; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc10G00570 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc10G00570
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionRossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold containing protein
Genome locationClcChr10:573948..577070
RNA-Seq ExpressionClc10G00570
SyntenyClc10G00570
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8649997.1 hypothetical protein Csa_011663 [Cucumis sativus]4.2e-11485.38Show/hide
Query:  MASLQSSISPFKPSFSLPSLSHFLFTFFFFLESPSS-------SSSNLPSMALARCFLPFPFETSKHPLSASVFT-SSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLP
        M  +Q S+SPFKPSFS PS    LF FFFFLESPS        SSSNL SMA+ARCFLPFP ETSKHPLSAS+FT SSTD SF++A  S+SRRPRGFKLP
Subjt:  MASLQSSISPFKPSFSLPSLSHFLFTFFFFLESPSS-------SSSNLPSMALARCFLPFPFETSKHPLSASVFT-SSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLP

Query:  ITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTRQAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQ
        ITTLCCKMP R+KAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNP+LSEGTRQAIATTAALAKNNGADITVVLID KQKDS PEHENQLSSIRWHLSEGGFQ
Subjt:  ITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTRQAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQ

Query:  EFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEFIPCPVMLLPL
        EF+LLERLG+GSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEA+HSKHVDANLLAEFIPCPVMLLPL
Subjt:  EFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEFIPCPVMLLPL

TYK11399.1 putative universal stress protein [Cucumis melo var. makuwa]2.2e-9990.48Show/hide
Query:  MALARCFLPFPFETSKHPLSASVFT-SSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR
        MA+ARCFLPF  ETSKHPLS S+FT SSTD SF++A  SD RRPRGFK PITTLCCKM  RVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR
Subjt:  MALARCFLPFPFETSKHPLSASVFT-SSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR

Query:  QAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEF
        QAIATTAALAKNNGADITVVLID KQKDS PEHENQLSSIRWHLSEGGFQEF+LLERLG+GSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEA+HSKHVDANLLAEF
Subjt:  QAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEF

Query:  IPCPVMLLPL
        IPCPVMLLPL
Subjt:  IPCPVMLLPL

XP_004146157.1 uncharacterized protein LOC101219661 [Cucumis sativus]2.8e-10291.43Show/hide
Query:  MALARCFLPFPFETSKHPLSASVFT-SSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR
        MA+ARCFLPFP ETSKHPLSAS+FT SSTD SF++A  S+SRRPRGFKLPITTLCCKMP R+KAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNP+LSEGTR
Subjt:  MALARCFLPFPFETSKHPLSASVFT-SSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR

Query:  QAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEF
        QAIATTAALAKNNGADITVVLID KQKDS PEHENQLSSIRWHLSEGGFQEF+LLERLG+GSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEA+HSKHVDANLLAEF
Subjt:  QAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEF

Query:  IPCPVMLLPL
        IPCPVMLLPL
Subjt:  IPCPVMLLPL

XP_008448520.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490671 [Cucumis melo]3.8e-9990.48Show/hide
Query:  MALARCFLPFPFETSKHPLSASVFT-SSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR
        MA+ARCFLPF  ETSKHPLS S+FT SSTD SF++A  SD RRPRGFK PITTLCCKM  RVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR
Subjt:  MALARCFLPFPFETSKHPLSASVFT-SSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR

Query:  QAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEF
        QAIATTAALAKNNGADITVVLID KQKDS PEHENQLSSIRWHLSEGGFQEF+LLERLG+GSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEA+HSKHVDANLLAEF
Subjt:  QAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEF

Query:  IPCPVMLLPL
        IPCPVMLLPL
Subjt:  IPCPVMLLPL

XP_038903454.1 uncharacterized protein LOC120090039 [Benincasa hispida]1.7e-10291.94Show/hide
Query:  MALARCFLPFPFETSKHPLSASVFTSS--TDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGT
        MA+ARCFLPFPFETSKHPLS S+FTSS  TD SF+VA HSDSR  RGFKLPI  LCCKMP R KAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGT
Subjt:  MALARCFLPFPFETSKHPLSASVFTSS--TDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGT

Query:  RQAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAE
        RQAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEH+NQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLG+GSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEA+HSKHVDANLLAE
Subjt:  RQAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAE

Query:  FIPCPVMLLPL
        FIPCPVMLLPL
Subjt:  FIPCPVMLLPL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L108 Uncharacterized protein1.4e-10291.43Show/hide
Query:  MALARCFLPFPFETSKHPLSASVFT-SSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR
        MA+ARCFLPFP ETSKHPLSAS+FT SSTD SF++A  S+SRRPRGFKLPITTLCCKMP R+KAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNP+LSEGTR
Subjt:  MALARCFLPFPFETSKHPLSASVFT-SSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR

Query:  QAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEF
        QAIATTAALAKNNGADITVVLID KQKDS PEHENQLSSIRWHLSEGGFQEF+LLERLG+GSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEA+HSKHVDANLLAEF
Subjt:  QAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEF

Query:  IPCPVMLLPL
        IPCPVMLLPL
Subjt:  IPCPVMLLPL

A0A1S3BJ95 uncharacterized protein LOC1034906711.9e-9990.48Show/hide
Query:  MALARCFLPFPFETSKHPLSASVFT-SSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR
        MA+ARCFLPF  ETSKHPLS S+FT SSTD SF++A  SD RRPRGFK PITTLCCKM  RVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR
Subjt:  MALARCFLPFPFETSKHPLSASVFT-SSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR

Query:  QAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEF
        QAIATTAALAKNNGADITVVLID KQKDS PEHENQLSSIRWHLSEGGFQEF+LLERLG+GSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEA+HSKHVDANLLAEF
Subjt:  QAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEF

Query:  IPCPVMLLPL
        IPCPVMLLPL
Subjt:  IPCPVMLLPL

A0A5A7UB34 Putative universal stress protein1.9e-9990.48Show/hide
Query:  MALARCFLPFPFETSKHPLSASVFT-SSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR
        MA+ARCFLPF  ETSKHPLS S+FT SSTD SF++A  SD RRPRGFK PITTLCCKM  RVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR
Subjt:  MALARCFLPFPFETSKHPLSASVFT-SSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR

Query:  QAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEF
        QAIATTAALAKNNGADITVVLID KQKDS PEHENQLSSIRWHLSEGGFQEF+LLERLG+GSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEA+HSKHVDANLLAEF
Subjt:  QAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEF

Query:  IPCPVMLLPL
        IPCPVMLLPL
Subjt:  IPCPVMLLPL

A0A5D3CMG3 Putative universal stress protein1.1e-9990.48Show/hide
Query:  MALARCFLPFPFETSKHPLSASVFT-SSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR
        MA+ARCFLPF  ETSKHPLS S+FT SSTD SF++A  SD RRPRGFK PITTLCCKM  RVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR
Subjt:  MALARCFLPFPFETSKHPLSASVFT-SSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTR

Query:  QAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEF
        QAIATTAALAKNNGADITVVLID KQKDS PEHENQLSSIRWHLSEGGFQEF+LLERLG+GSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEA+HSKHVDANLLAEF
Subjt:  QAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEF

Query:  IPCPVMLLPL
        IPCPVMLLPL
Subjt:  IPCPVMLLPL

A0A6J1FSW2 uncharacterized protein LOC111448467 isoform X11.5e-9378.99Show/hide
Query:  LPSLSHFLFTFFFFLESPSSSSSNLPSMALARCFLPFPFETSKHPLSASVF--TSSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEAT
        L +L H   + F    S S+    LP+MA ARC LP P ET KHP S S+F  +SST  SF+VA +S SRR   F LPI+TLCCK   RVKAKP DSEAT
Subjt:  LPSLSHFLFTFFFFLESPSSSSSNLPSMALARCFLPFPFETSKHPLSASVF--TSSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEAT

Query:  LVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTRQAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVA
        +VAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTRQAIATTAALAKNNGADITV+LIDEKQK+SFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQE++LLERLGDGSKPTAIIGEVA
Subjt:  LVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTRQAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVA

Query:  DDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEFIPCPVMLLPL
        DDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEFIPCPVMLLPL
Subjt:  DDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEFIPCPVMLLPL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G66090.1 unknown protein1.3e-5760.1Show/hide
Query:  ASVFTSSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATL----VAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTRQAIATTAALAKNNGADI
        A++ +SS+ SS    L S   +PR   L + ++  K   RVKA+ +++EA+     V  +F+  KHLLLP+ DRNP+LSEGTRQA ATT +LAK  GADI
Subjt:  ASVFTSSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQDSEATL----VAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTRQAIATTAALAKNNGADI

Query:  TVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEFIPCPVMLLPL
        TVV+IDE++++S  EHE Q+S+IRWHLSEGGF+EF+LLERLG+G K TAIIGEVAD+L ++LVV+SMEA+HSK++DANLLAEFIPCPV+LLPL
Subjt:  TVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAVHSKHVDANLLAEFIPCPVMLLPL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTCCCTACAATCTTCCATTTCCCCCTTCAAACCTTCATTTTCACTCCCATCTCTCTCTCACTTTCTCTTCACCTTCTTCTTCTTTCTCGAATCACCTTCTTCTTC
TTCTTCCAACCTTCCATCTATGGCCCTTGCTCGTTGCTTCCTCCCTTTTCCTTTTGAAACTTCGAAGCATCCACTCTCTGCTTCCGTTTTCACTTCCTCTACTGATTCTT
CCTTCTCTGTCGCGCTTCATTCTGATTCTCGTCGGCCCCGAGGTTTTAAGCTCCCAATCACCACTCTCTGCTGCAAAATGCCCCTTCGCGTAAAAGCCAAGCCACAAGAT
TCGGAAGCAACATTAGTTGCCGGCTCCTTCACTGAATTCAAACACCTGCTGCTTCCAATAACCGATCGCAATCCTTTTCTTTCCGAGGGAACGAGACAGGCTATTGCTAC
TACTGCTGCTTTGGCAAAGAACAATGGGGCTGACATAACAGTAGTCTTGATTGACGAAAAGCAGAAGGATTCGTTTCCGGAGCACGAGAACCAACTCTCGAGCATTCGTT
GGCATTTGTCTGAAGGTGGATTCCAAGAGTTTAGATTGTTGGAGAGGTTAGGGGATGGAAGCAAGCCAACAGCAATCATTGGGGAGGTGGCCGATGATCTGAACTTAGAT
TTGGTAGTTCTAAGCATGGAAGCCGTTCATTCTAAGCATGTAGATGCTAACCTACTGGCTGAGTTCATTCCATGCCCTGTTATGCTCTTGCCATTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGAAGGCCCATTTTTCTTAGGGGTGTAAAAACAGAGCCCATATGGAAATTTGGAAGATGTACAAATGGCGTCCCTACAATCTTCCATTTCCCCCTTCAAACCTTCATTTT
CACTCCCATCTCTCTCTCACTTTCTCTTCACCTTCTTCTTCTTTCTCGAATCACCTTCTTCTTCTTCTTCCAACCTTCCATCTATGGCCCTTGCTCGTTGCTTCCTCCCT
TTTCCTTTTGAAACTTCGAAGCATCCACTCTCTGCTTCCGTTTTCACTTCCTCTACTGATTCTTCCTTCTCTGTCGCGCTTCATTCTGATTCTCGTCGGCCCCGAGGTTT
TAAGCTCCCAATCACCACTCTCTGCTGCAAAATGCCCCTTCGCGTAAAAGCCAAGCCACAAGATTCGGAAGCAACATTAGTTGCCGGCTCCTTCACTGAATTCAAACACC
TGCTGCTTCCAATAACCGATCGCAATCCTTTTCTTTCCGAGGGAACGAGACAGGCTATTGCTACTACTGCTGCTTTGGCAAAGAACAATGGGGCTGACATAACAGTAGTC
TTGATTGACGAAAAGCAGAAGGATTCGTTTCCGGAGCACGAGAACCAACTCTCGAGCATTCGTTGGCATTTGTCTGAAGGTGGATTCCAAGAGTTTAGATTGTTGGAGAG
GTTAGGGGATGGAAGCAAGCCAACAGCAATCATTGGGGAGGTGGCCGATGATCTGAACTTAGATTTGGTAGTTCTAAGCATGGAAGCCGTTCATTCTAAGCATGTAGATG
CTAACCTACTGGCTGAGTTCATTCCATGCCCTGTTATGCTCTTGCCATTATGATTTTTGTACAATTTGTCACCAATATTAGAGTTTTATCATATGTATGTTTTTTGTAAC
AGTGTCCTGGGTGTACCTGTGATTTATGTATATATAAAGTGCTTTCGGAGTTTAATGGGACCCTTTTTTATATTATCTAGAAAAAATGATCCAATCAGTCTTCGAAATTT
GGGATATGTTGTTTATGGGGTTTTGAATATTCAAACAATAATTTTACTTCGAAAGTTTGCATTCTAAGCTTATATTTGGAAAATTCTCAGGTATAGTCTCTTTAAATTTT
CATATTTTAGAAATAACACGCCTTTTCAAAACTCGTTAAAAAGTTTTTCTCGGACATCCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASLQSSISPFKPSFSLPSLSHFLFTFFFFLESPSSSSSNLPSMALARCFLPFPFETSKHPLSASVFTSSTDSSFSVALHSDSRRPRGFKLPITTLCCKMPLRVKAKPQD
SEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTRQAIATTAALAKNNGADITVVLIDEKQKDSFPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFRLLERLGDGSKPTAIIGEVADDLNLD
LVVLSMEAVHSKHVDANLLAEFIPCPVMLLPL