CuGenDBv2

Gene ID	Clc10G19860
Organism	Citrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Description	60S ribosomal protein L12
Genome location	ClcChr10:33484094..33484594
RNA-Seq Expression	Clc10G19860
Synteny	Clc10G19860
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0070180 - large ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR000911 - Ribosomal protein L11/L12 IPR020783 - Ribosomal protein L11, C-terminal IPR020784 - Ribosomal protein L11, N-terminal IPR020785 - Ribosomal protein L11, conserved site IPR036769 - Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily IPR036796 - Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004137822.1 60S ribosomal protein L12-1 [Cucumis sativus]

3.7e-82

98.19

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+VEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPK LQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

XP_004143249.1 60S ribosomal protein L12-1 [Cucumis sativus]

8.2e-82

97.59

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+VEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPK LQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

XP_022935531.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Cucurbita moschata]

2.4e-81

96.99

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+V+VFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPK LQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

XP_022950157.1 60S ribosomal protein L12-3 [Cucurbita moschata]

6.9e-81

95.78

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+V+VFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPK LQQEI+DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

XP_038883892.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Benincasa hispida]

5.3e-81

96.39

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+V+VFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPK LQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KF33 Uncharacterized protein

3.9e-82

97.59

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+VEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPK LQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

A0A0A0LAX8 Uncharacterized protein

1.8e-82

98.19

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+VEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPK LQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

A0A1S3BLM0 60S ribosomal protein L12-1

3.9e-82

97.59

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+VEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPK LQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

A0A5D3DNF2 60S ribosomal protein L12

3.9e-82

97.59

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+VEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPK LQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

A0A6J1J2K8 60S ribosomal protein L12-1-like

1.1e-81

96.99

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+V+VFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPK LQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O50003 60S ribosomal protein L12

1.1e-76

87.95

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETA +WKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        H+G+ISLDDVIEIA++M+ RSMAK+L+G+VKEIL TCVSVGCTVDGKDPK LQQEI+DGDVEIP D
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

P0CT83 60S ribosomal protein L12-A

3.3e-62

70.48

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DP+++  +F+R  GGEV   S+LAPKIGPLGLSPKK+GEDIAK T K+WKGLRVTVKL++QNRQA VSVVPSA+ALVIKALKEP RDRKK KN+ 
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        H+GN+SLD++IE+AR MR +S+AK+LSG+VKEILGT  SVGCTVDGK+P  +Q+EI +G++EIPQ+
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

P50883 60S ribosomal protein L12-1

2.6e-78

87.95

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPK +QQEI DG+VEIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

Q9FF52 60S ribosomal protein L12-3

4.4e-78

87.35

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDVIEIA++MRPRS+AK+LSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPK LQ+EI+ GD++IP +
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

Q9LFH5 60S ribosomal protein L12-2

5.7e-78

87.35

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPK LQQEI +G++EIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G37190.1 Ribosomal protein L11 family protein

1.8e-79

87.95

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPK +QQEI DG+VEIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

AT3G53430.1 Ribosomal protein L11 family protein

4.0e-79

87.35

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPK LQQEI +G++EIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

AT5G60670.1 Ribosomal protein L11 family protein

3.1e-79

87.35

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDVIEIA++MRPRS+AK+LSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPK LQ+EI+ GD++IP +
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCCTCCGAAATTGGACCCAAGTCAGCTGGTTGAAGTCTTCGTTCGCGTTACTGGAGGTGAGGTCGGAGCCGCCAGTTCTCTCGCTCCCAAGATCGGTCCTCTT
GGTCTTTCCCCTAAGAAGATCGGAGAAGACATTGCCAAAGAGACCGCAAAGGAATGGAAAGGTCTTAGGGTTACTGTAAAGCTTTCCGTCCAAAATCGTCAGGCG
AAGGTCTCCGTTGTGCCTTCCGCGGCGGCTTTGGTAATTAAGGCCTTGAAGGAGCCGGAACGTGACCGGAAGAAAACTAAGAACATCAAGCACAATGGTAATATT
TCTCTCGATGATGTGATTGAGATTGCTCGGGTTATGCGGCCCAGATCGATGGCTAAGGACCTCTCTGGCTCCGTCAAGGAGATCCTTGGTACTTGTGTGTCTGTT
GGTTGTACTGTTGATGGCAAGGACCCGAAGGTTCTTCAACAGGAGATCTCTGATGGCGACGTTGAAATCCCCCAAGATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIKHNGNI
SLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKVLQQEISDGDVEIPQD

Clc10G19860 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome