; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc09G22540 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc09G22540
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionGDSL esterase/lipase
Genome locationClcChr09:35905970..35912595
RNA-Seq ExpressionClc09G22540
SyntenyClc09G22540
Gene Ontology termsGO:0016788 - hydrolase activity, acting on ester bonds (molecular function)
InterPro domainsIPR001087 - GDSL lipase/esterase
IPR035669 - GDSL lipase/esterase-like, plant
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023553654.1 GDSL esterase/lipase At2g04570-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-16390.34Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KEM2 Uncharacterized protein1.1e-16586.57Show/hide
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A0A1S3BM52 GDSL esterase/lipase At2g045702.3e-16385.96Show/hide
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A0A5D3C3R2 GDSL esterase/lipase2.3e-16385.96Show/hide
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A0A6J1I114 GDSL esterase/lipase At2g04570-like1.2e-16490.97Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q67ZI9 GDSL esterase/lipase At2g429902.3e-11261.11Show/hide
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Q8VY93 GDSL esterase/lipase At4g267901.1e-10358.6Show/hide
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        L FL + + L      T AK  A+IVFGDS+VD+GNNN I T+ +SNF PYGRD+  GKATGRFSNGRI  DFISE  GLK  VPAYLDPAYNI+D ATG
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        LGARK+SL GL P GCLPLERT  LF G+ C+E YN +A DFN K++    +LN+DL  I+LVFSNPYD++  +I  P  +GF+   +ACC TG +EM Y
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         C++ + FTC+DA+
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Q9LH73 GDSL esterase/lipase At3g148202.3e-6440.35Show/hide
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        L F  +    SS+       + A+IVFGDS +D GNNN IPT+ +SNF PYGRDF G   TGRFS+G++P+D I+E+ G+   +P YL       DL  G
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        + FAS G+GYD  TS +LSV+ +  QL+Y++EY AK+  + G       ++++++++   +ND  E Y+    RS +Y+   Y ++LV +A  FI++L  
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        LGA+ I L    P+GCLP +RT  LFGG    C E  NN+A+ FN+KL +    L K+LP   L+F + YD L+++IK P+ YGF V    CC TG  E+
Subjt:  LGARKISLGGLPPMGCLPLERTRNLFGG--NDCLESYNNLAMDFNNKLKALTVKLNKDLPDIELVFSNPYDVLMNMIKKPSLYGFDVTSTACCATGMFEM

Query:  GYACNRNSMFTCTDANNRT-RDSPHAPTLATTISIFQLPSNFHVSLS
           CN+ + FTC+DA+     DS H    A  I   +L + +   L+
Subjt:  GYACNRNSMFTCTDANNRT-RDSPHAPTLATTISIFQLPSNFHVSLS

Q9LU14 GDSL esterase/lipase APG7.9e-6541.34Show/hide
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        LT+VS LS   +     V A++ FGDS VD GNNN++PT+ R+++ PYGRDFA  KATGRF NG++ TD  +E  G     PAYL P  +  +L  G  F
Subjt:  LTIVSLLSSSTMITEAKVSAVIVFGDSSVDAGNNNFIPTIARSNFLPYGRDFAGGKATGRFSNGRIPTDFISEAFGLKPIVPAYLDPAYNISDLATGLTF

Query:  ASAGTGYDNATSDVLSVIPLWKQLEYYKEYQAKLIAYQGSSTANETIKEALYVMSLGTNDFLENYYTMPGRSSQYNIQQYQDFLVGIAGGFIEKLHGLGA
        ASA +GYD+  + +   IPL++Q+EY+KEY++KLI   GS  A+  IK A+ ++S G++DF++NYY  P     Y +  Y  FL+     FI++++ +GA
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Query:  RKISLGGLPPMGCLPLERTRNLFGGNDCLESYNNLAMDFNNKLKALTVKLNKDLPDIELVFSNPYDVLMNMIKKPSLYGFDVTSTACCATGMFE-MGYAC
        RKI +  LPP GCLP  RT   F    C+   N  A +FN KL A   KL K   D+++V  + Y  L ++++ PS  GF   +  CC TG  E     C
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Query:  NRNSMFTCTDANNRT-RDSPHAPTLATTI
        N  S  TC++A      DS H    A  I
Subjt:  NRNSMFTCTDANNRT-RDSPHAPTLATTI

Q9SJB4 GDSL esterase/lipase At2g045704.0e-12566.46Show/hide
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        TI+ L++ S+ +T A K+ A+IVFGDSSVDAGNNN+IPT+ARSNF PYGRDF GGK TGRF NG+I TDF+SEA GLKPI+PAYLDP+YNISD ATG+TF
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Query:  ASAGTGYDNATSDVLSVIPLWKQLEYYKEYQAKLIAYQGSSTANETIKEALYVMSLGTNDFLENYYTMPGRSSQYNIQQYQDFLVGIAGGFIEKLHGLGA
        ASA TGYDNATSDVLSV+PLWKQLEYYKEYQ KL AYQG     ETI+ +LY++S+GTNDFLENY+  PGRSSQY++  YQDFL GIA  F++KLHGLGA
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Query:  RKISLGGLPPMGCLPLERTRNLFGGNDCLESYNNLAMDFNNKLKALTVKLNKDLPDIELVFSNPYDVLMNMIKKPSLYGFDVTSTACCATGMFEMGYACN
        RKISLGGLPPMGC+PLER  N+  G +C+  YN++A+ FN+KL  +  KL+K+LP   LVFSNPY+  M +IK PS +GF+V   ACCATGMFEMGY C 
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Query:  RNSMFTCTDANNRTRDSPHAPTLAT
        RN+ FTCT+A+         PT  T
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G04570.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein2.8e-12666.46Show/hide
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        TI+ L++ S+ +T A K+ A+IVFGDSSVDAGNNN+IPT+ARSNF PYGRDF GGK TGRF NG+I TDF+SEA GLKPI+PAYLDP+YNISD ATG+TF
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Query:  ASAGTGYDNATSDVLSVIPLWKQLEYYKEYQAKLIAYQGSSTANETIKEALYVMSLGTNDFLENYYTMPGRSSQYNIQQYQDFLVGIAGGFIEKLHGLGA
        ASA TGYDNATSDVLSV+PLWKQLEYYKEYQ KL AYQG     ETI+ +LY++S+GTNDFLENY+  PGRSSQY++  YQDFL GIA  F++KLHGLGA
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Query:  RKISLGGLPPMGCLPLERTRNLFGGNDCLESYNNLAMDFNNKLKALTVKLNKDLPDIELVFSNPYDVLMNMIKKPSLYGFDVTSTACCATGMFEMGYACN
        RKISLGGLPPMGC+PLER  N+  G +C+  YN++A+ FN+KL  +  KL+K+LP   LVFSNPY+  M +IK PS +GF+V   ACCATGMFEMGY C 
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Query:  RNSMFTCTDANNRTRDSPHAPTLAT
        RN+ FTCT+A+         PT  T
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AT2G42990.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein1.6e-11361.11Show/hide
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        +L++   I  AK+ A+IVFGDSSVD+GNNNFI T+AR+NF PYGRDF GG+ATGRF NGR+ +DF SEA+GLKP VPAYLDP+YNISD ATG+ FASAGT
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Query:  GYDNATSDVLSVIPLWKQLEYYKEYQAKLIAYQGSSTANETIKEALYVMSLGTNDFLENYYTMPGRSSQYNIQQYQDFLVGIAGGFIEKLHGLGARKISL
        GYDN+T+DVL VIPLWK++EY+KEYQ+ L AY G   A + I+E+LY++S+GTNDFLENYYT+P R SQ++I QYQDFLV IA  F++ ++ LGARK+S 
Subjt:  GYDNATSDVLSVIPLWKQLEYYKEYQAKLIAYQGSSTANETIKEALYVMSLGTNDFLENYYTMPGRSSQYNIQQYQDFLVGIAGGFIEKLHGLGARKISL

Query:  GGLPPMGCLPLERTRNLFGGNDCLESYNNLAMDFNNKLKALTVKLNKDLPDIELVFSNPYDVLMNMIKKPSLYGFDVTSTACCATGMFEMGYACNRNSMF
         G+ PMGCLPLER  NL     C  SYN+LA+DFN +L+ L  KLN++L  I++ F+NPYD++ +++ KP+LYG +++S+ACC TG+FEMG+ C +++  
Subjt:  GGLPPMGCLPLERTRNLFGGNDCLESYNNLAMDFNNKLKALTVKLNKDLPDIELVFSNPYDVLMNMIKKPSLYGFDVTSTACCATGMFEMGYACNRNSMF

Query:  TCTDAN
        TC+DAN
Subjt:  TCTDAN

AT3G16370.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein5.6e-6641.34Show/hide
Query:  LTIVSLLSSSTMITEAKVSAVIVFGDSSVDAGNNNFIPTIARSNFLPYGRDFAGGKATGRFSNGRIPTDFISEAFGLKPIVPAYLDPAYNISDLATGLTF
        LT+VS LS   +     V A++ FGDS VD GNNN++PT+ R+++ PYGRDFA  KATGRF NG++ TD  +E  G     PAYL P  +  +L  G  F
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Query:  ASAGTGYDNATSDVLSVIPLWKQLEYYKEYQAKLIAYQGSSTANETIKEALYVMSLGTNDFLENYYTMPGRSSQYNIQQYQDFLVGIAGGFIEKLHGLGA
        ASA +GYD+  + +   IPL++Q+EY+KEY++KLI   GS  A+  IK A+ ++S G++DF++NYY  P     Y +  Y  FL+     FI++++ +GA
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Query:  RKISLGGLPPMGCLPLERTRNLFGGNDCLESYNNLAMDFNNKLKALTVKLNKDLPDIELVFSNPYDVLMNMIKKPSLYGFDVTSTACCATGMFE-MGYAC
        RKI +  LPP GCLP  RT   F    C+   N  A +FN KL A   KL K   D+++V  + Y  L ++++ PS  GF   +  CC TG  E     C
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Query:  NRNSMFTCTDANNRT-RDSPHAPTLATTI
        N  S  TC++A      DS H    A  I
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AT4G26790.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein8.1e-10558.6Show/hide
Query:  LCFLTIVSLLSSSTMITEAKVSAVIVFGDSSVDAGNNNFIPTIARSNFLPYGRDFAGGKATGRFSNGRIPTDFISEAFGLKPIVPAYLDPAYNISDLATG
        L FL + + L      T AK  A+IVFGDS+VD+GNNN I T+ +SNF PYGRD+  GKATGRFSNGRI  DFISE  GLK  VPAYLDPAYNI+D ATG
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Query:  LTFASAGTGYDNATSDVLSVIPLWKQLEYYKEYQAKLIAYQGSSTANETIKEALYVMSLGTNDFLENYYTMPGRSSQYNIQQYQDFLVGIAGGFIEKLHG
        + FASAGTG DNATS VLSV+PLWK++EYYKEYQ +L +Y G   ANE I E+LY++S+GTNDFLENYY +P +  +Y++ +YQ FL+GIA  F+  ++ 
Subjt:  LTFASAGTGYDNATSDVLSVIPLWKQLEYYKEYQAKLIAYQGSSTANETIKEALYVMSLGTNDFLENYYTMPGRSSQYNIQQYQDFLVGIAGGFIEKLHG

Query:  LGARKISLGGLPPMGCLPLERTRNLFGGNDCLESYNNLAMDFNNKLKALTVKLNKDLPDIELVFSNPYDVLMNMIKKPSLYGFDVTSTACCATGMFEMGY
        LGARK+SL GL P GCLPLERT  LF G+ C+E YN +A DFN K++    +LN+DL  I+LVFSNPYD++  +I  P  +GF+   +ACC TG +EM Y
Subjt:  LGARKISLGGLPPMGCLPLERTRNLFGGNDCLESYNNLAMDFNNKLKALTVKLNKDLPDIELVFSNPYDVLMNMIKKPSLYGFDVTSTACCATGMFEMGY

Query:  ACNRNSMFTCTDAN
         C++ + FTC+DA+
Subjt:  ACNRNSMFTCTDAN

AT4G26790.2 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein8.1e-10558.6Show/hide
Query:  LCFLTIVSLLSSSTMITEAKVSAVIVFGDSSVDAGNNNFIPTIARSNFLPYGRDFAGGKATGRFSNGRIPTDFISEAFGLKPIVPAYLDPAYNISDLATG
        L FL + + L      T AK  A+IVFGDS+VD+GNNN I T+ +SNF PYGRD+  GKATGRFSNGRI  DFISE  GLK  VPAYLDPAYNI+D ATG
Subjt:  LCFLTIVSLLSSSTMITEAKVSAVIVFGDSSVDAGNNNFIPTIARSNFLPYGRDFAGGKATGRFSNGRIPTDFISEAFGLKPIVPAYLDPAYNISDLATG

Query:  LTFASAGTGYDNATSDVLSVIPLWKQLEYYKEYQAKLIAYQGSSTANETIKEALYVMSLGTNDFLENYYTMPGRSSQYNIQQYQDFLVGIAGGFIEKLHG
        + FASAGTG DNATS VLSV+PLWK++EYYKEYQ +L +Y G   ANE I E+LY++S+GTNDFLENYY +P +  +Y++ +YQ FL+GIA  F+  ++ 
Subjt:  LTFASAGTGYDNATSDVLSVIPLWKQLEYYKEYQAKLIAYQGSSTANETIKEALYVMSLGTNDFLENYYTMPGRSSQYNIQQYQDFLVGIAGGFIEKLHG

Query:  LGARKISLGGLPPMGCLPLERTRNLFGGNDCLESYNNLAMDFNNKLKALTVKLNKDLPDIELVFSNPYDVLMNMIKKPSLYGFDVTSTACCATGMFEMGY
        LGARK+SL GL P GCLPLERT  LF G+ C+E YN +A DFN K++    +LN+DL  I+LVFSNPYD++  +I  P  +GF+   +ACC TG +EM Y
Subjt:  LGARKISLGGLPPMGCLPLERTRNLFGGNDCLESYNNLAMDFNNKLKALTVKLNKDLPDIELVFSNPYDVLMNMIKKPSLYGFDVTSTACCATGMFEMGY

Query:  ACNRNSMFTCTDAN
         C++ + FTC+DA+
Subjt:  ACNRNSMFTCTDAN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCATACATGGTCTTCTTATGCTTTCTTACAATTGTCTCCCTCCTTTCGTCTTCGACGATGATAACCGAAGCTAAGGTTTCAGCGGTTATCGTCTTTGGTGAC
TCGTCAGTCGATGCTGGAAATAACAACTTCATTCCAACTATTGCAAGAAGCAACTTCTTGCCATACGGTCGAGATTTCGCTGGCGGGAAGGCAACCGGAAGATTT
TCCAATGGAAGAATTCCGACGGACTTCATTTCTGAGGCATTTGGGTTGAAGCCAATTGTTCCGGCTTACTTGGATCCTGCATATAACATCTCGGATTTGGCCACT
GGACTCACTTTTGCTTCTGCTGGAACTGGCTATGACAATGCCACTTCAGACGTTTTGTCAGTGATACCATTATGGAAGCAACTTGAATACTACAAGGAGTATCAA
GCAAAGTTGATAGCATATCAAGGCTCATCCACAGCAAACGAAACAATAAAAGAAGCTCTATATGTTATGAGCTTAGGAACCAATGACTTTTTAGAGAATTACTAC
ACAATGCCAGGCCGTTCATCACAATACAACATCCAACAATACCAAGACTTTCTCGTTGGGATCGCGGGTGGGTTTATCGAGAAGCTCCATGGCCTCGGGGCTCGG
AAAATCTCCCTCGGAGGGCTACCGCCGATGGGGTGCTTGCCGCTGGAAAGAACAAGAAACCTTTTTGGAGGCAATGACTGTTTGGAGAGTTATAACAATCTTGCT
ATGGATTTCAACAACAAACTCAAGGCCTTGACTGTGAAACTTAACAAGGACCTTCCCGACATCGAGCTGGTGTTTTCGAATCCATATGACGTTCTCATGAACATG
ATCAAAAAGCCTTCGCTCTACGGGTTTGATGTAACATCGACGGCATGTTGTGCTACGGGGATGTTTGAAATGGGCTATGCTTGCAATCGGAACAGCATGTTTACA
TGCACAGATGCAAACAATCGTACCAGAGATTCCCCACATGCGCCGACTCTAGCAACAACGATATCCATCTTCCAACTTCCATCCAACTTTCACGTTTCCCTCTCC
TTCAATTCCATCCGGGCGCGCACGACTTCTAGCGACACGGTGGCAGAACAACTCTATTGGCAATGGATTCCATCTCCTTGCGTGAGCACCAGTTTTGGCGACCTG
GACTGGACAACACTTTTGCCACCTTCTTACTCAAACTTCGTTGTAAAGGACCTTGAATTTTTACTTGCGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTCTCTTTCACCAACACTCTGTTTTTTGATTCACCAAAAATCACAGAACCAAACCAAAGTTATGGCATACATGGTCTTCTTATGCTTTCTTACAATTGTCTCCCT
CCTTTCGTCTTCGACGATGATAACCGAAGCTAAGGTTTCAGCGGTTATCGTCTTTGGTGACTCGTCAGTCGATGCTGGAAATAACAACTTCATTCCAACTATTGC
AAGAAGCAACTTCTTGCCATACGGTCGAGATTTCGCTGGCGGGAAGGCAACCGGAAGATTTTCCAATGGAAGAATTCCGACGGACTTCATTTCTGAGGCATTTGG
GTTGAAGCCAATTGTTCCGGCTTACTTGGATCCTGCATATAACATCTCGGATTTGGCCACTGGACTCACTTTTGCTTCTGCTGGAACTGGCTATGACAATGCCAC
TTCAGACGTTTTGTCAGTGATACCATTATGGAAGCAACTTGAATACTACAAGGAGTATCAAGCAAAGTTGATAGCATATCAAGGCTCATCCACAGCAAACGAAAC
AATAAAAGAAGCTCTATATGTTATGAGCTTAGGAACCAATGACTTTTTAGAGAATTACTACACAATGCCAGGCCGTTCATCACAATACAACATCCAACAATACCA
AGACTTTCTCGTTGGGATCGCGGGTGGGTTTATCGAGAAGCTCCATGGCCTCGGGGCTCGGAAAATCTCCCTCGGAGGGCTACCGCCGATGGGGTGCTTGCCGCT
GGAAAGAACAAGAAACCTTTTTGGAGGCAATGACTGTTTGGAGAGTTATAACAATCTTGCTATGGATTTCAACAACAAACTCAAGGCCTTGACTGTGAAACTTAA
CAAGGACCTTCCCGACATCGAGCTGGTGTTTTCGAATCCATATGACGTTCTCATGAACATGATCAAAAAGCCTTCGCTCTACGGGTTTGATGTAACATCGACGGC
ATGTTGTGCTACGGGGATGTTTGAAATGGGCTATGCTTGCAATCGGAACAGCATGTTTACATGCACAGATGCAAACAATCGTACCAGAGATTCCCCACATGCGCC
GACTCTAGCAACAACGATATCCATCTTCCAACTTCCATCCAACTTTCACGTTTCCCTCTCCTTCAATTCCATCCGGGCGCGCACGACTTCTAGCGACACGGTGGC
AGAACAACTCTATTGGCAATGGATTCCATCTCCTTGCGTGAGCACCAGTTTTGGCGACCTGGACTGGACAACACTTTTGCCACCTTCTTACTCAAACTTCGTTGT
AAAGGACCTTGAATTTTTACTTGCGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAYMVFLCFLTIVSLLSSSTMITEAKVSAVIVFGDSSVDAGNNNFIPTIARSNFLPYGRDFAGGKATGRFSNGRIPTDFISEAFGLKPIVPAYLDPAYNISDLAT
GLTFASAGTGYDNATSDVLSVIPLWKQLEYYKEYQAKLIAYQGSSTANETIKEALYVMSLGTNDFLENYYTMPGRSSQYNIQQYQDFLVGIAGGFIEKLHGLGAR
KISLGGLPPMGCLPLERTRNLFGGNDCLESYNNLAMDFNNKLKALTVKLNKDLPDIELVFSNPYDVLMNMIKKPSLYGFDVTSTACCATGMFEMGYACNRNSMFT
CTDANNRTRDSPHAPTLATTISIFQLPSNFHVSLSFNSIRARTTSSDTVAEQLYWQWIPSPCVSTSFGDLDWTTLLPPSYSNFVVKDLEFLLA