; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc10G20980 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc10G20980
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionLegume-specific protein
Genome locationClcChr10:34315461..34316368
RNA-Seq ExpressionClc10G20980
SyntenyClc10G20980
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044116.1 legume-specific protein [Cucumis melo var. makuwa]4.6e-3694.38Show/hide
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KAE8650999.1 hypothetical protein Csa_002313 [Cucumis sativus]6.7e-3595.35Show/hide
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KAG6580521.1 hypothetical protein SDJN03_20523, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.9e-3185.39Show/hide
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KAG6596392.1 hypothetical protein SDJN03_09572, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.0e-2780.22Show/hide
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KAG7017269.1 hypothetical protein SDJN02_19132, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.0e-3186.52Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD26 Uncharacterized protein2.2e-3695.45Show/hide
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A0A0B2P904 Uncharacterized protein3.8e-2064.89Show/hide
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A0A5D3DNC7 Legume-specific protein2.2e-3694.38Show/hide
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C6SZB5 Uncharacterized protein2.5e-1963.83Show/hide
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K7MT87 Uncharacterized protein5.9e-2165.96Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37750.1 unknown protein4.1e-0645.35Show/hide
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AT5G02090.1 unknown protein3.4e-0550Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGGTCTAATTCCCTTTGTTTACAAAGCTATCGTTCAATACAAGAATGAAAAACAAGTACCGGCGATCCGATCTTGGCTCTGCGACTCCCCCTCCGCCTCCTACAT
CAGACTTCCCAGTGGTGATTCCGGCCGATTTCAGTTCCAATCCGACGGCTCGCCTTCTTCAAAATCACCCTCTTCCACCGCCACCCAGATTCTGGTTTCCACCGGAGTTC
AATCGCCGCTCCGCCATCTGACGACTCGACGGGTTGCCGCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TATTACGCCACGTCATCATAATCCTTCTCTTCCATTTTAAACCAATCCCTCTCTCTCATTTTCTCTTCAGCTTTCAAAATTCAAAATCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAG
AAATGGAAGGTCTAATTCCCTTTGTTTACAAAGCTATCGTTCAATACAAGAATGAAAAACAAGTACCGGCGATCCGATCTTGGCTCTGCGACTCCCCCTCCGCCTCCTAC
ATCAGACTTCCCAGTGGTGATTCCGGCCGATTTCAGTTCCAATCCGACGGCTCGCCTTCTTCAAAATCACCCTCTTCCACCGCCACCCAGATTCTGGTTTCCACCGGAGT
TCAATCGCCGCTCCGCCATCTGACGACTCGACGGGTTGCCGCCTAATCCGACCACCGACGATGGGTAAATAAAATTAAAGAAAAAAAAACTGTTTAATTTGTAATATCTG
GCTTATATTTTTTCTGCTTAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAGGAGTCTTGAAGTGTTTGGAAAGCCCAAAGGCACCGGCGCTTGGGATATGATCTGTGTAAGTTGTGAATA
TTGATGAATGTAATTGTTTGAGATGGAAGTTTGAGTTGTGGATGCCTCTGTGTTTGTTTGATATTTGTTAGATGATAAAATTTAGGTGGGGTAATGAGGTTAAAGTCTGG
AGTATCCTATATCTGTGAATAGTTAATTTGGATTAATTGGTGTGTGTTAGGGAAGAGGAGAGGCATTCGGGAGTGGTTAGATGTCAAATCCAAATGAACCCATAAAATAA
TAATAATAATAAAGACAAAAAGAATTTAGTAGGCTATGGGGAGAGTTGTTGGAAAATGATAAAGATTATTAAAAGCGATGGGGATTTTAAAAAATGGAGGAGAAGGATGT
GTAAGCTCAGATAGTGTGGCCCCATTCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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