; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc09G24250 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc09G24250
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationClcChr09:37578086..37580643
RNA-Seq ExpressionClc09G24250
SyntenyClc09G24250
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A0A0K424 Uncharacterized protein6.5e-8595.38Show/hide
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A0A1S3BHA3 uncharacterized protein LOC1034896443.8e-8595.95Show/hide
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A0A5A7U7C4 Putative transmembrane protein3.8e-8595.95Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G12870.1 unknown protein8.7e-6678.4Show/hide
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        IMEAK  HPLHQIA+TPTHKLLLKQWLKEEELI  R+S KE+QIDSVR+EIT L+IFFF+FHS ++LLLF+AS+     A   ACKRSWIPSLC+LL SL
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AT5G56120.1 unknown protein8.0e-2739.2Show/hide
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        +N  + I++    HPL +I+E+P H LLLK W +EE+L   R+ LKE++++S+++EI  L  FF VFH     L++++S  D        A CK+ WIPS
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          SL  SL +++ V+ K  V   + + + RE+ D   L++CV EL+ KG  FDL KE  + +R KS  VE  + WK
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGATAACAACAAAGCCTTATCGATCATGGAAGCAAAACCTTCACACCCACTTCACCAAATTGCAGAAACCCCAACCCACAAACTTCTTCTCAAGCAATGGCTGAA
GGAAGAAGAACTAATCTTTGGCAGAATTTCACTGAAAGAAACCCAAATCGACTCTGTGAGAAAAGAAATCACAATGCTTCACATCTTCTTCTTCGTCTTCCACTCCACAG
CCATACTCCTCCTCTTCAATGCGTCGACCAAGGATTTCCATGGCGCAGCCTGCAAGAGATCATGGATTCCCTCTCTCTGTTCTCTCTTGTTCTCTCTGGGAATCATCTGG
GCGGTGAGATATAAGACGGATGTTGAAGCCCATTTGGAGAAACTGCTGGAAAGGGAAAAAGAAGACAGGAATTTGCTGTCAAAGTGTGTGGATGAATTGAAGAGGAAAGG
GATTGAATTTGATTTGCTGAAGGAGGTGGATGCGCTTAGGAGGGCAAAGAGTCTGAGGGTTGAAGGTATCCTGGTTTGGAAGTTACAGCGGCCACTTCAATGTCTCCAGT
CAGCATTGCCACCACACGGGACATCGATGGCCGAAGAGCTGGAGATGTTTGAGTACACAGAAGAGCTACACCGATCACCCTTTTTACTTCCTCCTTACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGCTTTTCCAGATCCGACCGTTACAATTATTTGAAAAAAGCAATGATAGAAGCAGAGAGCCTGCTTTCAAAAACCTCCAATTTCATCCTCCCTCTTCTATCATTCTTCTT
CCTATTTTGTGCTTCTTCGTCTCTCTCTGTTTTTGTGGGTCATTTCCATGGATGATAACAACAAAGCCTTATCGATCATGGAAGCAAAACCTTCACACCCACTTCACCAA
ATTGCAGAAACCCCAACCCACAAACTTCTTCTCAAGCAATGGCTGAAGGAAGAAGAACTAATCTTTGGCAGAATTTCACTGAAAGAAACCCAAATCGACTCTGTGAGAAA
AGAAATCACAATGCTTCACATCTTCTTCTTCGTCTTCCACTCCACAGCCATACTCCTCCTCTTCAATGCGTCGACCAAGGATTTCCATGGCGCAGCCTGCAAGAGATCAT
GGATTCCCTCTCTCTGTTCTCTCTTGTTCTCTCTGGGAATCATCTGGGCGGTGAGATATAAGACGGATGTTGAAGCCCATTTGGAGAAACTGCTGGAAAGGGAAAAAGAA
GACAGGAATTTGCTGTCAAAGTGTGTGGATGAATTGAAGAGGAAAGGGATTGAATTTGATTTGCTGAAGGAGGTGGATGCGCTTAGGAGGGCAAAGAGTCTGAGGGTTGA
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AGCTACACCGATCACCCTTTTTACTTCCTCCTTACTGAACTCTGATAATTCAGAATCCACCATCTCAAGTTCACAGTTGTTTTCGTGGAGGTACCATGCCTACAAGCAAA
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TTTGGTTTTTTGGTTTTTTGTTTTTTTGGATATTCTCTCATATACCCTTCTTGGATCAAAATGGCCTAAGTATTATCTATCACTTGGTGGCCTCGTAGACAGATTATCAC
GTATGTCCAACTCCGAGTAATAATGTATATATTTCTGATCTCATCGTTGAGTTATGAGAGAAAATGCAAGGCAAGATATTGATAATTTGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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