1e-4863.51Show/hide
Query:  TRAADPESPAADPESGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPLKEAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISAL
        T    P+      ESG+D D FE RL+ +RLRYRSGTGKKAE+RK++K   GS +  + +YLPPV LKEAVSGGLKVE GFSP+SER+NG IA LG++AL
Subjt:  TRAADPESPAADPESGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPLKEAVSGGLKVEFGFSPYSERMNGWIAILGISAL

Query:  VLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPD
        +LVELATGK V+NYHTP+++ +Q+YFVAAV+A+++K EKEKVSVWP D
Subjt:  VLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPD

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCAATTCCATCTTCCTCCTTGAAATTCCCTAACTCTCTCGCACTACCTTCCAATTCAAAGCCTCACAAGCCGAAGCCTCTCACCTTCGTAACTAGAGCAGCAGA
TCCGGAATCTCCTGCCGCCGATCCAGAATCTGGATCGGACGGCGACGATTTCGAGGACCGACTGGCCAAGGTCCGACTCCGATACCGAAGTGGAACAGGAAAGAAAGCAG
AGATACGGAAGGCTCGGAAGTCCAAGAAAGGATCCAACGCCTCCGCCTCGTCGGTGTACCTACCGCCAGTGCCGTTGAAGGAGGCGGTTTCCGGCGGACTTAAAGTGGAA
TTCGGATTCAGCCCGTACAGTGAGAGGATGAATGGATGGATTGCGATACTCGGAATATCGGCGCTGGTTCTGGTGGAATTGGCTACCGGAAAAGGCGTCATCAATTACCA
TACGCCGGCGATTATACTGATTCAAGTGTATTTTGTAGCGGCGGTTGCTGCTCTATATATCAAATACGAGAAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCGCCGGATGAAATAAAAA
ATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAAAAAACAAAAAAAACCCACTAATTTAAAGAAAGCGAAAAAAAAATACAAAAAGAAAAACGCAAAAATATAAGGCTCAAACGGTTACAGCGAGAGAGGGGCGAGC
TTATCCTCGAGCTCAGATTTCTCCTTCCATGGCGGCAATTCCATCTTCCTCCTTGAAATTCCCTAACTCTCTCGCACTACCTTCCAATTCAAAGCCTCACAAGCCGAAGC
CTCTCACCTTCGTAACTAGAGCAGCAGATCCGGAATCTCCTGCCGCCGATCCAGAATCTGGATCGGACGGCGACGATTTCGAGGACCGACTGGCCAAGGTCCGACTCCGA
TACCGAAGTGGAACAGGAAAGAAAGCAGAGATACGGAAGGCTCGGAAGTCCAAGAAAGGATCCAACGCCTCCGCCTCGTCGGTGTACCTACCGCCAGTGCCGTTGAAGGA
GGCGGTTTCCGGCGGACTTAAAGTGGAATTCGGATTCAGCCCGTACAGTGAGAGGATGAATGGATGGATTGCGATACTCGGAATATCGGCGCTGGTTCTGGTGGAATTGG
CTACCGGAAAAGGCGTCATCAATTACCATACGCCGGCGATTATACTGATTCAAGTGTATTTTGTAGCGGCGGTTGCTGCTCTATATATCAAATACGAGAAGGAGAAGGTT
AGCGTTTGGCCGCCGGATGAAATAAAAAATTAGAATGAAGCTTTAACGATTCAGTAATTTTTTTTCTTCTTTTGCCTGTGTTTTTTGAATTTCCACCTTTCTTTTCTTCT
TTACTTGACATCGAACCAATGCTTTTGAGTTATGTATGAATGAACATGAGAAATATGCATTATTGAAAGGAAGTAACATTATTATTATTCTATGTTATTTTGAAGCTCCA
TGAGAACATGGAAGGAGGCTAAGATTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAIPSSSLKFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADPESGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSNASASSVYLPPVPLKEAVSGGLKVE
FGFSPYSERMNGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN